英国卫生部长称新DNA图谱着重于癌症
据医药新闻网PBR(Pharmaceutical Business Review)周一报道，英国卫生部长杰瑞米·亨特近日宣布新的DNA图谱测绘项目将会优先考虑肺癌、儿童癌症、罕见病以及传染病。 这个项目主旨是为了促进对各种癌症的进一步了解、提升检测水平以及引入更多个性化治疗服务。该项目由政府全额出资，并由一家名为英格兰基因组( Genomics England)的非营利性组织负责。 英国癌症研发政策和信息执行董事色拉·伍尔诺夫就表示说，这项提议会在未来能帮助更多人逃离癌症的魔爪。 ......阅读全文
PNAS重要成果：最详细的DNA突变进程图谱
来自印第安那大学的生物学家和信息学家们构建出了有史以来最广泛的生物体DNA序列突变进程图谱，阐明了关于突变的分子特性和这些可遗传的改变发生的速度等重要的新进化信息。 通过分析无自然选择压力条件下经历超过20万代的模型原核生物大肠杆菌(Escherichia coli)中精确的基因组改变，由
质粒DNA限制性酶切图谱分析
一、DNA的限制性酶切实验原理核酸限制性内切酶 是一类能识别双链ＤＮＡ中特定碱基顺序的核酸水解酶，这些酶都是从原核生物中发现，它们的功能犹似高等功物的免疫系统， 用于抗击外来ＤＮＡ的侵袭。限制性内切酶 以内切方式水解核酸链中的磷酸二酯键， 产生的ＤＮＡ片段５’端为Ｐ，３’端为ＯＨ。1. 限制性内切酶
酶解法测定DNA物理图谱的基本步骤
用部分酶解法测定DNA物理图谱包括二个基本步骤：⑴完全降解选择合适的限制性内切酶将待测DNA链（已经标记放射性同位素）完全降解，降解产物经凝胶电泳分离后进行自显影，获得的图谱即为组成该DNA链的酶切片段的数目和大小。⑵部分降解以末端标记使待测DNA的一条链带上示踪同位素，然后用上述相同酶部分降解该D
Science重要成果：人类癌症反转录转座子图谱
在人类基因组中，称为反转录转座子(retrotransposon)的小DNA元件通过自我复制和重新插入到基因组的多个位点从而具有造成突变性破坏的潜力。正常的成人细胞通过抑制机制阻止这些元件四处跳跃，然而根据发表在6月28日《科学》(Science)杂志上的一篇研究报道，这些机制在某些癌症中可能发
全球癌症基因组图谱计划又一研究突破
最近，发表在国际杂志the New England Journal of Medicine上的一篇研究论文中，来自从事癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas）研究计划的科学家通过进行研究，对第二种常见类型的肾癌的两种类型进行了分子特性的分析，并且对这种常见类型的肾癌进行了
《Cell》：如何根据癌症基因组图谱分析肿瘤
时至今日，这一计划已经取得了许多成果，最新Cell杂志公布了泛癌症图谱（Pan-Cancer Atlas），这也是癌症基因组图谱（TCGA）的收官项目，同期Cell杂志介绍了根据癌症基因组图谱分类的肿瘤类型列表，以及相关的一些主要发现（每种肿瘤类型的标记论文）。 生物通报道：2005年美国国立
多国科学家将绘制人类癌症基因图谱
图谱如果绘制成功，可望开辟癌症个性化治疗新时代 国际癌症基因组协会将开展一项与人类基因组计划具有同等重要意义的癌症研究计划，集世界各国和地区的科学家之力，绘制完整的人类癌症基因图谱。 该协会4月29日在英国伦敦正式成立，目前有英国、中国、美国、法国、印度、日本、新加坡、澳大利亚、加拿大和欧盟1
DNA检测将替代常用癌症检测方法
巴氏涂片检查方法(Pap smear)是公共卫生一种广泛使用的金标准检查方法，这种方法主要针对子宫颈癌等疾病，能有效的检测出人类乳头瘤病毒(HPV)细胞的异常变化。然而近期美国食品药品管理局(FDA)批准了一种以DNA为基础的病毒检测方法。 1943年，Papanicolaou和Tra
检测癌症相关DNA修饰新测序方法
牛津Ludwig癌症研究所助理成员Chunxiao Song和Benjamin Schuster-Boeckler领导的这项研究表明，他们开发的新方法，TET辅助吡啶硼烷测序（TET-assisted pyridine borane sequencing，TAPS）是一种比亚硫酸氢盐测序（bis
－DNA甲基化：癌症共有的“指纹”
8月26日在线发表在Genome Medicine上的一篇文章中，研究人员说他们发现了多种癌症中都存在的普遍特异性变化，DNA甲基化标记，它们帮助控制基因的开、关以及最终细胞的行为。这种DNA上可逆的化学标记就是表观遗传学。 约翰霍普金斯医学院的Andrew Feinber
神秘DNA提供新的癌症检测法
最近，美国弗吉尼亚大学的研究人员发现，存在于染色体外面的奇特环状DNA，根据产生它们的细胞类型，而有所差异。这一研究结果增加了一种诱人的可能性，即，这些环状DNA可以作为不同类型癌症的生物标志物。相关研究结果发表在最近的《Cell Reports》。 MicroDNAs，是一类已被命名的新DN
癌症“照妖镜”——游离DNA助力肿瘤早期探查
“人体细胞也有生命周期。细胞衰老凋亡后，细胞内的物质会渗透出来。其中，DNA会随之‘崩裂降解’，进入血液，成为游离DNA。”中国医学科学院肿瘤医院防癌科副主任张凯教授告诉科技日报记者，“肿瘤细胞的游离DNA和正常细胞的游离DNA有所不同，这就给了我们探测肿瘤细胞的机会。”随着分子检测技术的发展，科研
DNA修复机制如何帮助抵御癌症
2015年的诺贝尔化学奖颁发给了细胞DNA修复机制的相关研究，而理解细胞如何修复损伤的DNA对于开发有效的抗癌疗法或许非常重要。通过揭示机体细胞如何自发地修复引发疾病的DNA突变，研究者或许就可以帮助开发改善治疗癌症的化疗方法的有效性。 研究者Nora Goosen表示，我们可以利用知识来战胜
中国科学家发表泛癌症T细胞单细胞图谱
T细胞单细胞图谱的研究框架和主要发现。（张泽民供图） 12月17日，北京大学生物医学前沿创新中心教授张泽民课题组联合北京大学肿瘤医院季加孚、步召德课题组以及北京大学第三医院，在《科学》上发表了泛癌症T细胞图谱。结合基因表达谱和T细胞受体序列，研究者系统刻画了肿瘤浸润性T细胞的异质性和动态变化，并系
Cell：绘制转移性癌症的互作网络图谱
这一发表在8月4日《细胞》（Cell）杂志上的研究，是加州大学圣克鲁斯分校和加州大学洛杉矶分校研究小组的合作成果。他们一开始从致命转移前列腺癌患者尸体中获得的临床组织样本入手，随后完成了一系列复杂的分析以前所未有的细节确定了来自每位患者的癌细胞特征。对生成的数据集进行一种新颖的计算分析，绘制出
《科学》：北大团队发表泛癌症T细胞单细胞图谱
北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）、生命科学学院、北京未来基因诊断高精尖创新中心（ICG）张泽民课题组联合北京大学肿瘤医院季加孚、步召德课题组以及北京大学第三医院，在国际期刊Science上发表了题为“Pan-Cancer Single Cell Landscape of Tumor-
Cell：首个图谱！1篇论文揭秘769个癌症“关键”基因
7月27日，发表在Cell杂志上题为“Defining a Cancer Dependency Map”的研究成果中，来自Broad研究所和Dana-Farber癌症研究所的科学家们建立了癌细胞遗传弱点的综合目录。具体来说，研究人员鉴定出了超过760个癌细胞生长和生存强烈依赖的基因。其中，许多依
癌症“坏运气”？Science：近2/3癌症突变源于DNA复制出错！
“近2/3的癌症突变源于DNA复制过程中随机发生的错误！” 这是来自于约翰•霍普金斯大学基默尔癌症中心（Johns Hopkins Kimmel Cancer Center）的科学家们在3月24日发表于《Science》期刊上的一篇最新学术论文的结论。它意味着，DNA复制出错是导致癌变的主要因
癌症DNA环“密码”被科学家破解
美国斯坦福大学医学院团队及其国际合作者在《自然》杂志上发表了三篇研究论文，彻底改变了科学界对小DNA环（ecDNA）在人类癌症中所起作用的理解。这些研究详细阐述了ecDNA在近15000例癌症患者中的分布及对预后的影响，揭示了一种违反遗传学基本规律的新型遗传方式，并介绍了一种针对ecDNA的抗癌
超强DNA修复让弓头鲸远离癌症
据英国《新科学家》杂志网站22日报道，弓头鲸是世界上寿命最长的哺乳动物，很少受癌症的影响。美国科学家在一项新研究中发现，弓头鲸的细胞似乎能比人类或小鼠的细胞更快速有效地修复DNA，这或许可解释为什么它们能活到200岁以上，且癌症发病率较低。在最新研究中，罗切斯特大学科学家研究了不同动物的皮肤细胞如何
Cell子刊：癌症患者独有的古老DNA
一种改变了尼安德特人(Neanderthal)和丹尼索瓦人(Denisovan)的古老逆转录病毒，现在被发现同样也在现代人类——某些癌症患者的DNA中留下了一些改变。来自英国的一个研究人员小组在《当代生物学》(Current Biology)杂志的一篇论文中，著述了这一惊人的研究发现。
DNA的端粒长度可以有效预测癌症风险
匹兹堡大学癌症研究所（UPCI）的科学家在美国华盛顿特区的AACR年会上报道，保护染色体末端的DNA端粒长度可以预测癌症的风险并成为未来治疗的潜在靶标。 皮特和新加坡科学家率先研究的研究表明，超过预期的端粒由重复的DNA序列组成，每次细胞分裂时都会缩短---与癌症风险增加相关。 持有阿诺德·
科学家绘制正常组织DNA甲基化单体图谱
中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员石建涛，联合上海交通大学医学院附属瑞金医院教授方海，在《基因组研究》（Genome Research）上，在线发表了题为A DNA methylation haplotype block landscape in human tissues and preim
Nature－Genetics－|－迄今最大规模DNA甲基化QTL图谱
分子生物学领域内的一个重要课题是个体基因组特征，如单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism, SNP），与基因调控各层级之间的因果关联以及这种关联对表现型的影响机制。换句话说即是对表观修饰和基因表达等分子特征的遗传基础的解析。在这一研究方向上，最具代表性的范式无疑
基因图谱显示同人精子间亦存DNA差异
北京时间7月23日消息，人类精子争夺卵子的“比赛”看起来就像一群蝌蚪在争先恐后地蠕动，但哪一个精子获胜，结果是大不一样的。一项新研究显示，即使是来自同一个人的精子细胞，也存在显著的遗传差异。 科学家首次获得了来自同一个人的近100个精子的基因图谱。这些结果确认了科学家早已知道的一个事实：每
PNAS：科学家绘制出吸烟导致DNA受损的图谱
美国北卡罗来纳大学医学院的研究人员开发出一种高解析度的方法绘制出了吸烟导致的DNA受损。这项技术将帮助我们更好地理解吸烟带来的风险，以及它是如何导致癌症的出现，以及为什么烟民更容易患癌症，甚至是这些癌症如何被预防。这项研究已发表在近日的《PNAS》上。 吸烟、DNA损伤、肺癌之间的联系已经被确
科学家成功绘制出了癌症化疗疗效的动态学图谱
化疗通常会通过诱导DNA损伤引发细胞死亡来发挥作用，然而，有些癌细胞并不会因化疗而死亡，其会进入非活动状态，俗称为衰老阶段（senescence），在该状态下，其仍有活性但却停止了永久分裂。尽管正常细胞的衰老会驱动细胞衰老以及组织退化，但癌症疗法诱导的衰老却与患者积极的临床预后结果直接相关。理解
科学家成功绘制出了癌症化疗疗效的动态学图谱
化疗通常会通过诱导DNA损伤引发细胞死亡来发挥作用，然而，有些癌细胞并不会因化疗而死亡，其会进入非活动状态，俗称为衰老阶段（senescence），在该状态下，其仍有活性但却停止了永久分裂。尽管正常细胞的衰老会驱动细胞衰老以及组织退化，但癌症疗法诱导的衰老却与患者积极的临床预后结果直接相关。理解
－多项研究发现：癌症特征决定于基因图谱而非发病器官
以往我们对癌症的称谓都是依据其所在身体器官，如乳腺癌、前列腺癌、肺癌等。现在这点上发生了很大的转变，研究者越来越确信肿瘤的划分应该基于基因信息而不是发生的位置。这一新的理念将肿瘤治疗的焦点从器官转移到肿瘤发生相关的基因突变上来。其结果可能是，不同部位的肿瘤因为包含有相同的基因突变信息而使用同一种
NIH－340万美元资助癌症基因组图谱研究计划
美国国立卫生研究院于当地时间7月2日宣布，决定对八个单位（或个人）进行为期两年、总值340万美元的资助，以支持癌症基因组图谱研究计划（Cancer Genome Atlas pilot program）。 癌症基因组图谱计划是美国国立癌症研究所和美国国家人类基因组研究的合作项目，于2005年晚期，