研究利用噬菌体蛋白介导抗生素高效靶向病原菌
在细菌耐药性日益严重的全球背景下,传统抗生素的有效性正面临严峻挑战。特别是被称为ESKAPE的病原体,其强大的抗生素耐药性和毒性给全球公共卫生安全带来了前所未有的威胁。这些病原菌携带抗生素耐药基因,毒性很强,可引起危及生命的感染。更糟糕的是,过去20年中,新批准的首创抗生素数量一直在稳步减少,尤其是用于治疗革兰氏阴性病原体感染的抗生素。因此,迫切需要针对耐药菌感染的新型治疗策略,而更快、更便宜的获取方法可能是重新利用现有的抗生素。6月20日,《自然—通讯》在线发表了四川农业大学动物医学院赵兴洪/万红平团队的研究论文。为有效应对耐药菌感染的问题,该研究首创了以病原菌特异性噬菌体受体结合蛋白(RBPs)和内溶素细胞壁结合域(CBDs)作为药物递送系统靶向模块实现抗生素体内精准高效递送的新策略。研究以基因工程手段获得的肺炎克雷伯菌噬菌体RBP和金黄色葡萄球菌噬菌体内溶素CBD作为纳米药物载体的靶向模块,分别将抗菌药物精准高效递送至了肺......阅读全文
研究利用噬菌体蛋白介导抗生素高效靶向病原菌
在细菌耐药性日益严重的全球背景下,传统抗生素的有效性正面临严峻挑战。特别是被称为ESKAPE的病原体,其强大的抗生素耐药性和毒性给全球公共卫生安全带来了前所未有的威胁。这些病原菌携带抗生素耐药基因,毒性很强,可引起危及生命的感染。更糟糕的是,过去20年中,新批准的首创抗生素数量一直在稳步减少,尤其是
研究利用噬菌体蛋白介导抗生素高效靶向病原菌
在细菌耐药性日益严重的全球背景下,传统抗生素的有效性正面临严峻挑战。特别是被称为ESKAPE的病原体,其强大的抗生素耐药性和毒性给全球公共卫生安全带来了前所未有的威胁。这些病原菌携带抗生素耐药基因,毒性很强,可引起危及生命的感染。更糟糕的是,过去20年中,新批准的首创抗生素数量一直在稳步减少,尤其是
一种靶向控制噬菌体来对抗细菌的方法:噬菌体疗法
有人的地方就有江湖?微观世界其实也一样残酷。研究人员发现:假单胞菌会利用自己产生的信号分子,选择性操纵竞争菌株中的噬菌体来击败敌人。这个结果或许提示了一种靶向控制噬菌体来对抗细菌的方法:噬菌体疗法。 噬菌体仍然是人类微生物群中一个相对未知的组成部分。然而,它们可以在细菌的生命周期中发挥强大
蛋白质靶向分选
线粒体大多数线粒体蛋白被合成为含有摄取肽信号的胞质前体。胞质伴侣将前蛋白递送至线粒体膜中的通道连接受体。具有针对线粒体的前序列的前蛋白在外膜处与受体和通用输入孔(GIP)结合,统称为外膜转位酶(TOM)。然后它作为发夹环通过TOM易位。前蛋白通过膜间隙运输通过小的TIM(也充当分子伴侣)到内膜的TI
Nature-Biotechnology:噬菌体治疗方法的微生态机制
近些年,集约化农业发展中的不合理措施,如化肥农药的持续过量投入以及经济作物的单一连作等,导致土壤微生物群落结构严重失衡,生态功能急剧削弱。土壤养分周转不畅、污染难以消解、土传病害频发就是土壤微生态失衡重要证据,这些也是农业资源与环境领域亟待解决的难题。 来自南京农业大学资源与环境科学学院沈其荣
噬菌体蛋白质的结构
无尾部结构的二十面体:这种噬菌体为一个二十面体,外表由规律排列的蛋白亚单位——衣壳组成,核酸则被包裹在内部。有尾部结构的二十面体:这种噬菌体除了一个二十面体的头部外,还有由一个中空的针状结构及外鞘组成的尾部,以及尾丝和尾针组成的基部。线状体:这种噬菌体呈线状,没有明显的头部结构,而是由壳粒组成的盘旋
“专性猎杀”--“精准靶向”——噬菌体的强大之处远不止如此
噬菌体是环境中普遍存在的一类专门侵染细菌的病毒。此前,科学家对噬菌体能否抑制土壤中的病原菌不甚了解。 当地时间12月2日,《自然-生物技术》发表南京农业大学资源与环境科学学院最新研究成果。该成果揭示,噬菌体不仅可以“专性猎杀”和“精准靶向”土传青枯病的病原菌,降低其生存竞争能力;同时还能够重
人工智能推动病原菌效应蛋白功能鉴定
华东理工大学生物反应器工程全国重点实验室教授王启要团队,开发了人工智能赋能的蛋白质功能预测新方法,利用蛋白质语言模型进行效应蛋白预测鉴定,为病原菌毒力因子的大规模挖掘提供了技术平台,推动了病原菌效应蛋白的功能鉴定,为复杂的病原菌效应蛋白-宿主免疫互作机制网络的解析奠定了技术基础。相关研究近日发表
如何靶向降解促癌症蛋白?
癌症研究越来越关注于靶向作用引发疾病蛋白的疗法开发,其中研究者们对发生早期降解的蛋白进行了标记,近日发表于国际杂志Nature上的研究论文中,来自瑞士巴塞尔弗雷德里希米歇尔研究所的科学家就揭示了特殊化合物如何拦截遍在蛋白连接酶来靶向作用特殊的蛋白进行降解,该机制或为靶向降解特殊的癌症蛋白提供思路
什么是蛋白质靶向?
是蛋白质被运输到细胞内或细胞外适当目的地的生物学机制。蛋白质可以靶向细胞器的内部空间、不同的细胞内膜、质膜,或通过分泌物靶向细胞外部。蛋白质本身所含的信息指导着这一传递过程。正确排序对细胞至关重要;分类中的错误或功能障碍与多种疾病有关。
蛋白质靶向的历史
1970年,GünterBlobel进行了蛋白质跨膜转运实验。Blobel,当时是洛克菲勒大学的助理教授,在他的同事GeorgePalade的工作基础上建立起来。Palade之前已经证明,非分泌蛋白是由胞质溶胶中的游离核糖体翻译的,而分泌蛋白(通常是靶蛋白)是由与内质网结合的核糖体翻译的。当时的候选
M13-噬菌体衣壳蛋白改造在改良噬菌体展示技
M13 噬菌体衣壳蛋白改造在改良噬菌体展示技术中的应用 实验材料 羧苄青霉素 氯霉素 大肠杆菌 CJ2
靶向蛋白降解技术:“借刀”清除致病蛋白
人体就像是一台精密的仪器,任何一个零件出现问题,都有可能带来意想不到的麻烦。蛋白质就是其中一类最为重要的“零件”。很多疾病是由细胞内某种蛋白质表达失衡,特别是某种蛋白质过多表达引起的。科学家想到:如果消灭掉这些不该出现的“坏”蛋白质,疾病不就迎刃而解了吗?于是,靶向蛋白降解技术应运而生,作为一颗冉冉
细菌噬菌体蛋白质结构介绍
无尾部结构的二十面体:这种噬菌体为一个二十面体,外表由规律排列的蛋白亚单位——衣壳组成,核酸则被包裹在内部。 有尾部结构的二十面体:这种噬菌体除了一个二十面体的头部外,还有由一个中空的针状结构及外鞘组成的尾部,以及尾丝和尾针组成的基部。 线状体:这种噬菌体呈线状,没有明显的头部结构,而是由壳
噬菌体的蛋白质结构介绍
无尾部结构的二十面体:这种噬菌体为一个二十面体,外表由规律排列的蛋白亚单位——衣壳组成,核酸则被包裹在内部。 有尾部结构的二十面体:这种噬菌体除了一个二十面体的头部外,还有由一个中空的针状结构及外鞘组成的尾部,以及尾丝和尾针组成的基部。 线状体:这种噬菌体呈线状,没有明显的头部结构,而是由壳
用噬菌体ElISA快速鉴定噬菌体展示蛋白的结合亲和性
单价噬菌体展示系统能使一个单独的蛋白质(或多肽)分子呈递在噬菌体颗粒表面,这样的蛋白质与野生型pⅢ衣壳蛋白相连,作为融合蛋白在辅助噬菌体感染的大肠杆菌细胞中,由噬菌粒载体翻译表达出来。这种展示系统能实现单价展示,是由于这种融合蛋白极少替代来自辅助噬菌体基因组的野生型pⅢ蛋白。这种展示可以是高度可变的
对抗土传病害:来杯噬菌体“鸡尾酒”
噬菌体是专门“吃”某一种细菌的一类微生物,具有高度的宿主特异性。通常它们不会侵染非宿主细菌。由于这种专一性,科学家一直想利用噬菌体防控土壤中那些对作物生长有害的病原细菌。 2月1日,《微生物组》(Microbiome)在线发表南京农业大学资源与环境科学学院沈其荣院士团队的最新研究成果。该研究发
靶向探针精确操纵蛋白质
北京大学化学与分子工程学院教授陈鹏正在实验中。 作为生物体内含量最多的一类生物大分子,蛋白质是生物功能的主要执行者,在各种生命活动中扮演着关键角色。科学家一直在探索适用于活体环境的蛋白质操纵工具,以实现对目标蛋白质结构和功能的深入研究,这已经成为当今化学生物学领域的前沿热点之一。 在
GSK-新合作:靶向“不可成药”蛋白
尽管利用现代分子生物学在医学方面取得了巨大进步,但一大批广泛疾病相关蛋白质仍然是“不可成药”(undruggable)的。换句话说,它们缺乏明显的活性位点,很难发现可以相结合的小分子药物;或小分子药物有很大难度抵达胞内成为有效生物制剂。 Warp Drive Bio 正在开发利用天然分子和机制
GSK-新合作:靶向“不可成药”蛋白
尽管利用现代分子生物学在医学方面取得了巨大进步,但一大批广泛疾病相关蛋白质仍然是“不可成药”(undruggable)的。换句话说,它们缺乏明显的活性位点,很难发现可以相结合的小分子药物;或小分子药物有很大难度抵达胞内成为有效生物制剂。 Warp Drive Bio 正在开发利用天然分子和机制
利用λ噬菌体文库筛选-DNA-结合蛋白实验
试剂、试剂盒 ATP结合缓冲液变性溶液二硫苏糖醇EDTA乙醇激酶 连接酶缓冲液酚氯仿筛选缓冲液SDS醋酸钠TET4 噬菌体 DNA 连接酶T4 噬菌体多核苷酸激酶合成的寡核苷酸[a-32P]ATP非变性聚丙烯酰胺凝胶仪器、耗材 烤盘结晶皿平头镊子装有防水黑墨水注射器硝酸纤维素滤膜Sephadex G
利用λ噬菌体文库筛选-DNA-结合蛋白实验
试剂、试剂盒 ATP 结合缓冲液 变性溶液 二硫苏糖醇 EDTA 乙醇激酶 连接酶缓冲液 酚 氯
利用λ噬菌体文库筛选-DNA-结合蛋白实验
可利用合成双链寡核苷酸筛选构建于λ噬菌体的 cDNA 表达文库,以鉴定与特异 DNA 结合蛋白质相对应的克隆(Singhetal.1988,Vinsonetal.1988)。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。试剂、试剂盒ATP结合缓冲液变性溶
病原菌效应蛋白阻断植物免疫信号的新机制
病原微生物在侵染植物过程中,需要分泌效应蛋白,干扰宿主细胞活动,以利于病原微生物的侵染和定殖。但是植物通过进化,能够识别监控效应蛋白在宿主细胞内的生化活性,从而激活免疫反应。效应蛋白因此会“背叛”病原微生物,导致宿主产生抗病性。 中国科学院遗传与发育生物学研究所周俭民研究组发现,丁香假单胞菌效
M13-噬菌体衣壳蛋白改造在改良噬菌体展示技术中的应
M13 噬菌体衣壳蛋白改造在改良噬菌体展示技术中的应用实验 实验材料 羧苄青霉素氯霉素大肠杆菌 CJ236 试剂、试剂盒 生理磷酸缓冲液超纯甘油PBS-T 缓冲液PBS-T-BSA 缓冲液 仪器、耗材 2YT 培养基SOC 培养基 实验步骤 下述方法描述了 P8 库
M13-噬菌体衣壳蛋白改造在改良噬菌体展示技术中的应...
M13 噬菌体衣壳蛋白改造在改良噬菌体展示技术中的应用实验实验材料 羧苄青霉素氯霉素大肠杆菌 CJ236试剂、试剂盒 生理磷酸缓冲液超纯甘油PBS-T 缓冲液PBS-T-BSA 缓冲液仪器、耗材 2YT 培养基SOC 培养基实验步骤 下述方法描述了 P8 库的设计(见 12.3.1)、构建(见
M13噬菌体衣壳蛋白改造在改良噬菌体展示技术的应用实验
本章描述了改进融合蛋白在 M13 噬菌体颗粒表面展示水平的一个方法。向 M13 衣壳锚定蛋白引入突变后,蛋白质展示水平约能增加两个数量级。本实验来源「现代蛋白质工程实验指南」〔德〕K.M.阿恩特、K.M.米勒编著。实验材料羧苄青霉素氯霉素大肠杆菌 CJ236试剂、试剂盒生理磷酸缓冲液超纯甘油PBS-
LYTAC-与靶向蛋白降解技术讲解(二)
庞大的蛋白降解家族 当然,“蛋白降解家族”可不止 PROTAC,LYTAC 两个成员,还有很多其他的新兴靶向蛋白技术,如光控靶蛋白降解 (photo-PROTAC)、分子胶 (Molecular Glue),自噬介导的靶蛋白降解 (AUTAC)、利用 TRIM21 E3 连接酶靶向降解蛋白的 Tri
LYTAC-与靶向蛋白降解技术讲解(一)
近日,溶酶体靶向嵌合体 (LYTAC) 的发现在“江湖”上掀起了风浪,PROTAC 技术也安上了“开关”,到底是怎么回事儿呢?作为 5G 青年的小编又忍不住下手了,借此和大家聊一聊那些靶向蛋白技术~靶向蛋白降解 (TPD) 是一种有效性的,高度选择性的诱发蛋白降解方式。近年来,以 PROTAC
LYTAC-与靶向蛋白降解技术讲解(三)
到目前为止,除 CRBN/IMiD 分子胶之外,分子胶的设计构想仍依赖偶然的发现,包括通过系统地挖掘数据库得到的 CDK 抑制剂 CR8 分子,以及优化 MDM2 双功能降解剂 MD-222 得到的 MG-277 。 ■ 自噬介导的靶向蛋白质降解 (AUTAC): 自噬靶向嵌合体 (AUTAC