多臂老虎机助力无序蛋白药物虚拟筛选

最近,北京大学化学与分子工程学院的刘志荣教授课题组将多臂老虎机算法应用于天然无序蛋白质的药物设计问题,大大加速了基于构象系综的配体虚拟筛选过程,相关研究成果发表在Phys. Chem. Chem. Phys. (2021, 23, 6800-6806)上。 一个人在成长过程中会遇到各种各样的选择问题,如一些人生规划的抉择:上哪所大学,学什么专业,去哪家公司,等等。再如我们进入一家电玩城,那里摆着一排老虎机,虽然外表一模一样,但是每个老虎机吐钱的概率却不一样,作为一名资深玩家应该选择摇动哪台老虎机呢(图1)?这些选择问题有没有什么科学的办法来解决呢?答案是:有!而且是非常科学的办法,那就是强化学习中的多臂老虎机算法。该算法可以科学地推荐收益最大的方案,而且能够应用于许多领域,如:一种新疾病(如新冠),如何尝试各种治疗方法,来尽快治愈病人?一个新产品,如何调整定价,来获得最大收入?一个新闻稿,如何尝试推荐,来获得最多总点击次数......阅读全文

迄今最精确宇宙虚拟形象揭示

芬兰赫尔辛基大学领导的一个国际研究团队的科学家使用计算机模拟制作了迄今最大、最精确的3D宇宙模拟图,展示了自大爆炸以来宇宙的整个演化过程,它能帮助天文学家像探索地球一样探索宇宙。研究团队表示,该模拟与标准宇宙学模型非常吻合,从而增加了“冷暗物质”存在的证据。研究结果发表在近日的《皇家天文

迄今最精确宇宙虚拟形象揭示

芬兰赫尔辛基大学领导的一个国际研究团队的科学家使用计算机模拟制作了迄今最大、最精确的3D宇宙模拟图,展示了自大爆炸以来宇宙的整个演化过程,它能帮助天文学家像探索地球一样探索宇宙。研究团队表示,该模拟与标准宇宙学模型非常吻合,从而增加了“冷暗物质”存在的证据。研究结果发表在近日的《皇家天文学会月刊》上

提高种子发芽的虚拟环境

在外面的环境中有很多的变量,对种子进行发芽或者是其他的一些时候,大自然环境中的变量直接影响着测量结果,通常这些时候我们就要借助一个变量比较少的空间来进行测量,我们可以使用人工气候箱或者是智能人工气候箱来进行操作。这款人工气候箱是由我 公司自行研制的FPID控制模式的智能微电脑人工气候室控制系统,具有

“虚拟管道”解压中国天然气

  近日,GE石油天然气集团宣布与石油天然气、环保与汽车设备制造商耐德公司合作。耐德将在未来三年内采购260套CNG In A Box系统。   在GE石油天然气集团非常规天然气解决方案总经理Ujjwal Kumar看来,这一系统将缓解中国因天然气管道的局限带来的压力。   据了解,CNG In

虚拟现实技术或可帮助减肥

  锻炼、减肥食品、减肥药……当今,人们不断尝试新方法减轻体重。美国研究人员提出,如果用虚拟现实技术塑造一个形似自己的形象来“示范”,也许有助于人们在现实中减肥。   此前研究曾发现,人们观看一个类似于自身的虚拟人物在跑步机上跑步,更有可能在第二天进行锻炼。美国乔治·华盛顿大学副教授梅利莎·纳波利

超均匀无序波导和近红外硅光子学器件

  近日,来自美国和英国的一个联合研究小组的研究人员们推出了超均匀无序平台实现近红外(NIR)光子设备来创建、探测和操纵光。 他们在一个绝缘体上的硅(SOI)平台上建造了这个装置,以演示在一个不受晶体对称性约束的灵活的硅集成电路结构的功能。   科学家们报告了被动器件元件的结果,包括波导和谐振器与传

Countstar®-FL在抗体亲和力实验中的应用

抗体是自然产生用于帮助免疫系统抵御细胞内外侵害的免疫球蛋白。免疫荧光法测定细胞水平的抗体亲和力大小是评价抗体效果非常重要的指标,当前主要的测定方法是利用流式细胞仪以实现相对定量。而Countstar® FL可通过间接免疫荧光法检测不同抗原抗体反应呈现的平均荧光强度直接定量评价抗体亲和力大小,同时也可

毛细管电泳SELEX-技术(CESELEX)技术筛选适配体的介绍

  不同组分间的荷质比存在一定差异,导致物质的电泳迁移率有所不同,从而实现不同组分的分离。CE-SELEX 能在2-4轮内实现高亲和力适配体的筛选,常被用于筛选蛋白质、脂多糖、多肽等大分子物质。Yang等首次利用 CE-SELEX 实现了对小分子物质甲基吗啉的适配体的筛选,经过3轮筛选后获得了8条高

震动筛选机的筛选范围广

  震动筛选机筛选:任何颗粒、粉末、粘液一定范围内均可筛选。筛分最细至500目或O028rrlm,过滤最小可至5微米。分级筛选,可筛一至五层筛网,能同时进行二至六个等级的分选或过滤。

谷物筛选器的筛选原理是什么?

    说到筛选其实我们都不会太陌生,其实它就是根据物料粒度的不同,利用一层或数层静止的或运动的筛面对物料进行分选的方法。在种子检验领域,筛选仪器的代表就是谷物筛选器,它的作用就是用于检验颗粒粮食、油料试样的含杂率及大米中、糠粉含量,由于这些检测指标与谷物的品质息息相关,因此如果要确定谷物的品质等级

SLAS-2013分会:通过筛选获得新生物学作用和疾病靶点

  2013年6月6日,实验室自动化与筛选协会2013亚洲会展在上海金茂君悦大酒店盛大开幕,国内外知名药企、生物医学研究专家、学者等应邀参会。“通过筛选获得崭新生物学作用机制和疾病靶点”分论坛于6月6日上午在A厅举行,由中国科学院微生物研究所副研究员代焕琴博士、哈佛医学院副教授Gil Alter

适配体的筛选方法

适配体靶标范围广,靶标的大小与可溶性均不同,因此应用 SELEX 技术筛选核酸适配体可以采用不同的具体操作方法。离心沉淀法常用于针对细胞、细菌与病毒的适配体筛选,固相吸附与洗脱技术可以用于可溶性小分子的适配体筛选。适配体筛选的具体方法包括以下几个方面。基于不同固定介质的筛选方法。硝酸纤维素膜过滤法是

适配体的筛选方法

适配体靶标范围广,靶标的大小与可溶性均不同,因此应用 SELEX 技术筛选核酸适配体可以采用不同的具体操作方法。离心沉淀法常用于针对细胞、细菌与病毒的适配体筛选,固相吸附与洗脱技术可以用于可溶性小分子的适配体筛选。适配体筛选的具体方法包括以下几个方面。基于不同固定介质的筛选方法。硝酸纤维素膜过滤法是

适配体的筛选方法

适配体靶标范围广,靶标的大小与可溶性均不同,因此应用 SELEX 技术筛选核酸适配体可以采用不同的具体操作方法。离心沉淀法常用于针对细胞、细菌与病毒的适配体筛选,固相吸附与洗脱技术可以用于可溶性小分子的适配体筛选。适配体筛选的具体方法包括以下几个方面。基于不同固定介质的筛选方法。硝酸纤维素膜过滤法是

血清素化显著增加了WDR5对组蛋白H3的结合亲和力

  组蛋白 H3Q5 (H3Q5ser) 的血清素化是最近发现的组蛋白翻译后修饰,在神经元细胞分化过程中作为与 H3K4me3 协同作用的基因激活的许可标记。然而,任何特异性识别 H3Q5ser 的蛋白质仍然未知。  2021年6月18日,中国科学技术大学臧建业,张璇及上海交通大学Mo Xi共同通讯

深圳市虚拟联合会实验室落成南山虚拟大学园产业化基地

深圳市虚拟现实产业联合会实验室新址:深圳市粤兴三道2号深圳虚拟大学园产业化基地二楼A205&A206由深圳北航新兴产业技术研究院和深圳市虚拟现实产业联合会共建的深圳北航空地信息与虚拟现实实验室,日前落成于深圳市粤兴三道2号深圳虚拟大学园产业化基地二楼A205&A206。深圳市虚拟现实产业联合会MR剧

中国科大筛选出特异针对点突变蛋白的适配体

  近日,中国科学技术大学教授单革实验室发明了一种新的筛选方法,可筛选出能特异针对具有细微改变(比如单氨基酸残基突变)蛋白质的核酸(RNA)适配体。该研究成果发表在7月27日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)上,论文第一作者为博士陈亮。   RNA适配体是人工合成及筛选出的能特异结合小分子、蛋白质

三聚氰胺掺假蛋白食品的分析筛选试验

三聚氰胺是一种富含氮工业化学品,有多种用途,最常见的是用于制造三聚氰胺树脂——一种非常耐用的聚合物。在2007年春季北美地区,自从有报道表明出现在小麦麸质中的三聚氰胺可能引起宠物猫和狗的肾衰竭之后[1],三聚氰胺这一名字很快被人们所知。进一步的研究结果令科学家们相信就是这些三聚氰胺及其类似物—

液相法筛选cDNA表达文库中RNA结合蛋白实验

实验方法原理 将 cDNA 文库表达的蛋白固定于硝酸纤维素膜或尼龙膜上,然后用标记的 RNA 对其进行筛选的方法是筛选 RNA 结合蛋白研究中最常用的技术。实验材料 TY试剂、试剂盒 储存液溶菌酶干粉细菌裂解缓冲液甘油水溶液实验步骤 一、材料与设备1. 2X TY:16 g 蛋白胨,10 g 酵母提

中国科大筛选出特异针对点突变蛋白的适配体

   近日,中国科学技术大学生命科学学院单革教授实验室发明了一种新的筛选方法,从而筛选出能特异针对具有细微改变(比如单氨基酸残基突变)蛋白质的核酸(RNA)适配体。该研究成果于7月27日发表在《美国科学院院刊》(PNAS)上。   RNA适配体是人工合成及筛选出的能特异结合小分子、蛋白质,甚至完整细

液相法筛选cDNA表达文库中RNA结合蛋白实验

            实验方法原理 将 cDNA 文库表达的蛋白固定于硝酸纤维素膜或尼龙膜上,然后用标记的 RNA 对其进行筛选的方法是筛选 RNA 结合蛋白研究中最常用的技术。 实验材料

液相法筛选cDNA表达文库中RNA结合蛋白实验

将 cDNA 文库表达的蛋白固定于硝酸纤维素膜或尼龙膜上,然后用标记的 RNA 对其进行筛选的方法是筛选 RNA 结合蛋白研究中最常用的技术。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理将 cDNA 文库表达的蛋白固定于硝酸纤维素膜或尼龙膜上,然后用标记的 RNA 对其进行筛选的方法

脂筏角度的相关内容介绍

  膜蛋白可以分为三类:  ①存在于脂筏中的蛋白质;包括糖磷脂酰肌醇锚定蛋白(GPI anchored protein),某些跨膜蛋白,Hedgehog蛋白,双乙酰化蛋白(doubly acylated protein)如:非受体酪氨酸激酶Src、G蛋白的Gα亚基、血管内皮细胞的一氧化氮合酶(NOS

电动筛选器与谷物筛选器的区别

谷物筛选器和电动筛选器都是筛选器,用于粮食作物的筛选,包括种子的筛选。在育种、品质鉴定中都有非常大的作用。但是,电动筛选器和电动筛选器又是不同的,他们的运行机制也不同,但是功能却相似,都是为谷物筛选而准备的。下面我们就具体来介绍下电动筛选器和谷物筛选器。电动筛选器有DSX型电动筛选器,是根据GB54

Discovery-Studio——全方位抗体模拟计算平台

与小分子药物相比,生物疗法提供了一系列独特的益处。这使得以抗体和其他生物治疗方式(如双特异性抗体)为中心的研发项目大幅增加。然而,这些项目还必须克服小分子药物在安全性和药代动力学方面所面临的类似挑战。高免疫原性和低溶解度是影响抗体药物开发和疗效的重要因素。Discovery Studio从抗体序列出

无序、粗放开发导致中国海岛消失问题逐年加剧

  记者21日从国家海洋局获悉,中国908专项海岛海岸带调查已全面完成,调查研究发现在中国海岛开发利用过程中存在着无序、粗放式开发,以及由人类开发活动(围填海、挖沙、炸岛)导致海岛消失等问题,并有逐年加剧的趋势。  据悉,908专项海岛海岸带调查工作于2005年全面展开,采

量子相变的无序算符标度行为研究获重要进展

中山大学物理学院教授姚道新团队与合作者在量子相变的无序算符标度行为研究中取得重要进展,他们在国际上首次提出了无序算符可以用来探测边界态和边界的临界行为,并分析了其标度行为。相关成果于5月17日发表在《物理评论快报》(Physical Review Letters),并获得编辑推荐。量子相变一直是凝聚

有机无序体系的量子电子液体描述研究中获进展

  由于多种无序因素的影响,有机固体中电子传输的物理图像一直存在争议。近年来,“导电高聚物是否可被描述为一维拉廷格液体,其在低温下的非线性输运是否由拉廷格液体机制所主导”的话题受到学界关注,其由诺贝尔化学奖得主、导电高聚物之父阿兰·黑格提出(Nat. Mater. 8, 572(2009)),至今仍

物理所实现磁场对氢键无序有序相变的调控

  氢键是一种以氢原子为媒介的化学键,广泛存在于气态、液态和固态物质中。在一些含有氢键的晶体中,随着温度的降低,热涨落被抑制,氢键集体发生动态无序到静态有序的相变,同时伴随着晶体结构和对称性的变化,并可能产生铁电或反铁电有序。通常,氢键无序-有序的相变过程对外加磁场不敏感,因此,人们难以利用磁场来有

亲和素和生物素为什么亲和力最高

生物素容易与蛋白质和核酸类等生物大分子结合,形成的生物素衍生物,不仅保持了大分子物质的原有生物活性,而且比恬度高,具多价性。此外,每个亲和素分子有四个生物素结合部位,可同时以多价形式结合生物素化的大分子衍生物和标记物。因此,BAS具有多级放大作用,使其在应用时可极大地提高检测方法的灵敏度。特异性亲和