科学家开发出配体靶蛋白质鉴定新方法
近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员叶明亮团队和中国科学院上海药物研究所研究员罗成团队合作，利用蛋白质在结合配体后局部稳定性的变化，开发了一种在复杂体系中可以同时鉴定配体结合蛋白和结合位点的蛋白质组学分析新方法。该方法无需对配体进行化学修饰，广谱适用于包括药物、代谢物、污染物等不同结构配体的靶蛋白质鉴定，将为药学、基础生物学、环境毒理学等领域提供新的研究工具。相关成果于12月10日发表在《自然-方法》。配体靶蛋白质的鉴定新方法。大连化物所供图生物体仿佛拥有一套精密的“钥匙与锁”系统，其中的“钥匙”便是各式各样的配体分子，而“锁”则是蛋白质上那些特定的结合位点。这些配体与蛋白质的结合，就像是一场场精准无误的“对接仪式”，触发了生物体内的化学反应和生物功能。例如，当代谢物与蛋白质结合能使细胞感知到营养状态，而药物与蛋白质结合能够调控机体生理状态等。所以，充分了解和“捕捉”生物分子的“配对”蛋白质及“配对”位点，有助于揭示配体在生......阅读全文
核酸适配体的优点
自20世纪90 年代适配体的概念被提出以来，科研工作者不断致力于适配体的研究，发现适配体具有许多优点。首先，相比较传统微生物培养，检测周期短、检测限低且具有高亲和力与强特异性，这源于适配体具有较大表面积和大量受体结合位点且空间三维构型易形成螺旋、发卡、茎环、凸环、三叶草和假结等结构，能够与靶标物质基
配体的分类和特点
按配体中配位原子的多少，可将配体分为单齿配体和多齿配体。单齿配体：一个配体中只有一个配位原子的配体。如 NH3、H20等。多齿配体：一个配体中有两个或两个以上配位原子的配体。如二亚乙基三胺H2NCH2CH2NHCH2CH2NH2( 简写为DEN) 和乙二胺四乙酸根（简写为EDTA) 。两可配体：有些
配体提呈现象特点
中文名称配体提呈英文名称ligand presentation定 义通过细胞表面的分子与特异性配体结合而使配体浓缩富集，然后提呈给同一细胞或其他细胞上受体的现象。如在脂代谢中蛋白聚糖提呈脂蛋白相关蛋白的配体载脂蛋白E等。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），信号转导（二级学科）
配体的结构和特点
配体（ligand，也称为配基）是一个化学名词，表示可和中心原子（金属或类金属）产生键结的原子、分子和离子。一般而言，配体在参与键结时至少会提供一个电子。配体扮演路易斯碱的角色。但在少数情况中配体接受电子，充当路易斯酸。
概述适配体的应用
1990 年，Tuerk与Ellingtong基于 SELEX 技术率先分别筛选获得了噬菌体T4DNA聚合酶与有机染料的特异性RNA适配体。自此以来，适配体已经被广泛应用于细胞成像、新药研发、疾病治疗与微生物检测等众多方面。 细胞成像：荧光标记适配体或适配体复合物是适配体应用于细胞成像的基础。
适配体的筛选方法
适配体靶标范围广，靶标的大小与可溶性均不同，因此应用 SELEX 技术筛选核酸适配体可以采用不同的具体操作方法。离心沉淀法常用于针对细胞、细菌与病毒的适配体筛选，固相吸附与洗脱技术可以用于可溶性小分子的适配体筛选。适配体筛选的具体方法包括以下几个方面。基于不同固定介质的筛选方法。硝酸纤维素膜过滤法是
Science：药物绑定靶蛋白的效果首次可直接测量
瑞典卡罗林斯卡医学院的研究人员开发出一种方法，首次能够直接测量药物抵达其位于细胞中的目标蛋白的效果。《科学》杂志上描述的这项新技术，对于开发新的、改良型的原料药将是一个重大贡献。 大多数药物都是通过与一种或多种蛋白质结合并影响其功能来发挥效力的，但药物开发也因此面临两个常见问题：
《Nature》子刊：新型免疫治疗靶点——凝血蛋白
10月15日，《Nature Immunology》发表了他们的文章，研究人员用神经变性模型模拟血脑屏障渗漏、慢性炎症和血管异常相关的两种主要脑部疾病：多发性硬化和阿尔兹海默症。 正常情况下，血液中的蛋白质纤维不会进入大脑。但是，一些神经疾病情况下，阻止血液中大分子进入大脑的血脑屏障渗透性异常增大
最新抗衰老靶点：控制蛋白质组代谢
“蛋白质合成对细胞来说是一个极耗能的过程，当细胞投入宝贵资源生产蛋白时，其他重要功能很可能就会被忽视。我们的工作表明，正常和异常老化的一个驱动器会加速蛋白质周转（protein turnover），”文章通讯作者、Salk研究所首席科学官和副总裁Martin Hetzer说道。 注：Water
利用双杂交系统相互作用阱／筛选特定蛋白的肽适配体...
利用双杂交系统相互作用阱／筛选特定蛋白的肽适配体实验实验方法原理 实验材料 DNA酵母株试剂、试剂盒 PCR 引物聚乙二醇甘油存储液Tris·ClX-gal 平板完全极限（CM） 缺失成分培养基和平板仪器、耗材 30℃ 和 42℃ 培养箱或水浴实验步骤 实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其
利用双杂交系统相互作用阱／筛选特定蛋白肽适配体实验
实验材料DNA酵母株试剂、试剂盒PCR 引物聚乙二醇甘油存储液Tris·ClX-gal 平板完全极限（CM） 缺失成分培养基和平板仪器、耗材30℃ 和 42℃ 培养箱或水浴实验步骤实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他」1. 使用标准的亚克隆技术，将编码诱饵蛋白的 DNA 插入 PEG20
中科大PNAS文章发现p53突变蛋白的适配体
近日，中国科学技术大学教授单革实验室发明了一种新的筛选方法，可筛选出能特异针对具有细微改变（比如单氨基酸残基突变）蛋白质的核酸（RNA）适配体。该研究成果发表在7月27日的《美国国家科学院院刊》（PNAS）上，论文第一作者为博士陈亮。 RNA适配体是人工合成及筛选出的能特异结合小分子、蛋白质，
5羟色胺家族部分受体的配体识别和G蛋白选择调控机制
G蛋白偶联受体（GPCRs）是真核生物中最大的一类膜蛋白，在感知胞外信号和介导胞内信息转导中发挥了重要作用，并参与调控多种生理过程，与人类疾病密切相关，是重要的药物靶标蛋白家族。GPCR与第二信使环磷酸腺苷相关的信号通路中，主要通过刺激型G蛋白（Gs）和抑制型G蛋白（Gi）来区分细胞内不同的信号
靶蛋白的放射标记实验—酵母和细菌蛋白质代谢放射标记
实验材料细胞仪器、耗材基本培养基实验步骤1. 接种细胞于只含有必需氨基酸和辅因子的已知成分的基本培养基，于合适温度中度振荡培养过夜。2. 用新鲜的基本培养基稀释培养物，继续温育至 107 细胞/ml （酵母）或对数期中期（细菌）。3. 5000 g 室温离心 10 分钟收集细胞，用无硫酸盐基本培养基
南京大学李金波张艳方雷：基于共价疏水标记策略靶向降解DNA/RNA结合蛋白
近日，南京大学李金波、张艳和方雷等人合作开发了一种可用于DNA/RNA结合蛋白（DBP/RBP）靶向降解的共价疏水标记策略（LACHT）。在非共价蛋白配体辅助下，LACHT利用反应性N-酰基-N-烷基磺酰胺（NASA）连接基团在蛋白靶标表面共价标记疏水性金刚烷，从而进一步通过细胞内质量控制系统诱
PDPN蛋白有望成为脑胶质瘤潜在治疗靶点
中国网健康讯 北京市神经外科研究所神经分子病理室、首都医科大学附属北京天坛医院神经外科曾凡博士等一项研究发现，PDPN蛋白在脑胶质瘤的发生、进展过程中发挥了重要作用，可作为患者预后判断的重要指标及分子治疗的潜在靶点。这项研究为脑胶质瘤的治疗提供了新思路。相关研究论文日前刊发在《中华神经外科杂志》
以G蛋白偶联受体为靶点的多肽药物研发
G蛋白偶联受体（G Protein-Coupled Receptors, GPCRs)是人体内最大的一类蛋白家族。GPCR广泛参与生理过程的调控，与多种疾病相关，且结构上有结合口袋，是很好的成药位点。目前已有超过475种以GPCR为靶点的药物获批上市，销售额占整体药物市场的27%。 GPCR是
PDPN蛋白有望成为脑胶质瘤潜在治疗靶点
北京市神经外科研究所神经分子病理室、首都医科大学附属北京天坛医院神经外科曾凡博士等一项研究发现，PDPN蛋白在脑胶质瘤的发生、进展过程中发挥了重要作用，可作为患者预后判断的重要指标及分子治疗的潜在靶点。这项研究为脑胶质瘤的治疗提供了新思路。相关研究论文日前刊发在《中华神经外科杂志》上。 Pod
一组蛋白激酶是潜在抗癌靶点
最近，由伦敦大学玛丽皇后学院（QMUL）和Francis Crick学院带领的一项研究表明，一组蛋白激酶在胚胎发育中起着重要的作用，甚至可能是一个潜在的癌症药物靶点。延伸阅读：PNAS：蛋白激酶颠覆性新发现。 这项研究结果发表在最新一期的《Cell Reports》，第一次描述了在小鼠中敲除整
表面等离子共振检测蛋白相互作用实验
用 BlAcore 芯片 用 NTA-SAM 芯片 实验方法原理 实验材料 CM
表面等离子共振检测蛋白相互作用实验——用－BlAcore－芯片
实验材料CM-5 葡聚糖芯片（BIAcore）配体蛋白靶蛋白试剂、试剂盒PBS胺-偶联试剂盒（详见「其他」）仪器、耗材BIAcore SPR 设备BIA 评估软件（point-and-click）实验步骤1. 插入一个新的 BIAcore CM-5 葡聚糖芯片。2. 用 PBS 作为工作液以持续流动
表面等离子共振检测蛋白相互作用实验
实验方法原理 实验材料 CM-5 葡聚糖芯片（BIAcore）配体蛋白靶蛋白试剂、试剂盒 PBS胺-偶联试剂盒（详见「其他」）仪器、耗材 BIAcore SPR 设备BIA 评估软件（point-and-click）实验步骤 1. 插入一个新的 BIAcore CM-5 葡聚糖芯片。2. 用 PBS
用肽适配体正向分析细胞过程实验2
辅助方案 肽适配体靶点的鉴定实验方法原理通过配对相互作用或捕获法鉴定的肽适配体的假定靶点应当通过遗传学测试进行验证，例如：1. 用免疫沉淀法确定体内适配体的相互作用；2. 通过上位（显）性分析以确定适配体在与靶蛋白相同的区域发挥功能；3. 比较由靶蛋白删除或过表达引起的表型与由适配体造成的表型。实验
上海药物所解析亲吻素受体配体识别与下游G蛋白招募机制
1996年，亲吻素（kisspeptin）被发现。当科学家发现kisspeptin通过与其受体KISS1R结合并激活来发挥作用时，它的生理重要性才显现出来。KISS1R信号通路被认为是下丘脑-垂体-性腺轴的重要的上游调节因素。 研究表明，持续给予kisspeptin可以恢复黄体生成素的脉冲性分
科学家提出蛋白质—配体复合物柔性结构预测方法PackDock
作为细胞的“主力军”，蛋白质往往通过与小分子配体或其他蛋白质发生特异性结合来发挥功能。然而，蛋白质结构具有天然的动态性，配体结合也常伴随构象变化。因此，获得准确的结合构象是基于结构药物设计的重要前提。近日，中国科学院上海药物研究所研究团队提出了蛋白—配体复合物柔性结构建模新方法PackDock。该方
科学家提出蛋白质—配体复合物柔性结构预测方法PackDock
作为细胞的“主力军”，蛋白质往往通过与小分子配体或其他蛋白质发生特异性结合来发挥功能。然而，蛋白质结构具有天然的动态性，配体结合也常伴随构象变化。因此，获得准确的结合构象是基于结构药物设计的重要前提。近日，中国科学院上海药物研究所研究团队提出了蛋白—配体复合物柔性结构建模新方法PackDock。该方
概述适配体的筛选方法
适配体靶标范围广，靶标的大小与可溶性均不同，因此应用 SELEX 技术筛选核酸适配体可以采用不同的具体操作方法。离心沉淀法常用于针对细胞、细菌与病毒的适配体筛选，固相吸附与洗脱技术可以用于可溶性小分子的适配体筛选。适配体筛选的具体方法包括以下几个方面。 基于不同固定介质的筛选方法。硝酸纤维素膜
束缚配体的基本概念
中文名称束缚配体英文名称tethered ligand定 义被受体掩遮的配体。如凝血酶受体的真正配体是在受体内部。当表观配体——凝血酶与受体结合时就将受体降解，而被暴露出来束缚配体就将受体激活并发挥生理作用。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），信号转导（二级学科）
配体结合口袋的特点
中文名称配体结合口袋英文名称ligand-binding pocket定 义受体的配体结合域中的疏水氨基酸残基通过疏水相互作用所形成的一种口袋形结构。其形状与配体的互补性越大，则受体与配体的亲和力也就越大。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），信号转导（二级学科）
关于适配体的基本介绍
核酸适配体是一小段经体外筛选得到的寡核苷酸序列或者短的多肽，能与相应的配体进行高亲和力和强特异性的结合，它的出现为化学生物学界和生物医学界提供了一种新的高效快速识别的研究平台，并在许多方面展示了良好的应用前景。