定制40bp寡核苷酸实验

1. 制出正义链(top strand)。TRAFIG 程序可以在没有基因要翻译的情况下被运行,但可以指定输出为 40bp 长、度的线性链。这就可以很方便地提供一个设计序列的正义链的列表,它按 40bp 的线性链排序。如此每一个线性链都可以被标上一个名字或者编号,从而方便地以 E-mail 的形式从销售商那里定制。少于 40bp 的最后的一段则没有定购。2. 制出反义链。OTHSTR 程序用来生成互补链,因为这两条链对于组装都是需要定制的。在运行 TRAF1 G 程序产生 40bp 每段的反义链之前,必须注意的是(要删除开头的少量碱基),输出的结果要正好是从正义链图谱右侧的第 20bp 开始(定制的第一段线性链要正好在正义链的最后一段寡核苷酸的第 21 个核苷酸处终止)。目的是在整个基因的组装中精确建立 20:20 的重叠,如同 Stemmer 等(1995) 所描述的。如果制出的图谱从右边开始,那么......阅读全文

定制-40bp-寡核苷酸实验

实验步骤 1. 制出正义链(top strand)。TRAFIG 程序可以在没有基因要翻译的情况下被运行,但可以指定输出为 40bp 长、度的线性链。这就可以很方便地提供一个设计序列的正义链的列表,它按 40bp 的线性链排序。如此每一个

定制-40bp-寡核苷酸实验

1. 制出正义链(top strand)。TRAFIG 程序可以在没有基因要翻译的情况下被运行,但可以指定输出为 40bp 长、度的线性链。这就可以很方便地提供一个设计序列的正义链的列表,它按 40bp 的线性链排序。如此每一个线性链都可以被标上一个名字或者编号,从而方便地以 E-mai

定制-40bp-寡核苷酸实验

实验步骤1. 制出正义链(top strand)。TRAFIG 程序可以在没有基因要翻译的情况下被运行,但可以指定输出为 40bp 长、度的线性链。这就可以很方便地提供一个设计序列的正义链的列表,它按 40bp 的线性链排序。如此每一个线性链都可以被标上一个名字或者编号,从而方便地以 E-mail

简并寡核苷酸诱变实验

本方法的一个重要特点就是将单链的简并寡核苷酸转变成同源双链分子后直接克隆进常规载体。由于不同的寡核苷酸可通过其3’末端的回文结构杂交,因此,寡核苷酸实际上起互为引物的作用,在大肠杆菌DNA聚合酶I klenow片段作用下延伸。实验材料大肠杆菌试剂、试剂盒DNA聚合酶dNTP甘油NaClEDTASDS

简并寡核苷酸诱变实验

小段DNA序列中产生大量突变             实验材料 大肠杆菌 试剂、试剂盒

简并寡核苷酸诱变实验

实验材料 大肠杆菌试剂、试剂盒 DNA聚合酶dNTP甘油NaClEDTASDS无水乙醇仪器、耗材 水浴锅离心机分光光度计实验步骤 1.  设计寡核苷酸,其3‘端含有由8个核苷酸组成的回文结构,且包含某一限制性内切酶的识别位点;如果可能的话,5’端也应有一含某个限制性内切酶位点的序列。中间区段则应含目

简并寡核苷酸基因混编实验

简并寡核苷酸基因混编             实验材料 pBSII KS 质粒 大肠杆菌 DH5α

简并寡核苷酸基因混编实验

蛋白酶生化性质的改善可以通过对该酶基因的错掺突变和 DNA 混编方法实现。混编技术可用于同一基因的一组突变体,或者对相关家族基因的片段进行新的组合,产生嵌合突变基因产物。本实验来源「现代蛋白质工程实验指南」〔德〕K.M.阿恩特、K.M.米勒编著。实验材料pBSII KS 质粒大肠杆菌 DH5α试剂、

寡核苷酸介导的诱变实验

实验材料 大肠杆菌试剂、试剂盒 PEGTEATP寡核苷酸诱变引物T4多核苷酸激酶EDTASSC仪器、耗材 水浴锅电泳仪培养箱实验步骤 1.  将一个单链噬菌体产生的噬斑转移至含有1 ml 灭菌TY培养基的1.5 ml 微量离心管中,60℃温育5 min,以杀灭细菌细胞,剧烈振荡以释放琼脂中的噬菌体,

简并寡核苷酸基因混编实验

实验材料 pBSII KS 质粒大肠杆菌 DH5α试剂、试剂盒 Pfx 聚合酶碱性磷酸酶通用缓冲液覆盖液刚果红溶液脱色液桦木木聚糖底物溶液PAHBAH 储液实验步骤 我们以 DNA 重组 D.thermophilum Rt46B.1 木聚糖酶基因( xynB) 及其 5 个相关的木聚糖酶基因为例

寡核苷酸介导的诱变实验

基本方案             实验材料 大肠杆菌 试剂、试剂盒

寡核苷酸介导的诱变实验

用突变的寡核苷酸引导模板的合成,从而改变DNA序列,突变效率可达50~80%。实验材料大肠杆菌试剂、试剂盒PEGTEATP寡核苷酸诱变引物T4多核苷酸激酶EDTASSC仪器、耗材水浴锅电泳仪培养箱实验步骤1.  将一个单链噬菌体产生的噬斑转移至含有1 ml 灭菌TY培养基的1.5 ml 微量离心管中

凝胶纯化实验

试剂、试剂盒 蒸馏水乙醇甲酰胺胶的缓冲液亚甲基蓝十二烷基硫酸钠储存液TAE 缓冲液Tris 乙酸盐乙酸纳EDTA蓝色葡聚糖TEN 缓冲液40mer聚丙烯酰胺胶仪器、耗材 解剖刀UV 灯过滤 UV 的安全破璃实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂蒸馏水乙醇,95%甲酰胺 (使用安珀莱特单床离子交换

凝胶纯化实验

            试剂、试剂盒 蒸馏水 乙醇 甲酰胺 胶的缓冲液 亚甲基蓝 十二烷基硫酸钠储存液 TAE 缓冲液 Tris

凝胶纯化实验

试剂、试剂盒蒸馏水乙醇甲酰胺胶的缓冲液亚甲基蓝十二烷基硫酸钠储存液TAE 缓冲液Tris 乙酸盐乙酸纳EDTA蓝色葡聚糖TEN 缓冲液40mer聚丙烯酰胺胶仪器、耗材解剖刀UV 灯过滤 UV 的安全破璃实验步骤一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂蒸馏水乙醇,95%甲酰胺 (使用安珀莱特单床离子交换树脂

寡核苷酸5末端磷酸化实验

试剂、试剂盒 T4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液Tris-ClT4噬菌体多核苷酸激酶寡核苷酸[γ-32P]ATP仪器、耗材 微量离心管水浴箱实验步骤 材料缓冲液与溶液稀释贮存液至适当浓度10XT4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液Tris-Cl(1mol/L,pH8.0)酶和缓冲液T4噬菌体多核苷酸激酶野生型T4噬

寡核苷酸5末端磷酸化实验

以下介绍的是标记 10pmol 高比活度的寡核苷酸的反应,标记不同量的寡核苷酸可以通过增加或减少反应体积而保持各组分的相应浓度来实现。也可用类似的反应条件,将非放射性的磷酸加到用于定点突变的合成寡核苷酸 5'末端。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:黄培堂。试剂、试剂盒T4噬菌

寡核苷酸5末端磷酸化实验

            试剂、试剂盒 T4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液 Tris-Cl T4噬菌体多核苷酸激酶 寡核苷酸 [γ-32P]ATP

实验台的定制及通风管

1、空间利用率大  实验室对空间布局和实际用途都有不同的要求,选择定制实验台可以省去不少的时间和精力。因为定制的尺寸规格都是根据客户要求来的,可以大大增加实验室的空间利用率。2、个性化需求  实验室对实验台的用途要求不同,比如存储物品的多少、载重要求、耐腐蚀性要求、能承受的温度等等。可以根据不同的需

用于表达监测的寡核苷酸分析实验1

用于表达监测的 mRNA 的扩增及其与寡核苷酸分析芯片的杂交实验材料样品 RNA试剂、试剂盒Superscript cDNA kit (Life Technologies)RNA 酶抑制剂制备对照转录池酚 氯仿 异戊醇乙酸铵乙醇10 X 转录缓冲液10 X rNTP 混合液T7 RNA 聚合酶RNe

用制备凝胶电泳纯化寡核苷酸实验

用制备凝胶电泳纯化寡核苷酸实验             试剂、试剂盒 丙烯酰胺 双丙烯酰胺 尿素

寡核苷酸探针在溶液中的杂交实验

            试剂、试剂盒 寡核苷酸杂交液 寡核苷酸预杂交液 SSC 或 SSPE TEAC1 洗涤液 TMAC1或 TEACl TMAC1 洗涤液

寡核苷酸指导的单链-DNA-诱变实验

实验材料 适用于转化的大肠杆菌菌株 用于转化的大肠杆菌 TG1 感受态菌试剂、试剂盒 ATPPE1缓冲液PE2 缓冲液噬菌体 T4 DNA 连接酶噬菌体 T4 多核苷酸激酶大肠杆菌 DNA 聚合酶ⅠKlenow 片段M13 噬菌体通用测序引物含 4 种 dNTP 的 dNTP 溶液诱变的 M

寡核苷酸探针在溶液中的杂交实验

Jabobs等 ( 1988)介绍了在含季铵盐缓冲液中杂交的方法与原理。下述为该法的简单变通方案。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:黄培堂。试剂、试剂盒寡核苷酸杂交液寡核苷酸预杂交液SSC 或 SSPETEAC1 洗涤液TMAC1或 TEAClTMAC1 洗涤液核酸和寡核苷酸放射性标

寡核苷酸探针在溶液中的杂交实验

试剂、试剂盒 寡核苷酸杂交液寡核苷酸预杂交液SSC 或 SSPETEAC1 洗涤液TMAC1或 TEAClTMAC1 洗涤液核酸和寡核苷酸放射性标记的寡核苷酸探针仪器、耗材 杂交装置振荡培养器实验步骤 材料溶液和缓冲液稀释贮存液至适当浓度。寡核苷酸杂交液6XSSC(或 6XSSPE)0.05mol/

寡核苷酸指导的单链-DNA-诱变实验

            实验材料 适用于转化的大肠杆菌菌株 用于转化的大肠杆菌 TG1 感受态菌 试剂、试剂盒 ATP

用制备凝胶电泳纯化寡核苷酸实验

试剂、试剂盒丙烯酰胺双丙烯酰胺尿素过硫酸铵NNN'N'-四甲基乙二胺合成的互补寡核苷酸仲丁醇(2-丁醇)二乙醚NaOAcMgCl2乙醇TBE甲酰胺加样缓冲液TE仪器、耗材SpeedVac 旋转浓缩仪实验步骤材料与设备丙烯酰胺双丙烯酰胺尿素过硫酸铵(10%;w/v)N,N,N'

用于表达监测的寡核苷酸分析实验2

数据分析与处理以及数量评定实验步骤1.用 Affymetrix Gene Chip 软件进行最初的数据处理。通过检测图像像素值,此软件测定每种寡核苷酸探针的荧光强度从而计算出每种转录本的简化值。此简化值被称为「平均差异」,它通过确定某一特定转录本在所有引物对中的特异信号而得(即将某一特定转录本由完全

寡核苷酸指导的单链-DNA-诱变实验

本文介绍了由 Zoller 和 Smith 的双引物技术(1984,1987) 结合 Kunkel 的诱变体产量富集方法(1985) 构成的经典方案。本方案中使用的单链 DNA 模板含有较高的尿嘧啶残基,因为它们是从生长于 dut 和 ung 基因突变大肠菌中的 M13 噬菌体中制备的(见方案 1)

用制备凝胶电泳纯化寡核苷酸实验

试剂、试剂盒 丙烯酰胺双丙烯酰胺尿素过硫酸铵 NNN'N'-四甲基乙二胺合成的互补寡核苷酸仲丁醇(2-丁醇)二乙醚 NaOAcMgCl2 乙醇TBE 甲酰胺加样缓冲液 TE仪器、耗材 SpeedVac 旋转浓缩仪实验步骤 材料与设备丙烯酰胺双丙烯酰胺尿素过硫酸铵(10%;w/v)N,