Nature：只需要几滴血，研究人员就可以找到治疗癌症方法
今天发表在《Nature》杂志上的一项研究概述了这项技术。这项史无前例的血液测试分析了转移性癌症进入血液的DNA，即循环肿瘤DNA (ctDNA)。通过对ctDNA的整个基因组进行测序，该测试揭示了每个患者癌症的独特特征，为医生提供了新的工具来制定更个性化的治疗计划。“只需要几滴血，我们就可以发现一个人整体疾病的关键信息，以及如何最好地管理他们的癌症，”Alexander W. Wyatt博士说，他是不列颠哥伦比亚大学泌尿科学助理教授，也是温哥华沿海健康研究所(VCHRI)和BC癌症研究科学家。“这项测试有可能帮助临床医生选择更好的量身定制的治疗方案，并更有效地发现治疗耐药性，让临床医生根据需要调整临床护理。”在这项研究中，研究人员检查了从转移性前列腺癌患者身上收集的ctDNA样本。转移性癌症——已经扩散到身体其他器官的癌症——通常是无法治愈的，化疗和新的靶向疗法可能对所有患者都有效。由于活检的侵袭性和并发症的高风险，很少进行活......阅读全文
Nat－Genet：揭秘线粒体基因组奥秘有望开发多种癌症新疗法
近日，一项刊登在国际杂志Nature Genetics上的研究报告中，来自德克萨斯大学安德森癌症中心等机构的科学家们对细胞的能量工程—线粒体进行了深入研究，由于线粒体在肿瘤发生中扮演着关键角色，因此深入研究线粒体的基因组对于揭示肿瘤发生机制及开发新型疗法至关重要。图片来源：CC0 Public
“寄生虫”DNA片段会破坏癌症基因组稳定性
27日的《科学》杂志发表了一项研究，揭示了人类基因组中一类可“跳跃”的DNA片段——被称为遗传“寄生虫”的LINE-1（L1）元件，如何成为破坏癌症基因组稳定性的主要力量。基因组的不稳定正是癌症演化的温床，为恶性细胞提供了更多生长、适应和逃避治疗的机会。该研究挑战了传统观点，发现了对癌症基因组有全面
－AACR：“GENIE”呼之欲出，志在共享癌症基因组临床数据
11月6日，Genomeweb报道，美国癌症研究协会（AACR）推出了一项叫做“GENIE”的国际基因组和临床数据共享项目，旨在将不同癌症中心的基因组和结果数据汇总起来。 该项目中的“GENIE”寓意Genomics（基因组学）、Evidence（证据）、Neoplasia（肿瘤）Inform
1300多名学者合作－迄今最全面癌症基因组分析完成
英国韦尔科姆基金会桑格研究所5日宣布，一个国际团队完成了迄今覆盖面最广泛的癌症全基因组分析，这有助于加深研究人员对癌症的认识，为开发出更高效的治疗方案铺平道路。这个被称为“泛癌症计划”的项目由来自37个国家的1300多名科学家合作开展，旨在研究可导致癌症的变异基因，绘制出这些基因的全图谱，桑格研
Nature子刊：非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破
近日，匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归（Elastic Net regression）的机器学习模型，从1,001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱（long noncoding RNAs, lncRNAs）与265种抗癌药物敏感性数据中，挖掘出了27
6篇Nature齐发！癌症基因组计划成果成井喷之势
除了Nature一次性发表6篇论文外，Nature Genetics杂志发表了3篇，Nature Communications发表9篇，Nature Biotechnology一篇，详细报道BioArt后续会陆续发布。文章合集网址：https://www.nature.com/collectio
大多数转移性结直肠癌在可以确诊前就已经发生转移！
斯坦福大学医学院(Stanford University School of Medicine)的研究人员对近3000名患者进行了一项研究，研究结果于近日在《Nature Genetics》杂志上，该研究显示，多达80%的移性结直肠癌在原始肿瘤超过罂粟籽大小之前可能已经扩散到身体的远端。 鉴别
饮食中的棕榈酸可增加癌症扩散风险
最新一期《自然》杂志发表一项研究，揭示了棕榈酸如何改变癌症基因组，从而增加癌症扩散的可能性。研究人员表示，他们已在开发中断这一过程的疗法，未来几年可能会开始临床试验。 癌细胞的转移或扩散仍然是癌症患者死亡的主要原因，绝大多数转移性癌症患者只能得到治疗，而不能治愈。脂肪酸是我们身体和饮食中脂肪的
Cell:组学“全景”分析推动前列腺癌精准治疗
最近来自美国UCLA的癌症研究人员开发了一组复杂的分析工具对患有转移性前列腺癌的病例进行分析，绘制了帮助前列腺癌细胞增殖和抵抗治疗的复杂基因和蛋白质网络的详细图谱。研究人员还开发了一种计算方法来分析病人个体化数据帮助每位病人选择最有效的治疗药物。 相关研究结果发表在国际学术期刊Cell上。
Cell：组学“全景”分析推动前列腺癌精准治疗
最近来自美国UCLA的癌症研究人员开发了一组复杂的分析工具对患有转移性前列腺癌的病例进行分析，绘制了帮助前列腺癌细胞增殖和抵抗治疗的复杂基因和蛋白质网络的详细图谱。研究人员还开发了一种计算方法来分析病人个体化数据帮助每位病人选择最有效的治疗药物。 相关研究结果发表在国际学术期刊Cell上。
DNA甲基化检测或可帮助预测乳腺癌复发
发表在今天《临床实验胚胎学》杂志上的新研究表明有一种简单的血液测试方法可以确定癌症侵犯其他器官如肺、骨头或大脑等疾病复发的风险。这样的测试对改善所有类型的女性乳腺癌会产生深远影响，这种疾病会影响八分之一的女性。 在研究中，翻译基因组学研究院(TGen)的研究人员确定了21 DNA甲基化热点——
CCR：“癌症登月”想要成功不应忽视蛋白组学
最近一篇发表在国际学术期刊Clinical Cancer Research上的文章指出，美国启动的癌症登月计划除了进行基因组学研究还应当靶向直接推动癌症发展的蛋白质。 巴拉克奥巴马总统在今年年初对国会发表的国情咨文中提出国家癌症登月计划。据估计明年将有10亿美元投入到该计划中，主要聚焦在免疫治
基因编辑疗法或使癌细胞永久失活
据《科学进展》杂志日前报道，以色列特拉维夫大学的一项研究证明，CRISPR/Cas9系统在治疗侵入性癌症方面非常有效，这是在寻找癌症治愈方法迈出的重要一步。 研究人员开发的一种基于脂质纳米颗粒的新型递送系统CRISPR—LNP，可专门针对癌细胞并通过基因操作将其破坏。该系统携带的一个遗传信使（信
乳腺癌耐药和转移竟存在千丝万缕的关联
原位肿瘤和转移部位肿瘤的异质性是肿瘤进展期治疗的严重障碍。转移是肿瘤的致命特征，其中在转移的级联过程中最为复杂的播散机制仍不明确。清晰的认识患者的肿瘤异质性和转移中细胞和分子机制，对个体化肿瘤治疗至关重要。由伦敦帝国理工学院和伦敦癌症研究所的科学家领导的早期研究确定了乳腺癌细胞中的遗传“转换”
应用癌症基因组学方法，发现与年龄相关的血液疾病
克隆造血是一种生物过程，在这个过程中，血液干细胞(产生多种血细胞类型的细胞群)获得了有利的突变，超过了邻近的细胞。当这种突变出现在一个特定个体2%的血细胞中时，克隆造血就被诊断出来。驱动克隆造血的有利突变处于正选择状态，就像导致细胞恶性化的癌症基因突变一样。在ICREA研究教授Núria López
定义癌症突变：破坏基因组3D相互作用的突变
在细胞中，DNA紧密地包裹在蛋白质周围，并以一种复杂的3D结构包装，我们称它们为“染色质”。染色质不仅可以保护我们的遗传物质不受损伤，而且通过调节基因组在3D空间的表达来组织整个基因组：展开呈现给细胞基因表达机器，然后再将它们卷回去。 在3D染色质结构中，一些区域被称为“拓扑关联域（TADs）
上海交大教授通过7000个癌症基因组分析找到全新靶标
来自上海交通大学医学院，德州大学健康科学中心等处的研究人员解析了33类肿瘤的7000例临床病人基因组，将识别的47,000多个突变数据映射至已发现的蛋白结构上，用以寻找各类型肿瘤全新靶标，并找到了非小细胞肺癌的全新靶标PDE10A。这一研究成果公布在AJHG杂志上，文章的通讯作者分别是上海交通大学医
分子层面鉴定遗传－儿童癌症基因组找到可用药物靶点
英国《自然》杂志1日在线发表的两篇文章，美国和欧洲科学家在基因组和分子层面上详细表征了上千例儿童癌症，这是在儿童中进行的首次泛癌症基因组分析。其结果有利于人们理解儿童癌症的起因，并有助于研发新的治疗方案。图片来源于网络 德国NCT海德堡霍普儿童癌症中心（KiTZ）的科学家团队，此次选取914名
Cell：非吸烟肺癌的基因组重排早于癌症确诊前30年
在一项新的研究中，来自韩国科学技术高级研究院（KAIST）和首尔大学等研究机构的研究人员发现早在童年和青春期发生的灾难性基因组重排可导致非吸烟者在晚年患上肺癌。这一发现发有助于解释一些与非吸烟有关的肺癌是如何产生的。相关研究结果近期发表在Cell期刊上，论文标题为“Tracing Oncogen
Nature－Genetics公布又一大规模癌症基因组分析结果
超过20个研究机构的63位研究人员公布了一项包括30,000多人血液样本的大规模研究成果，通过这项分析，研究人员确定了13种胶质瘤新遗传危险因素，这揭示了增加胶质瘤易感性的个体DNA的特殊差异，同时也首次为临床医师提供了一种能区分成胶质细胞瘤和非胶质母细胞瘤等胶质瘤类型的新方法。 这一研究成果
－Nature：癌症基因组计划宣布完成，下一步路在何方？
癌症基因组图谱计划（The Cancer Genome Atlas，TCGA）是国际癌症基因组联盟（International Cancer Genome Consortium）最大的项目。该项目于2006年启动，耗资1亿美元，旨在绘制1万个肿瘤基因组图谱。目前，来自16个国家的科学家合作完成了
国际癌症基因组联盟在中国发起四个新项目
2012年12月5日，国际癌症基因组联盟(ICGC)宣布在中国发起四个新项目，主要对结直肠癌、食道癌、肝癌和鼻咽癌的驱动基因进行检测，为实现个体化医疗奠定基础。中国是ICGC的创始成员之一，在2008年时曾经发起了胃癌基因组项目。 ICGC带领全球科学家对各种常见和罕见的癌症进行基因组图谱
北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cance
－Cell特辑：从基因组到代谢组学——癌症标记物的进展
“Cell Press Selections”是由Cell出版社推出的一份推荐文章集合手册，主要介绍某个生命科学研究领域最新的进展及突出成果。相关特辑内容包括研究论文，评论性文章以及snapshots，涉及了同一领域的方方面面，更为重要的是这些文章由赞助商赞助，可以免费获取。 癌症生物标记物是
北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human can
Nature子刊公布癌症基因组研究重要成果：新的遗传突变
在一项多达10万人（包括17,000名最常见类型的卵巢癌患者）的遗传分析研究中，研究人员确定了12种新的增加卵巢癌患病风险的遗传变异，并找到了它们与以前发表的18种变异之间的关联。 这项研究成果公布在3月27日的Nature Genetics杂志上，由OncoArray Consortium联
Cell重大成果：绘制癌症药物基因组互作景观图
在发表于7月7日《细胞》（Cell）杂志上的一项研究证实，患者来源的癌细胞系中包含存在于患者肿瘤中大多数同样的遗传改变，可以利用来了解肿瘤对新药可能产生的反应，提高开发新型个体化癌症疗法的成功率。 由来自韦尔科姆基金会桑格研究所、欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)和荷兰癌症研究所的科学家
上海交大教授通过7000个癌症基因组分析找到全新靶标
生物通报道：来自上海交通大学医学院，德州大学健康科学中心等处的研究人员解析了33类肿瘤的7000例临床病人基因组，将识别的47,000多个突变数据映射至已发现的蛋白结构上，用以寻找各类型肿瘤全新靶标，并找到了非小细胞肺癌的全新靶标PDE10A。 这一研究成果公布在AJHG杂志上，文章的通讯作者
NEJM：循环肿瘤DNA监测转移性乳腺癌潜力巨大
转移性乳腺癌的治疗需要监测肿瘤负荷以明确治疗应答，并且还需要改善生物标志物，如癌抗原15-3(CA 15-3)和循环肿瘤细胞。这类生物标志物已得到广泛研究。然而，对于乳腺癌，携带有肿瘤特异性变异的循环游离细胞DNA(循环肿瘤DNA)尚未得到充分的研究，或尚未与其他循环生物标志物进行比较。英国
转移性皮肤钙化病的检查
组织病理：皮下组织一般呈大块钙沉积，在真皮内侧通常为颗粒状和小的沉积物。梗死性坏死区，受累的血管壁钙化。苏木紫染色时钙沉积物染成深蓝色，易确诊。