PCR进阶——GCRich片段的扩增策略

PCR早已是分子生物学实验的常规技术,但是GC-rich扩增始终是有难度的应用。 以人基因组为例,大约3%的序列可划为GC-rich序列,尤其是在启动子,增强子等控制元件,GC-rich序列更为常见。因此,GC-rich片段的PCR扩增困难,也就阻碍了有关这类序列的科研进展。 GC-Rich片段案例:FMR1 脆性X综合征(Fragile X Syndrome)是一种X连锁遗传病,是最常见的遗传性智能障碍疾病之一,发病率仅次于唐氏综合征。致病原因是X染色体上FMR1基因(CGG)n扩展突变,导致维持脑部正常神经传导的FMRP蛋白缺乏,患者会有严重的智力低下、发育迟缓、语言障碍和行为问题,包括多动症、自闭症、注意力不集中和伴有癫痫等症状。 GC-Rich片段的扩增策略 在此先给出一般定义上的GC-Rich定义:Master P综合多种论文文献及产品技术文档等,对于一个片段内GC含量高于65%即可认为是GC-Rich片......阅读全文

An-Economic-PCR-Enhancer-for-GCRich-PCR-Templates

Since PCR is often problematic on GC-rich templates, we have evaluated different PCR enhancing additives and generated an Combinatorial Enhancer Solut

PCR进阶——GCRich片段的扩增策略

  PCR早已是分子生物学实验的常规技术,但是GC-rich扩增始终是有难度的应用。  以人基因组为例,大约3%的序列可划为GC-rich序列,尤其是在启动子,增强子等控制元件,GC-rich序列更为常见。因此,GC-rich片段的PCR扩增困难,也就阻碍了有关这类序列的科研进展。  GC-Rich

利用Mastercycler-X50系列PCR独有的2D梯度实现高效的PCR条件...

利用Mastercycler  X50系列PCR独有的2D梯度实现高效的PCR条件优化Ultimate PCR Optimization with Eppendorf Mastercycler® X50 2D-gradientArora Phang, Tim Schommartz,Eppendorf

普通PCR技术和数字PCR技术,什么区别?

PCR技术自问世以来,在遗传病、病原体、癌基因等分子诊断领域和法医鉴定等方面发挥了巨大作用。按照PCR技术的演进,人们习惯性将PCR技术划分为三代:普通PCR技术、实时荧光定量PCR技术(qPCR)以及数字PCR(dPCR)技术。以前也介绍了很多关于qPCR相关知识,这期给大家分享另外两种PCR技术

PCR-Additives

A variety of PCR additives and enhancing agents have been used to increase the yield, specificity and consistency of PCR reactions. Whilst these addit

高GC含量PCR样本的扩增困难与防止污染与降解的操作方法

       每天做实验小心翼翼,时时担心提取的DNA被污染、被降解。终于,废了九牛二虎之力,好不容易提取到高质量的DNA,然而PCR仍然P不出来条带。是试剂加漏了吗?是酶失活了吗?换上新试剂,冰上重来一次,然并卵,不仅P不出来,更重要的是也不知道为啥P不出来,贝多芬都弹不出我的悲伤!    

Thermal-Cycling-Profile-for-Standard-PCR

Initial denaturationIt is very important to denature the template DNA completely. Initial heating of the PCR mixture for 2 minutes at 94°–95°C is enou

PCR佐剂手册

A variety of PCR additives and enhancing agents have been used to increase the yield, specificity and consistency of PCR reactions. Whilst these addit

Troubleshooting-for-PCR-and-multiplex-PCR

Troubleshooting discussion is based on the PCR protocol as described in the table below. All reactions are run for 30 cycles.COMPONENTVOLUMEFINALCONCE

重叠PCR—overlap-PCR

1、简介 重叠PCR也是基本的PCR原理:变性-退火-延伸。不同的是在重叠PCR过程是两个或者几个片段重叠延伸之后,再进行指数扩增的PCR过程。  2、基本原理*步:PCR产生两个或者几个片段,这几个片段之间必须有重叠区。 第二步:以两个片段为例,见上图,*步产生的两个片段,A D链之间有互补,B

多重PCR(Multiplex-PCR)

一般PCR仅应用一对引物,通过PCR扩增产生一个核酸片段,主要用于单一致病因子等的鉴定.多重PCR(multiplex PCR),又称多重引物PCR或复合PCR,它是在同一PCR反应体系里加上二对以上引物,同时扩增出多个核酸片段的PCR反应,其反应原理,反应试剂和操作过程与一般PCR相同.    多

PCR简介/PCR仪

PCR的要素基本的PCR须具备PCR仪图册1.要被复制的DNA模板 Template2.界定复制范围两端的引物Primers.3.DNA聚合酶Taq. Polymearse4.合成的原料(四种脱氧核苷酸)及水。 PCR仪工作原理利用升温使DNA变性,在聚合酶的作用下使单链复制成双链,进而达到基因复制

多重PCR(Multiplex-PCR)

一般PCR仅应用一对引物,通过PCR扩增产生一个核酸片段,主要用于单一致病因子等的鉴定.多重PCR(multiplex PCR),又称多重引物PCR或复合PCR,它是在同一PCR反应体系里加上二对以上引物,同时扩增出多个核酸片段的PCR反应,其反应原理,反应试剂和操作过程与一般PCR相同.    多

普通PCR梯度PCR-原位PCR-荧光定量PCR仪的区别

  普通PCR仪:   一般把一次PCR扩增只能运行一个特定退火温度的PCR仪,称之为普通PCR仪,也就是传统的PCR仪。如果要用它做不同的退火温度则需要多次运行。如;(ABI 2720)   梯度PCR仪:   一次性PCR扩增可以设置一系列不同的退火温度条件(通常12种温度梯度)的称

反转录PCR(RTPCR,-Reversed-Transcript-PCR)

1 原理   RT—PCR是一种将cDNA合成与PCR技术结合分析基因表达的快速灵敏的方法,主要用于对表达信息进行检测或定量分析,还可以用来检测基因表达差异而不必构建cDNA文库克隆cDNA。RT-PCR的模板可以为总RNA或poly(A)+选择性RNA。逆转录反应可以使用逆转录酶,以随机引物、ol

直接原位PCR(In-situ-PCR)

原位PCR是原位杂交细胞定位和PCR的高灵敏度相结合的技术,使得靶基因检测有了极大的改进。此技术是在细胞(爬片、甩片或涂片)或组织(石蜡、冰冻切片)上直接对靶基因片段进行扩增,通过掺入标记基团直接显色或结合原位杂交进行检测的方法。一、组织切片和细胞样品的制备试剂与配置10%福尔马林;二甲苯;PBS操

直接原位PCR(In-situ-PCR)

原位PCR是原位杂交细胞定位和PCR的高灵敏度相结合的技术,使得靶基因检测有了极大的改进。此技术是在细胞(爬片、甩片或涂片)或组织(石蜡、冰冻切片)上直接对靶基因片段进行扩增,通过掺入标记基团直接显色或结合原位杂交进行检测的方法。一、组织切片和细胞样品的制备试剂与配置10%福尔马林;二甲苯;PBS操

菌落PCR(Colony-PCR)方法

菌落PCR(Colony PCR)可不必提取基因组DNA,不必酶切鉴定,而是直接以菌体热解后暴露的DNA为模板进行PCR扩增,省时少力。建议使用载体上的通用引物。通常利用此方法进行重组体的筛选或者DNA测序分析。最后的PCR产物大小是载体通用引物之间的插入片断大小。具体方法:1、PCR混合物的制备T

反向PCR-(inversePCR)

            实验方法原理 反向PCR可用于研究与已知DNA区段相连接的未知染色体序列,因此又可称为染色体缓移或染色体步移。这时选择的引物虽然与核心DNA区两末端序列互补,但两引物3’端是相互反向的。扩增前先用限制性内切酶酶切样品DNA,然后用DNA连接

反向PCR-(inversePCR)

实验方法原理 反向PCR是克隆T-DNA插入位点侧翼DNA序列非常有效的方法。 1.  选择合适的限制性内切酶位点。并在T-DNA的边界(左边界、右边界均可)和酶切位点附近设计引物P1、P2;2.  回收DNA,T4连接酶连接,使酶切后的DNA片段环化;3.  回收连接后的DNA,用引物P1、P2做

反向PCR-(inversePCR)

利用反向PCR可对未知序列扩增后进行分析,探索邻接已知DNA片段的序列,并可将仅知部分序列的全长cDNA进行分子克隆,建立全长的DNA探针。可用于:(1)基因游走研究;(2)转位因子研究;(3)已知序列DNA旁侧病毒整合位点分析等研究。实验方法原理反向PCR可用于研究与已知DNA区段相连接的未知染色

PCR技术(十四):反向PCR

描述一种大聚合酶链反应(PCR)应用的方法,使在已知序列的核心区边侧的未知 DNA成几何级数扩增。用适当的限制性内切裂解含核心区的DNA,以产生适合于PCR扩 增大小的片段,然后片段的末端再连接形成环状分子。PCR的引物同源于环上核心区 的末端序列,但其方向性,使链的延长经过环上的未知区而不是分开引

反向PCR(inverse-PCR)简介

反向PCR是一种多聚合酶链式反应(PCR)应用的方法,可使已知序列的核心区边侧的未知DNA成几何级数扩增。用适当的限制性内切裂解含核心区的DNA,以产生适合于PCR扩增大小的片段,然后片段的末端再连接形成环状分子。PCR的引物同源于环上核心区的末端序列,但其方向可使链的延长经过环上的未知区而不是分开

PCR

实验概要protocal for PCR实验步骤PCR 1) Add the following to a microfuge tube:        10 ul reaction buffer        1 ul 15 uM forward primer        1 ul 15 uM

PCR

PCRPolymerase Chain Reaction1) Add the following to a microfuge tube:10 ul reaction buffer1 ul 15 uM forward primer1 ul 15 uM reverse primer1 ul templ

PCR技术-PCR技术的应用

  一滴残留在裙子上的精液使得美国总统Bill Clinton不得不坦承他与白宫实习生有不正当的关系。因为他知道现在的生物科技就连一个精子也能被用来做为证据。这种将极微量的生物标本化为可供鉴定的现代技术正是PCR(Polymerase chain reaction)--聚合酶链式反应具有的特色之一。

降落PCR(Touchdown-PCR)的原理

Touchdown PCR是指每隔一个循环降低1°C反应退火温度,直至达到“Touchdown”退火温度,然后以此退火温度进行10个左右的循环。该方法最初出现是为了避开确定最佳退火温度而进行的复杂的反应优化过程。正确和非正确退火温度之间的任何差异将造成每个循环PCR产物量的两倍差异(每摄氏度造成4倍

PCR技术(一):PCR技术概论

  PCR技术概论PCR技术简史PCR技术的基本原理PCR反应体系与反应条件PCR反应特点PCR扩增产物的分析  聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction ,PCR)是80年代中期发展起来的体外核酸扩增技术。 它具有特异、敏感、产率高、 快速、 简便、重复性好、易自动化等突出

实时荧光定量PCR(realtime-PCR)

实验步骤一、 样品RNA的抽提 1.  取冻存已裂解的细胞,室温放置5分钟使其完全溶解。2.  两相分离 每1 ml的TRIZOL试剂裂解的样品中加入0.2 ml的氯仿,盖紧管盖。手动剧烈振荡管体15秒后,15到30℃孵育2到3分钟。4℃下12 000 rpm离心15分钟。离心后混合液体将分为下层的

降落PCR(Touchdown-PCR)的原理?

  Touchdown PCR是指每隔一个循环降低1°C反应退火温度,直至达到“Touchdown”退火温度,然后以此退火温度进行10个左右的循环。该方法最初出现是为了避开确定最佳退火温度而进行的复杂的反应优化过程。正确和非正确退火温度之间的任何差异将造成每个循环PCR产物量的两倍差异(每摄氏度造成