海洋模式并行异构加速研究获进展
中国科学院南海海洋研究所(以下简称南海海洋所)仪器中心联合山东科技大学,在海洋模式并行异构加速研究方面取得新进展,成功开发出基于OpenACC的GPU加速并行POM(Princeton Ocean Model)模式。近日,相关成果发表于《环境建模与软件》(Environmental Modelling & Software)。 “该项技术为高精度海洋数值模拟与实时预报提供了一种新的高效能计算解决方案。”论文通讯作者、南海海洋所高级工程师周巍表示,随着海洋建模对空间分辨率与物理过程复杂度的双重需求不断提升,传统串行POM的计算效率已难以满足实际应用需求。 研究团队通过并行计算区域选择、数据传输优化和计算模式调整等多维度优化策略,对经典POM代码实施系统性重构。实测数据显示,该并行版本在不同时空尺度的模拟实验中均实现45倍加速比,较传统并行方法展现出显著优势。 研究进一步揭示了GPU加速性能的关键制约因素——通过引......阅读全文
海洋模式并行异构加速研究获进展
中国科学院南海海洋研究所(以下简称南海海洋所)仪器中心联合山东科技大学,在海洋模式并行异构加速研究方面取得新进展,成功开发出基于OpenACC的GPU加速并行POM(Princeton Ocean Model)模式。近日,相关成果发表于《环境建模与软件》(Environmental Modell
立体异构与顺反异构有什么区别
顺反异构是立体异构的一种,顺反异构主要指由于双键的不可旋转性,造成的同分异构现象。简单的说就是同一侧上下连的东西不同造成的。至于立体异构里主要是旋光异构,大部分是由于手性碳造成(一个碳连了四个不同的基团)。造成对应镜像关系的异构。
什么立体异构?
立体异构(stereoisomerism)是在有相同分子式的化合物分子中,原子或原子团互相连接的次序相同,但在空间的排列方式不同,与构造异构(根据情况不同可以分为:碳链异构、位置异构、官能团异构三种。)同属有机化学范畴中的同分异构现象。
立体异构的分类
立体异构分为几何异构(顺反异构)、旋光异构、构象异构三类。
常见的异构类型
常见的异构类型分为两大类:1.构造异构:(1).碳链异构 由于分子中碳链形状不同而产生的异构现象。如正丁烷和异丁烷。(2).位置异构 由于取代基或官能团在碳链上或碳环上的位置不同而产生的异构现象;2.立体异构:结构相似,但由于微小偏差导致结构不同。具体又可分为构型异构和构象异构
异构酶的分类
异构酶isomerase 亦称异构化酶,是催化生成异构体反应的酶之总称。是酶分类上的主要类别之一。根据反应方式而分类。(1)结合于同一碳原子的基团的立体构型发生转位反应(消旋酶、差向异构酶),如UDP葡萄糖差向酶(生成半乳糖);(2)顺反异构;(3)分子内的氧化还原反应(酮糖-醛糖相互转化等),如葡
顺反异构发现历史
贝采里乌斯建议把相同组成而不同性质的物质称为“同分异构(isomerism)‘’的物质。同分异构现象的发现以及从理论上的阐明,是在物质组成和绪构理论发展中迈出的重要一步,它开始了分子结构问题的研究,促进了有机化学的发展。在发现了酒石酸的旋光异构之后,1874年9月荷兰物理化学家范特霍夫(Jacobu
顺反异构互相转换
自然界的顺反异构体中通常是反式比较稳定,而顺式较不稳定。顺反异构体的构型转化是一个化学动态平衡过程。此过程一般可分为3种类型:光致异构化、热致异构化和催化异构化。基态时反式异构体总是比顺式稳定,所以后一类异构化过程的结果通常是反式异构体占多数,而光致异构化的结果往往相反 [1] 。如将顺式异构体加
差向异构的作用
具两个手性碳原子的L-异亮氨酸,仅在α-碳原子上发生构型变化,部分转化成其非对映体D-别异亮氨酸的过程。含有多个手性碳原子,其中一个手性碳原子的构型相反,其他手性碳原子的构型相同,这样的两种异构体互称差向异构体。两种差向异构体的组成和构造式相同,它们之间不是构造异构体,而是立体异构中的构型异构体。差
顺反异构活性应用
活性不同人工合成的乙烯雌酚是一种雌性激素,反式构型的生物活性比顺式构型的高7~10倍。维生素A分子中所有的双键全部都为反式构型。具有降血脂作用的亚油酸及花生四烯酸分子的碳碳双键都是顺式构型。若改变上述化合物的构型,将导致生理活性的降低甚至丧失。并且反式脂肪酸(TFA)对血管内皮细胞的功能具有损伤作用
顺反异构命名法
两个相同原子或基团在双键或脂环的同侧的为顺式异构体,也用 cis- 来表示。两个相同原子或基团在双键或脂环的异侧的为反式异构体,也用 trans- 来表示。用顺反异构命名法命名的有机化合物例举顺反异构命名举例顺反命名法命名存在一个缺陷:若双键上两个碳原子上连有四个完全不同的原子或基团,就无法命名,因
电荷异构体
对于单抗电荷变异体的测定有多种分析方法,20版中国药典通则3129收录了单抗电荷变异体测定法-全柱成像毛细管等电聚焦电泳法(icIEF法)外,新版中国药典将毛细管等电聚焦电泳(cIEF法)也写入3129通则。 离子交换(IEX)色谱和成像毛细管等电聚焦(iCIEF)或(CIEF),传统上都使用
构造异构的种类
1、碳链异构:异构体的分子式相同而碳骨架不同的现象。例如:正丁烷CH3CH2CH2CH3和异丁烷(CH3)2CHCH32、位置异构:异构体的分子式相同而分子中官能团或取代基在碳骨架上的位置不同的现象。又可分为官能团位置异构和取代基位置异构。①官能团位置异构是因官能团取代不同类型的氢而引起的。例如:1
异构酶的测定实验_D木糖异构酶测定
实验方法原理D-木糖 ⇌ D-木酮糖实验材料酶溶液试剂、试剂盒TES NaOHD-木糖MnSO4半胱氨酸·HCl咔唑溶液硫酸仪器、耗材分光光度计实验步骤实验所需「试剂」具体见「其他」20 ul 的实验混合物和 20 ul 酶溶液(各自用 20 ul TES 缓冲液作对照)混合,并在测定温度(例 50
异构酶的测定实验_葡萄糖异构酶微板测定
实验材料酶溶液试剂、试剂盒TES NaOHD-葡萄糖间苯二酚FeNH4(SO4)2·12H2O仪器、耗材微孔板读数仪实验步骤实验所需「试剂」具体见「其他」测定步骤与木糖苷基本相同,唯一不同的是在 490 nm 处测定吸光值。注意事项其他试剂:0.2 mol/L TES/NaOH,pH 8.0[N-t
异构酶的测定实验_葡萄糖异构酶的测定实验
实验方法原理D-葡萄糖 ⇌ D-木果糖实验材料酶溶液试剂、试剂盒TES NaOHD-葡萄糖CoCl2半胱氨酸·HCl咔唑溶液硫酸仪器、耗材分光光度计实验步骤实验所需「试剂」具体见「其他」实验步骤与木糖异构酶基本相同,唯一不同的是在酶反应以及加完半胱氨酸后,咔唑和硫酸混合物可以放置 30 min 进行
异构酶的主要类别
异构酶isomerase 亦称异构化酶,是催化生成异构体反应的酶之总称。是酶分类上的主要类别之一。根据反应方式而分类。(1)结合于同一碳原子的基团的立体构型发生转位反应(消旋酶、差向异构酶),如UDP葡萄糖差向酶(生成半乳糖);(2)顺反异构;(3)分子内的氧化还原反应(酮糖-醛糖相互转化等),如葡
对映[异构]体的定义
中文名称对映[异构]体英文名称enantiomer定 义某一化合物的两个光学异构体之一,其分子在整体上互为不能重叠的镜像。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),总论(二级学科)
顺反异构的概念辨析
同分异构是指分子式相同但结构式不同的异构现象,它包括构造异构和立体异构。立体异构指的是原子或原子团互相连接的次序相同,但在空间的排列方式不同的异构现象。而顺反异构是指空间构象不同,顺反异构属于立体异构,故也属于同分异构。
拓朴异构酶的结构
拓朴异构酶(英语:Topoisomerase ;type I:EC EC 异构酶,能使DNA长链断裂与接合。专门参与DNA拓扑构形(DNA topology)改变的过程,最早的发现者是出身台湾的生化学家王倬。
顺反异构的结构特点
顺反异构(Cis-trans isomerism),又名几何异构,属于立体异构中的一种。顺反异构是指化合物分子中由于具有自由旋转的限制因素,使各个基团在空间的排列方式不同而出现的非对映异构现象。这种限制因素一般是有机化合物结构中出现如C=C双键、C=N双键、C=S双键、N=N双键或脂环等不能自由旋转
葡萄的异构体
同分异构体 阿洛酮糖(psicose,allulose);果糖(fructose);山梨糖(sorbose);塔格酮糖(tagalose);肌醇(inositol) 手性异构体 阿洛糖(allose);阿卓糖(altrose);甘露糖(mannose);古洛糖(gluose);艾杜糖(id
顺反异构的活性应用
活性不同人工合成的乙烯雌酚是一种雌性激素,反式构型的生物活性比顺式构型的高7~10倍。维生素A分子中所有的双键全部都为反式构型。具有降血脂作用的亚油酸及花生四烯酸分子的碳碳双键都是顺式构型。 若改变上述化合物的构型,将导致生理活性的降低甚至丧失。并且反式脂肪酸(TFA)对血管内皮细胞的功能具有损伤作
互变异构现象特点
指一类特殊的同分异构现象。其特点是含有杂原子(如氮、氧或硫原子)的两个同分异构体,其结构差异仅在于质子和相应的双键的迁移,且这两个异构体共存于一个平衡体系中,以相当高的速率互相变换着。酮-烯醇互变异构是较普遍的现象,它可以被酸或碱所催化。
异构酶的测定实验
暂未评分点评实验,有机会获丁当奖励 +收藏异构酶的测定实验标签:D-木糖异构酶 葡萄糖异构酶 酶学实验手册 第三章葡萄糖异构酶是应用最多的酶之一,本质上它是木糖异构酶而非葡萄糖异构酶。它从各种各样的微生物中分离得来,它在微生物体内作为木糖代谢物。半纤维素,像木聚糖或阿拉伯糖,是最丰富的自然营养物质之
顺反异构的产生条件
1.分子中至少有一个键不能自由旋转(否则将变成另外一种分子);2.每个不能自由旋转的同一碳原子上不能有相同的基团,必须连有两个不同原子或原子团。而下图,这两个模型都是不存在顺反异构现象的一般构型,这是因为左侧存在相同的原子或原子团,旋转之后还是同一个构型:示例: 下图中,除中间的双键存在顺反异构外,
异构酶的测定实验
实验方法原理 D-木糖 ⇌ D-木酮糖实验材料 酶溶液试剂、试剂盒 TES NaOHD-木糖MnSO4半胱氨酸·HCl咔唑溶液硫酸仪器、耗材 分光光度计实验步骤 实验所需「试剂」具体见「其他」20 ul 的实验混合物和 20 ul 酶溶液(各自用 20 ul TES 缓冲液作对照)混合,并在测定
顺反异构分析测定方法
高效液相色谱法HPLC法在顺反异构体药物的分离分析中应用广泛,其可与多种检测器联用,在分离分析高沸点、大分子、热稳定性差的化合物方面具有极大优势,而其对顺反异构体的分离选择性和检测精确度主要取决于选用合适的色谱柱和检测器。毛细管电泳法CE法对带电荷物质的分离效果显著,但有时为改善峰形或提高分离度,需
异构体的分类
导致旋光异构现象的原因,可以按照旋光异构体的种类来分类,有三种:分子中含有一个手性碳原子图4 乳酸的旋光异构含有一个手性碳原子时,分子必定有手性,有两个旋光异构体,它们具有互为实物和镜像的关系,故也称对映体。对映异构体旋光度大小相等,方向相反,其物理和化学性质极为相似,如乳酸(图4):一个可以使平面
顺反异构的命名方法
顺反异构命名法两个相同原子或基团在双键或脂环的同侧的为顺式异构体,也用 cis- 来表示。两个相同原子或基团在双键或脂环的异侧的为反式异构体,也用 trans- 来表示。用顺反异构命名法命名的有机化合物例举顺反异构命名举例顺反命名法命名存在一个缺陷:若双键上两个碳原子上连有四个完全不同的原子或基团,