GenomeBiology：大豆重要性状遗传网络解析
不同复杂性状间的耦合是分子设计育种的关键科学问题。作物的产量、品质等大都是多基因控制的复杂性状，由于受到一因多效和遗传连锁累赘的影响，使某些性状在不同材料和育种后代中协同变化，呈现耦合性相关。解析复杂性状间耦合的遗传调控网络，明确关键调控单元，对分子设计育种具有重要意义。大豆原产中国，是人类和动物油脂和蛋白质的主要来源。高效分子设计育种新体系的研究对于高产优质大豆新品种的培育具有重要意义。 中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜研究员联合王国栋研究员、朱保葛研究员、华盛顿州立大学张志武研究员等多家研究团队深入解析了大豆84个农艺性状间的遗传调控网络，为大豆的分子设计育种提供重要的理论基础。为了解析不同农艺性状之间的内在遗传调控网络，该研究团队首先对809份大豆栽培材料进行了重测序（平均深度约为8.3×），并对其遗传多样性进行了分析，明确了这些材料的群体结构。进而，对这809份材料的84个产量和品质性状进行了连续多年多点......阅读全文
Genome－Biology：大豆重要性状遗传网络解析
不同复杂性状间的耦合是分子设计育种的关键科学问题。作物的产量、品质等大都是多基因控制的复杂性状，由于受到一因多效和遗传连锁累赘的影响，使某些性状在不同材料和育种后代中协同变化，呈现耦合性相关。解析复杂性状间耦合的遗传调控网络，明确关键调控单元，对分子设计育种具有重要意义。大豆原产中国，是人类和动
遗传发育所大豆重要性状遗传网络解析取得新进展
不同复杂性状间的耦合是分子设计育种的关键科学问题。作物的产量、品质等大都是多基因控制的复杂性状，由于受到一因多效和遗传连锁累赘的影响，使某些性状在不同材料和育种后代中协同变化，呈现耦合性相关。解析复杂性状间耦合的遗传调控网络，明确关键调控单元，对分子设计育种具有重要意义。大豆原产中国，是人类和动
Genome－Biology：为CRISPR选择最佳向导
细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争，为此它们演化出了多种防御机制，CRISPR-Cas9 适应性免疫系统就是其中之一。规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合，可以在引导RNA的指引下，靶标并切割入侵者的遗传物质。 2012年研究者们利用这一特点，将CRISPR系统发展成了强大
Genome－Biology：食物会影响DNA序列
牛津大学的研究人员在两种寄生虫中检测到了食物组分造成的DNA序列差异。他们在Genome Biology杂志上发表文章指出，食物能够影响生物的基因序列。 “生物从食物中获取原料构建自己的DNA。我们认为，食物组分可能应该能够改变生物的DNA。我们也许可以预测素食者熊猫与肉食者北极熊之间的基因差
Genome－Biology发文介绍RNA印记法
生物学家们逐渐意识到，RNA不只是DNA和蛋白之间的过渡产物，它对调节基因的表达有重要作用。深入研究RNA调控，能够帮助科学家们进一步理解相关疾病。 宾夕法尼亚大学的科学家们开发了分析RNA调控的新方法，这一方法能够有效获得RNA与RNA结合蛋白(RBP)互作的所有位点。这一发表在Geno
Genome－Biology：上海交大解析阿司匹林的抗结直肠癌机制
癌症化学预防指利用天然或合成的化学物质来阻止、逆转、减缓癌症的发生发展过程。虽然阿司匹林的化学预防效果已经被广泛研究，但人们还不完全清楚细胞组分在其中起到的作用，比如长非编码RNA（lncRNA）。lncRNA是长达两百个核苷酸以上的转录本，绝大多数位于细胞核内。 上海交大医学院的研究团队发现
遗传发育所大豆茸毛密度遗传网络调控研究获进展
大豆驯化起源于中国，随后广泛传播于世界各地，为人类提供了主要的植物油和蛋白资源，是世界性的重要粮食经济作物。表皮毛是植物表皮细胞分化形成的一种特殊的细胞形态，广泛分布于植物的叶片、茎秆以及花萼等地上部器官表面。作为植物应对外界环境（生物或者非生物胁迫）的第一道防线，表皮毛在植物的生长发育以及抗逆
Genome－Biology：RNAseq需要多长的读长？
随着新一代测序（NGS）的读长在不断增长，研究人员也开始纠结：到底多长的读长才合适？双端测序是不是优于单端测序？近日，康奈尔大学维尔医学院的研究人员在《Genome Biology》杂志上发表文章，认为对于差异表达分析而言，读长并非越长越好。不过，双端测序和长的读长无疑能改善剪接的检测。 最初
Genome－Biology发布菜豆基因组测序结果
菜豆（Phaseolus），是世界上最古老的作物之一。几千年前，它与玉米和木薯一起，在美国被驯养，成为世界性的主要主食。根据联合国粮食和农业组织（FAO）的研究显示，普通菜豆是最重要的粮食豆类，占世界食用豆类食品的50%，在超过5亿人的饮食中显得尤为重要。这种作物种植在拉丁美洲、非洲、中东、中国
农作物产量性状的遗传网络解析研究计划项目指南
本重大研究计划以玉米、水稻为主要研究对象，围绕控制产量性状的遗传网络解析，综合应用生物学、农学及信息学等多学科交叉的手段，集中深入地探讨株型发育和籽粒形成这两个密切相关并影响作物产量性状的重要生物学过程的遗传及生理生化调控机理，进一步通过分析籽粒形成和株型发育过程中不同阶段生物学过程之间的互作关
973首席科学家发表《Genome－Biology》文章
来自西南大学蚕学与系统生物学研究所的研究人员利用家蚕全基因组芯片分析家蚕多种组织基因表达特征，这一研究成果公布在国际生物学权威期刊《Genome Biology》网络版上。 领导这一研究的是夏庆友教授，现任教育部“长江学者”特聘教授，“973”项目首席科学家 原文检索：Genome Biolog
“主要农作物产量性状的遗传网络解析”重大研究计划启动
2012年8月18-19日，国家自然科学基金重大研究计划（以下简称计划）“主要农作物产量性状的遗传网络解析”指导专家组及管理工作组第一次会议在山东泰安召开。该计划指导专家组成员和管理工作组成员以及特邀专家等共20余人出席会议。 指导专家组组长武维华院士主持会议并简要回顾了该重大
Genome－Biology：普通小麦精细表观组图谱绘制成功
7月15日，Genome Biology期刊在线发表中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张一婧研究组与南京农业大学张文利研究组等合作完成的研究论文。该工作生成并绘制普通小麦精细的表观组图谱，以此为基础针对性开发整合计算流程对全基因组顺式调控元件进行了系统的挖掘与鉴定，并初步探索
《Genome－Biology》：上海交大参与发表强迫症研究成果
报道： 在2014年3月份的《基因组生物学》(Genome Biology)发表的一项研究中，美国哈佛-麻省理工博德研究所(The Broad Institute of MIT and Harvard)、麻省理工学院、上海交通大学、明尼苏达大学和康奈尔大学等研究结构的研究人员，采用全基因
苏州大学Genome－Biology：聚焦基因组中的新基因
来自苏州大学、芝加哥大学的研究人员在新研究中，调查了人类和小鼠基因组中新基因驱动基因间相互作用（GGI）网络的速度及模式。这项研究发布在近期的《基因组生物学》（Genome Biology）杂志上。 苏州大学的沈百荣（Bairong Shen）教授及芝加哥大学遗传与进化系终身教授龙漫远(Man
遗传发育所大豆多基因聚合育种研究取得重要进展
黄淮海流域是我国大豆的第二产区和夏大豆的最大产区，常年播种面积在3000多万亩，而平均单产不足130公斤/亩。除了单产低以外，该地区存在的另一主要问题是大豆病毒病危害严重，导致大豆产量下降和品质变劣。解决上述问题的有效途径是培育高产抗病大豆新品种在生产上推广应用。 中国科学院遗
Genome－Biology：胰腺癌肝转移的分子特征研究新进展
近日，中国科学院上海营养与健康研究所研究员李虹、李亦学研究组，与上海交通大学附属仁济医院主任医师孙勇伟、研究员薛婧、主任医师王理伟及研究员张志刚团队合作的研究成果，以Integrated genomic and transcriptomic analysis reveals unique cha
新研究解析调控大豆粒重遗传位点和驯化基因
近日，广东省科学院南繁种业研究所教授王振宇团队联合南京农业大学国家大豆改良中心教授赵团结团队，研究解析调控大豆粒重遗传位点和驯化基因。相关成果发表于《理论与应用遗传学》。俗语说：“宁可食无肉，不可食无豆。”大豆是优质的植物蛋白资源，也是健康的食用植物油源。我国是大豆的原产地，种植和消费历史悠久。然而
国产大豆为何重要？
大豆是我国重要口粮作物，目前年产1300万吨左右。我国大豆油用量最高，以大豆为主要原料的酱油为居民佐餐必备，面包等烘焙品，火腿肠等肉制品要用大豆蛋白做添加剂…… 大豆不仅能够提供优质蛋白和植物油，还富含人体必需多种营养。大豆油所含亚麻酸、亚油酸等必需脂肪酸和脂溶性维生素对脂质蛋白代谢、血液流变
“秦岭四宝”遗传密码解析研究取得重要进展
朱鹮、大熊猫、金丝猴和羚牛这四种珍稀动物被称为“秦岭四宝”。日前，由西北农林科技大学昝林森教授牵头承担的陕西林业科技创新计划揭榜挂帅项目“‘秦岭四宝’遗传密码解析及种质评价与保护”通过了省级科技成果评价。专家组的评价认为，该项目总体达到国际先进水平，其中有关羚牛遗传多样性和朱鹮羽色变化机制的研究达到
遗传发育所揭示大豆籽粒性状调控的新机制
大豆含有丰富的油脂和蛋白质，是重要的粮食作物和经济作物。种子大小和粒重是植物适应环境的一个重要特征，也是产量构成的要素之一。然而，人们当前对大豆种子粒重调控机制的认识仍十分有限，因此挖掘粒重调节基因并解析其分子机制，对培育优质的大豆品种具有重要意义。 4月17日，《植物学报》（Journal
研究新发现|TaSPL17基因竟能控制小麦籽粒数目和大小
小麦是重要的粮食作物。穗部性状是决定小麦产量的关键因素，增加籽粒同化物的分配对提高小麦产量具有重要的影响。籽粒和其他穗部结构（穗糠）之间遗传关系是决定籽粒同化物分配的重要因素。然而，同化物在小麦籽粒和其他穗部结构（穗糠）之间分配的遗传分子机理尚未被充分解析。因此，鉴定同化物在小麦籽粒和穗糠之间分
Genome－Biology：新技术90分钟完成全基因组序列分析
美国国家儿童医院（Nationwide Children's Hospital）的研发人员最近在Genome Biology上发布了一个自主开发的分析软件，表示这个软件使寻找全基因组致病变异从几周缩短到按几十个小时。 第一个人类基因组测序完成耗时大约13年，耗费30亿美元，而现在技术测序技术的
Genome－Biology：联合鉴定肺癌筛查与临床预后生物标志物
肺癌是最常见的癌症类型，并且表现出复杂的发病机理和高度异质性，遗传因素是导致肺癌发生的风险之一，但目前其机制尚不清楚，研究发现13q12.12中的SNP rs753955（A> G）与中国人群中的肺癌发生风险高度相关。 2019年5月24日，南京医科大学孙玉洁、沈洪斌，昆明医科大学宋鑫等人在Ge
Genome－Biol－Evol：重新揭秘遗传密码的规律
众所周知，细胞可以通过转录过程“解码” 其基因组DNA中包含的信息，并将其“翻译”为氨基酸，进而组装为蛋白质。通过大量的实验，科学家们找到了和核苷酸碱基分子与氨基酸分子之间的对应关系，并被称为“三联体”密码子。这种编码规则在进化上是十分保守的。例如，在几乎所有生物中，密码子“ AGA”对应着天冬
Genome－Biol－Evol：重新揭秘遗传密码的规律
众所周知，细胞可以通过转录过程“解码” 其基因组DNA中包含的信息，并将其“翻译”为氨基酸，进而组装为蛋白质。通过大量的实验，科学家们找到了和核苷酸碱基分子与氨基酸分子之间的对应关系，并被称为“三联体”密码子。这种编码规则在进化上是十分保守的。例如，在几乎所有生物中，密码子“ AGA”对应着天冬
新研究！揭示现代大豆品种重要性状结构变异
近日，《自然—遗传学》（Nature Genetics）在线发表河北农业大学张彩英团队研究论文。该研究率先组装高产优质抗病现代品种“农大豆2号”高质量基因组，在基因组水平发掘现代大豆育成品种特有结构变异及其作用，并揭示影响黄淮海地区大豆群体重要产量和品质性状的结构变异与基因，为大豆遗传改良提供新
新研究揭示现代大豆品种重要性状结构变异
近日，《自然—遗传学》（Nature Genetics）在线发表河北农业大学张彩英团队研究论文。该研究率先组装高产优质抗病现代品种“农大豆2号”高质量基因组，在基因组水平发掘现代大豆育成品种特有结构变异及其作用，并揭示影响黄淮海地区大豆群体重要产量和品质性状的结构变异与基因，为大豆遗传改良提供新的理
Genome－Biology：构建猪体细胞染色质三维结构图谱
猪不仅是重要的经济家畜，在生物医学领域也有重要应用。生猪的育种中广泛应用了辅助生殖技术，包括体外受精技术、孤雌和孤雄生殖技术等。但与体外受精胚胎相比，孤雌和孤雄胚胎的存活率级低。这一存活率差异产生的机制目前还不清楚。深入理解这一机制不仅有助于增加商业化猪育种的产仔数，也将有利于生物医学研究中转基
我国学者利用SMRT、HiC等技术破解大豆Gmax_ZH13基因组
大豆是重要的粮食经济作物，为人类提供了主要的油料和蛋白资源。大豆起源于中国，古称“菽”，约在5000年前由其野生种驯化而来，随后广泛传播于世界各地。大豆在引种和改良过程中产生了遗传瓶颈效应，使来自不同主产区的大豆品种间具有显著的遗传变异。目前，我们广泛采用的大豆参考基因组来源于美国品种“Will