科研人员在酵母中合成记忆环
哈佛医学院的研究人员成功在酵母细胞中合成了一种以DNA为基础的记忆环。这一成果标志着人们向着合成生物学领域又前进了重要一步。 在利用随机的DNA小片断构建出基因后,Pamela Silver教授的实验室的研究人员不但重构了基因的动态过程,而且还创造出了一种能够预测记忆如何接收的数学模型。这项研究的结果发表在9月15日的《Gene and Development》杂志上。 合成生物学是一个令人无法置信的、激动人心的领域。与其他新生领域一样,合成生物学到底是怎样还存在一些不确定方面。问及任何三个科学家这个词语的定义,你可能得到四种答案。 一些人认为合成生物学是促进生物技术产品制造的方法,而另外一些人则认为是创造可能绕过繁琐的临床试验步骤的计算机平台。 由Caroline Ajo-Franklin领导的研究组不但希望能够构建遗传物质环路,而且还希望能够建立具有预测功能的数学模型。 研究人员建立的这个记忆环的成份很简单......阅读全文
科研人员在酵母中合成记忆环
哈佛医学院的研究人员成功在酵母细胞中合成了一种以DNA为基础的记忆环。这一成果标志着人们向着合成生物学领域又前进了重要一步。 在利用随机的DNA小片断构建出基因后,Pamela Silver教授的实验室的研究人员不但重构了基因的动态过程,而且还创造出了一种能够预测记忆如何接收的数学模型。这项研究
关于基因转录的转录因子介绍
转录因子(transcription factor)是起调控作用的反式作用因子。转录因子是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。真核生物基因在无转录因子时处于不表达状态,RNA聚合酶自身无法启动基因转录,只有当转录因子(蛋白质)结合在其识别的DNA序列上后,基因才开始表达。转录因子的结合位点
基因转录因子的相关介绍
转录因子(transcription factor)是起调控作用的反式作用因子。转录因子是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。真核生物基因在无转录因子时处于不表达状态,RNA聚合酶自身无法启动基因转录,只有当转录因子(蛋白质)结合在其识别的DNA序列上后,基因才开始表达。转录因子的结合位点
DNA重组(DNA-recombination)技术:外源基因的蛋白表达2
2.包涵体的分离与纯化细胞破碎时提取细胞内产物的关键。对于细菌的裂解常用的有酶溶法、超声破碎法、化学渗透法、玻璃珠研磨等。包涵体可通过超声波、匀浆等常规的方法是菌体破碎后,离心就可得到。密度梯度离心后可得到高纯度的包涵体。包涵体一般不溶于水,为了获得可溶性的蛋白质可加入强蛋白质变性剂后使其溶解。一般
能控制转录终止的蛋白质ρ因子
能控制转录终止的蛋白质ρ因子(ρ factor)是一种与转录终止相关的蛋白质。1969年,Roberts J在T4噬菌体感染的大肠杆菌中发现了能控制转录终止的蛋白质,命名为ρ因子。ρ因子是由相同亚基组成的六聚体蛋白质,亚基分子量为46kD 。ρ因子能结合RNA,又以对poly C的结合能力最强
关于酵母单杂交体系的基本介绍
酵母单杂交体系用于研究DNA-蛋白质之间相互作用的技术。 其特点是可识别稳定结合于DNA上的蛋白质,可在酵母细胞内研究真核生物中DNA-蛋白质之间的相互作用,并通过筛选DNA文库直接获得靶序列相互作用蛋白的编码基因。 酵母单杂交体系的原理是将已知的特定顺式作用元件构建到最基本启动子的上游,把
北京基因组所转录因子TALE和DNA相互作用研究获进展
近日,中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室雷红星研究组,在其开展的转录因子TALE(transcription activator-like effector)和DNA相互作用研究方面取得阶段性进展,该研究对TALE蛋白的构象可塑性以及特异性识别DNA的机制进行了深入的计
关于酵母单杂交的缺点介绍
酵母单杂交技术是一种研究蛋白质和特定DNA序列相互作用的技术方法,主要包括四个流程即:一、筛选含有报告基因的酵母单细胞株;二、构建表达文库;三、重组质粒转化至酵母细胞;四、阳性克隆菌株的筛选。 由于插入的靶元件与酵母内源转录激活因子可能发生相互作用,或插入的靶元件不需要转录激活因子就可以激活报
Cell惊人发现:酵母也有记忆
酵母可以通过无性繁殖,经有丝分裂产生基因型相同的子细胞,也可以通过有性繁殖,与另一个酵母相互融合,形成拥有两套染色体的杂合子。能相互融合的酵母细胞为了彼此靠近,会释放出特定的信息素。酵母发现彼此后,就会停止细胞分裂,形成特殊突起相互接触。如果两个酵母没有成功接触,它们就会继续进行无性繁殖。
酵母双杂交系统的发展和应用
随着对多种重要生物的大规模基因组测序工作的完成,基因工程领域又迎来了一个新的时代---功能基因组时代。它的任务就是对基因组中包含的全部基因的功能加以认识。生物体系的运作与蛋白质之间的互相作用密不可分,例如:DNA合成、基因转录激活、蛋白质翻译、修饰和定位以及信息传导等重要的生物过程均涉及到蛋白质复合
人肌肉基因首次插入面包酵母DNA
荷兰研究人员成功将人类肌肉基因插入面包酵母的DNA中,这是科学家首次将如此重要的人类特征植入酵母细胞,得到的人源化酵母模型,可作为药物筛选和癌症研究工具。相关论文发表于《细胞报告》杂志。 代尔夫特理工大学研究团队添加到酵母细胞中的特征由一组十个基因控制,人类没有这些基因就无法生存。这组基因包含了
酵母基因组DNA简易高效提取方案
1. 10ml菌液过夜培养至饱和(OD600值为2-3) 2. 离心沉降细胞(Sorvall中以2000rpm的速度),然后以冷的、等体积的无菌蒸馏水洗涤 3. 将细胞沉淀在200μl 裂解缓冲液中重悬浮,然后加入约300μl 玻璃珠和200μl的1:1苯酚:氯仿混和液 4. 漩涡摇匀1-2min
CCAAT转录因子
中文名称CCAAT转录因子英文名称CCAAT transcription factor定 义可与启动子中的CCAAT元件发生特异性相互作用的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)
辅助转录因子
中文名称辅助转录因子英文名称ancillary transcription factor定 义协助RNA聚合酶同启动子结合,并促进已结合的RNA聚合酶启动转录速率的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)
转录因子组成
真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录结构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所需要的。一般这些促成转录起始所需的转录结构包括三个重要的组成部分:亚基RNA聚合酶的亚基,它们是转录必须的,但并不对某一启动子有特异性。复合物某些转录因子能与RNA聚合酶结合形成起始复
酵母双杂交原理(蛋白相互作用)
概述酵母双杂交系统由Fields和Song等首先在研究真核基因转录调控中建立。典型的真核生长转录因子, 如GAL4、GCN4、等都含有二个不同的结构域: DNA结合结构域(DNA-binding domain)和转录激活结构域(transcription-activating domain)。前者
三种常用基因功能验正方法
科研人员在分析项目的过程中,碰到这样的问题:通过各种手段(选择清除分析、比较基因组学分析、转录组分析)获得的行驶某种功能的某基因,如果进行实验的验正呢?一般分为:基因上调(基因转染法)、基因下调(基因干扰法)后看蛋白表达水平、细胞功能改变、在体动物模型中相关功能的变化等。1、 RNA 干扰技术RNA
酵母双杂是什么?
酵母双杂交技术,它是通过利用转录激活因子GAL4的特性而建立的。GAL4由两个结构域组成,一个为N端的DNA结合域(DNAbinding domain,DBD),另一个是C端的转录激活域(active domain,AD),二者可以从核酸一级结构上分开而独立表达出有功能的结构域;当二者在物理空
什么是酵母双杂?
酵母双杂交技术,它是通过利用转录激活因子GAL4的特性而建立的。GAL4由两个结构域组成,一个为N端的DNA结合域(DNAbinding domain,DBD),另一个是C端的转录激活域(active domain,AD),二者可以从核酸一级结构上分开而独立表达出有功能的结构域;当二者在物理空
CDK7基因的结构特点和生理作用
该基因编码的蛋白是细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶(cdk)家族的成员。cdk家族成员与酿酒酵母cdc28和裂殖酵母pombe cdc2的基因产物高度相似,是细胞周期进程的重要调控因子。该蛋白与细胞周期素h和mat1形成三聚体复合物,发挥cdk激活激酶(cak)的作用。它是转录因子tfiih的重要组成部分
体内甲醛交联及染色质免疫沉淀研究DNA和蛋白质作用
染色质由真核基因组包装而成,它参与了转录、复制、重组、修复等许多以DNA一蛋白质相互作用为基础的生化过程。研究者感兴趣的是这些过程涉及到哪些特异的基因或DNA序列,有哪些蛋白质参与。尽管有许多人对染色质进行分类,就像Holde将其分为转录活性或非活性位点,但染色质构本身是动态的,并且DNA与非组蛋白
酵母基因组DNA的玻珠制备法
实验概要本实验利用玻珠制备法制备了酵母基因组DNA。主要试剂无菌水,裂解缓冲液,5mol/L NaCl,苯酚,氯仿:已戊醇(24:1),乙醇,TE缓冲液,EDTA-Sark,蛋白酶K,5mol/L醋酸铵主要设备摇床,玻璃离心管,台式离心机,玻珠,振荡器,P-1000移液器,1.5ml离心管实验步骤1
酵母菌基因组DNA的提取实验
基本方案 实验材料 酵母菌 试剂、试剂盒
酵母菌基因组DNA的提取实验
实验材料 酵母菌试剂、试剂盒 SE缓冲液山梨醇EDTA溶菌酶PVP蛋白酶K缓冲液 Tris仪器、耗材 高速冷冻离心机台式离心机恒温水浴低温冰箱冷冻真空干燥器取液器电泳仪水平电泳槽紫外观测仪实验步骤 1. 1.5 ml 对数生长期细菌细胞。2. 离心,12 000 rpm,1-2 min。3.
克隆化酵母DNA的操作实验——基因置换技术
实验材料酵母实验步骤一、整合性破坏1. 将基因的内部片段亚克隆到YIP载体。2. 在此内部片段中将质粒线性化。3. 继续整合性转化步骤3(见基本方案1)。二、基因破坏一步法1. 将合适的选择性基因亚克隆到目的基因上,必要时,可在亚克隆的同时引入一个缺失。2. 采用合适的限制性位点,从步骤1
酵母双杂交技术及其在蛋白质组研究中的应用
作为后基因组时代出现的新兴研究领域之一, 蛋白质组学(proteomics)正受到越来越多的关注。 蛋白质组学的研究目标是对机体或细胞的所有蛋白质进行鉴定和结构功能分析。 蛋白质组学的研究不局限任何特定的方法。 高分辨率的蛋白质分离技术如二维凝胶电泳和高效液相层析, 经典的蛋白质鉴定方法如
酵母DNA微量制备
实验概要本实验介绍了分别从40ml和5ml酵母培养液中制备酵母DNA的操作流程。实验步骤1. 酵母DNA微量制备(40ml) 1) 在125ml三角瓶中用40ml YPD培养液在30℃条件下培养细胞达最大生长量(过夜)。 2) 将上述培养物移入螺盖离心管,用医用离心机或Sorvall SS-
酵母双杂交技术及其在蛋白质组研究中的应用
作为后基因组时代出现的新兴研究领域之一, 蛋白质组学(proteomics)正受到越来越多的关注。 蛋白质组学的研究目标是对机体或细胞的所有蛋白质进行鉴定和结构功能分析。 蛋白质组学的研究不局限任何特定的方法。 高分辨率的蛋白质分离技术如二维凝胶电泳和高效液相层析, 经典的蛋白质鉴定方法如氨
BLT小课堂丨植物蛋白互作技术(一)
植物蛋白互作技术我们的世界物种多种多样,而与我们人类生存关系最密切的就是植物。随着时间的推移与科技的进步,人类在逐步揭示自身基因真相的同时,也在不断探寻植物基因的种种功能。其中,蛋白质是植物生命活动的主要承担者。因此,在植物学相关研究中,蛋白质之间的相互作用是研究的重要基础和手段。目前,研究蛋白质-
酵母双杂交技术及其在蛋白质组研究中的应用
摘要 蛋白质组学是在后基因组时代出现的一个新兴的研究领域, 它的主要任务是识别鉴定细胞、组织或机体的全部蛋白质, 并分析蛋白质的功能及其模式。 因此, 揭示蛋白质组中蛋白质间的相互作用关系也是蛋白质组学的重要内容之一。 酵母双杂交技术是用来检测蛋白质间是否相互作用的一个非常有效的手段。 该技术在酵