通过qPCR开展基因表达谱分析
一提起基因表达谱分析，大家马上会想到芯片。然而，并不是每个实验室都具备这个条件。现在，利用每个实验室都有的定量PCR仪，也能开展可靠的基因表达谱分析啦。 QIAGEN推出的RT2 Profiler PCR Array是一种高度可靠且灵敏的基因表达谱分析技术，它利用实时定量PCR分析信号转导、生物过程或疾病研究通路中聚焦的一组基因。 目录上的每个RT2 Profiler PCR Array都包含一列通路聚焦的基因以及5个看家(参考)基因。此外，每个阵列还包含一组ZL的对照，以监控基因组DNA污染(GDC)以及第一链合成(RTC)和实时定量PCR的效率(PPC)。 为什么要使用RT2 Profiler PCR Array? - 简约：RT2 Profiler PCR Array的简约让常规的表达谱分析可在任何科研实验室的实时定量PCR仪上实现。 - 性能：RT2 Profiler ......阅读全文
基因表达数据分析主成分分析－PCA
DNA微阵列基因表达数据分析 主成分分析 ( Princ ipal Component Analysis ， PCA ) 是一种掌握事物主要矛盾的统计分析方法，它可以从多元事物中解析出主要影响因素，揭示事物的本质，简化复杂的问题。计算主成分的目的是将高维数据投影到较低维空间。给定 n 个变量的 m
在Matlab中探索基因表达数据分析
DNA微阵列基因表达数据分析 本文利用Matlab及其生物信息学 工具箱提供的函数识别差异表达基因并利用基因本体论确定差异表达基因的生物学功能。 引言 包含寡核苷酸或cDNA 探针的微阵列可用来比较基因组尺度的基因表达谱，微阵列试验的重要目的在于确定不同条件下，如两种不同的肿瘤
基因表达谱数据聚类分析相关内容
DNA微阵列基因表达数据分析 对于基因表达谱数据的分析是生物信息学 的研究热点和难点。转化为数学问题，分析任务是从数据矩阵 M 中找出显著性结构，结构类型包括全局模型 (model) 和局部模式 (pattern) 。对基因表达谱数据的分析是数据挖掘问题，所采用的方法包括通过可视化进行探索性数据分析
基因表达的系列分析
中文名称基因表达的系列分析英文名称serial analysis of gene expression;SAGE定 义通过构建较短的表达序列标签规模化地检测基因表达种类及其丰度的实验技术。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
基因表达系列分析简介
1995年Velculescu等提出了基因表达系列分析(Serial Analysis of Gene Expression,SAGE)技术，能同时对上千个转录本进行研究。 SAGE是一种快速分析基因表达信息的技术,它通过快速和详细分析成千上万个表达序列标签（Expressed Sequenc
plos－biology：我们对基因表达数据存在普遍误解
数据可重复性一直以来都是实验生物学的一个主要问题，随着基因组技术的发展以及相关数据复杂性的不断提高，这一问题的严重性又得到了很大程度地提升。 11月12日，特拉维夫大学的Shir Mandelbaum，Zohar Manber，Orna Elroy-Stein和Ran Elkon在《PLOS
DNA－microarray相关的基因表达数据处理攻略
基因表达谱 的发展有助于科研工作人员进一步的理论知识充实及应用到研发等领域中。基因芯片是最近几年发展起来的基因表达重要工具，本文主要对这种技术的数据分析和管理方法作具体介绍。一、引言DNA微阵列(DNA microarray),也叫基因芯片，是近几年发展起来的一种能快速、高效检测DNA片段序列、基因
基因表达的系列分析实验
实验材料 玻璃及塑料器皿 试剂、试剂盒 溶液与缓冲液 引物
基因表达的系列分析实验
SAGE(Velculescuetal.1995) 是基于 PCR 技术的一种高灵敏度研究基因表达的方法，可得到 mRNA 文库的定性及定量信息。自 1995 年此技术产生以来，发表了大量的相关文章，表明 SAGE 可同时检测大量基因的表达水平的变化。实验材料玻璃及塑料器皿试剂、试剂盒溶液与缓冲液引
基因表达系列分析实验（SAGE）
实验材料感兴趣的细胞或组织试剂、试剂盒糖原EDTA缓冲液SDSBSATween 20连接子T4 DNA 连接酶BsmFIPC8SeeDNA乙酸钠乙醇DMSOPCR引物乙酸铵DNA ladder聚丙烯酰胺 TBE凝胶DNA参照pZErO-1 质粒TE缓冲SOC培养液Tris · Cl仪器、耗材微量离心
Cell：基因表达分析的反思
在最新一期（10月26日）的《细胞》（Cell）杂志上，来自怀特黑德研究所的研究人员报告称在生成和注释来自全基因表达（global gene expression）分析的数据时所采用的一种常用假设可以造成当前广泛的生物学研究中关于基因活性与细胞行为的结论出现严重错误。 怀特黑德研究所成员Richa
基因表达差异分析方法进展
高等真核生物的基因组一般具有80 000～100 000个基因，而每一个细胞大约只表达其中的15%［1］。基因在不同细胞间及不同生长阶段的选择性表达决定了生命活动的多样性，如发育与分化、衰老与死亡、内环境稳定、细胞周期调控等。比较细胞间基因表达的差异为我们揭示生命活动的规律提供了依据。
TLP基因的表达模式分析
实验概要本实验对水稻、拟南芥及杨树的TLP基因表达模式进行了分析，为进一步研明植物中TLP基因的功能奠定基础。实验步骤1. 水稻TLP基因的RT-PCR分析 1) 植物材料选取水稻的根、茎、叶、花和种子的新鲜组织用于RNA的提取。水稻材料采集后，用液氮速冻，以保证RNA不被降解，然后冻存于-70
基因表达的系列分析实验
实验材料 玻璃及塑料器皿试剂、试剂盒 溶液与缓冲液引物仪器、耗材 试剂盒MPC-EPCR仪Gene PulserII 型系统实验步骤 一、一般原则若用于 SAGE 的 RNA 有足够的量，最好用 2.5~5 ug polyA+RNA, 可按实验方案 A 进行。这里我们还提供了实验方案 B，它在多
基因表达快速分析新技术
实验概要介绍了一种新的基因表达快速分析技术-MPSS 技术的基本原理、技术路线及其优点和应用。实验原理MPSS技术是利用限制性内切酶和荧光检测知识,发展出的一种辨认和测定细胞每一个cDNA 克隆片段末端16～20bp序列的方法,从而查明细胞内所有基因的表达情况。MPSS 分析系统大体可划分为三大部分
定量－PCR－基因表达的实验数据应如何处理？
总的来说，有三个层次的校正是必须要做的。 参比信号校正。试剂中必须包含固定浓度的 ROX，这样由于反应总体积的差异、所在孔的位置不同、试管壁的厚度差异、管盖透光性能的差异等所引起的荧光信号波动都能够被扣除，使数据真正反映 PCR 进程。ROX 校正能够极大地改进定量的精确度，提高重复管之间的
大型衰老相关基因表达谱数据库建成
英国《自然·通讯》杂志30日发表的一项研究称，包括人类在内的4个物种的大型衰老相关基因表达谱数据库建成。德国科学家团队分析数据后发现，衰老相关基因的表达变化与退行性慢性病相关基因的表达变化轨迹一致，但与癌症的相反。 对衰老及衰老相关疾病的研究，一直是人类医学的难题。但随着“衰老基因”的确定，衰
什么是基因表达的系列分析？
中文名称基因表达的系列分析英文名称serial analysis of gene expression;SAGE定 义通过构建较短的表达序列标签规模化地检测基因表达种类及其丰度的实验技术。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
基因表达系列分析实验（SAGE）（四）
83. 用作测序的 2 ul PCR 产物（所需的确切用量取决于测序的方案，并应当优化）用下述方法处理：0.1 ul 外切核酸酶 I0.1 ul 虾碱性磷酸酶1.8 ul 50 mmol/L Tris·Cl，pH 8. 0加 2 ul 消化混合液到 2 ul DNA 中。84. 在热循环仪上进行反应
基因表达系列分析实验（SAGE）（二）
31. 乙醇沉淀：11.5 ml 样品10 ul SeeDNA100 ul 糖原5.1 ml 7.5 mol/L 乙酸铵38.3 ml 100％ 乙醇干冰/甲醇浴 15 min。然后室温溶化 2 min。32. 轻轻涡旋混匀，台式离心机的吊桶转子室温约 3000 g （4000 r/min） 离心
基因表达系列分析的原理简介
第一、一个9～10碱基的短核苷酸序列标签包含有足够的信息，能够唯一确认一种转录物。例如，一个9碱基顺序能够分辨262144个不同的转录物（49），而人类基因组估计仅能编码80000种转录物，所以理论上每一个9碱基标签能够代表一种转录物的特征序列。 第二、如果能将9碱基的标签集中于一个克隆中进行
基因表达系列分析实验（SAGE）（三）
58. 用 1：10 000 的 SYBR Green I 染 15 min。在 UV 盒上观察，分出感兴趣的区带。59. 把每一块凝胶放入底部有约 0.5 mm 小洞的 0.5 ml 微量离心管中（用 21-G 针头刺的）。60. 把 0.5 离心管连同凝胶块放入 2.0 ml 的硅烷化的离心管里
TaqMan探针基因表达分析全面升级
TaqMan探针对于大家来说不是什么新名词了，然而你知道吗，对于部分降解的RNA，如福尔马林固定、石蜡包埋（FFPE）样品中的RNA，TaqMan引物探针的设计有更多的讲究，你知道这是为什么吗？FFPE样本在固定时导致核酸相互交联且片段化，RNA片段的大小在50-300 nt，大部分片段在100 n
基因表达系列分析实验（SAGE）（一）
实验方法原理 实验材料 感兴趣的细胞或组织试剂、试剂盒 糖原EDTA缓冲液SDSBSATween 20连接子T4 DNA 连接酶BsmFIPC8SeeDNA乙酸钠乙醇DMSOPCR引物乙酸铵DNA ladder 聚丙烯酰胺 TBE凝胶DNA参照pZErO-1 质粒TE缓冲SOC培养液Tris · C
RSV感染的基因表达谱分析
发表在11月12日的PLOS Medicine杂志上的一项研究，采用全血基因表达谱分析估测了儿童RSV感染的发病机制和疾病严重程度，揭示了在儿童中由RSV感染引起的免疫反应的系统学调节异常，表明分子标记能够用来预测疾病的严重程度。 呼吸道合胞体病毒(RSV，Respiratory sy
通过qPCR开展基因表达谱分析
一提起基因表达谱分析，大家马上会想到芯片。然而，并不是每个实验室都具备这个条件。现在，利用每个实验室都有的定量PCR仪，也能开展可靠的基因表达谱分析啦。 QIAGEN推出的RT2 Profiler PCR Array是一种高度可靠且灵敏的基因表达谱分析技术，它利用实时定量PC
转基因植物的GUS表达分析
实验概要本实验对转基因拟南芥进行了GUS组织化学染色分析及GUS活性测定。主要试剂X-Gluc，丙酮，乙醇，BSA，考马斯亮蓝溶液主要设备显微镜(BX50 OLYPUS)，研钵，高速离心机，Nano drop核酸蛋白测定仪实验材料转基因拟南芥实验步骤1. 转基因植物的GUS组织化学染色分析 1)
用－cDNA－芯片分析人类基因表达实验
实验材料 母板试剂、试剂盒 细菌细胞中的标记LB 培养基氨苄青霉素乙醇Super 肉汤培养基 甘油96孔碱裂液T low E 缓冲液10 X PCR 缓冲液 20 X SSC琥拍酸酐仪器、耗材 96深孔板和V 形塑料细胞培养皿水平微量培养板离心96孔多位点复制针1 加仑储存袋多微孔的带层带孔的振荡器
加速干细胞疗法的基因表达分析技术
最近，美国国立卫生研究院（NIH）的研究人员开发出一种技术，将加快干细胞衍生组织的生产。 这种方法可同时测量多个基因的表达，使科学家们能够根据细胞的功能和发育阶段，快速地描述细胞。该技术将帮助研究人员使用患者的皮肤，再生视网膜色素上皮细胞（RPE，眼睛后面的一种组织，在几种致盲眼疾中受影响）。
什么是基因表达调控？基因表达调控有什么意义
意义：1.适应环境、维持生长和增殖：生物体赖以生存的外环境是在不断变化的，为了生存，所有活细胞都必须对外环境变化作出适当反应，调节代谢，以适应环境变化。生物体适应环境、调节代谢的能力与蛋白质分子的生物学功能有关。而蛋白质的水平又受基因表达的调控。2.维持个体发育与分化：多细胞生物调节基因的表达除为适