基因组学助力芸薹属抗性基因挖掘与育种
芸薹属包含许多重要的蔬菜、油料和饲料作物，如白菜、甘蓝、油菜、芥菜等。与其它农作物一样，芸薹属作物在生产中不断受到病毒、细菌和真菌等的侵害，造成巨大经济损失。 近日，《园艺学研究》在线发表了中国农业科学院蔬菜花卉研究所甘蓝课题组方智远院士团队的综述文章。该文针对芸薹属作物主要病害芜菁花叶病毒病、黑腐病、黑胫病、菌核病、枯萎病、霜霉病和根肿病等，详细介绍了近年来国内外在芸薹属抗性基因挖掘及育种应用等方面取得的进展。 论文通讯作者、中国农业科学院蔬菜花卉研究所副研究员吕红豪介绍，传统的物理、化学防治手段往往操作复杂、成本高、易对环境造成危害。相比之下，利用作物的自然抗性是最理想的策略。因此，挖掘抗性种质和抗病基因，培育抗病、优良的新品种成为芸薹属育种工作者的重要任务。近年来，基因组学、分子遗传学和生物技术的快速发展使得抗性基因的高效挖掘和应用成为可能。 这些成果既缓解了上述病害对芸薹属作物生产的危害，也加深了人们对R基因抗......阅读全文
解决基因组学重要挑战的新工具
单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术，可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多，但是，仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列，从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前，去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列，还是一个手动和耗时的过程，为了去除污染
Neogen农业基因组学解决方案（三）
猪的基因组学解决方案GeneSeek 的猪基因组学解决方案为窥探猪的遗传结构打开了一个重要的窗口，包括是否易感染治疗昂贵的疾病以及繁殖中对想要性状的锁定。GeneSeek猪全基因组低密度微珠芯片该微珠芯片提供约 10,000个 SNP，包括经常使用的 USDA血统和身份 SNP、用于识别品种的 SN
英国基因组学研究进展迅速
随着基因数据的逐渐增多，临床医生能够更好地治疗患者，同时减少医疗事故的发生。英国国家医疗服务体系(National Health Service，NHS)中的许多遗传学中心现在都在使用芯片和外显子测序。 近日，英国卫生大臣Jeremy Hunt和生命科学部长George Freeman将宣布新
研究指出基因组学引领生物育种变革
记者从近日举行的第五届国际农业基因组会议暨深圳国际食品谷研讨会上获悉，现代农业研究已迈入生物组学大数据时代，特别是基因组学及其衍生技术在生物育种中发挥着重要的引领作用。 基因组学是对生物体所有基因进行集体表征、定量研究及不同基因组比较研究的一门交叉生物学学科。基因组学主要研究基因组的结构、功能
基因组学推动生命科学大步向前
2010年下旬，河南安阳曹操墓真伪之辩正酣。而一则来自上海的重磅消息更是引发了多方关注。复旦大学现代人类学教育部重点实验室宣布，向全国征集曹姓男性DNA样本，拟用基因组科学的手段验证出土的头骨是否为曹操本人。 一下子，基因组科学成为热门，这一话题“落入寻常百姓家”。 事实上，伴随着2
Neogen农业基因组学解决方案（二）
遗传异常测试遗传病不仅会导致生产商的经济损失，还会对牲畜造成过大的压力。在接种前的遗传测试可以给生产商提供必要的信息，以做出最佳的接种决定，从而避免遗传病，诸如：• 小腿弯曲（多发性关节硬化症）• 神经性脑积水（NH）• 先天性西昌趾（挛缩性蜘蛛指综合征）• 肺发育不良，并全身水肿（PHA）
宏基因组学技术测序木乃伊的肺结核基因组
来自华威大学的研究者使用宏基因组学技术发现215年之久的木乃伊的肺结核基因组。 由Mark Pallen带领的研究团队试图用技术来发现组织学标本中的肺结核的DNA。 宏基因组学是一种从样本中检测DNA序列的技术，并且样本不需要培养或扩增。这种方法避免了与细菌培养或DNA扩增
墨兰花朵性状分子标记和功能基因挖掘研究获进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/511088.shtm
利用GWAS方法挖掘谷子资源中蕴含的抗谷瘟病基因
谷子是中国传统粮食作物，具有抗旱耐贫瘠、营养丰富平衡、粮草兼用、耐储存等特点，作为谷子三大病害之一的谷瘟病，严重影响谷子产量和商品品质，目前对谷瘟病的研究仅局限于抗病性鉴定和评价，有关抗谷瘟病基因的研究尚未见报道。 近期，中国农业科学院作物科学研究所刁现民研究组完成的题为“Identifica
美X大奖基因组学挑战赛流产
图片来源：美国国家人类基因组研究所 美国X大奖基金会宣布废止其备受瞩目的奖金为1000万美元的基因组学挑战赛。报名截止时，该比赛仅吸引了两组竞争者参加。不过发言人表示，取消竞赛的决定与参赛人数无关。 7年前，阿康基因组学X大奖高调设立。该奖项旨在通过提供1000万美元奖金
解局：腾飞前夜的基因组学检测市场
2001年是一个遥远的年份。那一年，维基百科刚刚上线，苹果公司推出了第一代iPod，微软的操作系统也仅停留在Windows XP。但如果论对未来的影响，这些成果或许都比不上人类基因组草图的公布。在短短的15年里，基因/基因组测序从昂贵的科研项目，迅速成为了可靠且价格合适的工具。它推动了靶向药物与
GENEWIZ收购Beckman－Coulter基因组学服务业务
分析测试百科网讯 近日，全球领先的基因组学服务提供商——GENEWIZ已经签署收购Beckman Coulter基因组学服务业务的最终协议，该业务提供医疗保健、学术和政府机构的专业的基因组测序解决方案（GS）。 “Beckman Coulter的基因组学服务业务和GENEWIZ的全球战略和扩张
2013国际基因组学大会在青岛召开
10月29日，由中科院北京基因组研究所、中国遗传学会、中国海洋大学等单位主办的“2013国际基因组学大会”在青岛召开。来自美国、加拿大、德国、瑞士等国家的著名科学家和我国相关领域的知名学者与会，以“基因组学的突破和转化”为主题，交流和研讨基因组学研究的最新进展和成果。 本届大会首次为海洋与水产
Illumina推出全球首个基因组学孵化器
Illumina公司是生命科学工具和遗传变异及功能分析集成系统的领先的开发商、制造商和销售商。它不仅能为基因分型、拷贝数变异分析、甲基化研究、基因表达分析以及DNA、RNA、蛋白质的低复制率分析等提供创新的排序和基于阵列的解决方案，同时，它还为消费者的基因组学和诊断学研究进展提供工具和服务。Il
科学家绘制肝癌药物基因组学“蓝图”
8月1日，国际学术期刊Cancer Cell 在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所惠利健研究组、中国科学院上海营养与健康研究所李亦学研究组、第二军医大学附属东方肝胆外科医院张海斌研究组以及南京大学医学院附属鼓楼医院施晓雷合作的题为A Pharmacogenomic Landscape
国际遗传和医学基因组学大会近日召开
日前，安捷伦科技有限公司作为主要赞助商参与了于6月9日至11日在香港大学举行的国际遗传和医学基因组学大会。该次国际会议由美洲华人遗传学会和香港医学遗传学会在历年分别举办的国际学术会议的基础上首次联合举办。会议吸引了国内外从事遗传学和医学基因组学研究的知名学者参与。诺贝尔奖获得者Oliver Smit
谢晓亮：当单分子遇上基因组学
当单分子遇上基因组学，它们会擦出什么样的火花？著名华人学者谢晓亮（Sunney Xie）博士围绕这个话题，在《美国医学会杂志》（JAMA）上发表了文章。谢博士现任哈佛大学化学及化学生物学系教授，也任北京大学生物动态成像中心主任。 谢博士写道，单分子成像和操作的进步导致了单分子生物学的出现。由于
单分子遇上基因组学：会擦出什么火花
当单分子遇上基因组学，它们会擦出什么样的火花?著名华人学者谢晓亮(Sunney Xie)博士围绕这个话题，在《美国医学会杂志》(JAMA)上发表了文章。谢博士现任哈佛大学化学及化学生物学系教授，也任北京大学生物动态成像中心主任。 谢博士写道，单分子成像和操作的进步导致了单分子生物学的出现。由于
文特尔：合成基因组学利大于害
美国生物学家克雷格·文特尔领导的一个研究小组5月20日宣布创造了世界上第一个由人造基因组控制的细胞，引起广泛关注和争议。6月7日，文特尔教授接受了记者的书面采访。 问：有人说你们从事的是“人造生命”的研究，请简单介绍一下“人造生命”与自然界生命之间的相似点与不同点。 答：我们不说它
英国成立功能基因组学实验室
近日，英国科研与创新署（UKRI）宣布，医学研究理事会（MRC）、剑桥大学米尔纳治疗研究所（MTI）等联合成立功能基因组学实验室，作为英国卓越研究中心和国家资源中心，汇集英国生命健康领域学术界、产业界优势和专业知识，加速新药物和诊断方法的研究发现，巩固英国在全球基因组学方面的领先地位。 该实验
治疗鼻咽癌新策略：药物基因组学
鼻咽癌是我国华南地区高发的肿瘤类型，但过往对其癌症发生机制和分子分型的研究较少，因而在鼻咽癌的临床治疗中，尚缺乏有效的精准治疗策略。化疗和放化疗是鼻咽癌治疗常用的手段，尤其是对于中晚期或者癌转移患者。但是，如何为不同类型的鼻咽癌患者提供最佳的个性化药物治疗方案，仍是临床上亟待解决的难题。 澳门
英国成立功能基因组学实验室
近日，英国科研与创新署（UKRI）宣布，医学研究理事会（MRC）、剑桥大学米尔纳治疗研究所（MTI）等联合成立功能基因组学实验室，作为英国卓越研究中心和国家资源中心，汇集英国生命健康领域学术界、产业界优势和专业知识，加速新药物和诊断方法的研究发现，巩固英国在全球基因组学方面的领先地位。 该实验
深度解读：个人基因组学的现状与发展
什么是Personal Genomics？ Personal Genomics，一般翻译为“个人基因组学”。是基因组学的一个分支，主要关注个人基因组的测序和分析。 1990年开始发起的浩大的“人类基因测序计划”是从大量的个体中获取基因信息，综合之后建立一个具有“参考价值”的人类“平均”基因组
基因组学结合传统育种获得优质主食作物
“我喜欢这个。”Ismail Rabbi边说边将手掌放在木薯上，就像父母在夸赞自己心爱的孩子，他羞涩地笑了。“它们看上去没什么了不起的——并不高。”Rabbi说，“但它克服了我们设置的所有障碍。” Rabbi是尼日利亚伊巴丹国际热带农业研究所（IITA）的遗传学家。他和同事正在开展一项改良木
解码“基因组学之父”桑格：测序，测序，测序
“桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’，他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础，彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、 有一天，65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验，转身走出实验室，宣布自己正式退休。那一年是1983
全国玉米功能基因组学研究协作平台建立
近日，由中国农业科学院生物技术研究所、安徽农业大学和齐鲁师范学院共同主办的第四届全国玉米功能基因组学术研讨会在海南三亚召开。会议旨在通过创新共享玉米EMS突变体库种质材料，搭建全国玉米功能基因组研究协作平台，协力推动我国玉米功能基因组学研究迈上新台阶。 中国农业科学院生物技术研究所所长李新海致开
基因组学常规流程中SPIA通路分析方法
基因组学常规流程中通过实验样本组与组之间的比较得到成千上百的差异基因，再通过通路分析，从生物学角度探究差异基因的功能。但是常规的ORA、FCS方法往往忽视了基因在通路中复杂的相互作用关系，所以给大家介绍一种考虑更周全的分析方法SPIA。 SPIA整合了差异倍数、基因集显著性和拓扑分析，为每条通路计算
PNAS:从基因组学角度剖析“你幸福吗？”
好的心态会对你的基因产生影响。在首个该类研究中，来自加州大学洛杉矶分校和北卡罗来纳大学的研究人员调查了积极心理状态对于人类基因表达的影响。他们发现，不同类型的快乐对人类基因组的影响有着很大的差异。研究报告在线发表在《PNAS》杂志上。 那些有着高水平实现幸福感(eudaimonic w
生物信息分析数据挖掘
DNA芯片技术能够在基因组水平分析基因表达，检测许多基因的转录水平及在不同条件下的基因转录变化，显示反映特征组织类型、发育阶段、环境条件应答、遗传改变的基因谱。基因芯片产生了海量的数据，仅仅进行差异表达分析还远远不够，如何管理分析这些数据、从中挖掘信息已经成为利用这一技术的新的难点。芯片数据大量出现
北京基因组所开发出比较群体基因组学新算法
随着基因组测序技术的发展，物种和群体水平基因组数据呈指数增长。这些数据为在基因组水平鉴定和解析自然选择机制提供了机遇。然而，目前的分析方法面临着技术瓶颈和挑战。其中，关键问题是如何高效准确地检测作用于非编码区的自然选择效应。同时，能够高效、高性能地分析多物种大样本数据，成为方法学方面的迫切要求。