中国科学家领衔完成第一张蒙古人基因组图谱
来自纽约9月14日的消息，由深圳华大基因研究院（Shenzhen Genomics Institute）领导的国际研究小组即将公布“蒙古人”的“第一张基因组测序图谱”。 深圳华大基因研究院即中科院北京基因组研究所的分支机构，对于此次测序活动，他们表示，对世界上超过20亿人口的蒙古人种进行测序得到的图谱可以用于这一人种遗传疾病的识别及追踪。 同时科技日报也报道，深圳华大基因研究院以黄种人的基因组图谱为研究目标，绘制世界上第一个黄种人全基因组序列图，这将为黄种人的基因研究和疾病治疗提供更准确和更有针对性的“基因标准图库”。 参予这一研究的包括深圳华大基因研究院、生物信息系统国家工程中心及中国科学院北京基因组研究所的科学家，这一合作团队是曾经参与了“人类基因组计划”1%任务的主要成员。计划一旦成功，意味着中国将实现人类基因组序列图绘制工作从1%到100%的成功跨越。 这一被命名为“炎黄一号”的计划同时也是我国科学家与英国桑格......阅读全文
盘点最新基因组测序成果
the scientist杂志发表文章盘点了几项最新的基因组测序成果以飨读者： 种属：非洲腔棘鱼（Latimeria chalumnae） 基因组：~2.86 billion bp 人们曾经认为腔棘鱼早在七千万年前就已灭绝，直到1938年一只腔棘鱼在南非海岸被渔民捕获。这种鱼看上去跟三亿年
我国完成小麦A基因组测序
本报讯（记者丁佳）5月10日，《自然》杂志刊发了中国科学院的一项最新成果，该项研究完成了小麦A基因组的测序和染色体精细图谱的绘制。 这项由中科院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工程国家重点实验室、中科院种子创新研究院和遗传发育所基因组分析平台等合作完成的研究，全面揭示了小麦A基因组的结构和
人类全基因组测序计划
全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。 1986年， Renato Dulbecco是Z早提出人类基因组测序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列，对癌症的研究将会很有帮助。美国能源部（DOE）与美国国家卫生研究院（NIH），分别在1986年与1987年加入人类基
测序解读基因组，真的好吗？
测序解读基因组，真的好吗？ “对基因组了解过多也不全是好事。”贝勒医学院生物医学伦理学副教授、医学伦理和健康中心主任Amy McGuire，在今年旧金山举办的TEDMED机构年度大会上说，“尤其是对自己基因组信息的了解。” 虽然McGuire 从事人类基因组学研究已有多年，但
让基因组测序绕过PCR
在基因组测序中，PCR扩增似乎是绕不过去的一步。然而，PCR也带来一些问题，包括不均匀扩增，导致某些序列的比例过高。对目前的新一代测序（NGS）平台而言，测序某些碱基组成上存在严重偏向的基因组区域仍是一大挑战。在GEN杂志上，Patricia Fitzpatrick Dimond博士介绍了PCR-
华大智造－“超级生命计算机”DNBSEQT7－正式交付商用
019年9月9日，由深圳华大智造科技有限公司（以下简称“华大智造”）自主研发的超高通量基因测序仪——DNBSEQ-T7正式交付商用，首批测序仪已抵达华大基因科技服务有限公司和微基因（WeGene）等合作伙伴的实验室。来自交付前的用户测试数据表明，T7数据表现符合预期，各项指标均表现良
基因测序描绘个体化医疗产业图谱
随着高通量测序技术的引入和“大数据”处理能力的提高，现代医学正在经历巨大的变革，由传统标准化医疗模式向个体化医疗模式转变。而人类基因组计划和DNA元素百科全书计划的完成及肿瘤基因图谱的绘制，也为“量体裁药”式的个体化医疗提供了有力工具，医学领域面临新的机遇。不过，业内人士表示，尽管市场空间可观，
PNAS：单细胞测序绘制大脑的细胞图谱
斯坦福大学的著名学者Stephen Quake及其同事本周在《美国科学院院刊》（PNAS）上发表文章，介绍了人类脑细胞的单细胞转录组测序研究成果。 研究小组对近500个成人或胎儿脑细胞进行了单细胞RNA测序。利用这种方法，他们能够鉴定出大脑中所有主要的细胞类型，并确定神经元的亚型。他们还观察了
基因组物理图谱的主要构架途径
基因组物理图谱的构建不需要经过减数分裂的世代群体，可直接利用DNA分子分析，主要有以下三种构建途径：限制性酶图谱。利用限制性内切酶构建图谱，对于DNA分子长度在50kb以下的片段，一般没有什么困难。而对于大于50kb的DNA分子，可选用稀有切点的内切酶酶切DNA。（1）用识别较多核苷酸的内切酶，如N
玉米基因组更详细图谱出炉
美国研究人员12日在《自然》杂志网络版上发表论文称，他们利用新一代测序技术对玉米自交系B73进行测序，得到了新的、更详细的基因组图谱。研究显示，玉米具有良好的表型可塑性，不同品系玉米的基因组差异明显。这意味着在全球气候环境变化不断加剧的情况下，玉米仍有巨大的发展空间。 玉米是生物学研究中的重要
玉米基因组更详细图谱出炉
美国研究人员12日在《自然》杂志网络版上发表论文称，他们利用新一代测序技术对玉米自交系B73进行测序，得到了新的、更详细的基因组图谱。研究显示，玉米具有良好的表型可塑性，不同品系玉米的基因组差异明显。这意味着在全球气候环境变化不断加剧的情况下，玉米仍有巨大的发展空间。 玉米是生物学研究中的重要
小须鲸全基因组图谱获破译
11月25日，韩国海洋科学技术研究所、深圳华大基因研究院等宣布成功破译了小须鲸全基因组图谱，并对鲸类独特生理习性的遗传学机制进行了分析。相关成果在线发表于《自然—遗传学》杂志。 人们一直痴迷于海洋生物是如何演化为陆生生物的。鲸类的进化却反其道而行之，由陆生向水生演化，和陆生偶蹄动物如牛、猪等
老鼠基因组单体型图谱出炉
美国的研究人员希望通过对15只常用于生物医药研究的小鼠的DNA进行研究来帮助科研人员确定出与环境疾病敏感性相关的基因。目前这些数据被存放在了基因变异数据目录之下，即小鼠基因组单体型图谱（将染色体分隔成许多小的片段），从而帮助研究人员找出小鼠中影响健康和疾病的基因和遗传变异。这个单体型图谱公布在7月2
Scientific－Reports：创建首个全面基因组图谱
近日，澳大利亚加文医学研究所的研究人揭示身体不同部位脂肪积聚所造成的伤害的驱动因素。他们的一项新研究比较了皮肤下的脂肪细胞和腹部内的有害脂肪，创建了第一个全面的基因组图谱。该图谱揭示了在细胞发育早期独特的特征，不同类型的脂肪似乎“硬捆绑”（hard-wire）在一起。该研究发表于Scientif
铁树“开花”：苏铁喜获完整基因组图谱
苏铁基因组图谱研究由来自22个科研机构的65位科学家联合完成。 苏铁目系统发育树支持现存苏铁是在经历大量灭绝以后，几次辐射演化的后代。如今苏铁有2科10属。（刘阳供图） 也许你不熟悉苏铁类植物，但你一定听说过“铁树开花”这个成语，比喻事情很难实现。相传因受苏东坡青睐，铁树得名“苏铁”。作为现存最
“人类基因组图谱”20年——30亿碱基“拼出”大科学时代
20年前，2001年2月，被誉为生命科学“登月计划”的“人类基因组计划”（HGP）发布首张人类基因组图谱。 这是人类生命科学发展历史上的重要“分水岭”。 20年来，曾作为单一学科独立发展的生命科学迎来多学科交叉融合、新技术前沿汇聚的“大科学”时代。 中国科学院北京基因组研究所特聘研究员于
华大智造助力“测序+合成”交叉领域融合
进入21世纪以来，人类世界的数据信息增长速度急剧增快，随着数据量级越来越大，在可预见的未来，基于传统硅基储存介质的储存方式将不可避免地陷入资源枯竭的困境。因此，开发新的储存技术就显得尤为重要。DNA是自然生物储存遗传信息的载体——在细胞核尺度的空间里，就能储存一个物种所有的遗传信息，信息存储密度非常
华大在新冠病毒基因组变异监测及研究方法上取得突破
随着新型冠状病毒肺炎（COVID-19）肆虐全球，世界卫生组织（WHO）已经正式宣布其为全球流行病（Pandemic）。WHO最新新冠疫情状态报告显示，截至北京时间2020年3月26日10点，新冠肺炎疫情已蔓延至全球198个国家和地区，确诊患者超过46万例，且仍呈现迅速增长态势。 病毒在传播过
华大智造发布“桌面”测序仪等3款产品－构建测序“生态”
2019年10月25日于深圳召开的第十四届国际基因组学大会（ICG-14）上，华大智造发布三款新产品，分别是其自主研发的新型“桌面”一站式测序解决方案、便携式单细胞组学产品及CoolMPS高通量测序试剂套装。新产品聚焦便携式、智能化、自动化等未来发展方向，打破传统测序的时间、空间、人员限制，进一步满
基因测序技术大升级
DNA就像是漆黑的夜里萤火虫发的光，第二代测序技术无法辨别每一只萤火虫，所以就把上千只萤火虫放在同一个袋子里，才能收集到它们的光。但第三代技术却可以辨别每一只萤火虫，而且可以同时测量很多个DNA片断。 日前，南方科技大学生物系副教授贺建奎与另外几名中美科学家联合在生物医学杂志BioRxiv上
科区与华大基因科技有限公司签订合作协议
5月6日，科尔沁区政府与深圳华大基因科技有限公司签订合作协议。华大基因将在医学、农业、制药、精准扶贫等方面为科尔沁区提供科技平台、技术平台、教育平台支撑。 华大基因是全球最大的基因组学研究中心，其数据中心、产业孵化中心、测序能力及基因组信息分析能力位居世界第一，在全世界基因测序上贡献率近50%
单细胞测序的重要性及应用方向（一）
单细胞测序研究一直是当今的热门话题，想知道单细胞技术有哪些重要的应用？想深入了解当今主流的单细胞测序技术吗？华大智造《单细胞测序技术讲堂》开讲啦！跟着小造一起寻找这些问题的答案。单细胞测序的重要性随着第二代测序(next generation sequencing，NGS) 技术和第三代测序(
关于“炎黄一号”的研究故事
“金凤凰”栖落梧桐山深圳华大基因研究院于今年4月落户盐田，被形容为“深圳与华大就像谈恋爱，相互看对了眼”。作为一家亚洲领先的基因组科研机构，自成立以来，华大先后完成了多项人类基因组计划的基因组研究工作。作为华大公益科研任务的主要承担者，在短短几个月的时间里，深圳华大基因研究院迅速完成了多个高水平实验
中大绘出广东食管鳞状细胞癌遗传变异图谱
由中山大学肿瘤防治中心贾卫华教授领衔，中山大学、美国NIH等多家机构的科研人员组成的国际合作团队，基于新一代测序技术、基因的表达谱分析、体内外实验以及大量临床数据，对食管鳞状细胞癌的全基因组变异进行了历时五年的研究，绘制出广东食管鳞状细胞遗传变异图谱。 广东是食管癌高发大省，人群具有独特的遗传
Cell公布最新基因组测序结果
去年夏天西非埃博拉爆发的早期阶段，科学家们以空前的规模和速度测序了这种致命病毒的基因组，为人们揭示了许多疫情蔓延的关键信息，比如说病毒只通过人与人接触传播，病毒在多次传播中获得了许多新突变等等。 虽然埃博拉爆发最糟糕的时期已经过去，但这场疫情并未结束，还有许多问题需要人们去解答。为此，哈佛大学
基因组测序助力肿瘤精密治疗
最近，约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心的科学家，在对101例胰腺癌患者的血液和肿瘤进行基因组测序后发现，至少三分之一患者的肿瘤有基因突变，这些突变有朝一日可能帮助指导疾病的精密治疗。他们说，与标准的影像学检查方法相比，血液检测的结果，可以早半年预测到癌症的复发。 约翰斯霍普金斯大学医学院肿
基因组测序揭示家鸽起源史
2月1日，由美国犹他大学、深圳华大基因研究院等单位合作完成的鸽子基因组研究成果在《科学》杂志在线发表。该研究从分子层面揭示了家鸽的起源历史，并发现了鸽子羽冠多样性的遗传基础。 据悉，鸽子是目前为数不多的已完成测序的鸟类之一，其基因组与家鸡、火鸡、斑马雀及虎皮鹦鹉的基因组一起，将为鸟类的群体
PNAS：基因组测序的惊人发现
科学家们发现，水母（平凡的海洋生物）经过漫长的进化变成了生活在其它动物体内的奇特寄生虫。这项研究发表在本周的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 Myxozoa是感染无脊椎动物和脊椎动物宿主的微小寄生虫，由少数几个细胞组成。美国堪萨斯大学的研究人员对这种生物进行了基因组测序，发现它们实际上是高度
Nature发布基因组测序惊人发现
来自冲绳科学技术研究院大学(OIST)的一支研究团队与合作者们，完成了对两个称作为柱头虫(acorn worm)的小水生生物物种的测序，显示相比于许多其他动物，我们与柱头虫共享了更多的基因，确立了它们是我们的远亲。研究结果发布在《自然》（Nature）杂志上。 研究发现，所有后口动物（deut
GenomeBiology发布基因组测序重要成果
Genome Biology杂志发布了远东豹（Far Eastern Amur leopard）的首个全基因组序列，为人们揭示了肉食对基因多样性和种群规模的影响。“我们将远东豹基因组与其它哺乳动物基因组进行比较，发现肉食似乎是很强的选择压力。这种现象在杂食动物和食草动物中并不明显。举例来说，牛吃肉对