生物物理所揭示CCP6蛋白调控血液巨核细胞谱系发育机制
10月20日,实验医学杂志Journal of Experimental Medicine 在线发表了中国科学院生物物理研究所范祖森研究组与田勇研究组合作的题为Cytosolic carboxypeptidase CCP6 is required for megakaryopoiesis through modulating Mad2 polyglutamylation 的研究论文,首次报道了胞内羧肽酶CCP6及其调控的Mad2蛋白的多聚谷氨酸化修饰对造血谱系发育中骨髓巨核细胞成熟具有重要的调控作用。 血液是维持机体生理功能重要的组成部分,然而,血液细胞谱系建立的机制仍尚未阐明。血小板在机体止血、新生血管形成以及天然免疫等过程中发挥着重要的生理作用。骨髓巨核细胞是血小板发育的前体细胞,关于骨髓巨核细胞生成、发育及成熟分化的分子机制目前阐释的并不清楚。范祖森研究组与田勇研究组合作,利用基因敲除小鼠模型系统探讨了羧肽酶CCP6......阅读全文
生物物理所揭示CCP6蛋白调控血液巨核细胞谱系发育机制
10月20日,实验医学杂志Journal of Experimental Medicine 在线发表了中国科学院生物物理研究所范祖森研究组与田勇研究组合作的题为Cytosolic carboxypeptidase CCP6 is required for megakaryopoiesis thr
磷酸化多肽及其修饰方法
蛋白质磷酸化是生物界最普遍,也是最重要的一种蛋白质翻译后修饰,20世纪50年代以来一直被生物学家看作是一种动态的生物调节过程。在细胞中,大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关,如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质
磷酸化多肽及其修饰方法
蛋白质磷酸化是生物界最普遍,也是最重要的一种蛋白质翻译后修饰,20世纪50年代以来一直被生物学家看作是一种动态的生物调节过程。在细胞中,大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关,如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质及多
磷酸化多肽及其修饰方法
蛋白质磷酸化是生物界最普遍,也是最重要的一种蛋白质翻译后修饰,20世纪50年代以来一直被生物学家看作是一种动态的生物调节过程。在细胞中,大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关,如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质
多肽磷酸化修饰及检测方法
磷酸化影响着细胞生命的方方面面。在细胞中,大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关,如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质及多肽的研究可以帮助人们阐述上述过程的机理,进一步认识生命活动的本质。肽谷生物依据自身原料优势和技
sumo化与磷酸化修饰联合分析
随着质谱技术的不断进步,大规模修饰组学的方法也越来越成熟,PTM作为生物体内非常重要的生理现象也逐步被揭示出参与各项生命活动。今天我们就一起来学习一篇运用质谱技术对磷酸化修饰和类泛素化修饰鉴定,找出两种修饰联合作用对在DNA复制损伤压力时的响应。该篇文献来自哥本哈根大学的研究人员于2017年10月发
蛋白质N磷酸化修饰富集方法进展
蛋白质N-磷酸化修饰富集方法进展 江波1, 高博2, 魏淑娴2, 梁振1, 张丽华1,*, 张玉奎1 1.中国科学院大连化学物理研究所,医学蛋白质组全国重点实验室,国家色谱研究中心, 中国科学院分离分析化学重点实验室,辽宁 大连 116023 2.中国石油大学(华东)化学化工学院,山东 青
NLRP3磷酸化修饰与炎症小体通路激活的调控机制
9月21日,Molecular Cell在线发表了国家生物医学分析中心李涛研究员和周涛研究员合作的题为“NLRP3 phosphorylation is an essential priming event for inflammasome activation”的最新研究成果。该文报道了磷
双剑合璧-|-sumo化与磷酸化修饰联合分析赢高分文章
随着质谱技术的不断进步,大规模修饰组学的方法也越来越成熟,PTM作为生物体内非常重要的生理现象也逐步被揭示出参与各项生命活动。今天我们就一起来学习一篇运用质谱技术对磷酸化修饰和类泛素化修饰鉴定,找出两种修饰联合作用对在DNA复制损伤压力时的响应。该篇文献来自哥本哈根大学的研究人员于2017年1
中科大吴缅教授最新文章:p53磷酸化修饰
p53 蛋白被认为是迄今为止最著名的肿瘤抑制因子之一, 在肿瘤发生发展过程中发挥复杂而重要的调控作用. 在正常生理情况下, 细胞内的p53 维持在很低的水平, 当细胞受到多种刺激后, p53被翻译后修饰, 蛋白因稳定而活性被激活, 参与细胞周期阻滞、细胞凋亡、细胞衰老、细胞代谢等生命活动过程.
双剑合璧-|-sumo化与磷酸化修饰联合分析赢高分文章
随着质谱技术的不断进步,大规模修饰组学的方法也越来越成熟,PTM作为生物体内非常重要的生理现象也逐步被揭示出参与各项生命活动。今天我们就一起来学习一篇运用质谱技术对磷酸化修饰和类泛素化修饰鉴定,找出两种修饰联合作用对在DNA复制损伤压力时的响应。该篇文献来自哥本哈根大学的研究人员于2017年1
4D组学新时代!更精确的磷酸化修饰组学
离子淌度分离概念的引入使得蛋白质组学进入了4D新时代。4D蛋白质组学是在3D分离即保留时间(retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity)这三个维度的基础之上增加了第四个维度,离子淌度(mobility)的分离(图1),进而大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度,带来蛋白
磷酸化修饰蛋白质组学共性关键技术研究获突破
近日,广东省农业科学院农业生物基因研究中心晏石娟团队联合加拿大约克大学、德国马普分子植物生理研究所等研究人员在磷酸化修饰蛋白质组学共性关键技术研发方面取得重大突破,首次搭建全自动在线磷酸化蛋白质组学分析技术平台,解决了磷酸化蛋白质组学研究的一大瓶颈。相关研究以农业生物基因研究中心为第一完成单位在线发
J-Exp-Med:蛋白去磷酸化修饰调控炎症微环境的新机制
浙江大学基础医学院柯越海课题组与附属邵逸夫医院曹倩团队合作在J Exp Med杂志上发表研究论文"Phosphatase Shp2 exacerbates intestinal inflammation by disrupting macrophage responsiveness to int
水生所四膜虫蛋白质磷酸化修饰特征等研究获进展
11月7日,国际蛋白质组学领域刊物Molecular & Cellular Proteomics在线发表了题为Phosphoproteomic analysis of protein phosphorylation networks in Tetrahymena thermophila, a
邻位连接技术PLA在蛋白蛋白相互作用,蛋白磷酸化修饰..
邻位连接技术PLA在蛋白-蛋白相互作用,蛋白磷酸化修饰的应用摘要 邻位连接技术(proximityligationassay,PLA),是新研发的一项高灵敏度的蛋白质体外分析技术。该方法利用一对邻位探针(proximityprobes)对靶分子进行双识别,通过连接反应产生可扩增的检测信号,以实时PC
蛋白质磷酸化修饰的进化与功能相关性研究取得新成果
10月18日,Molecular Biology and Evolution杂志在线发表了中科院系统生物学重点实验室李亦学研究组与曾嵘研究组、日本国立遗传研究所Yoshio Tateno教授以及德国国家环境生物学研究中心流行病研究所在中科院系统生物学重点实验室的进修生Ludwig
张丽华发文:N磷酸化修饰蛋白质的富集和鉴定方法
摘要 蛋白质磷酸化修饰在细胞的信号转导、代谢、发育等生命过程中发挥着重要作用。除了研究较为透彻的发生在丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸侧链羟基的O-磷酸化修饰之外,近年来,发生在组氨酸、精氨酸和赖氨酸侧链氨基的N-磷酸化修饰受到了越来越广泛的关注。然而,由于N-磷酸化修饰具有独特的P-N键结构,导致其化
什么是去酪氨酸?
去酪氨酸化是发生在α-微管蛋白上的一种翻译后修饰形式。它包括去除C端酪氨酸以在新形成的C端暴露谷氨酸。含有去酪氨酸化α-微管蛋白的微管蛋白聚合物,称为微管,通常称为Glu-微管,而未改性的聚合物称为Tyr-微管。裂解末端酪氨酸的微管蛋白羧肽酶是两种称为血管抑制素(VASH1/VASH2)的蛋白酶,与
植物所揭示糖基化和磷酸化修饰介导小麦春化作用新机制
冬小麦开花需要长时间环境低温的诱导,该过程称之为春化作用。不同冬小麦品种的春化特性及其与冬春季气温适应程度会直接影响其产量。到目前为止,许多春化相关基因VRNs相继被克隆和研究,但人们对春化时间的衡量以及春化感知机制并不十分清楚,影响了冬小麦分子育种的开展。氧-乙酰氨基葡萄糖(O-GlcNAc)
多肽修饰合成常用策略(一)
多肽是由多个氨基酸通过肽键连接而形成的一类化合物,普遍存在于生物体内,迄今在生物体内发现的多肽已达数万种。多肽在调节机体各系统、器官、组织和细胞的功能活动以及在生命活动中发挥重要作用,并且常被应用于功能分析、抗体研究、药物研发等领域。随着生物技术与多肽合成技术的日臻成熟,越来越多的多肽药物被开发并应
精确修饰位点谱图库的建立与磷酸化蛋白质组的-DIA-解析3
结果显示,从 DIA 数据中提取、定量到 6401 条可信的磷酸化肽,占谱图库磷酸化肽总数(6505 条)的 98.4%(图 5)。磷酸化肽的丰度和离子化效率普遍较低,本实验如此高的解析成功率表明,基于 Orbitrap 的 DIA 数据具有极高的谱图质量和出色的灵敏度。 图5. DIA可
精确修饰位点谱图库的建立与磷酸化蛋白质组的-DIA-解析1
引言 数据非依赖采集(Data-Independent Acquisition, DIA)是当前最热门的质谱采集技术之一,它以非目标的方式将质量范围分为若干窗口,依次并循环采集窗口内所有母离子的二级碎片[1,2]。DIA 与 SRM 类似,也是基于子离子(transition)定量,相比
精确修饰位点谱图库的建立与磷酸化蛋白质组的-DIA-解析2
2. 磷酸化样本的 DDA 鉴定、可信度筛选和谱图库建立磷酸化样本信息和色谱质谱参数见实验条件部分。3 针 DDA 数据按磷酸化检索流程使用 Proteome Discoverer 2.0 软件搜库鉴定(S/T/Y+79.966 Da),并使用 ptmRS 模块对位点打分(图 2-1)。搜库完成
美科学家发现肝脏调控血小板合成新机制
近日,国际生物学顶尖期刊nature medicine刊登了来自哈佛医学院Karin M Hoffmeister研究小组的一项最新研究成果,他们通过研究证明循环系统中的血小板会发生去唾液酸化,从而被AMR识别并清除,同时,这一清除机制会驱动肝脏细胞中JAK2-STAT3信号通路激活,促进血小板生
细胞水平的代谢调节(二)
(二)酶分子化学修饰调节 1.酶分子化学修饰的概念 酶分子肽链上的某些基团可在另一种酶的催化下发生可逆的共价修饰,从而引起酶活性的改变,这个过程称为酶的酶促化学修饰(chemical modification)。如磷酸化和脱磷酸,乙酰化和去乙酰化,腺苷化和去腺苷化,甲基化和去甲基化以及-
孙毅团队发现拟素化调控肿瘤细胞谷氨酰胺吸收和代谢
代谢是细胞及机体生命活动能量与物质来源的基础,其稳态平衡是机体应对内外时空变化的重要保障。代谢紊乱或调控机制异常与多种人类疾病密切相关,例如,肿瘤代谢异常赋予肿瘤细胞特异性增殖优势,影响和改变肿瘤微环境,促进肿瘤细胞的存活。因此,揭示代谢途径调控机制,将为包括肿瘤在内的疾病发病机理提供全新突破口
什么是磷酸化与去磷酸化
磷酸化,将磷酸基团加在中间代谢产物上或加在蛋白质(protein)上的过程。其中除去磷酸基团的酶称为磷酸酶。 蛋白质磷酸化可发生在许多种类的氨基酸(蛋白质的主要单位)上,其中以丝氨酸为多,接着是苏氨酸。去磷酸化:磷酸基团的除去,对许多生物起着“开/关”作用。防止质粒载体的自身连接,最常用于质粒进行单
PEG修饰及其修饰GLP1的意义
PEG修饰是一个使多肽或蛋白质在治疗或生物技术方面的效力得以提高的重要过程。当PEG以适当的方式连接在蛋白质或多肽上时,它能改变许多的特征,而主要的生物活性功能,如酶活性或特异结合位点,可以保留下来。PEG修饰通过如下几种途径改善药物的性能。首先,PEG连接在蛋白质或多肽的表面上,提高了它的分子大小
多肽荧光标记——FITC修饰和AMC修饰
荧光标记所依赖的化合物称为荧光物质。荧光物质是指具有共轭双键体系化学结构的化合物,受到紫外光或蓝紫光照射时,可激发成为激发态,当从激发态恢复基态时,发出荧光。荧光标记技术指利用荧光物质共价结合或物理吸附在所要研究分子的某个基团上,利用它的荧光特性来提供被研究对象的信息。荧光标记的无放射物污染,操