马心肌红蛋白质量肽谱基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法
本方法采用胰蛋白酶裂解-基质辅助激光解吸飞行时间质谱法测定蛋白质的肽质量指纹图谱来鉴定马心肌红蛋白。点击这里进入下载页面:进入下载页面......阅读全文
肽质量检索实验
基本方案 其他方案 实验方法原理 实验材料 蛋白样品
肽质量检索实验
实验方法原理 实验材料 蛋白样品仪器、耗材 质谱仪实验步骤 鉴定数据库中已有序列的蛋白质的算法基于以下一些理念:(1) 肽段是由切点专一的试剂水解蛋白质产生的,通常用已知切点专一的蛋白酶。(2) 这些肽段的质量由 MALDI-MS 或 ESI-MS 精确测定。(3) 计符蛋白序列数据库中的每一序列被
肽质量检索实验_其他方案
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤用肽质量数据鉴定蛋白质所控制的实验参数中,最具决定性的参数是肽质量测量的精确度 。质量精确度越高,结果判定越可信。另一决定性参数是所用酶(或化学试剂)的专一性。酶越纯,专一性胞高,检索结果可信。常用的酶是胰蛋内酶。但是要注意的是,即便是高纯度的胰蛋白酶也会在非
肽质量检索实验_基本方案
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤鉴定数据库中已有序列的蛋白质的算法基于以下一些理念:(1) 肽段是由切点专一的试剂水解蛋白质产生的,通常用已知切点专一的蛋白酶。(2) 这些肽段的质量由 MALDI-MS 或 ESI-MS 精确测定。(3) 计符蛋白序列数据库中的每一序列被实验中所用水解试剂水
单一同位素肽段质量和平均同位素肽段质量有什么不同?
单一同位素肽段质量(monoisotopic peptide mass)和平均同位素肽段质量(average peptide mass)有什么不同?组成蛋白质的原子在自然界中存在着不同比例的同位素(见下表)。所以含有这些同位素原子的肽段的质量比不含任何同位素的肽段的质量要大。不含任何同位素的肽段的质
一文了解肽质量指纹图谱原理
肽质量指纹谱分析也称肽指纹图谱,是目前蛋白质组研究中鉴定蛋白较为常用的方法。 由于每种蛋白质的氨基酸序列(一级结构)都不同,蛋白质被酶水解后,产生的肽片段序列也各不相同,其肽混合物质量数亦具特征性,所以称为指纹谱,可用于蛋白质的鉴定,即用实验测得的蛋白质酶解肽段质量数在蛋白质数据库中检索,寻找
具有广谱杀菌抑菌作用的抗菌肽
Hepcidin是一种由肝脏细胞产生的具有广谱杀菌抑菌作用的抗菌肽,属于防御性蛋白家族。 Hepcidin在肝脏合成时,首先产生一种早期多肽,由84个氨基酸残基组成。在其Gly24和Ser25之间存在一个酶切位点,当酶切去除其24个氨基酸残基的信号肽后,形成由60个氨基酸残基组成的前体肽(pro-H
指尖“质谱”:纳米孔技术打造便携肽段质谱仪
质谱仪对蛋白质研究来说可谓是无价之宝,但是它们通常体积庞大,价格昂贵,局限于专门的实验室。当下,生物医学领域的下一个革命直指蛋白质组学——对不同细胞类型中表达的蛋白质进行大规模分析。尽管你的身体里每一个细胞似乎都携带相同的DNA,但不同细胞类型的蛋白质表达差异很大。此外,蛋白质生产出来后会被修饰
用质谱数据对肽段从头测序实验
方案一 方案二 方案三 实验方法原理 单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列,即相邻肽段间相差一个氨基酸残基,用质谱分析肽阶梯,通常用 MALD
方案16-SDSPAGE-肽谱作图方法(Cleveland法)
实验材料纯化后的蛋白质样品试剂、试剂盒进行 SDS-PAGE所必需的缓冲液和聚丙烯酰胺使蛋白质显现的固定液 染色液 脱色液β-巯基乙醇SDS样品缓冲液中已知分子量的蛋白质标准品选定的蛋白酶SDSSDS-PAGE样品缓冲液仪器、耗材聚丙烯小管平板凝胶电泳仪沸水浴实验步骤展开
用质谱数据对肽段从头测序实验
实验方法原理 单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列,即相邻肽段间相差一个氨基酸残基,用质谱分析肽阶梯,通常用 MALDI-TOF,MS 分析。 MS/MS 测序用的是上文所述用于数据库检索的 CID 谱,但碎片离子由人工完全解析。用于MS 序列分析的肽阶梯是由化学或酶法降解肽段产生,由 C 未端或N未端
环脂肽氨基酸顺序的质谱测定
杨世忠 牟伯中 吕应年 陈涛 (华东理工大学化学与制药学院,上海 200237) 摘要:从一株枯草芽孢杆菌的培养液中分离到一种生物表面活性剂,红外光谱、茚三酮显色及质谱分析表明它是一种具有环状结构的脂肽。质谱显示脂肽的脂肪酸部分为β-羟基脂肪酸;氨基酸分析表明肽部分由4 个亮氨酸、1 个天门东
用质谱数据对肽段从头测序实验(一)
实验方法原理单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列,即相邻肽段间相差一个氨基酸残基,用质谱分析肽阶梯,通常用 MALDI-TOF,MS 分析。 MS/MS 测序用的是上文所述用于数据库检索的 CID 谱,但碎片离子由人工完全解析。用于MS 序列分析的肽阶梯是由化学或酶法降解肽段产生,由 C 未端或N未端断
方案17-原位-SDSPAGE-肽谱作图方法(Cleveland法)
实验材料含有已分离蛋白质的聚丙烯酰胺平板凝胶试剂、试剂盒化学切割剂考马斯亮蓝含1mol L Tris-Cl 的乙醇聚丙烯酰胺平板凝胶蛋白酶消化缓冲液蛋白酶溶液仪器、耗材白光盒和手术刀聚丙烯试管平板凝胶电泳仪SpeedVac 浓缩器实验步骤方法 1: 酶催化的蛋白质片段化1.固定聚丙烯酰胺凝胶中分离的
用质谱数据对肽段从头测序实验(三)
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤另外一种便于人工解析 CID 谱及从头测序的化学方法是对肽段的羧基实行甲酯化。这个反应使肽段每一个羧基质量增加 14u, 包括未修饰的(末端、 Asp 和 Glu上的羧基。如果肽段中没有酸性残基,同时C未端没有被修饰,那么只有 y 系列离子及其中性丢失离子会表
用质谱数据对肽段从头测序实验(二)
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤第二种方法,也称为"nested peptide secquendng", 是在一个 Edman 降解循环中多次加入多肽/蛋白质底物心在此法中加入过量易挥发的 Edman 试剂以使反应完全,每一循环中的过显试剂可通过蒸发被除去。经 MALDI-MS 分析得到肽
关注临床质谱质量管理-了解临床质谱前沿应用
分析测试百科网讯2019年4月23-25日,由复旦大学附属中山医院检验科主办,复旦大学生物医学研究院中国医药教育协会检验医学分会、上海市生物医学工程学会检验医学专业委员会和美国临床质谱协会(MSACL)协办的“国家级I类继续教育学习班-第四届液相色谱–质谱技术临床应用培训班”在中山医院东院区18
肽、多肽、活性肽与大肽如何划分?
分子量段在50~5000之间的才能称为肽。分子量段在5000~10000之间的称为大肽。分子量段在50~2000之间的称为小肽、寡肽、低聚肽,也称为小分子活性多肽。生物学家将肽称为“氨基酸链”,将小分子活性多肽统称为“生物活性肽”。常见的有二肽(Dipeptide),三肽(Tripeptide),甚
电泳分离的蛋白质肽谱和序列分析实验
方案1 蛋白质的过甲酸氧化实验 方案2 蛋白质还原和S-羧甲基化:大规模方法 方案3 蛋白质还原和S-羧甲基化:微量方法 方案4 用Ellman 试剂测定自由巯基和二硫键实验 方案5 蛋白质的胰酶消化实验 方案6 用溴化氰切割 M
电泳分离的蛋白质肽谱和序列分析实验
实验材料 冻干的纯化蛋白样品试剂、试剂盒 甲酸氢溴酸过氧化氢NaOH 固体仪器、耗材 旋转蒸发器小试管实验步骤 1.加入 100ul 过氧化氢到 900ul 甲酸中,在室温下放置让,将反应产生过甲酸 (HCOOOH)。2.在冰上冷冻过甲酸至 0°C。3.在预冷的小试管中,将蛋白质溶解于 50ul 过
高分辨质谱能测得质量范围
zwlinxm(站内联系TA)高分辨质谱能测质量多少范围,这样的说法不够准确。因为质谱检测的是质荷比。那么,当你的样品只能带一个电荷的时候,往往3000的分子量就已经很高了。但是,很多很多的化合物都可以带多电荷,只要你带上足够的电荷,使得质荷比小于3000,就可以测试了。多电荷需要有一些判断的方法,
红外光谱谱图质量影响因素汇总
红外光谱谱图质量影响因素汇总1、扫描次数对红外谱图的影响:傅里叶变换红外光谱仪测量物质的光谱时,检测器在接受样品光谱信号的同时也接受了噪声信号,输出的光谱既包括样品的信号也包括噪声信号.信噪比与扫描次数的平方成正比.增加扫描次数可以减少噪声、增加谱图的光滑性.2、扫描速度对红外谱图的影响:扫描速度减
质谱实验质量控制之数据质控
质谱实验的QC方法包括:样品准备、液相色谱、质谱采集以及谱图质量等。前两期关于质谱污染物的防控,大部分是属于样品准备阶段的质控工作。质控专题共分三期内容:1. 质谱污染的来源与防控篇2. 质谱原始数据中的污染物信息篇3. 质谱数据质控篇——Quic软件介绍点击目录链接可以回顾往期,本期质控专题进行到
红外光谱谱图质量影响因素汇总
1、扫描次数对红外谱图的影响: 傅里叶变换红外光谱仪测量物质的光谱时, 检测器在接受样品光谱信号的同时也接受了噪声信号, 输出的光谱既包括样品的信号也包括噪声信号。 信噪比:与扫描次数的平方成正比。增加扫描次数可以减少噪声、增加谱图的光滑性。
红外光谱谱图质量影响因素汇总
1、扫描次数对红外谱图的影响: 傅里叶变换红外光谱仪测量物质的光谱时, 检测器在接受样品光谱信号的同时也接受了噪声信号, 输出的光谱既包括样品的信号也包括噪声信号。 信噪比:与扫描次数的平方成正比。增加扫描次数可以减少噪声、增加谱图的光滑性。 2、扫描速度对红外谱图的影响:
肽的应用抗菌活性肽
当昆虫受到外界环境刺激时会产生大量具有抗菌活性的阳离子多肽,2013年已从中筛选出百余种抗菌肽。体内外实验证实,很多抗菌肽不仅有很强的抗菌、杀菌能力,而且还能杀死肿瘤细胞。
肽质量指纹图谱—MALDITOF-法鉴定蛋白质实验
实验材料测序级猪胰蛋白酶 试剂、试剂盒碳酸氢铵 碳酸氢铵
肽质量指纹图谱—MALDITOF-法鉴定蛋白质实验
实验材料测序级猪胰蛋白酶试剂、试剂盒碳酸氢铵碳酸氢铵缓冲液乙腈 碳酸氢铵缓冲液消化缓冲液仪器、耗材真空离心机烤箱实验步骤许多凝胶染色方法适用于后续的 MALDI-TOF 肽质量指纹图谱(PMF ) 分析。在第 14 章已经比较讨论了一些染色方法的性能和兼容性。3.1 胶内消化凝胶消化方法改编自 Je
质谱方法的质量分析的相关介绍
质谱方法的一个重要特点就是它对各种物理状态的样品都具有非常高的灵敏度,而且在一定程度上与待测物分子量的大小无关。但是,因为质谱仪的质量分析器安装在真空腔里,分析样品只有通过特定的方法和途径才能被引入到离子源,并被离子化,然后被引入质量分析器进行 质量分析。一般把所有用于完成这种样品引入任务的部
评论:空气质量排名怎样更靠谱?
近两年,雾霾已成为我国首要的环境问题之一。为保障公民的环境知情权,也为了更有效地治理雾霾,环境保护部要求省会城市于2013年、环保重点城市于2014年开始实时发布空气质量数据,并进行排名。 随着公众环境意识的增强,对空气质量数据的关注度也越来越高,加之环境问题与地方政绩和形象挂钩,这些都给提供