APOBEC3介导的DNA修复在CRISPR/Cas9基因编辑中突变新机制
中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所杨力研究组与上海科技大学陈佳研究组、南京医科大学沈彬研究组合作研究揭示了胞嘧啶脱氨酶(APOBEC)在CRISPR/Cas9引发的DNA断裂修复过程中产生突变的新机制,为进一步提高基因组编辑保真度提供了新思路。 CRISPR/Cas9是迄今为止最为高效便捷的基因组编辑技术。虽然其在生命科学基础研究和生物技术开发等领域被广泛应用,并在临床研究中显示出了极大潜力,但由于编辑过程中存在的非靶向突变以及基因治疗的不可逆性,CRISPR/Cas9技术的精确性问题一直是科学界的焦点所在。由于APOBEC能够在DNA单链断裂修复过程中结合单链DNA并造成随机突变,而单链核酸(如单链寡聚核苷酸、基因组单链DNA)在CRISPR/Cas9引发的DNA修复过程中广泛存在。因此,评估APOBEC能否在CRISPR/Cas9引发的基因组DNA修复过程中产生突变,对......阅读全文
Cell子刊综述:多能干细胞的基因组编辑
具有敲除或突变等位基因的人类多能干细胞(hPSCs),可以通过定制设计的核酸酶产生。转录激活因子样效应物核酸酶(TALENs)和成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)-Cas9核酸酶,是编辑hPSC基因组最常用的技术。 1月6日,Cell子刊《Cell Stem Cell》在线发表了来自哈佛
精确编辑基因!利用机器预测细胞修复CRISPR诱发的DNA断裂
当双螺旋DNA因损伤(比如X射线暴露)发生断裂时,细胞中的分子机器会开展基因“自动校正(auto-correction)”,从而将基因组重新连接在一起,但是这种修复通常是不完美的。细胞中的天然DNA修复过程能够以一种看似随机且不可预测的方式在断裂位点处添加或移除DNA片段。利用CRISPR-Ca
Science发布创新性CRISPR/Cas9技术
利用一种脱氨酶将单核苷酸改变导入DNA中,研究人员创建了一种改进的CRISPR/Cas9工具,它能够避免生成有害的双链断裂,减少采用CRISPR/Cas9技术可能引入的附加突变,且不需要添加DNA模板。这项发布在8月4日《科学》(Science)杂志上的新研究工作,是第二次报道这样的精确基因编辑
科学家在植物中实现超长基因片段高效精准无赘敲入
5月17日,国际学术期刊《自然-通讯》(Nature Communications)在线发表了中国科学院上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为CRISPR/Cas9-mediated gene targeting in Arabidopsis using sequential transfo
基因编辑进展梳理-Part-I-CRISPR系统拓展及机制研究(二)
两篇研究揭示Cas4核酸酶对于CRIPSR免疫反应的重要性2018年3月27日的,Shiimori团队在Cell Reports期刊上发文,证明了Cas4核酸酶是间隔序列前体临近基序( PAMs )靶向选择所必须的,有助于Cas1和Cas2选择新的CRISPR间隔物,并赋予天然宿主Synech
刘光慧研究员Cell-Res发表CRISPR新文章
CRISPR/Cas系统已被证实一种可应用于体内外的强大的基因编辑工具。1月30日,来自中科院生物物理研究所、Salk生物科学研究所等处的研究人员,在《细胞研究》(Cell Research)杂志上发表了题为“Regenerative medicine: targeted genome edit
电转仪助力CRISPR编辑iPSC新进展:首次报告协同基...(一)
电转仪助力CRISPR编辑iPSC新进展:首次报告协同基因编辑效应 2006年,日本科学家山中伸弥(Shinya Yamanaka)教授利用逆转录病毒将4个转录因子转入成体细胞,将其转变为诱导多能干细胞(induced pluripotent stem cells, iPSC)。从此后,
甘薯中利用CRISPR/Cas9基因编辑技术改良淀粉的品质
9月23日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心张鹏研究组在International Journal of Molecular Sciences 杂志上在线发表了题为CRISPR/Cas9-Based Mutagenesis of Starch Biosynthetic Genes in Swe
谷峰:PAM序列可影响CRISPR/Cas9介导的基因组编辑效率
9月26日,由生物谷主办的2014基因组编辑研讨会在上海好望角大饭店隆重举行。温州医科大学附属眼视光医院的谷峰教授参加了此次大会并发表了题为"PAM序列对CRISPR/Cas9介导的基因组编辑的影响及AAV-CRISPR/Cas9对人类胚胎干细胞的基因组编辑"的精彩报告。 谷教授基于GFP
中国学者:提高CRISPR/Cas9介导基因组编辑的效率
来自中国医学科学院、上海科技大学的研究人员报告称,在大鼠中他们通过抑制非同源末端连接(NHEJ)以及利用Cas9蛋白提高了CRISPR/Cas9介导的精确基因组编辑的效率。这一研究成果发布在5月10日的RNA Biology杂志上。 精确的修饰如点突变、密码子替换,插入或精确的定点缺失对于研究
PNAS追溯CRISPR技术的前世今生
就在几年前,如果分子生物学想要改变目标生物体的基因组,那还是一件十分困难的事,需要花费数周的时间进行多个实验尝试。然而今天,科学家们能快速的沉默或者编辑一个基因,因为他们有了这种称为成簇规律间隔的短回文重复DNA碱基序列的CRISPR新技术。 之后CRISPRs 引起了许多微生物学家的兴趣,J
基因编辑CRISPR/Cas9新技术路在何方?
CRISPR/Cas9这项新技术使人们能更精准地对DNA代码进行控制,引发了遗传学和细胞生物学领域的革新,科学家们对它寄予厚望,希望借助它的力量,治疗包括癌症在内的疾病并进一步解开人类细胞身上笼罩的谜团。 但这一基因编辑技术也引发了科学家们的忧虑。据美国趣味科学网站报道,有科学家担心,这一新工
顶级期刊:用光控制CRISPR/Cas9基因编辑
一段时间以来,科学家们一直都在尝试操纵基因。最近,美国匹兹堡大学的Alexander Deiters就发现了一种方式,以更高的精度来控制这个过程。他采用的是光。Deiters及其研究团队首次实现了这一技术突破,他们将相关研究结果发表在最近的化学领域顶级期刊《美国化学学会杂志》(Journal o
PNAS:利用RNA控制CRISPR/Cas9基因编辑
在过去的几年里,研究人员找到了一种方法利用天然存在的细菌免疫系统CRISPR/Cas9来失活或纠正任何生物体内的特定基因。然而,CRISPR/Cas9持续地发挥基因编辑活性,带来了额外编辑不必要位点的风险。 现在,来自加州大学圣地亚哥医学院、Ludwig癌症研究所和艾希司制药公司(Isis P
研究人员利用碱基编辑器可以治愈人细胞中的遗传病
2012年开发的基因组编辑工具CRISPR/Cas9可以将基因中的突变片段切割掉,并用一个未发生突变的片段进行替换,而一种称为碱基编辑器的新型CRISPR可以在不切割DNA的情况下修复突变。因此,使用碱基编辑器进行基因组编辑被认为更安全。如今,在一项新的研究中,来自荷兰乌得勒支研究所和乌得勒支大
科学家揭示基因编辑治疗家族性高胆固醇血症研究新进展
11月29日,国际学术期刊Circulation在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心/生物化学与细胞生物学研究所周斌研究组的最新合作研究成果“In Vivo AAV-CRISPR/Cas9-mediated Gene Editing Ameliorates Atherosclerosis
借助电转方法将Cas9蛋白质/sgRNA导入小鼠原核受精卵生...
借助电转方法将Cas9蛋白质/sgRNA导入小鼠原核受精卵生成非嵌合体突变体胚胎基因编辑解析:借助电转方法将Cas9蛋白质/sgRNA导入小鼠原核受精卵生成非嵌合体突变体基因编辑技术指能够让人类对目标基因进行“编辑”,实现对特定DNA片段的敲除、加入等。而CRISPR/Cas9技术自问世以来,就有着
检测CRISPR/Cas9基因编辑系统的副作用
目前,弗吉尼亚大学医学院的研究人员设计出一种方法,检测风靡科学界的CRISPR/Cas9基因编辑系统中意想不到的副作用。相关研究结果发表在最近的《Nature Biotechnology》。 称为CRISPR的基因打靶系统,可让我们编辑基因组中特定靶位点的遗传信息。这种新方法揭示的系统,有可能
国际期刊评论CRISPR基因疗法
在医疗领域,基因编辑技术可以更加准确、深入地了解疾病发病机理和探究基因功能,可以改造人的基因,达到基因治疗的目的等。今年五月份,来自中山大学的遗传学,在世界上首次尝试使用CRISPR–Cas9基因组编辑技术,修改来自人类胚胎的疾病相关DNA,从而引发了科学界的激烈争论。这篇论文发表在五月份的《P
国际期刊评论CRISPR基因疗法
在医疗领域,基因编辑技术可以更加准确、深入地了解疾病发病机理和探究基因功能,可以改造人的基因,达到基因治疗的目的等。今年五月份,来自中山大学的遗传学,在世界上首次尝试使用CRISPR–Cas9基因组编辑技术,修改来自人类胚胎的疾病相关DNA,从而引发了科学界的激烈争论。这篇论文发表在五月份的《P
-Cell子刊突破:无需克隆的CRISPR新技术
来自荷兰Hubrecht研究所和乌特勒支医学中心(UMC Utrecht)、麻省理工学院的研究人员称,他们开发出了一种自身克隆CRISPR/Cas9(scCRISPR)技术,可以绕开基因编辑过程中所有的克隆步骤,在数小时内完成CRISPR/Cas9介导基因突变及位点特异性转基因敲入。他们的研究成
CRISPRCas系统引领药物发现途径和疾病治疗方案的革新
CRISPR-Cas系统作为基因组编辑和调节的编程工具,可以在各种细胞中(包括人类细胞)进行遗传操作。虽然目前科学家们的注意力主要集中在CRISPR-Cas系统治疗孟德尔遗传疾病方面的潜力,但是该技术还有望为复杂的体细胞疾病提供新的治疗方法,同时CRISPR-Cas通过加速药物靶点的鉴定和验证,
华人学者惊人发现:HIV可以逃避CRISPR/Cas9治疗
当前CRISPR/Cas9已被成功改造成基因组定点编辑工具。因此,如何利用CRISPR/Cas9系统对HIV-1病毒基因进行高效靶向修饰,从而达到治疗HIV-1感染病患的目的成为了国内外许多实验室的研究热点。 2015年10月,来自吉林大学和斯坦福大学的研究人员,利用一种工程设计的CRISPR
Nature:重磅!首次成功地在哺乳动物中进行基因驱动
基因驱动(gene drive)是一种基因工程技术,它促进后代要比正常情形时更频繁地遗传来自一个亲本的特定等位基因。它已在昆虫中发挥作用。如今,在一项新的研究中,来自美国加州大学圣地亚哥分校的研究人员发现它也能够成功地在脊椎动物中发挥作用。在这项研究中,他们描述了一种方法,它利用CRISPR-C
首个CRISPR/Cas9靶序列数据库
近期,来自美国国立卫生研究院和瑞典乌普萨拉大学的研究人员,在国际著名学术期刊《Nucleic Acids Research》上发表的一项研究中,首次提出了一个已在斑马鱼中经过实验验证的CRISPR/Cas9靶序列数据库。 CRISPR及CRISPR相关蛋白(Cas9),是在古细菌和细菌中发现的
陈玉林教授团队新技术流程用于创制基因编辑绵羊模型
近年来,以基因编辑技术为代表的家畜分⼦设计育种技术迅速发展。CRISPR/Cas9基因编辑技术是具有简单、高效、精确等优点的新型基因编辑⼯具,将其应用于家畜育种,有望对多个基因实现同步的精准编辑,提高家畜选育的精准度,缩短育种周期,加快育种进程。绵羊是重要的经济动物,更是基因编辑的模式动物,研究
-张锋Nature-Medicine综述:基因编辑技术最新进展
人体内已命名的基因共有25000多条,目前已知一部分基因(3000)的突变会引起各类疾病。对于此类疾病的治疗,最本质的手段是通过一些方法将突变后的遗传物质矫正回原来的状态。这类方法被称为遗传疗法(genetic therapies)。目前最广泛的遗传疗法手段为:1. 以病毒载体感染方式引导的源基
Nature子刊发布CRISPR突破性技术:替换整个编码序列--同时保留关键的调控元件
以色列Bar-Ilan大学的研究人员提出了一种名为GE x HDR 2.0: Find and Replace的新方法,将crispr -cas9介导的基因组编辑与重组腺相关血清型6 (rAAV6) DNA供体载体结合起来,在保留调控元件的同时精确替换erag2编码序列。这种策略也可以应用于其
用基因编辑治疗家族性高胆固醇血症-你相信吗?
11月29日,国际学术期刊Circulation在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心/生物化学与细胞生物学研究所周斌研究组的最新合作研究成果“In Vivo AAV-CRISPR/Cas9-mediated Gene Editing Ameliorates Atherosclerosis
基因编辑CRISPR/Cas9技术构建转基因小鼠的优势
当当当!敲黑板!!看这里!!! 2016年国家自然科学基金放榜已经有一段时间啦!各位老师是不是还沉浸在喜悦中不能自拔呢?O(∩_∩)O清醒一下,我们的目标是:基金年年有,明年中更多! 每年的国家自然科学基金都是中国科研领域的风向标!通过分析国自然,可以看出最新的研究热点、目前国家重视