北京基因组所阿尔兹海默症基因知识库ALzBase正式上线
阿尔兹海默症（Alzheimer’s disease,AD）是一种在老年人人群中常见的神经退行性疾病，目前无有效治疗手段。人们对AD致病机理方面的研究也没有取得突破性的进展。为了能够更好地助力AD相关的研究，中国科学院北京基因组研究所雷红星研究组通过整合不同来源的数据，以阿尔兹海默症扰动基因为核心整理并开发了阿尔兹海默症基因知识库AlzBase，相关论文于近期发表于Molecular Neurobiology。 雷红星研究员多年来一直从事AD相关的研究工作，特别是在组学数据相关的研究领域开展了一系列的研究，例如AD相关致病机制的系统生物学研究，AD外周血扰动特异性研究以及AD相关染色体区域的研究等。这些研究成果为Alzbase的开发与上线打下了坚实的基础，同时也使得AlzBase作为AD组学研究领域的知识型数据库更具专业性和指导性。 AlzBase知识库收集了若干组代表性的AD脑转录组研究结果，并结合AD研究中的一些热点......阅读全文
概念动态|华大基因新增“数据要素”概念
2024年10月14日，华大基因（300676）新增“数据要素”概念。 据同花顺数据显示，入选理由是：2023年年报：公司在科研和产业化过程中形成了庞大的数据积累，在生物样本和表型数据的基础上，采用测序、质谱、PCR等多维度技术对生物样本进行多组学的数据化，利用智能化技术、数据挖掘系统和生物信
基因数据分析的主流软件
基因组测序在过去的几年中，许多生物的基因组完成了测序工作，如何对如此庞大的原始序列信息进行分析和应用，正是现在最为棘手的问题。大量的基因预测软件和在线工具应运而生。如何广泛而深入地了解并能有的放矢地利用这些工具，已经成为21世纪分子生物学家的必修课。随着大规模EST和cDNA序列信息的获取，那些基于
Science：癌症基因数据提出技术质疑
据美国国立癌症研究所的一位病理学家David Levens称，在PubMed数据目录上有超过25,000篇关于Myc基因的论文，这种基因与转移性癌症有关，但是现在由于一项最新研究成果，因此都需要重新再评估，这项研究指出了Myc的致癌作用比大多数人认为的都要更广泛，而目前的实验方法具有缺陷，也
基因数据噪音或可保护患者隐私
大型基因组数据库对于科学家寻找同疾病相关的遗传变异来说是必不可少的。不过，对于贡献了DNA的人来说，这会带来隐私风险。一项2013年的研究显示，黑客能利用网络上公开可用的信息，从被匿名的基因组数据中辨别出人们的身份。 为解决这些担忧，一个由美国麻省理工学院计算机科学家Bonnie Berger
冰岛基因公司数据挖掘计划泡汤
图片来源：基因解码公司 因采集冰岛人DNA用于发现基因和疾病之间关系而著名的基因解码公司遇到了一个棘手问题。近日，《科学》杂志报道称，冰岛负责监督数据保密性的国家机构驳回了基因解码公司的请求——该公司希望可以使用计算机方法分析该国的宗系记录，以估算28万名并未同意参与该公司的研究，
基因数据分析的主流软件
在过去的几年中，许多生物的基因组完成了测序工作，如何对如此庞大的原始序列信息进行分析和应用，正是现在最为棘手的问题。大量的基因预测软件和在线工具应运而生。如何广泛而深入地了解并能有的放矢地利用这些工具，已经成为21世纪分子生物学家的必修课。随着大规模EST和cDNA序列信息的获取，那些基于表达序列同
科学家研究认为：大数据时代“小数据”仍有未来
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504106.shtm大数据时代，“小数据”有未来吗？武汉纺织大学数理科学学院江健教授团队与美国密歇根州立大学Guo-wei Wei教授团队共同研究认为：“有！”相关研究成果日前在线发表在国际期刊《化学评论
大数据时代：海量数据为科学研究带来重大机遇
“大数据的概念听上去和云计算一样，有些‘高大上’，但是大数据绝不是一个空泛的口号，事实上它不仅改变了人们的生存面貌，更为科学研究带来重大的机遇。”中国科学院遥感与数字地球所研究员郭华东说。 依托海量的数据状态和云级别的数据处理能力，大数据以其Volume（大量）、Velocity（高速）、Va
研究人员发布全基因组单核苷酸变异数据库
10月22日，国际学术期刊Genome Biology 以PGG.SNV： understanding the evolutionary and medical implications of human single nucleotide variations in diverse popul
“大数据”助力人类疾病研究
近年来，科学家们依托“大数据”在改善人类健康、助力人类疾病研究上取得了重大进展，本文中，小编就对近期相关研究成果进行整理，分享给大家！ 图片来源：CC0 Public Domain 【1】Front Immunol：大数据帮助设计更好的流感疫苗 doi：10.3389/fimmu.2019
癌症学研究公布最新数据集
据英国《自然》杂志10月17日在线发表的一项癌症研究，美国俄勒冈健康与科学大学公布了一个数据集，揭示了此前未发现的、急性髓性白血病（AML）患者的特定突变与药物敏感性之间的关联。这些发现将增进对急性髓性白血病的生物学和临床方面的理解。 急性髓性白血病是一种非常多样化的疾病，目前已在患者中观察到
遥感数据智能重构研究获进展
近日，中国科学院南海海洋研究所研究员唐世林团队与自然资源部南海预报减灾中心正高级工程师杨超宇合作，在遥感数据智能重构研究方面取得新进展，实现了南海多源遥感高分辨率海表叶绿素逐日产品的精准重构。相关成果发表于《地球系统科学数据》（Earth System Science Data）。 OI-SwinU
药品研究色谱数据工作站及色谱数据管理要求
本文规定了药品注册申报研究工作采用的色谱数据工作站的基本要求和色谱数据的管理要求。同时，为保证色谱数据的完整性和可靠性，色谱数据工作站需建立信息安全管理体系。 1、色谱数据工作站基本要求 色谱数据工作站获得的色谱数据应当可靠、安全、完整、可溯源。 鼓励采用经规范和系统验证的色谱数据工作站进
药品研究色谱数据工作站及色谱数据管理要求
1、色谱数据工作站基本要求 色谱数据工作站获得的色谱数据应当可靠、安全、完整、可溯源。 鼓励采用经规范和系统验证的色谱数据工作站进行研究工作。 色谱数据工作站验证可由工作站制造商进行，注册申请人依据工作站制造商的评估和验证报告对工作站获得色谱数据的完整性、可靠性、安全性
－华大基因收购美国上市公司CG－奠定基因大数据基础
对深圳华大基因，腾讯马化腾有一段评价：用大数据的算法，与以前的医学理论不一样。看一个人的疾病，只是看他得病的特征与哪种病吻合，推导出具体对哪个部 位对症下药。到时，药可能是治基因的某一段。基因哪一段出问题，就拿相应的药去治。这个思路很开放，用了大数据，是一个很好的案例。 带领华大基因建
国家基因组科学数据中心公布数据资源整合挖掘体系
近日，国家基因组科学数据中心在国际学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表题为Database Resources of the National Genomics Data Center in 2020 的文章，以整体形式介绍基因组数据资源整合与挖掘体系建设
Nat－Genetics：大数据揭示疾病的基因关联
想象一下，雨水落在人行道上的场景。虽然雨滴落地似乎是随机发生的，但随着时间的推移，人行道仍然会有一片区域保持干燥。这个类比类似于犹他大学健康研究所的研究人员设计的一种新方法。他们探索了超过100,000名健康人，以确定我们不容易改变的基因区域。他们认为，这些“受限制”区域的DNA突变可能会导致严
基因“好”“坏”，大数据说了算
为什么白菜有卷心不卷心之分，颜色也有黄绿蓝白多种，但同属十字花科的拟南芥，全世界的却都长一个样？4月18日，科技日报记者从江苏省农业科学院获悉，该院杜建厂研究团队发现，基因性质在很大程度上取决于选择方式，白菜的多样性可能是因为正选择作用基因较多。 根据自然选择方式的不同，基因一般可分为两种类型
基因大数据深度挖掘，我们将面临挑战
在日前于北京召开的第四届全国功能基因组学高峰论坛上，众多与会专家就基因技术发展方向及面临的机遇与挑战进行了深入交流。作为一种新型基因检测技术，基因测序能从血液或唾液中分析测定基因全序列，预测罹患多种疾病的可能性、个体的行为特征及行为合理性。基因测序技术能锁定个人病变基因，予以提前预防和治疗。
基因组数据分析的“金标准”
五月十八日，美国安大略癌症研究所、俄勒冈健康与科学大学、赛智生物网络（Sage Bionetworks）、分布式DREAM 团体(Dialog for Reverse Engineering Assessment and Methods)和加州大学圣克鲁兹分校的癌症研究人员，在《Nature M
警惕基因检测背后的数据安全问题
日前，国内知名基因检测公司23魔方推出第四代基因检测产品。23魔方CEO周坤称，目前，23魔方已累积16万人的样本数据库，是中国消费级基因检测公司中最大的。“得益于真实可留存的规模用户数据，23魔方可以进一步开展科学研究，做准做精项目。” 点评：基金检测公司主张用科技预测未来，并提供精准的护肤
在Matlab中探索基因表达数据分析
DNA微阵列基因表达数据分析 本文利用Matlab及其生物信息学 工具箱提供的函数识别差异表达基因并利用基因本体论确定差异表达基因的生物学功能。 引言 包含寡核苷酸或cDNA 探针的微阵列可用来比较基因组尺度的基因表达谱，微阵列试验的重要目的在于确定不同条件下，如两种不同的肿瘤
首款体内基因编辑疗法公布首批数据
今天美国生物技术公司Sangamo公布了其Hunter氏症（也称MPS II）体内基因编辑疗法SB-913的早期数据。两位低剂量患者没有什么应答，但两位中剂量患者使用SB-913 16周后糖胺聚糖（GAGs）水平有显着下降（尿GAG下降51%，硫酸皮肤素下降32%，硫酸类肝素下降61%）。但在外
－生物医学基因大数据：现状与展望
生物医学大数据广泛涉及人类健康相关的各个领域：临床医疗、公共卫生、医药研发、医疗市场与费用、个体行为与情绪、人类遗传学与组学、社会人口学、环境、健康网络与媒体数据。 大数据(big data)是指由于容量太大和过于复杂，无法在一定时间内用常规软件对其内容进行抓取、管理、存储、检索、共享、传输和
双创：科技是基因－大数据是骨骼
2016年5月30日，全国科技创新大会明确了我国科技事业的发展目标，并把创新驱动放在了国家发展全局的核心位置。 作为新兴前沿科技，大数据是这个时代开放与创新的标志。数字经济时代所带来的颠覆与革新，正在让这个世界悄然发生着巨变。数字经济完全打破了区域时空的限制，让资源配置更有效率，促进了产业间的
测序新技术提供基因表达高精数据
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/6/481704.shtm 科技日报北京6月27日电 （实习记者张佳欣）最近，日本东京理科大学的一个研究小组开发了一种新改进的单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术。这种新方法，即终止子辅助固相互补DN
华大基因中心正研究智商基因
中国有基因中心进行天才基因比对研究，希望解开人类智力密码。相关研究容易引起道德争议，被利用来针对某个族群。亦有学者担心，人类有朝一日会藉研究成果，透过胚胎筛选技术製造天才婴儿。 深圳华大基因中心进行的基因智力专桉，是将从世界各地收集到的2000组聪明人的基因样本，和普通人的基因样本做比对，
华大基因回应14万中国人基因大数据是否外泄
就深交所问询函，华大基因回复表示：“14 万中国人基因大数据”项目无外方合作机构。项目分析工作均在境内由中国科研团队完成。14 万中国人基因大数据来自同意将样本和数据供科学研究的受检者。研究披露的是群体分析结果，不包含任何可识别个人身份信息，不存在泄露个人隐私的风险。 昨天北京青年报记者获悉，
GenomeAsia－100K最新数据公布！探索亚洲人基因数据的秘密
目前已经测序的人类基因组序列中约有6%的样本来自亚洲个体。而世界上约一半的人口是亚洲人。GenomeAsia 100K项目成立于2016年，由Macrogen、盆唐首尔大学医院精准医疗中心、新加坡南洋理工大学、印度基因组分析企业MedGenome和美国罗氏集团子公司Genentech等组成，旨在
多项血液肿瘤研究数据亮相ASH年会
近日，多项血液肿瘤管线最新数据在第65届美国血液学协会（ASH）年会上公布。其中奥布替尼联合方案治疗初治套细胞淋巴瘤（MCL）患者研究入选口头报告。 一项由天津医科大学肿瘤医院张会来教授作为第一作者和通讯作者的奥布替尼+来那度胺+利妥昔单抗联合方案治疗初治MCL患者的前瞻多中心II期研究（PO