中科院专家完成我国第一个杀蚊微生物全基因组测序
近日,我国第一个杀蚊微生物基因组——球形芽孢杆菌C3-41菌株全基因组已经测序完成,通过序列的比较分析,表明该细菌同一种海洋芽孢杆菌具有亲缘关系,其不能利用糖类物质的主要原因是缺乏糖转运系统和糖代谢的关键酶。该研究成果在最近的《细菌学杂志》和《应用微生物学杂志》上发表。球形芽孢杆菌是专一感染各类蚊幼虫的天然病原菌,C3-41菌株是中国科学院武汉病毒研究所筛选出来的优良杀蚊细菌,由其开发研制的我国第一个登记注册的微生物杀蚊剂在我国进行了连续二十年成功应用,该基因组的完成将进一步推动生物防治灭蚊的基础研究。 中国科学院武汉病毒研究所袁志明研究员率领的研究小组,长期从事杀虫细菌的基础和应用基础研究。在杀虫细菌资源、毒素蛋白基因的克隆和表达及高效广谱杀蚊工程菌的构建、抗性昆虫抗性机理、杀虫剂的生产和应用等方面取得了一系列重要科研成果。所研制的球形芽孢杆菌杀蚊幼剂制剂对疾病媒介库蚊、按蚊具有特异性毒杀作用,对人畜禽、水生生物无毒、不污染......阅读全文
中科院农资中心团队部在环境功能基因发掘方法上获进展
从环境宏基因组中挖掘功能基因通常有两条技术路线,一条是建立克隆文库后直接用筛选压力筛选阳性克隆,一条是通过设计引物,从宏基因组中克隆目标基因,然后进行功能研究。近日,中科院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心研究员李小方团队发展了第三条技术路线,实现了规模化、回避筛选压力的功能宏基因组路线,并
谁在先?“鸡基因组”和“鸡蛋基因组”
是先有鸡还是先有鸡蛋?这个问题相当恼人,恐怕很难说清楚。现在,研究人员回答了与这个问题一样恼人的问题:是人类基因组中的成千上万的长重复DNA片段中,那个是第一个产生的?那些被复制了? 这个答案发表在10月7日的《自然·遗传学》杂志上。该研究给出了人类基因组中DNA重复片段复制的第一个进化证据,这种
第三条路线,我学者实现环境宏基因组功能基因发掘突破
从环境宏基因组中挖掘功能基因通常有两条技术路线,一条是建立克隆文库后直接用筛选压力筛选阳性克隆,一条是通过设计引物,从宏基因组中克隆目标基因,然后进行功能研究。近日,李小方研究员团队发展了第三条技术路线,实现了规模化、回避筛选压力的功能宏基因组路线,并用于了金属硫蛋白基因的高通量挖掘。该研究以“
基因组测序
如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的
叶绿体基因组
叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能的重要细胞器,叶绿体中进行的光合作用是严格地受到遗传控制的。早在20世纪初,人们就已知叶绿体的某些性状是呈非孟德尔式遗传的,但直到60年代才发现了叶绿体DNA(chloroplast DNA,ctDNA)。叶绿体基因组是一个裸露的环状双链DNA分子,其大小在1
微生物矿化和感磁运动起源于太古代
近日,中科院地质地球所研究人员与国内外科学家合作,利用谱系年代学分析方法,揭示趋磁细菌起源于距今30亿年前的中太古代,早于地球大氧化事件,是地球上最早出现的既能感应磁场又能进行矿化的生物类群。相关成果于2月28日发表于《美国国家科学院院刊》。 地球在太古代是否具有地核发电机一直是地球内部结构和
科学家发现高等真核生物中DNA新修饰方式
DNA甲基化作为重要表观遗传机制调控基因的表达,从而影响一系列的生物学过程,如细胞命运决定、发育和组织、器官的稳态维持。医学上,DNA甲基化失调与人类疾病密切相关,如肿瘤。DNA甲基化以多种修饰方式[5-methylcytosine (5mC), N6-methyladenine (6mA) 和
研究揭示细菌粉碎技术对抗超级耐药细菌
研究人员利用液态金属开发了新的杀菌技术,这可能是解决抗生素耐药性这一致命问题的答案。 这项技术使用磁性液态金属的纳米颗粒来粉碎细菌和细菌生物膜--细菌茁壮成长的保护性"房子"--而不伤害有益细胞。 这项由RMIT大学领导的研究发表在ACS Nano杂志上,为寻找更好的抗菌技术提供了一个突破性
细菌鉴定仪出现“不能鉴定细菌”的处理
我们对现今应用较为普遍的VITEK-AMS鉴定系统中报告“不能鉴定细菌”(UIO)菌株作了进一步分析,探讨其发生原因、处理方法,以期建立一套切实可行的仪器与手工方法相结合的细菌鉴定方法。 一、材料与方法 1. 仪器与试剂:VITEK-AMS 60型全自动细菌鉴定仪及其配套GNI、GPI、YBC试
细菌RNA制备实验——革兰氏阴性细菌中提取
实验材料RNA试剂、试剂盒STET氯仿乙酸钠氯化铯无水乙醇EDTA仪器、耗材离心机分光光度计摇床实验步骤1. 培养100 ml 大肠杆菌或500 ml 蓝细菌至对数生长期,加入1/20体积终止缓冲液,置于冰上。2. 于4℃用JA-10转子17 700 g 离心5 min 收集细胞。3. 用2
细菌鉴定仪出现“不能鉴定细菌”的处理
我们对现今应用较为普遍的VITEK-AMS鉴定系统中报告“不能鉴定细菌”(UIO)菌株作了进一步分析,探讨其发生原因、处理方法,以期建立一套切实可行的 仪器与手工方法相结合的 细菌鉴定方法。 一、材料与方法 1.仪器与试剂:VITEK-AMS 60型全自动细菌鉴定仪及其配套GNI、GPI
磷细菌和钾细菌混合培养的研究
本文对生产菌肥的磷细菌和钾细菌进行了混合培养,设计了三因素随机区组试验,探讨混合菌肥的最佳生产工艺,并对实验结果进行了方差分析。结果表明磷细菌和钾细菌可以混合培养,各处理结果经LSR测验,主效A因素(混合比例)中A4水平、B因素(培养基配方)中B2水平和c因素(培养时间)中C5水平显著高于同组中的其
细菌鉴定仪出现“不能鉴定细菌”的处理
我们对现今应用较为普遍的VITEK-AMS鉴定系统中报告“不能鉴定细菌”(UIO)菌株作了进一步分析,探讨其发生原因、处理方法,以期建立一套切实可行的仪器与手工方法相结合的细菌鉴定方法。 一、材料与方法 1. 仪器与试剂:VITEK-AMS 60型全自动细菌鉴定仪及其配套GNI、
GenomeResearch发表基因组研究新发现基因组
多伦多大学的科学家们发现,作为基因组看门人的C2H2-锌指蛋白(C2H2-ZF)实际上肩负着更加多样化的职责。这项发表在Genome Research杂志上的研究,有助于我们更准确地解读个人基因组。C2H2-ZF有大约七百个成员,是规模最大的一种人类蛋白。然而,人们对这些蛋白一直知之甚少。C2H2-
全基因组的比较基因组杂交技术介绍
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a
清华大学Nature子刊:利用Cas9实现基因克隆
来自清华大学、中科院微生物研究所的研究人员报告称,他们开发出了一种新技术,通过Cas9辅助靶向染色体片段(CATCH),可一步靶向克隆出大基因簇。这一重要的研究成果发布在9月1日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。 清华大学的朱听(Ting Zhu)研究员、特
植物基因组“剪刀”-被成功打造-可编辑基因组任意位置
中科院上海植物逆境生物学研究中心朱健康课题组通过模仿和改造微生物中的一种抵御外源侵染的防护机制,成功开发出能对植物基因组进行精确定点修饰的技术,从而使高效植物分子改良性状成为可能。这一适用于植物的CRISPR-Cas技术就像一把剪刀,可以对基因组中任意感兴趣的位置进行编辑,它的成功开发将革命性地改变
上海科技大学等研制出“超级细菌”碱基编辑器
上海科技大学物质学院教授季泉江课题组与中科院北京基因组所研究员韩大力课题组合作,首次在金黄色葡萄球菌中建立单碱基编辑技术。相关研究成果近日在线发表于英国皇家化学会旗舰期刊《化学科学》。图片来源于网络 季泉江课题组此前已成功开发出金黄色葡萄球菌中基于CRISPR/Cas9的基因组编辑技术,简化了
Nature子刊:来自人类肠道细菌的小型化Cas9,可用于高效精准的基因组编辑
CRISPR基因编辑技术极大地加速了遗传疾病治疗方法的开发。然而,临床的进一步发展在很大程度上取决于开发多样化工具以应对基因组编辑的挑战。其中,最关键的一个方面是递送,因为Cas核酸酶及其衍生的融合产物(包括碱基编辑器、先导编辑器)的尺寸较大。 腺相关病毒(AAV)是最高效和最广泛使用的体内递
聪明的细菌
据《每日科学》网站报道,瑞典隆德大学(Lund University)研究人员发现,呼吸道内的细菌可以“互相帮助”,以实现存活。这也就是是说,细菌可能要比我们之前所认为的要更加聪明。 这种名为流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae)的细菌属于呼吸道细菌的一种,能够导致耳部感
细菌的结构
细菌的结构分为基本结构和特殊结构。基本结构是各种细菌都具有的结构,包括细菌的细胞壁、细胞膜、细胞质、核质。某些细菌特有的结构称为特殊结构,包括细菌的荚膜、鞭毛、菌毛、芽胞。
细菌的种类
并可根据形状分为三类,即:球菌、杆菌和螺旋菌(包括弧菌、螺菌、螺杆菌)。按细菌的生活方式来分类,分为两大类:自养菌和异养菌,其中异养菌包括腐生菌和寄生菌。按细菌对氧气的需求来分类,可分为需氧(完全需氧和微需氧)和厌氧(不完全厌氧、有氧耐受和完全厌氧)细菌。按细菌生存温度分类,可分为喜冷、常温和喜
细菌的合成
2016年3月28日科学家在实验室中制造了一个人工细菌基因组,只包括生命所需的最少量基因。这一成果使得为了特定任务——如清除石油——而定制基因组的合成生物体成为可能。这种人工细菌能够代谢营养物质并自我复制(分裂和增殖)。它只具有473个基因,相比之下,自然界中的细菌往往具有数千个基因。不过,研究
细菌的转导
一、基本知识与原理 转导是以噬菌体为媒介将一个细胞的遗传物质转移给另一个细胞的过程。随着分子遗传学的发展,转身已成为基因精细结构分析的常用方法之一。 根据噬菌体转导供体菌基因的差异,转导可分为普遍性转导和局限性转导。这里以局限性转导为例说明转导的基本原理。局限性转导实验中常用的是大噬菌体,它能整合在
细菌的培养
实验概要学习细菌的培养方法及培养基的配置。实验原理在基因工程实验和分子生物学实验中,细菌是不可缺少的实验材料。质粒的保存、增殖和转化;基因文库的建立等都离不开细菌。特别是常用的大肠杆菌。 大肠杆菌是含有长约3000kb的环状染色体的棒状细胞。它能在仅含碳水化合物和提供氮、磷和微量元素的无机盐的培养基
细菌的转导
一、基本知识与原理 转导是以噬菌体为媒介将一个细胞的遗传物质转移给另一个细胞的过程。随着分子遗传学的发展,转身已成为基因精细结构分析的常用方法之一。 根据噬菌体转导供体菌基因的差异,转导可分为普遍性转导和局限性转导。这里以局限性转导为例说明转导的基本原理。局限性转导实验中常用的是大噬菌体,它能整合在
如何鉴定细菌?
细菌的鉴定程序:①细菌形态学检查;②细菌生长特性;③生物化学试验;④抗原构造及血清学诊断;⑤噬菌体及药物敏感试验;⑥毒力测定及动物试验。
细菌的运动
运动型细菌可以依靠鞭毛,细菌滑行或改变浮力来四处移动。另一类细菌,螺旋体,具有一些类似鞭毛的结构,称为轴丝,连接周质的两细胞膜。当他们移动时,身体呈现扭曲的螺旋型。螺旋菌则不具轴丝,但其具有鞭毛。细菌鞭毛以不同方式排布。细菌一端可以有单独的极鞭毛,或者一丛鞭毛。周毛菌表面具有分散的鞭毛。运动型细菌可
细菌的概述
细菌的概述:细菌(英文:germs;学名:bacteria)是生物的主要类群之一,属于细菌域。广义的细菌即为原核生物, 是指一大类细胞核无核膜包裹,只存在拟核区(nuclear region)(或拟核)的裸露DNA的原始单细胞生物,包括真细菌(eubacteria)和古生菌(archaea)两大类群
细菌细胞密度
细菌细胞密度(OD 600) 实验室确定细菌生长密度和生长期,多根据经验和目测推断细菌的生长密度。在遇到要求较高的实验,需要采用分光光度计准确测定细菌细胞密度。OD600是追踪液体培养物中微生物生长的标准方法。以未加菌液的培养液作为空白液,之后定量培养后的含菌培养液。为了保证正确操作,必须