08年度盘点：颠覆经典microRNA理论
【编者按：非编码RNA（non-coding RNA）就像机器猫的百宝袋一样，慢慢挖掘发现很多RNA都出乎意料，具有重要的功能和作用，其中最热门的研究焦点是microRNA的研究，今年关于microRNA的研究取得了有意义的进展，发现了microRNA新的作用靶位，颠覆传统的理论体系。】 经典microRNA理论体系 microRNA是细胞内源性的一种非编码的RNA，有microRNA基因表达出最初的pri-miRNA分子，在细胞核中转录的较大的pri-miRNA，经由Drosha（一种RNAse III酶）和Pasha（含有双链RNA结合区域）加工成为单链pre-miRNA；接着，发卡状、部分互补的单链pre-miRNA在细胞核中被Dicer1（一种RNAse）酶切割成22nt的miRNA。 成熟的microRNA能与RISC形成复合体（利用AGO蛋白家族成员为AGO1），接着与靶标mRNA发生不完全结合，并且结合的位......阅读全文
MicroRNA－Expression－Profiling－by－Bead－Array－3
Table 2 Modulation of microRNA expression by IFNα—4 and 24 h after stimulation ControlInterferon-alpha treated4 h24 h4 h24 haME-15HuH7CHFME-15HuH7CHFM
研究揭示microRNA定量调控规律
将系统生物学建模分析与合成生物学实验相结合解析microRNA 定量调控规律。 日前，清华大学的汪小我、谢震研究组，通过合成与系统生物学方法揭示microRNA定量调控规律。相关成果发布在《美国科学院院刊》上。 microRNA是一类短的非编码RNA，通过与靶RNA结合抑制靶基因表达，在动植物中
线粒体microRNA成像研究获进展
近日，国家纳米科学中心研究员李乐乐课题组在线粒体microRNA成像研究中取得重要进展。相关研究成果以Spatially Selective Imaging of Mitochondrial MicroRNAs via Optically Programmable Strand Displace
小分子RNA——microRNA综述(2)
未来要解决的问题miRNAs在多个物种中广泛被发现，而且在进化上高度保守。这些“小玩意儿”留给我们一大堆谜团：miRNA的确切功能是什么？它的目标靶是什么？作用机制是什么？也许需要对植物或者线虫的基因组进行miRNAs突变株的筛选，在果蝇中可以用targeted-disruption缺失miRNA序
小分子RNA——microRNA综述(1)
RNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”，但越来越多的证据清楚的表明，RNA在生命的进程中扮演的角色远比我们早前设想的更为重要。RNA 干扰（RNA interference）的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识，更因为可以简化/替代基因敲除而成为研究基因功能的有
microRNA的肿瘤抑制因子角色
美国南加州大学的研究人员报道说，一种新的方法通过活化癌细胞基因组中保护性的microRNA的表达，从而使致癌基因的表达水平显著降低。这篇发表在6月的Cancer Cell杂志上的文章证明已知能调节基因表达的制剂还能够影响调节性的RNA。这种调节性的RNA即为microRNA，它能充当正常细胞中的肿瘤
MicroRNA－Expression－Profiling－by－Bead－Array－4
Bead-array-based microRNA detection technology, including the bio-statistic analysis, is currently not well established or widely used and we have app
从体液中高效提取microRNA
谈到microRNA(miRNA)的提取，大部分试剂盒都是针对哺乳动物细胞和组织，血液的也有，但针对体液的产品，至今好像仍是空白。为此，丹麦 Exiqon公司近日推出了miRCURY™ RNA Isolation Kit C Biofluids，能够从血清、血浆、尿液及其他体液中提取小分
MicroRNA－Expression－Profiling－by－Bead－Array－2
Materials and MethodsCell Culture, Interferon Treatment, and RNA PrecipitationMelanoma cells (ME-15) were cultured in RPMI 1640 with L-Glutamine suppl
如何查找microrna的前体
在NCBI主页输入要查找的miRNA的名称，all database中选择GENE；在搜索结果中选择目的miRNA，在NCBI reference sequences（RefSeq）栏中点击目的miRNA的ID号即转到序列，还可以通过链接到UCSC、miRBase查找。
MicroRNA(miRNA)荧光定量PCR原理
一、什么是miRNA?MicroRNAs (miRNAs)是一种大小约21—23个碱基的单链小分子RNA，是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成，不同于siRNA（双链）但是和siRNA密切相关。据推测，这些非编码小分子RNA（miRNAs）参与调控基
Nucleic－Acids－Research发布最全面的microRNA数据库
基因是蛋白质的蓝图，而microRNA可以帮助细胞决定是否要根据这些蓝图制造蛋白。研究者们常常会面临这样的问题：某个与疾病有关的基因受到哪些microRNA的调控？或者，患者体内发现的某种microRNA负责调控什么基因？这些问题的答案，可以帮助医生和研究者们操纵机体中的致病蛋白水平（尤其是癌症
双荧光素酶报告基因检测（二）
双荧光素酶报告基因检测（二）双荧光素酶实验通常被用来评估miRNA是否与其潜在的靶基因发生相互作用。实验中，预测的miRNA靶标基因的3’-UTR序列被克隆到含有萤火虫荧光素酶的报告基因载体的3’-UTR位置。如果miRNA与插入到质粒中的目标序列发生结合，miRNA将通过抑制该序列的翻译来降低萤火
Cancer－Cell：致癌突变的关键执行者
科学家们发现，肠癌中的许多重要致癌基因都通过一种microRNA起作用，这一核心分子将成为相关药物开发的关键。文章于四月十四日发表在Cancer Cell杂志上。研究指出，靶标这种microRNA的药物可以同时阻断多个致癌突变的影响，此外这种分子的水平还可以帮助人们预测肠癌的侵袭性。
什么是靶标发现技术
靶标发现技术靶标的发现对发展创新药物、生物诊断和生物治疗技术具有重要意义。重点研究生理和病理过程中关键基因功能及其调控网络的规模化识别，突破疾病相关基因的功能识别、表达调控及靶标筛查和确证技术，“从基因到药物”的新药创制技术。简单来说就是一种准确定位致病基因并通过对该基因的修复达到治疗疾病的目的的技
促进ECG1/S细胞周期转变和增殖－加强肿瘤内皮细胞作用
来自北卡罗来纳大学Lineberger综合癌症中心研究人员使用整合的生物信息学方法，发现作为RNA结合蛋白（RBP）的QKI蛋白是miR-200b内皮靶标，其在肺癌肿瘤微环境中的研究尚未得到详尽的研究。 此次，由Chad V. Pecot博士领导的研究团队证实， QKI通过稳定细胞周期蛋白D
曹雪涛小组发现人肝癌预后判断和治疗新靶标
为进一步研究mRNA在肝脏生理和肝脏疾病中的作用奠定了基础 最新一期(当地时间2月15日)《癌细胞》(Cancer Cell)杂志发表了中国工程院院士、医学免疫学国家重点实验室主任曹雪涛课题组及其合作者的研究论文，报道了其通过深度测序技术进行人正常肝脏、病毒性肝炎肝脏、肝硬化肝脏和人肝癌m
中国医学科学院PNAS肿瘤研究新成果
近日来自中国医学科学院和清华大学的研究人员在新研究中揭示了神经胶质瘤(Gliomas)的病因分子机制，证实cAMP反应元件结合蛋白(CREB) 通过调控致癌microRNA-23a的表达促进了神经胶质瘤形成。相关论文发表在《美国科学院院刊》(PNAS)上。 来自中国医学科学院的彭小忠(
Nature子刊：高效靶标肿瘤的新型载体
布莱根妇女医院（Brigham and Women's Hospital）的研究人员开发了一种有效递送基因疗法的新载体。他们将这一技术用于三阴乳腺癌的临床前模型，使肿瘤缩小了近90%。这项研究发表在十二月七日的Nature Materials杂志上。 乳腺癌是女性中最常见、也最严重的恶性肿瘤之
BMC－Genomics:－Let7b调控矮脚鸡的骨骼肌生长和脂肪沉积
生长激素受体（Growth Hormone Receptor, GHR）基因的一个缺失突变将抑制矮脚鸡的骨骼肌生长和脂肪沉积。华南农业大学李玉谷教授和张细权教授领衔的课题组从miRNA角度入手，分析了miRNA调控GHR表达进而影响骨骼肌生长和脂肪沉积的机制。这一研究成果于近期发表于BMC Ge
中国农大PLOS解析脱发分子机制
今年三月份，中国农业大学生物学院农业生物技术国家重点实验室的于政权博士，与美国宾夕法尼亚大学的研究人员合作，发现了结肠癌的一个新元凶——一种称为 MSI2的蛋白质。他们的研究结果，为结直肠癌的干预治疗提供了新靶点，并增强了我们对于癌症发生、发展复杂性的认识。这项结果发表在国际知名期刊《Natur
科研人员开发内源基因非编码区定向进化新技术
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517501.shtm近日，中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队开发了核酸酶LbCas12a介导的内源基因非编码区定向进化技术。相关研究成果发表在《植物通讯 (Plant Comm
基因组密码被解锁：深度学习模型破解非编码区奥秘
人类基因组中超98%的遗传变异位于非编码区，这些变异通过调控染色质可及性、三维构象、剪接加工等多种分子机制影响基因表达，最终导致疾病发生。由于调控机制的复杂性和细胞类型特异性，目前解读非编码变异的分子效应仍是重大挑战。现有深度学习模型在预测功能基因组特征时，往往在输入序列长度与预测分辨率之间难以兼顾
MicroRNA是牛皮癣背后原因？
瑞典卡罗琳斯卡医科大学的一个研究组首次证实microRNA、小RNA分子可能在皮肤炎症如牛皮癣和异位性皮炎（atopic-eczema）发生过程中起到关键作用。该研究组由Mona Ståhle教授领导。 MicroRNA是一种能够调节基因表达的小RNA分子，并且通过作用于不同蛋白质和皮肤和免疫细胞
Gastroenterology：microRNA调节肠道通透性
肠易激综合征（IBS）是一组持续或间歇发作，以腹痛、腹胀、排便习惯和（或）大便性状改变为临床表现的肠道功能紊乱性疾病。一些患有腹泻型肠易激综合征（IBS-D）的病人伴随肠道通透性增高的现象，导致其出现腹泻和腹部疼痛的症状。已有的研究表明，MicroRNA -29（miR-29）能调节IBS-D病
JCI：应用FISH技术检测肿瘤microRNA
霍华德•休斯医学研究所(HHMI)的研究人员通过微调荧光探针的设计以及RNA固定技术，开发出一种检测和定量肿瘤活检样本中microRNA分子的方法。这种新的荧光原位杂交(FISH)技术实现了肿瘤类型的鉴定。《The Journal of Clinical Investigation》杂志近日
microRNA－RTPCR实验方法
Stem-loop实时定量RT PCR传统实时定量RT PCR只能检测到miRNA前体，而Stem-loop实时定量RT PCR技术可以解决这一问题。Stem loop实时定量RT PCR是一项高特异度、敏感度的检测miRNA表达的实验技术，包括设计具有茎环（stem loop）结构的反
Detection－of－MicroRNA－Heterogeneity－in－Single－Cells－Using－an－Automated
Introduction MicroRNA (miRNAs) are short (18–24 nucleotides), non-coding RNAs that regulate gene expression by both disrupting messenger RNA (mRNA
线粒体microRNA成像研究取得重要进展
近日，国家纳米科学中心研究员李乐乐课题组在线粒体microRNA成像研究中取得重要进展。相关研究成果以Spatially Selective Imaging of Mitochondrial MicroRNAs via Optically Programmable Strand Displace
miRNA的特征、功能及识别方法等详解（三）
2) miRNA的靶基因预测方法 miRNA的研究意义之重大是毋庸置疑的。然而，与新的miRNA的频频发现相比，miRNA的功能研究相对缓慢。到目前为止，在发现的4449多个miRNA中，确定功能的miRNA仅有几十个。导致miRNA功能研究进展缓慢的非常重要的原因是miRNA的作用靶标难以确定。事