dPCRvs.qPCR我该如何选择?

数字PCR(dPCR)是PCR领域的新浪潮。它的与众不同之处在于样品分液。通过微流体芯片、通道或液滴实现分液,而每个都作为单独的PCR反应,带来了出色的灵敏度。同时,也无需建立标准曲线。然而,我们究竟应不应该追赶这个新浪潮?这在很大程度上取决于你的应用和所需的灵敏度水平。何时应该选择dPCR,让我们听听专家的意见。 当你需要检测稀有事件时 美国Sangamo BioSciences公司是锌指核酸酶研究领域的先锋。它试图改造DNA结合的锌指核酸酶,从而定制基因表达,实现基因治疗。Sangamo目前正利用数字PCR平台(QX100系统,Bio-Rad),开发HIV的功能疗法。 Sangamo的资深科学家Gary Lee表示:“对于定量PCR能够给出精确答案的传统应用,那就没必要转向数字PCR。由于我们面对的是低拷贝事件,有时利用qPCR无法获得答案。数字PCR对我们跟踪患者的治疗进展很关键。”......阅读全文

提高RTPCR的灵敏度和产物长度

RT-PCR 已经成为研究者确定感兴趣的器官、组织或细胞中mRNA 转录本出现、结构和表达水平的基本方法。RT-PCR的基本步骤包括:首先对样品中出现的所有mRNA 合成一个cDNA拷贝,接着扩增感兴趣的基因。因为两个步骤中使用的反应缓冲液不能兼容,所以这两个步骤(RT 和PCR)通常分别进行。即使

提高RTPCR的灵敏度与产物长度

摘要RT-PCR 已经成为研究者确定感兴趣的器官、组织或细胞中mRNA 转录本出现、结构和表达水平的基本方法。RT-PCR的基本步骤包括:首先对样品中出现的所有mRNA 合成一个cDNA拷贝,接着扩增感兴趣的基因。因为两个步骤中使用的反应缓冲液不能兼容,所以这两个步骤(RT 和PCR)通常分别进行。

PCR技术迈入第三代-微滴式数字PCR

  你说世界变化快不快,PCR已经迈入第三代!近日,一种称为微滴式数字PCR(ddPCR™)的新技术出现在《Analytical Chemistry》杂志上,它能够确定样品中待测靶分子的绝对数目。   第一代PCR就是我们目前最常用的终点PCR技术,通过凝胶电泳获得定性的结果。风靡全球的实时定

一文知晓PCR,定量PCR与数字PCR的实验方法与选择(一)

从1985年至今的30多年时间里,PCR分析经历了三代技术的发展。第一代传统PCR技术,采用琼脂糖凝胶电泳的方法对PCR产物进行定性分析。第二代荧光定量PCR技术,通过在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号的积累实时监控PCR进程,最后用Cq值对基因进行定量分析。第三代数字PCR技术,通过将P

一文知晓PCR,定量PCR与数字PCR的实验方法与选择(二)

数字 PCR数字 PCR 是通过将样本DNA随机分布至独立的反应单元中,每个反应单元中包含或者不包含1个或多个拷贝的目标分子,所有独立的反应单元进行平行扩增后,对每个反应单元的阴性或者阳性荧光信号进行检测并进行统计学分析,就可以计算出原始样本的拷贝数,无需参考标准品或内源性对照品,也不需要标准曲

数字PCR在肠道菌群分析的应用

数字PCR技术直接计算目的序列的拷贝数,对样品中的微生物实现了绝对定量,可用于微生物检测,以便进一步研究肠道菌群的结构、功能以及数量。

数字PCR在基因表达差异研究的应用

数字PCR由于检测时完全不依赖传统的Ct值即可实现真正意义上的绝对定量,因而可以提供比实时荧光定量PCR更精确的基因差异表达研究,尤其对于那些靶基因表达差异微小的情况,如:mRNA、microRNA、lncRNAs等的表达分析;等位基因的不平衡表达;单细胞基因表达分析;外泌体核酸分子定量分析等。

数字PCR助力艾滋病疗法的开发

Bio-Rad公司于去年底推出了QX100微滴式数字PCR系统,市场反应不错。最近,Sangamo BioSciences公司的研究人员利用此系统产生了高度精确且重复的数据,离HIV功能疗法的开发又近了一步。 让我们听听Sangamo BioSciences资深科学家Gary Lee的评价。“QX

数字PCR在移植排斥监控中的应用

为了降低器官移植中移植物排斥导致的风险,数字PCR技术通过监测受体中移植器官供体的循环DNA水平来检测早期移植排斥。

数字PCR助力艾滋病疗法的开发

  Bio-Rad公司于去年底推出了QX100微滴式数字PCR系统,市场反应不错。最近,Sangamo BioSciences公司的研究人员利用此系统产生了高度精确且重复的数据,离HIV功能疗法的开发又近了一步。   让我们听听Sangamo BioSciences资深科学家Gary Le

NaicaTM-crystal-微滴芯片式数字PCR系统

   导语:数字PCR技术是基于PCR技术发展起来的核酸检测和定量的最新技术,在众多应用中,在精准医疗方面的应用尤为突出。法国Stilla Technologies公司专注于开发新一代核酸绝对定量技术,其旗下品牌Naica TM Crystal全自动微滴芯片数字PCR仪系统具有高灵敏度、高精

数字PCR在病毒临床检测中的应用

概述2015年刚成历史,2016年已在眼前。就这样,年复一年间沧海成桑田。生命科学领域,新方法层出不穷,老方法不断升级,好不热闹。也如孔子的感叹:逝者如斯夫,不舍昼夜。就拿PCR技术来说,荧光定量PCR作为一种进行基因表达分析的技术,截至目前最大的应用市场是病原微生物的核酸体外诊断。展望未来,作为q

crystal数字PCR如何实现的核酸绝对定量?

crystal数字PCR技术是一种核酸分子的绝对定量技术,原理是将PCR反应体系分配到大量微小的反应器中,在每个微反应器中包含或不包含 1 个或多个拷贝的目标核酸分子 (DNA 模板) ,进行"单分子模板"PCR 扩增。扩增结束后,通过阳性反应单元(通过终点荧光信号判断)的数目和统计学方法计

数字PCR技术更准确检测新冠病毒

  对于新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的检测,实时定量PCR一直是金标准。不过对于某些患者,qPCR的结果似乎每天都在变化,而且有不少假阴性。近期的研究表明,ddPCR检测能够减少假阴性结果,而Bio-Rad Laboratories公司也利用其微滴式数字PCR系统开发出新型冠状病毒的检测产品

数字PCR在食品安全检测的应用

食品安全日益成为一个重要的公共卫生问题, 受到社会及国家的高度重视。食源性疾病、食品原料造假、转基因食品等逐渐呈现出普遍增长的趋势。食源性疾病是指通过摄食而进入人体的有毒有害物质等致病因子所造成的疾病。比如常见的食物中毒、肠道传染病、人畜共患传染病、寄生虫病等。食源性疾患的发病率居各类疾病总发病率的

数字PCR在早期精准检验疫情的应用

  2016年,全球首例数字PCR动物疫病检测试剂研发成功,包括禽流感、禽流感H7N9、蓝耳病、高致病性美州株、猪的流行性腹泻等动物疫病检测试剂盒。此项技术的推出,将有助于在食品安全的源头及早发现疫情,尽早处理避免更大面积的传染,更好地控制漏检,减少传染人的几率;也将有助于国家建立规范化、规模化的动

数字PCR在基因型鉴定的应用

PCR也可以用于检测一个生物中是否存在某特定DNA序列,这被称为基因型鉴定。例如,基因型鉴定可通过发现样品中是否存在某种群特异性序列来判断样本的真实性。基因型鉴定还可用于法医分析判断在现场发现的DNA样品是否和嫌疑人的吻合,令凶手无处遁形。

数字PCR在-药物基因组检测的应用

  能够通过PCR技术实现药物基因组的检测,提高合理用药水平,具有通量较高,操作简单,仪器设备易普及等优点。    数字PCR冷知识:胎儿性别不是只有B超可以看出来,一只精通数字PCR的科研狗,也可以测出来。

数字PCR技术精确检测癌症基因组扩增

  来自斯坦福大学以及Bio-Rad的研究人员证实,数字PCR系统能够精确测定长期存放的癌组织样本中的癌症基因组扩增。该研究成果发表在《Translational Medicine》杂志上。   某些拷贝数变异(如基因组扩增)可能导致特定癌基因的过表达,推动癌症发展。靶定扩增的癌基因有望实现癌

数字PCR在糖尿病治疗中的应用

    数字PCR技术目前在糖尿病中的研究热点,通过定量检测非甲基化DNA的水平,对I型糖尿病β细胞死亡进行定量,从而监控病情发展。

数字PCR技术能否终结核酸检测“灰区”?

郭永(清华大学供图)目前,新冠疫情仍在全球猖狂肆虐。虽国内新冠疫情防控卓有成效,但在西安、河南、天津、北京等地仍有确诊病例出现,特别是新冠病毒接连出现了德尔塔株、奥密克戎株等变异株,无疑让严峻的防疫形势“雪上加霜”。实时荧光PCR核酸检测被认为是新冠检测的金标准,但仍有亟须解决的问题,如单基因阳性、

数字PCR技术:从液体活检走向商业临床市场

2017年12月Bio-Rad BCR-ABL基因融合ddPCR检测试剂盒获得CE-IVD 认证(产品进入欧盟境内销售的通行证),这是基于ddPCR技术第一个获批的可用于临床检测的、基于血液样本的、用于监测慢性粒细胞白血病患者疗效的诊断试剂。在上周 JP摩根健康产业大会上, Bio-Rad CE

Nacia数字PCR在基因表达分析中的应用

华盛顿大学医学院儿科和加利福尼亚大学圣地亚哥分校医学院儿科的研究人员建立了一个稳定可靠的基于RNA磁珠提取和数字PCR的方法,可从粪便样本中检测与EE(热带肠病)关联的人mRNA,灵敏度可达20拷贝GAPDH mRNA/200mg粪便样本。已有报道表明病人粪便中存在人mRNA,可作为反应病人消化道病

你想要知道的数字PCR应用及前景

 一. PCR的发展历史  PCR技术自问世以来,在遗传病、病原体、癌基因等分子诊断领域和法医鉴定等方面发挥了巨大作用。第一代 PCR在进行扩增后通过凝胶电泳进行定性分析。  随着生物分子荧光技术的发展,1992年实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,

基于EVAGREEN®方法的CRYSTAL数字PCR绝对定量检测

基于EVAGREEN®方法的CRYSTAL数字PCR绝对定量检测EvaGreen®是一种无致突变性、无细胞毒性的DNA结合染料,NaicaTM Crystal全自动微滴芯片数字PCR仪系统可兼容EvaGreen®染料进行的数字PCR实验分析。反应体系中游离的的EvaGreen®染料不发出荧光信号,但

数字PCR在肿瘤治疗的伴随诊断的应用

 常用体液来源(如血液,胸腹水,唾液及尿液等)的待检标本中的DNA,有正常脱落体细胞和病变脱落细胞两种来源,前者的量远大于后者。通过微液滴处理能在每个微液滴中有效减少正常体细胞DNA的干扰,实现肿瘤标记物的有效检测,如EGFR,ALK,ROS1,KRAS、BRAF等基因的突变检测、乳腺癌/胃癌的HE

数字PCR技术能否终结核酸检测“灰区”

郭永(清华大学供图)目前,新冠疫情仍在全球猖狂肆虐。虽国内新冠疫情防控卓有成效,但在西安、河南、天津、北京等地仍有确诊病例出现,特别是新冠病毒接连出现了德尔塔株、奥密克戎株等变异株,无疑让严峻的防疫形势“雪上加霜”。实时荧光PCR核酸检测被认为是新冠检测的金标准,但仍有亟须解决的问题,如单基因阳性、

数字PCR在甲基化含量鉴定的应用

作为表观遗传学研究中重要的一个研究方向——甲基化程度分析,现阶段有不同的方法或技术来进行研究:如传统的亚硫酸氢盐处理后的克隆测序法、抗体检测法、定量PCR检测法等受限于方法学的问题,不能获得甲基化程度的精确定量,而数字PCR系统通过对样品的微液滴处理及目标分子的绝对拷贝数定量,为甲基化程度的精确定量

数字PCR和HRM在肿瘤样本中的应用

摘要:Vogelstein和Kinzler(美国国家科学院院刊,1999年)第一次描述了Digital PCR(dPCR)的概念,一种在微量细胞群中(如原发性肿瘤组织)鉴定突变的方法。通过稀释样品DNA到一个单个分子水平,它可以把PCR自然模拟指数转化为数字信号。当PCR成功的扩增出这些单个

数字PCR在无创产前筛查的应用

 无创伤的产前诊断, 如21号染色体为3倍体的唐氏综合征、已知父母基因型的胎儿地中海贫血或胎儿遗传性耳聋基因检测等。目前无创检测标本来源主要为孕妇血液,而待检测的胎儿DNA受到母体DNA的干扰,影响了检测的准确性。数字PCR技术可以作为二代测序法的补充来进行无创伤产前诊断,从而提高工作效率、降低检测