首个韩国人基因组图谱绘制成功
据韩国联合通讯报道，韩国研究机构日前宣布，第一个完整的韩国人基因组图谱已经绘制成功。 报道指出，这是人类染色体碱基序列第四次被完整破译，这项成果是由韩国嘉泉医科大学和韩国生命工程研究院的两个研究团队通过共同研究取得的。研究人员宣布，分析测序中使用的基因物质来自于嘉泉医科大学教授金圣镇。 研究的目的是建立韩国人标准染色体数据库。研究人员期待，在染色体碱基序列图谱基础上进一步分析韩国人特有的遗传特性，有助于探明韩国人种发病率较高的遗传性疾病的病因，找到后基因时代的解决办法。 联合通讯社引用研究人员的观点说，对韩国人基因组图谱的初步解读从科学意义上证实了韩国人同中国人和日本人的差异性。染色体碱基序列分析发现，在非洲人、西方人及东方人中，韩国人的基因属于东方人类型，居中国人和日本人之间。以单核苷酸多态性位点（SNP）分析，金圣镇的染色体与美国沃森和中国杨焕明此前发表的染色体序列的差异度分别为0.05%和0.......阅读全文
《Genome－Research》：根据基因组序列预测MRSA毒性
微生物毒力一直是一个复杂的多因素表型，与病原体的进化轨迹有着复杂的关联。毒性，破坏宿主细胞膜和粘附的能力，粘附到人体组织的能力，是许多细菌病原体的主要毒力因子，包括金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)。 金黄色葡萄球菌是临床上常见的毒性较强的细菌，自从上世纪40
Genome－Biology发布菜豆基因组测序结果
菜豆（Phaseolus），是世界上最古老的作物之一。几千年前，它与玉米和木薯一起，在美国被驯养，成为世界性的主要主食。根据联合国粮食和农业组织（FAO）的研究显示，普通菜豆是最重要的粮食豆类，占世界食用豆类食品的50%，在超过5亿人的饮食中显得尤为重要。这种作物种植在拉丁美洲、非洲、中东、中国
Illumina收购Edico－Genome，加速基因组数据分析
Edico的DRAGEN™ Bio-IT平台为新一代测序带来了更快更简化的输出。 圣迭戈——2018年5月15日——Illumina公司（纳斯达克代码：ILMN）宣布收购新一代测序（NGS）数据分析加速解决方案的领先供应商Edico Genome。Edico Genome的DRAGEN™ B
Genome－Res：全基因组测序追踪耐药细菌传播机制
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）是一种常见的引发院内感染的致病菌，其也是资源不足医院感染的一大负担，此前当资源较好的临床机构运用全基因组测序来追踪MRSA的扩散时，针对有限的感染控制的传播动力学常常并不清楚，近日，来自剑桥大学的研究人员就利用全基因组测序的技术揭示了高传播率的资源受限医院中M
苏州大学Genome－Biology：聚焦基因组中的新基因
来自苏州大学、芝加哥大学的研究人员在新研究中，调查了人类和小鼠基因组中新基因驱动基因间相互作用（GGI）网络的速度及模式。这项研究发布在近期的《基因组生物学》（Genome Biology）杂志上。 苏州大学的沈百荣（Bairong Shen）教授及芝加哥大学遗传与进化系终身教授龙漫远(Man
植物基因组DNA提取试剂盒MagExtractor®Plant－Genome
产品索引 5871 中文名称： 植物基因组DNA提取试剂盒 英文名称： MagExtractor®-Plant Genome- 产品编号： NPK -500 产品类别： 分子生物学 生产厂家： TOYOBO 产品价格：
Genome－Biology：新技术90分钟完成全基因组序列分析
美国国家儿童医院（Nationwide Children's Hospital）的研发人员最近在Genome Biology上发布了一个自主开发的分析软件，表示这个软件使寻找全基因组致病变异从几周缩短到按几十个小时。 第一个人类基因组测序完成耗时大约13年，耗费30亿美元，而现在技术测序
Plant－Genome－Annotation－Methods
Annotation of plant genomic sequences can be separated into structural and functional annotation. Structural annotation is the foundation of all
sothing－about－Genome－walking
Can anyone recommend a good kit for genome walking? I would like to find out the promoter sequence of a known gene. Is genome walking the way to do it
软件：Genomewide－Association－Study－Software
The software included are listed bellow IMPUTE a program for genotype imputation in genome-wide association studies and fine-mapping studies
Genome－Biology：为CRISPR选择最佳向导
细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争，为此它们演化出了多种防御机制，CRISPR-Cas9 适应性免疫系统就是其中之一。规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合，可以在引导RNA的指引下，靶标并切割入侵者的遗传物质。 2012年研究者们利用这一特点，将CRISPR系统发展成了强大
Genome－Biology：食物会影响DNA序列
牛津大学的研究人员在两种寄生虫中检测到了食物组分造成的DNA序列差异。他们在Genome Biology杂志上发表文章指出，食物能够影响生物的基因序列。 “生物从食物中获取原料构建自己的DNA。我们认为，食物组分可能应该能够改变生物的DNA。我们也许可以预测素食者熊猫与肉食者北极熊之间的基因差
Genome－Biology发文介绍RNA印记法
生物学家们逐渐意识到，RNA不只是DNA和蛋白之间的过渡产物，它对调节基因的表达有重要作用。深入研究RNA调控，能够帮助科学家们进一步理解相关疾病。 宾夕法尼亚大学的科学家们开发了分析RNA调控的新方法，这一方法能够有效获得RNA与RNA结合蛋白(RBP)互作的所有位点。这一发表在Geno
Genome－Res展现肿瘤与免疫的互动
现在，癌症的免疫疗法越来越受到人们的重视。去年，Science杂志将癌症免疫疗法被评为了“年度突破”之一。不过开发这类抗癌药物并不容易，因为肿瘤的突变模式存在很高的异质性，人体的免疫系统也各不相同。 在一项新研究中，研究人员分析了大量的肿瘤样本，并在此基础上鉴定了可以激活患者免疫系统的肿
Genome－Research：常见病源自基因调控
许多罕见疾病都是由基因突变引起的，例如镰状细胞贫血。然而，人们至今还未能确定引起复杂常见病(类风湿关节炎等)的基因突变。 Case Western Reserve大学医学院的研究人员对六种复杂的常见病进行研究，向人们展示这些疾病的病因在于基因以外的DNA改变，文章发表在Genome
Genome－Biol－Evol：重新揭秘遗传密码的规律
众所周知，细胞可以通过转录过程“解码” 其基因组DNA中包含的信息，并将其“翻译”为氨基酸，进而组装为蛋白质。通过大量的实验，科学家们找到了和核苷酸碱基分子与氨基酸分子之间的对应关系，并被称为“三联体”密码子。这种编码规则在进化上是十分保守的。例如，在几乎所有生物中，密码子“ AGA”对应着天冬
Genome－Biol－：PTEN基因缺失触发卵巢癌
英国癌症研究中心科学家都揭示名为PTEN基因的缺失会触发某些形式的卵巢癌，即所谓的高分级浆液性卵巢癌，相关研究公布在Genome Biology杂志上。 由英国癌症研究、剑桥研究所研究人员开展的一种革命性方法，即结合癌症样本图像与遗传数据获得了这项研究发现。他们证明确证PTEN的缺失是只在癌细
Genome－Biol－Evol：重新揭秘遗传密码的规律
众所周知，细胞可以通过转录过程“解码” 其基因组DNA中包含的信息，并将其“翻译”为氨基酸，进而组装为蛋白质。通过大量的实验，科学家们找到了和核苷酸碱基分子与氨基酸分子之间的对应关系，并被称为“三联体”密码子。这种编码规则在进化上是十分保守的。例如，在几乎所有生物中，密码子“ AGA”对应着天冬
染色体步移技术(genome－walking)简介
染色体步移技术（genome walking）是一种重要的分子生物学研究技术，使用这种技术可以有效获取与已知序列相邻的未知序列。染色体步移技术主要有以下几方面的应用：①根据已知的基因或分子标记连续步移，获取人、动物和植物的重要调控基因，可以用于研究结构基因的表达调控。如分离克隆启动子并对其功能进行研
染色体步移技术(genome－walking)简介
染色体步移技术（genome walking）是一种重要的分子生物学研究技术，使用这种技术可以有效获取与已知序列相邻的未知序列。染色体步移技术主要有以下几方面的应用：①根据已知的基因或分子标记连续步移，获取人、动物和植物的重要调控基因，可以用于研究结构基因的表达调控。如分离克隆启动子并对其功能进行研
Genome－Biology：大豆重要性状遗传网络解析
不同复杂性状间的耦合是分子设计育种的关键科学问题。作物的产量、品质等大都是多基因控制的复杂性状，由于受到一因多效和遗传连锁累赘的影响，使某些性状在不同材料和育种后代中协同变化，呈现耦合性相关。解析复杂性状间耦合的遗传调控网络，明确关键调控单元，对分子设计育种具有重要意义。大豆原产中国，是人类和动
厦门大学Genome－Res解析水稻基因调控机制
可选择性多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation,APA)是一种普遍存在于真核生物中的基因调控机制。APA事件的发生能使一个基因产生多种mRNA转录本，从而增加转录本的复杂度。选择不同的多聚腺苷酸化位点可以使不同的转录本具有不同的编码序列，或具有不同长度的3'
GenomeWide－Identification－of－Transcription－FactorBinding－Sites－in...
Genome-Wide Identification of Transcription Factor-Binding Sites in Plants Using Chromatin Immunoprecipitation Followed by Microarray (ChIP-chip)
中科院Genome－Research发表环状RNA新成果
早在几十年前，生物学家们就发现了环状RNA（circRNA）。环状RNA呈封闭环状结构，不受RNA外切酶影响不易降解，比线性RNA稳定得多。随着二代测序的发展，人们逐渐意识到环状RNA其实是非常普遍的。这些分子广泛存在于多种生物的细胞中，从古生菌、酵母、小鼠到人类。 环状RNA通常表达水平比较
Genome－Biology：RNAseq需要多长的读长？
随着新一代测序（NGS）的读长在不断增长，研究人员也开始纠结：到底多长的读长才合适？双端测序是不是优于单端测序？近日，康奈尔大学维尔医学院的研究人员在《Genome Biology》杂志上发表文章，认为对于差异表达分析而言，读长并非越长越好。不过，双端测序和长的读长无疑能改善剪接的检测。 最初
Genome－Research－：3基因或助人类进化成特殊种群
从人类基因组的30亿个碱基对中寻找进化出人类的基因并不是一件容易的事。现在，一组研究人员寻找到了由非编码DNA产生的3个基因，也许正是它们帮助人类进化成了独特的种群。 人类和黑猩猩在遗传学上非常相似，但是我们不难分辨两者之间的许多不同。据《基因组研究》(Genome Research
Genome－Medicine:－提高癌症治疗效果的新方法
通过挖掘大量的遗传数据，弗吉尼亚大学医学院的研究人员有望促进医生治疗癌症，预测患者预后并确定哪种治疗方法最适合某类患者的能力。 研究人员已经确定了我们基因的遗传变异，这些变异影响患者在诊断后和治疗过程中的表现。有了这些信息，医生将能够检查患者的基因组成，从而提供真正个性化的药物。 “肿瘤学家
973首席科学家发表《Genome－Biology》文章
来自西南大学蚕学与系统生物学研究所的研究人员利用家蚕全基因组芯片分析家蚕多种组织基因表达特征，这一研究成果公布在国际生物学权威期刊《Genome Biology》网络版上。 领导这一研究的是夏庆友教授，现任教育部“长江学者”特聘教授，“973”项目首席科学家 原文检索：Genome Biolog
六篇Genome－Res：模式生物的“百科全书”
modENCODE项目的一系列最新成果登上了本期Genome Research杂志的封面。这一项目启动于2007年，是建立在ENCODE计划之上的模式动物“生命百科全书”，旨在对两个模式生物（黑腹果蝇和秀丽隐杆线虫）的功能性基因组元件进行综合性分析。modENCODE联盟本次发表的六篇文章，为人
上海生科院《Genome－Res》生物信息学新成果
十月十三日，国际基因组研究权威刊物《Genome Research》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所（中国科学院—马普学会计算生物学伙伴研究所）的一项最新研究，题为“A probabilistic method for testing and estimating sele