《NatureGenetics》：癌症的基因组结构研究
癌症的基因组结构研究发表《Nature Genetics》 B细胞通过一系列精心控制的染色体重排和“良好”突变产生抗体，这些突变使细胞能够产生大量不同的抗体。“尽管变化对产生大量多样的抗体至关重要，但仍有可能发生‘坏’突变并导致B细胞源性癌症，”研究负责人、哥伦比亚大学内科医师和外科医生学院微生物学和免疫学教授Uttiya Basu博士说。 Basu的最新研究表明，一种名为DIS3的蛋白质在维持基因组结构和防止不受控制的染色体重排（可能导致癌症）方面至关重要。 这些针对小鼠的新研究表明，当DIS3缺失时，B细胞变得不稳定，具有更有害的染色体重排，并且产生特异性抗体的能力降低。 研究还发现，DIS3通过阻止非编码RNA（不编码蛋白质的RNA）的积累来稳定染色体。 Basu说：“这些RNA的大量积累扰乱了基因组在细胞核中的排列方式，使基因组容易受到DNA易位的影响。” 因为DIS3突变在多发性骨髓瘤（一种来源于B细胞......阅读全文
定义癌症突变：破坏基因组3D相互作用的突变
在细胞中，DNA紧密地包裹在蛋白质周围，并以一种复杂的3D结构包装，我们称它们为“染色质”。染色质不仅可以保护我们的遗传物质不受损伤，而且通过调节基因组在3D空间的表达来组织整个基因组：展开呈现给细胞基因表达机器，然后再将它们卷回去。 在3D染色质结构中，一些区域被称为“拓扑关联域（TADs）
应用癌症基因组学方法，发现与年龄相关的血液疾病
克隆造血是一种生物过程，在这个过程中，血液干细胞(产生多种血细胞类型的细胞群)获得了有利的突变，超过了邻近的细胞。当这种突变出现在一个特定个体2%的血细胞中时，克隆造血就被诊断出来。驱动克隆造血的有利突变处于正选择状态，就像导致细胞恶性化的癌症基因突变一样。在ICREA研究教授Núria López
上海交大教授通过7000个癌症基因组分析找到全新靶标
生物通报道：来自上海交通大学医学院，德州大学健康科学中心等处的研究人员解析了33类肿瘤的7000例临床病人基因组，将识别的47,000多个突变数据映射至已发现的蛋白结构上，用以寻找各类型肿瘤全新靶标，并找到了非小细胞肺癌的全新靶标PDE10A。 这一研究成果公布在AJHG杂志上，文章的通讯作者
上海交大教授通过7000个癌症基因组分析找到全新靶标
来自上海交通大学医学院，德州大学健康科学中心等处的研究人员解析了33类肿瘤的7000例临床病人基因组，将识别的47,000多个突变数据映射至已发现的蛋白结构上，用以寻找各类型肿瘤全新靶标，并找到了非小细胞肺癌的全新靶标PDE10A。这一研究成果公布在AJHG杂志上，文章的通讯作者分别是上海交通大学医
Nature－Genetics公布又一大规模癌症基因组分析结果
超过20个研究机构的63位研究人员公布了一项包括30,000多人血液样本的大规模研究成果，通过这项分析，研究人员确定了13种胶质瘤新遗传危险因素，这揭示了增加胶质瘤易感性的个体DNA的特殊差异，同时也首次为临床医师提供了一种能区分成胶质细胞瘤和非胶质母细胞瘤等胶质瘤类型的新方法。 这一研究成果
Nature子刊公布癌症基因组研究重要成果：新的遗传突变
在一项多达10万人（包括17,000名最常见类型的卵巢癌患者）的遗传分析研究中，研究人员确定了12种新的增加卵巢癌患病风险的遗传变异，并找到了它们与以前发表的18种变异之间的关联。 这项研究成果公布在3月27日的Nature Genetics杂志上，由OncoArray Consortium联
国际癌症基因组联盟在中国发起四个新项目
2012年12月5日，国际癌症基因组联盟(ICGC)宣布在中国发起四个新项目，主要对结直肠癌、食道癌、肝癌和鼻咽癌的驱动基因进行检测，为实现个体化医疗奠定基础。中国是ICGC的创始成员之一，在2008年时曾经发起了胃癌基因组项目。 ICGC带领全球科学家对各种常见和罕见的癌症进行基因组图谱
北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cance
北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human can
Cell重大成果：绘制癌症药物基因组互作景观图
在发表于7月7日《细胞》（Cell）杂志上的一项研究证实，患者来源的癌细胞系中包含存在于患者肿瘤中大多数同样的遗传改变，可以利用来了解肿瘤对新药可能产生的反应，提高开发新型个体化癌症疗法的成功率。 由来自韦尔科姆基金会桑格研究所、欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)和荷兰癌症研究所的科学家
－Nature：癌症基因组计划宣布完成，下一步路在何方？
癌症基因组图谱计划（The Cancer Genome Atlas，TCGA）是国际癌症基因组联盟（International Cancer Genome Consortium）最大的项目。该项目于2006年启动，耗资1亿美元，旨在绘制1万个肿瘤基因组图谱。目前，来自16个国家的科学家合作完成了
《Nature》子刊：从你的基因组测序结果告知你是否会得癌症
许多遗传因素都会导致癌症，有些突变来自你的父母，有些是从其他外因或你自身DNA复制来的。大规模基因组测序已经有能力区分体细胞突变（somatic mutations）所引起的癌症，但是在鉴定哪些癌症可能来自父母遗传变异方面并没有那么有效。目前，我们对这类癌症相关突变的了解仍基于几个关键的家族研究
科学家利用机器学习解开临床癌症样本中的基因组密码
分析癌症基因组中的突变过程有助于在早期发现和准确诊断癌症，并可以揭示某些癌症患者对治疗产生耐药性的原因。 临床癌症样本是一个巨大的资源，可以为分子诊断技术提供更全面的支持，使特定的癌症患者与适合的癌症疗法相匹配，从而达到最好的治疗效果。然而，由于临床癌症样本中的DNA质量较差（如福尔马林会对D
北大特聘教授探讨破解癌症耐药性的基因组学方法
近日，北京大学的张泽民教授在Trends in Genetics杂志上发表文章，探讨了破解癌症耐药性机制的基因组学方法。 癌症精确医疗面临的主要障碍是，靶向性治疗总是会遇到抵抗。因此了解和克服癌症耐药性，成为研究的焦点。 癌症耐药性背后的生化和遗传机制非常复杂。为了克服这一巨大的挑战，近年来人
Nature发布大规模癌症蛋白质基因组学研究重要成果
基于来自癌症基因组图谱(TCGA)计划的数据，一个多机构科学家小组完成了首个大规模的乳腺癌“蛋白质基因组学”（ proteogenomic）研究，将一些DNA突变与蛋白质信号联系到一起，并帮助确定了一些驱动癌症的基因。 这项研究旨在通过蛋白质和它们的修饰来更好地认识癌症。发表在5月25日《自然
北大特聘教授探讨破解癌症耐药性的基因组学方法
近日，北京大学的张泽民教授在Trends in Genetics杂志上发表文章，探讨了破解癌症耐药性机制的基因组学方法。 癌症精确医疗面临的主要障碍是，靶向性治疗总是会遇到抵抗。因此了解和克服癌症耐药性，成为研究的焦点。 癌症耐药性背后的生化和遗传机制非常复杂。为了克服这一巨大的挑战，近年来人
迄今最综合癌症基因组图出炉－确定约300个致癌基因
美国科学家在探究癌症的基因根源方面取得重要成果。据美国圣路易斯华盛顿大学官网近日消息，来自该校医学院等机构的科学家完成了对1.1万个肿瘤（涵盖33种癌症）的基因测序和分析工作，得到的迄今最综合癌症基因组图谱（TCGA）详述了引发癌症的基因突变。最新研究为提高癌症疗法的疗效和研发新药物提供了路线图
人类癌症基因组非编码区域中鉴别出关键的致癌突变
近日，一项刊登在国际杂志Nature上的研究报告中，来自加拿大安大略省癌症研究所的科学家们通过研究在人类癌症基因组中的大量非编码区域（也被称之为人类癌症DNA的“暗物质”）中发现了一种新型的致癌突变；这种突变或能作为一种新型潜在的治疗靶点，帮助科学家们开发治疗多种类型癌症的新型疗法，包括脑癌、肝
构建单细胞癌症基因组时间序列模型，可预测乳腺癌细...
构建单细胞癌症基因组时间序列模型，可预测乳腺癌细胞克隆适应性不同生物会随着时间的推移不断进化，环境压力可促使具有某些特征的个体在群体中变得更加普遍。癌症也不例外，在不断增殖的肿瘤中，具有最佳竞争资源和抵御环境压力的癌细胞会逐渐占据主导地位。癌细胞的适应性（fitness）并不是一成不变的。在化疗药物
章冰博士：首次阐析人类癌症“蛋白组基因组学”特征
由范德堡大学领导的一个研究小组鉴别出了驱动大肠癌的一些遗传突变的蛋白质“标签”。这项发表在《自然》（Nature）杂志上的重要研究，第一次综合阐析了人类癌症的“蛋白组-基因组学”（proteogenomic）特征，这将推动结直肠（大肠癌）癌诊断和治疗取得新的进展。在美国，结直肠癌是仅次于肺癌的第
美纳里尼集团与Macrogen公司合作开发基因组癌症检测方法
2016年2月16日，意大利美纳里尼集团(Menarini)旗下的Silicon Biosystems公司与韩国Macrogen公司宣布它们将合作共同开发用于癌症精准医疗的临床检测和操作方法。 这两家公司说，它们的合作会把Silicon Biosystems公司的DEPArray™数字分类技术
美纳里尼集团与Macrogen公司合作开发基因组癌症检测方法
2016年2月16日，意大利美纳里尼集团(Menarini)旗下的Silicon Biosystems公司与韩国Macrogen公司宣布它们将合作共同开发用于癌症精准医疗的临床检测和操作方法。 这两家公司说，它们的合作会把Silicon Biosystems公司的DEPArray™数字分类技术
癌症蛋白在基因组和肿瘤抑制过程中扮演的关键角色
近日，一项刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中，来自美国威斯达研究所的科学家们通过研究发现，DNA复制后，ARID1A肿瘤抑制蛋白能够帮助维持端粒的内聚和染色体的分离，相关研究结果表明，ARID1A突变的细胞或会经历与细胞生存不相容的基因组改变，这或许也能够解释
Nature子刊：癌症基因组三维结构和拷贝数变异关系
来自北京大学生命科学学院，清华-北大生命科学联合中心等处的研究人员发表了题为“3D genome of multiple myeloma reveals spatial genome disorganization associated with copy number variations”的
科学家总结癌症基因组学发展历程，展望未来发展方向
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498613.shtm近日，北京大学生物医学前沿创新中心主任、生命科学学院教授张泽民受邀全面总结了癌症基因组学的发展历程，展望了其未来发展方向。相关文章于4月13日发表于《细胞》。 ?刻画肿瘤微
基因组学做不了的事－蛋白质组学更精准打击癌症
近日，国际人类蛋白质组组织公布了2020年度权威奖励获奖名单，中国科学院院士、军事科学院军事医学研究院研究员贺福初荣获蛋白质组学杰出成就奖。 贺福初院士率先提出人类蛋白质组计划的科学目标与技术路线，倡导并领衔了人类第一个关于组织、器官的蛋白质组计划，揭示了人体首个器官（肝脏）蛋白质组。2014年
首创全基因组大数据的高精度计算技术揭示癌症复杂性
2月6日出版的《自然》集中发表了国际癌症基因组联盟（ICGC）泛癌全基因组分析协作组（PCAWG）完成的6篇论文，分别聚焦泛癌全基因组数据画像、肿瘤体细胞突变的路径图谱、非编码区的驱动突变特征、基因组结构突变的特征模式、复现肿瘤的演化历程和多组学荟萃的RNA变化规律六个方面。同日，PCAWG还在
《分子细胞生物学报》出版“基因组不稳定性与癌症”专刊
《分子细胞生物学报》（JMCB）刚出版的2011年第一期，是由本刊副主编之一，美国新泽西癌症研究所沈智渊教授所组织的综述专刊，主题是“基因组不稳定性与癌症”。由于基因组不稳定性和癌症之间存在着复杂的关系，因此本专刊涵盖了DNA复制、DNA损伤反应和修复几个方面，并列举了它们在
构建癌症基因组学的非组织特异标签的药物重定位新方法
10月9日，国际学术期刊《细胞通讯》（Cell Reports）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院（营养与健康研究院）计算生物学研究所韩敬东研究组的论文“Accurate Drug Reposition through Non-Tissue Specific Core Signatures
癌症治疗新曙光：癌症建模
现在科学家们将患者的肿瘤细胞接种到小鼠体内，进而建立肿瘤模型，以用于分析和开展药物测试。目前研究人员已鉴定了一系列小儿实体肿瘤模型，同时相关数据的允许免费获取。 罕见癌症的研究面临着两方面的挑战：可用的肿瘤样本少；缺乏相应的小鼠模型。最近科学家们非常成功地开发了将人类肿瘤细胞高效移植到免疫缺陷