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PCR后测序结果怎样分析

首先,看测序峰图,如果结果的彩图显示峰型是尖锐单一的,碱基所对应的编码是一致的,那么可以判断序列是可以使用的.如果出现双峰,信号中断等异常现象,那么需要重新制备或者克隆后再测序.其次,将PCR产物在NCBI上blast,看是否与你预期想要的片段符合,如果是匹配度一致,那么可以进行下一步,例如克隆,表达等.如果是匹配度不高,那么建议重新制备,最好是采用touchdown或巢式PCR等方法,提高产物的特异性后再扩增测序.另外,如果是做SNP分析的,那么需要你通过看测序彩图,找出相应的突变杂合位点.......阅读全文

Troubleshooting for PCR and multiplex PCR

Troubleshooting discussion is based on the PCR protocol as described in the table below. All reactions are run for 30 cycles. COMPONENT VO

PCR简介/PCR仪

PCR的要素基本的PCR须具备PCR仪图册1.要被复制的DNA模板 Template2.界定复制范围两端的引物Primers.3.DNA聚合酶Taq. Polymearse4.合成的原料(四种脱氧核苷酸)及水。 PCR仪工作原理利用升温使DNA变性,在聚合酶的作用下使单链复制成双链,进而达到基因复制

多重PCR(Multiplex PCR)

一般PCR仅应用一对引物,通过PCR扩增产生一个核酸片段,主要用于单一致病因子等的鉴定.多重PCR(multiplex PCR),又称多重引物PCR或复合PCR,它是在同一PCR反应体系里加上二对以上引物,同时扩增出多个核酸片段的PCR反应,其反应原理,反应试剂和操作过程与一般PCR相同.    多

重叠PCR—overlap PCR

1、简介 重叠PCR也是基本的PCR原理:变性-退火-延伸。不同的是在重叠PCR过程是两个或者几个片段重叠延伸之后,再进行指数扩增的PCR过程。  2、基本原理*步:PCR产生两个或者几个片段,这几个片段之间必须有重叠区。 第二步:以两个片段为例,见上图,*步产生的两个片段,A D链之间有互补,B

多重PCR(Multiplex PCR)

一般PCR仅应用一对引物,通过PCR扩增产生一个核酸片段,主要用于单一致病因子等的鉴定.多重PCR(multiplex PCR),又称多重引物PCR或复合PCR,它是在同一PCR反应体系里加上二对以上引物,同时扩增出多个核酸片段的PCR反应,其反应原理,反应试剂和操作过程与一般PCR相同.    多

普通PCR梯度PCR 原位PCR 荧光定量PCR仪的区别

  普通PCR仪:   一般把一次PCR扩增只能运行一个特定退火温度的PCR仪,称之为普通PCR仪,也就是传统的PCR仪。如果要用它做不同的退火温度则需要多次运行。如;(ABI 2720)   梯度PCR仪:   一次性PCR扩增可以设置一系列不同的退火温度条件(通常12种温度梯度)的称

反转录PCR(RT-PCR, Reversed Transcript PCR)

1 原理   RT—PCR是一种将cDNA合成与PCR技术结合分析基因表达的快速灵敏的方法,主要用于对表达信息进行检测或定量分析,还可以用来检测基因表达差异而不必构建cDNA文库克隆cDNA。RT-PCR的模板可以为总RNA或poly(A)+选择性RNA。逆转录反应可以使用逆转录酶,以随机引物、ol

反向PCR (inverse-PCR)

            实验方法原理 反向PCR可用于研究与已知DNA区段相连接的未知染色体序列,因此又可称为染色体缓移或染色体步移。这时选择的引物虽然与核心DNA区两末端序列互补,但两引物3’端是相互反向的。扩增前先用限制性内切酶酶切样品DNA

反向PCR (inverse-PCR)

利用反向PCR可对未知序列扩增后进行分析,探索邻接已知DNA片段的序列,并可将仅知部分序列的全长cDNA进行分子克隆,建立全长的DNA探针。可用于:(1)基因游走研究;(2)转位因子研究;(3)已知序列DNA旁侧病毒整合位点分析等研究。 实验方法原理 反向PCR可用于研究与已知DN

直接原位PCR(In situ PCR)

原位PCR是原位杂交细胞定位和PCR的高灵敏度相结合的技术,使得靶基因检测有了极大的改进。此技术是在细胞(爬片、甩片或涂片)或组织(石蜡、冰冻切片)上直接对靶基因片段进行扩增,通过掺入标记基团直接显色或结合原位杂交进行检测的方法。 一、组织切片和细胞样品的制备 试剂与配置 10%福尔马林;二