一种基于化学交联质谱分析蛋白质动态学研究新方法
解析蛋白质的动态结构，能够揭示蛋白质行使功能的内在机制。化学交联质谱分析（Chemical cross-linking coupled with mass spectrometry，CXMS），结合高灵敏质谱分析，是近十年发展起来的结构生物学技术。利用有特定长度的化学交联剂将蛋白质中的特定氨基酸连接起来，可获得蛋白质上特定氨基酸之间的距离信息。CXMS技术具有灵敏度高，不受分子量大小限制等特点，得到愈加广泛的使用。 CXMS测量所获得的距离约束传统上施加于蛋白质的Cα原子或Cβ原子之间，这样的距离约束会超过20，对结构精度的提升有限。针对这一问题，中国科学院精密测量科学与技术创新研究院副研究员龚洲、研究员唐淳发展建立了一种基于化学交联质谱分析研究蛋白质结构和动态变化的新方法，对已有CXMS实验数据进行比对分析，借鉴生物磁共振思路，将交联剂修饰的侧链Cω原子作为距离约束点。这种方法将约束范围缩小到6以内，提高了蛋白质结构计算......阅读全文
一种基于化学交联质谱分析蛋白质动态学研究新方法
解析蛋白质的动态结构，能够揭示蛋白质行使功能的内在机制。化学交联质谱分析（Chemical cross-linking coupled with mass spectrometry，CXMS），结合高灵敏质谱分析，是近十年发展起来的结构生物学技术。利用有特定长度的化学交联剂将蛋白质中的特定氨基酸
蛋白质组学质谱分析
Proteomics Primer1. Proteomics2. 2-D PAGE3. Immobilised pH gradients (IPGs)4. Mass spectrometry5. Principles of mass spectrometry6. Matrix assisted la
NIBS董梦秋组发表Nature子刊文章
2012年7月8日，北京生命科学研究所董梦秋实验室与中科院计算技术研究所贺思敏教授领导的pFind研究团队合作在《Nautre Methods》在线发表题为“Identification of Cross-linked Peptides from Complex Samples”的文章。
基于糖苷键质谱可碎裂交联剂的蛋白质复合物原位解析
近日，中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组研究员张丽华团队，研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂，显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度，同时具有良好的两亲性和生物兼容性，实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和规模化精准解析。作为生命活动的执行者，蛋白质通过相
武汉物数所等建立蛋白质动态研究新方法
近日，中国科学院武汉物理与数学研究所研究员唐淳带领的生物大分子动态学研究团队和北京生命科学研究所董梦秋研究组合作，在《生物化学杂志》（The Journal of Biological Chemistry）发表题为Modeling protein excited-state structures
中科院大连化物所开发蛋白质复合物原位解析新技术
近日，中科院大连化物所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组（1810组）张丽华研究员团队研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂，显著地提高了交联信息的检索通量和鉴定准确度，同时具有良好的两亲性和生物兼容性，实现了活细胞内蛋白质复合物原位交联和规模化精准解析。作为生命活动的执行者，蛋白质通
蛋白质化学交联结合质谱鉴定技术取得新进展
3月8日，国际著名期刊《eLife》在线发表了北京协和医学院、北京生命科学研究所（NIBS）、北京大学和清华大学等处的一项最新成果，题为 “Trifunctional cross-linker for mapping protein-protein interaction networks an
原位化学交联可以解码细胞中蛋白质动态结构策略
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/505975.shtm
董梦秋、雷晓光eLife发表重要成果
3月8日，国际著名期刊《eLife》在线发表了北京协和医学院、北京生命科学研究所（NIBS）、北京大学和清华大学等处的一项最新成果，题为“Trifunctional cross-linker for mapping protein-protein interaction networks and
董梦秋：破译衰老密码
办公桌上、窗台上，摆满了绿植，还有一个精致的小鱼缸，四平方米左右的办公室干净温馨。在见识前几位PI简陋的办公室后，这里的风景让人眼前一亮。“哈哈，肯定是黄牛说的，他老说我这是闺房。”董梦秋的一串爽朗笑声瞬间让我轻松许多。 受“女生不太擅长理科”这种根深蒂固观点的影响，我向来对很牛的女科研人
蛋白质质谱分析具体流程
肽指纹图谱：每个蛋白都有理论上消化后所得出的不同肽段，这些肽段的质量（分子量）就是这个蛋白的肽指纹图。当一个未知蛋白被酶解，用质谱可以检测出其中所含有几乎所有肽段的质量。然后把这些质量与数据库中已知的所有蛋白指纹进行匹配。匹配分值高过一定的 就可以认为索要坚定的蛋白就是那个目的蛋白。步骤：2DE 切
蛋白质质谱分析具体流程
肽指纹图谱：每个蛋白都有理论上消化后所得出的不同肽段，这些肽段的质量（分子量）就是这个蛋白的肽指纹图。当一个未知蛋白被酶解，用质谱可以检测出其中所含有几乎所有肽段的质量。然后把这些质量与数据库中已知的所有蛋白指纹进行匹配。匹配分值高过一定的 就可以认为索要坚定的蛋白就是那个目的蛋白。步骤：2DE 切
董梦秋：化学交联质谱让结构生物学研究如虎添翼
在蛋白质组学分析方法中，质谱获得的是多肽序列结构的信息；那么用质谱是否可研究大分子蛋白的结构信息？近几年来，董梦秋实验室在中国做出了多项先驱性工作，主要集中在化学交联质谱领域。在用单颗粒冷冻电镜技术研究结构生物学屡创佳绩的当下，很多研究者都把样品一分为二，一份做冷冻电镜，一份做交联质谱。那么交联
大连化物所等发展出利用原位化学交联解码细胞中蛋白质动态结构的策略
近日，中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组研究员赵群、张丽华等，与中国科学院精密测量科学技术创新研究院副研究员龚洲合作，提出了利用原位化学交联-质谱技术（in vivo XL-MS），解码细胞中蛋白质动态结构的策略。该策略将AlphaFold2的结构作为先验信息
2025蛋白质组学大会之蛋白质组动态
2025年10月14日14点在广州白云国际会议中心国际会堂珠水厅，第12届AOHUPO大会暨第8届AOAPO大会暨π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会“Proteome Dynamics”分论坛顺利拉开帷幕。本论坛由中国科学院大连化学物理研究所张丽华研究员、南京大学刘
动态二次离子质谱分析（DSIMS）
动态二次离子质谱分析（D-SIMS）1. 飞行时间二次离子质谱技术二次离子质谱技术（Dynamic Secondary Ion Mass Spectrometry，D-SIMS）是一种非常灵敏的表面分析技术，通过用一次离子激发样品表面，打出极其微量的二次离子，根据二次离子的质量来测定元素种类，具有极
质谱界重磅：继Nature子刊后董梦秋团队又发Nature
交联质谱技术（英文全称Chemical cross-linking of proteins coupled with mass spectrometry, 简称CXMS或XL-MS）；CXMS利用化学交联剂将蛋白质或蛋白质复合体中空间距离足够接近的两个氨基酸通过共价键连接起来，酶切成肽段后用质谱
基于质谱分析技术的蛋白质组学检测法能更有效识别肝癌
随着丙型肝炎病毒感染的不断发生，肝癌病例不断增加，这就急需一种针对肝癌的早期诊断方法。 一项发表在1月15日《临床癌症研究》(Clinical Cancer Research)杂志上的研究性文章称，一种基于质谱分析技术的蛋白质组检测比传统的生物标志物检测更为准确，可以更好地区分肝癌患者和丙型肝炎肝硬
如何使蛋白质和脂肪酸化学交联
指在光、热、高能辐射、机械力、超声波和交联剂等作用下，大分子链间通过化学键联结起来，形成网状或体形结构高分子的过程。橡胶的硫化、不饱和树脂的交联、环氧树脂的熟化等都是化学交联的例子。通过化学交联可改善聚合物的性能。如聚乙烯的化学交联可提高其强度和耐热性，又如皮革的鞣制过程是利用其蛋白质分子与甲醛作用
武汉物数所蛋白质动态学研究助力重要蛋白结构解析
近日，中国科学院武汉物理与数学研究所研究员唐淳课题组利用基于973重大科学研究计划“蛋白质动态学研究的新技术新方法”建立的研究技术，协助华中农业大学教授殷平课题组首次解析了N6腺嘌呤甲基转移酶METTL3-METTL14蛋白复合体结构，该研究成果发表于《自然》杂志。 该工作揭示了RNA N6腺
武汉物数所蛋白质动态学新技术助力重要蛋白结构解析
近日，中国科学院武汉物理与数学研究所研究员唐淳课题组利用基于973重大科学研究计划“蛋白质动态学研究的新技术新方法”建立的研究技术，协助华中农业大学教授殷平课题组首次解析了N6腺嘌呤甲基转移酶METTL3-METTL14蛋白复合体结构，该研究成果发表于《自然》杂志。 该工作揭示了RNA N6腺
2025蛋白质组学大会之非质谱蛋白质组学专场
2025年10月14日上午10点10分，第12届AOHUPO大会暨第8届AOAPO大会暨π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会“非质谱蛋白质组学” (Proteomics Beyond Mass Spectrometry) 分会场于广州白云国际会议中心岭南B厅拉开序幕。
雷晓光课题组在发展化学交联质谱技术领域取得最新进展
化学交联结合质谱技术 (chemical cross-linking coupled with mass spectrometry, CXMS) 是近年来迅猛发展的一种检测蛋白质结构和蛋白质相互作用的方法。随着质谱仪器以及交联数据搜索软件的发展，CXMS技术已经获得了长足的进步，但在该技术中能够
杭州质谱学术大会系列：Astral突破质谱组学新极限
——2020-2023杭州质谱学术大会系列报导 6月11日，中国质谱学术大会 “新方法与新技术”专场报告中，来自北京生命科学研究所董梦秋研究员、中科院大连化物所张丽华研究员、南京大学鞠幌先教授、赛默飞应用主管范自全等专家、学者和企业代表带来了关于蛋白质相互作用、结构分析的最新质谱检测方法与应用
研究开发出可一步富集和定量分析的新型交联剂
近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员张丽华、研究员赵群团队研制了基于二甲基哌啶基的可一步富集和定量分析的新型交联剂，通过降低样品损失，实现了少量细胞（1×104个）中蛋白质复合物的原位交联质谱（XL-MS）分析。相关成果发表在《德国应用化学》。新型交联剂特征。大连化物所供图细胞内的蛋白质通过构象
化学交联原理
化学交联是通过形成共价键将两种或多种分子连接在一起的一种化学方法。其中，共价键的形成主要依赖于使用特定的交联试剂，通常情况下，交联试剂分子都含有可与蛋白质或其他分子发生化学反应的活性基团，如氨基，巯基等。目前，交联试剂已经应用于蛋白质-蛋白质相互作用，蛋白质三维结构，及细胞膜分子结合等方面的研究
质谱分析
主要包括电感耦合等离子体质谱ICP-MS和飞行时间二次离子质谱法TOF-SIMS（1） 电感耦合等离子体质谱(inductively coupled plasma mass spectrometry, ICP-MS)ICP-MS是利用电感耦合等离子体作为离子源的一种元素质谱分析方法；该离子源产生的样
质谱分析
实验概要本实验在二维电泳图像获取和分析的基础上，利用质谱分析及数据库搜索鉴定部分蛋白质斑点。实验步骤1. 胶内酶切随机选择重复性好，差异显著，无明显变形、拖尾，与周围蛋白点分离明确的蛋白点作为质谱分析对象，进行胶内酶解。 1) 从胶上切取蛋白质凝胶颗粒置入96孔培养板内，用去离子水清洗数次。
质谱和蛋白质组学：击中目标
Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008) 作者：Nathan Blow 分析测试百科 译 近年来，质谱仪大幅提高了动态范围和灵敏度，使研究者们在疾病生物标志物的发现和验证方面，更从容地面对挑战。 在2008年6月的美国质谱大会（ASMS）
460万元！中科院采购血浆4D蛋白质组学质谱分析系统
近日，中国科学院分子细胞科学卓越创新中心发布《分子细胞科学卓越创新中心血浆4D蛋白质组学质谱分析系统招标》公告，预计花费近460万元采购高灵敏高分辨血浆4D蛋白质组学质谱分析系统。详细信息如下： 一、项目名称：中国科学院分子细胞科学卓越创新中心质谱分析系统采购项目 二、招标编号：OITC-G