蛋白质胰蛋白酶磷酸肽图谱制定实验
实验方法原理 实验材料 含 32P 标记的蛋白质的样品试剂、试剂盒 荧光墨水/染料碳酸氢铵2-巯基乙醇SDS载体蛋白(溶于去离子水中)三氯乙酸(TCA)乙醇过氧化氢甲酸TPCK-处理的胰蛋白酶(溶于去离子水/ HCl )电泳缓冲液绿色标记染料层析缓冲液仪器、耗材 单边剃刀刀片/手术刀片闪烁计数器1.7 ml 微量离心管一次性的组织研磨件摇床台式离心机纤维素薄层色谱板小体积可调移液器由韧性塑料制成的一次性长吸头带滤器的空气管HTLE 7000 电泳装置聚乙烯膜 电泳芯子层析缸风扇65℃ 烘箱实验步骤 实验试剂仪器的具体要求和准备见「其他」。1. 用 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分离含有 32P 标记的蛋白质样品。2. 电泳后,干胶,四周边缘用荧光墨水标记,对 X 射线胶片曝光(放射自显影)。3. 通过与胶片上的凝胶四周荧光标记的位置的比对确定蛋白质的位置。将胶片与干胶钉在一起,胶片朝下放入一个光盒里。......阅读全文
蛋白质胰蛋白酶磷酸肽图谱制定实验
实验方法原理 实验材料 含 32P 标记的蛋白质的样品试剂、试剂盒 荧光墨水/染料碳酸氢铵2-巯基乙醇SDS载体蛋白(溶于去离子水中)三氯乙酸(TCA)乙醇过氧化氢甲酸TPCK-处理的胰蛋白酶(溶于去离子水/ HCl )电泳缓冲液绿色标记染料层析缓冲液仪器、耗材 单边剃刀刀片/手术刀片闪烁计数器1
蛋白质胰蛋白酶磷酸肽图谱制定实验
基本方案 备择方案 固相蛋白消化 辅助方案 从纤维平板上 实验方法原理实验材料 含 32P 标记的蛋白质的样品 试剂、试剂盒
蛋白质胰蛋白酶磷酸肽图谱制定实验1
实验材料含 32P 标记的蛋白质的样品试剂、试剂盒荧光墨水/染料碳酸氢铵2-巯基乙醇SDS载体蛋白(溶于去离子水中)三氯乙酸(TCA)乙醇过氧化氢甲酸TPCK-处理的胰蛋白酶(溶于去离子水/ HCl )电泳缓冲液绿色标记染料层析缓冲液仪器、耗材单边剃刀刀片/手术刀片闪烁计数器1.7 ml 微量离心管
蛋白质胰蛋白酶磷酸肽图谱制定实验——固相蛋白消化
试剂、试剂盒甲醇PVP-360(溶于乙酸)50 mmol L 碳酸氢铵pH 8.0仪器、耗材PVDF 膜/硝酸纤维素膜保鲜膜/聚酯薄膜实验步骤1. 用 SDS-PAGE 凝胶电泳分离 32P 标记的样品,用标准的湿式或半干式蛋白质转移方法将蛋白质转移到 PVDF 或硝酸纤维素膜上。2. 将膜晾干并用
蛋白质胰蛋白酶磷酸肽图谱制定实验_从纤维平板上
验材料烧结的聚乙烯片TLC 平板(已分离过磷酸肽并经过放射自显影的)试剂、试剂盒电泳缓冲液仪器、耗材玻璃棒1000 μl(蓝色)移液器吸头单边剃刀刀片实验步骤实验材料、试剂、仪器耗材详见「其他」。1. 用锋利的刀片小心地切去蓝色吸头领圈的部分,细的吸口端也裁去约 3 mm。2. 用玻璃棒将一烧结的聚
磷酸化蛋白鉴定实验
实验材料测序级膜蛋白酶试剂、试剂盒二硫苏糖醇碘代乙酰胺乙酸溶液甲酸乙酰氯仪器、耗材螯合琼脂糖凝胶层析介质实验步骤这里所述的方法概括为下列几个步骤:胰蛋白酶水解消化膜和可溶性组分中的蛋白质(见 24. 3.1 );固相金属螯合亲和层析(IMAC) 富集磷酸肽(见 24. 3. 2 );用串联质谱对磷酸
磷酸化蛋白鉴定实验
实验材料 测序级膜蛋白酶试剂、试剂盒 二硫苏糖醇碘代乙酰胺乙酸溶液甲酸乙酰氯仪器、耗材 螯合琼脂糖凝胶层析介质实验步骤 这里所述的方法概括为下列几个步骤:胰蛋白酶水解消化膜和可溶性组分中的蛋白质(见 24. 3.1 );固相金属螯合亲和层析(IMAC) 富集磷酸肽(见 24. 3. 2 );用串
磷酸化蛋白鉴定实验
实验材料测序级膜蛋白酶 试剂、试剂盒二硫苏糖醇 碘代乙酰
磷酸化位点分析实验磷酸肽的分离
2D-PP 分离磷酸肽 RP-HPLC 分离磷酸肽 高分辨凝胶电泳分离磷酸肽 IMAC 分离/富集磷酸肽 实验方法原理
磷酸化位点分析实验磷酸肽的分离——2DPP-分离磷酸肽
实验方法原理即使纳喷 MS/MS 技术已经成功用于直接分析蛋白酶解产生的磷酸肽但是出于以下一些原因,通常建议在质谱分析前作一些分离:(1) 磷酸肽在蛋白酶切产物中通常只占少数因此容易淹没在低率度离子产生的总背景中,肽分离技术可浓缩分析物,因此会提高信噪比。(2) 如果磷酸肽被放射性标记并具有相同比活
磷酸化位点分析实验磷酸肽的分离
实验方法原理 即使纳喷 MS/MS 技术已经成功用于直接分析蛋白酶解产生的磷酸肽但是出于以下一些原因,通常建议在质谱分析前作一些分离:(1) 磷酸肽在蛋白酶切产物中通常只占少数因此容易淹没在低率度离子产生的总背景中,肽分离技术可浓缩分析物,因此会提高信噪比。(2) 如果磷酸肽被放射性标记并具有相同比
磷酸化位点分析实验磷酸肽的分离——IMAC-分离/富集磷酸肽
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤磷酸肽分析的常见困难是由磷酸化的低化学计量值导致的,样品中相同序列肽段的磷酸肽的含量要比非磷酸化肽段含量少得多,这种情况下即使 32p标记的 2D-PP 上的点,经全蛋白质水解及 HPLC 组分收集,已经确定磷酸肽存在,用质谱技术也难以鉴定磷酸肽。数据依赖的
磷酸化位点分析实验磷酸肽的分离——RPHPLC-分离磷酸肽
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤反相 HPLC 分段收集磷酸肽重现性好,简单,且不需要特殊装备。在 RP-HPLC 中,磷酸肽根据其疏水性被分离。分离后收集的组分经 Cerenkov计数检测。对 Cerenkov计数和时间作图,显示具放射性活性的组分的计数。纯化的磷酸肽用 MS 分析;可用不
鲁克在-timsTOF-4D蛋白质组学和表观蛋白质组学平台上扩展
在蛋白质组论坛| EuPA 2022,布鲁克公司(纳斯达克股票代码:BRKR)宣布扩展了更深层次的蛋白质组学和表观蛋白质组学覆盖的能力,包括使用创新的 TIMScore 算法增强磷酸肽分析,该算法现在是基于 GPU 的新 PaSER 2022 平台的一部分。新的 TIMScore 算法利用机器学
肽质量指纹图谱—MALDITOF-法鉴定蛋白质实验
实验材料测序级猪胰蛋白酶试剂、试剂盒碳酸氢铵碳酸氢铵缓冲液乙腈 碳酸氢铵缓冲液消化缓冲液仪器、耗材真空离心机烤箱实验步骤许多凝胶染色方法适用于后续的 MALDI-TOF 肽质量指纹图谱(PMF ) 分析。在第 14 章已经比较讨论了一些染色方法的性能和兼容性。3.1 胶内消化凝胶消化方法改编自 Je
肽质量指纹图谱—MALDITOF-法鉴定蛋白质实验
实验材料测序级猪胰蛋白酶 试剂、试剂盒碳酸氢铵 碳酸氢铵
抗磷酸肽的多克隆抗体制备实验
实验方法原理 实验材料 用磷酸肽-BSA 交联物免疫过的兔的粗制血清试剂、试剂盒 PBS/叠氮化物MgCl2仪器、耗材 分光光度计透析袋填装有 BSA-琼脂糖亲和介质的柱子填装有磷酸酪氨酸亲和介质的柱子填装有同种非磷酸肽亲和介质的柱子填装有同源的磷酸肽亲和介质的柱子填装有阳性-筛选的磷酸肽亲和介质的
抗磷酸肽的多克隆抗体制备实验
实验材料用磷酸肽-BSA 交联物免疫过的兔的粗制血清试剂、试剂盒PBS/叠氮化物MgCl2仪器、耗材分光光度计透析袋填装有 BSA-琼脂糖亲和介质的柱子填装有磷酸酪氨酸亲和介质的柱子填装有同种非磷酸肽亲和介质的柱子填装有同源的磷酸肽亲和介质的柱子填装有阳性-筛选的磷酸肽亲和介质的柱子实验步骤1. 将
胰蛋白酶的测定实验
实验方法原理 实验材料 胰蛋白酶试剂、试剂盒 磷酸钾N'-苯甲酰-L-精氨酰对硝基苯胺仪器、耗材 分光光度计实验步骤 实验所需「试剂」具体见「其他」25℃,在 405 nm 测定吸光值,ε405=9620 l/(mol·cm)。注意事项 其他 试剂:0.3 mol/L 磷酸钾,pH 8.02
胰蛋白酶的测定实验
基本方案 实验方法原理 实验材料 胰蛋白酶
胰蛋白酶的测定实验
实验材料胰蛋白酶试剂、试剂盒磷酸钾N'-苯甲酰-L-精氨酰对硝基苯胺仪器、耗材分光光度计实验步骤实验所需「试剂」具体见「其他」25℃,在 405 nm 测定吸光值,ε405=9620 l/(mol·cm)。注意事项其他试剂:0.3 mol/L 磷酸钾,pH 8.020 mool/L N
《PNAS》:蛋白α-1抗胰蛋白酶(AAT)的表达和成熟图谱
马萨诸塞大学阿默斯特分校(University of Massachusetts Amherst)和马萨诸塞大学陈医学院(UMass Chan Medical School)的研究人员最近宣布,他们以前所未有的清晰程度绘制了蛋白α -1抗胰蛋白酶(AAT)的表达和成熟图谱,这是一项寻求更好的基因疗法
肽质量指纹图谱—MALDITOF-法鉴定蛋白质实验(一)
实验材料 测序级猪胰蛋白酶试剂、试剂盒 碳酸氢铵碳酸氢铵缓冲液乙腈 碳酸氢铵缓冲液消化缓冲液仪器、耗材 真空离心机烤箱实验步骤 许多凝胶染色方法适用于后续的 MALDI-TOF 肽质量指纹图谱(PMF ) 分析。在第 14 章已经比较讨论了一些染色方法的性能和兼容性。3.1 胶内消化凝胶消化方法改编
肽质量指纹图谱—MALDITOF-法鉴定蛋白质实验(二)
1. 目标样本沉积 1 ) 经典干燥液滴法( 1 ) 半饱和氰基-4-羟基肉桂酸(约 5 mg/ml) 的配制:将 α-氰基-4-羟基苯甲酸溶解在 300 μl 1 : 1 乙腈/ TFA 溶 液(超声 10 min) 。离心几秒钟得到上清液。取 200 μl 上清液加到微量离心管中,并加入相同
磷酸化位点分析实验确定磷酸化氨基酸类型
实验方法原理 实验材料 蛋白样品 实验步骤 了解肽或蛋白质中磷酸化氨基酸的类型
磷酸化位点分析实验确定磷酸化氨基酸类型
实验材料蛋白样品实验步骤了解肽或蛋白质中磷酸化氨基酸的类型,可以限定可能的磷酸化位点,并因此简化(对多肽链中磷酸化残基的确认。磷酸化残基类型通常由磷酸氨基酸分析或磷酸氨基酸特异性免疫检测确定。磷酸氨基酸分析是对肽键进行气相或液相水解,此水解条件下要至少保留一段磷酸酯键完整。 32p标记的磷酸蛋白质或
抗磷酸肽的单克隆抗体制备实验
实验方法原理 实验材料 融合后的候选杂交瘤细胞系BSA 交联的同种磷酸肽BSA 交联的同种非磷酸肽BSA 交联的非同种磷酸酪氨酸肽BSA 交联的同源磷酸肽试剂、试剂盒 筛选稀释液阴性对照(用于制备杂交瘤系的小鼠的免疫前血清)阳性对照(用于制备杂交瘤系的小鼠的免疫后血清)仪器、耗材 HT 培养基96
磷酸化位点分析实验磷酸肽的分离
实验方法原理 磷酸化分析的原理研究的最常见的磷酸化类型是丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸的磷酸酯化。已知发生的磷酸化还有精氨酸、组氨酸和赖氨酸的亚酰胺化,以及天冬氨酸和谷氨酸的酰化。这些修饰中的其中一些是化学不稳定的,通常观察不到,除非采取特殊的保护措
抗磷酸肽的单克隆抗体制备实验
实验材料融合后的候选杂交瘤细胞系BSA 交联的同种磷酸肽BSA 交联的同种非磷酸肽BSA 交联的非同种磷酸酪氨酸肽BSA 交联的同源磷酸肽试剂、试剂盒筛选稀释液阴性对照(用于制备杂交瘤系的小鼠的免疫前血清)阳性对照(用于制备杂交瘤系的小鼠的免疫后血清)仪器、耗材HT 培养基96 孔聚苯乙烯组织培养板
抗磷酸肽的单克隆抗体制备实验
基本方案 实验方法原理 实验材料 融合后的候选杂交瘤细胞系 BSA 交联