研究人员为所有癌症患者带来精准药物治疗新策略
分析测试百科讯 来自密歇根大学综合癌症中心和赛默飞世尔科技的研究人员已经开发并测试了一种新的工具，可以对由遗传性异常引发的常见癌症进行搜索。试验表明基因测序在一个大体积样品里能发挥更好的能力。 “密歇根大学在应用测序领域有丰富的经验。做分析是我们面临的一个主要挑战和一大瓶颈。我们的目标是找到一种方法，使这一过程能够扩展到更大的规模和容量中去。” 密歇根大学医学院病理学和泌尿学助理教授Scott A. Tomlins博士说。 Tomlins是发表肿瘤描述新方法论文的资深作者，论文里的方法叫做Oncomine综合分析法，研究只通过赛默飞世尔科技开发测试。 研究人员通过对超过700000个肿瘤样本数据库进行筛选并确定在癌症类型中最常见的遗传变异体。然后，他们过滤FDA批准的药物相关联的变体、在临床指南中被引用的变体以及临床研究治疗有关的变体的列表数据。 研究人员评估了300多个组织样本，其中包括超过100个常规......阅读全文
不同二代测序平台用于临床肿瘤样本体细胞突变检测的...
使用二代测序技术检测肿瘤组织FFPE样品中的DNA体细胞突变用于临床分子诊断存在的问题是，DNA质量和数量的变异较大，以及检测到的低频突变难以用二代测序以外的其他技术予以验证。以下实验测评了MiSeq和Ion Proton两个平台检测体细胞突变的表现，分别选用了 TruSeq Amplicon
Illumina牵头制定DNA测序肿瘤临床检测规范
Illumina联合娜法伯癌症中心、弗雷德哈钦森癌症研究中心、MD安德森癌症中心、纪念斯隆凯特林癌症中心，宣布成立AGC（规范基因组联盟）联合机构，指导下一代测序技术在肿瘤临床诊断中的应用。 他们的目标是定义什么是“癌症专属基因组”，即到底那些变异是癌症真正特有的，由此肿瘤学家和病理学家可以确
活体肿瘤样本库与常规肿瘤生物样本库有什么区别？
一、常规生物样本库 肿瘤在临床上有实体瘤和非实体瘤之分。来源于临床活检或外科手术的固体肿瘤组织，由病理医生决定切割组织的关键部份用于常规病理诊断，且在不影响常规病理诊断的情况下，组织的剩余部份被生物样本库切割收集，将肿瘤蜡块存储到样本库中。但是这种方式保存的样本，不能够保证保存下来的肿瘤块是否
二代测序在肿瘤临床中的应用
二代测序，又名下一代测序（Next Generation Sequencing，NGS），也叫高通量测序（High-Throughput Sequencing），是相对于传统的桑格儿测序（Sanger Sequencing）而言的。有些文章中可能还会称为大规模平行测序平台（massive
空间转录组测序样本准备指南
现有空间转录组研究平台是基于冰冻样本进行研究，所以在样本冻存前至少10分钟，将异戊烷和液氮浴准备好（之所以用异戊烷而不直接用液氮进行速冻，是因为液氮沸点比较低，直接液氮处理可能在沸腾过程中使组织周围形成空穴，导致不同区域降温不同步而改变内部形态，甚至组织碎裂）。然后用镊子或者刮刀将新鲜组织转移到
空间转录组测序样本准备指南
现有空间转录组研究平台是基于冰冻样本进行研究，所以在样本冻存前至少10分钟，将异戊烷和液氮浴准备好（之所以用异戊烷而不直接用液氮进行速冻，是因为液氮沸点比较低，直接液氮处理可能在沸腾过程中使组织周围形成空穴，导致不同区域降温不同步而改变内部形态，甚至组织碎裂）。然后用镊子或者刮刀将新鲜组织转移到异戊
空间转录组测序样本准备指南
一、外泌体研究热度持续攀升 外泌体（exosome）是活细胞分泌的30-200nm的囊泡，在电镜下具有非常明显单层膜结构，通常为茶托型或一侧凹陷的半球形。其主要来源于细胞内溶酶体微粒内陷形成的多囊泡体，经多囊泡体外膜与细胞膜融合后释放到胞外基质中。多种细胞在正常及病理状态下均可分泌外泌体，
基因测序肿瘤检测
临床医生在肿瘤治疗中发现，人体肿瘤千差万别，即使是同一个部位的肿瘤，治疗效果和方法也应因人而异，这种因人、因病而采取的不同疾病治疗方法称为“个体化治疗”。因此在癌症治疗过程中，只有同病异治，因人而异，实施个体化治疗，才能针对不同类型的病人选择合适他们的药物。下图中给出的是在乳腺癌中HER2基因的表达
重磅!－首批肿瘤基因测序临床应用试点单位公布
2014年3月，国家卫生计生委医政医管局发布《关于开展高通量基因测序技术临床应用试点单位申报工作的通知》（以下简称通知）。《通知》指出已经开展高通量基因测序技术，且符合申报规定条件的医疗机构可以申请试点，并按照属地管理原则向所在省级卫生计生行政部门提交申报材料，同时明确申请试点的基因测序项目（如
临床测序重磅成果！300多种肿瘤，突变数据集问世
肿瘤分子分析是精准肿瘤医学的基本组成部分，它能够识别基因以及通路中所发生的变化，这是个性化医疗的关键。不同组织复发性突变的存在，加上分子靶向治疗组合的扩大，这就需要灵活且综合性的方法来分析全癌谱中与临床相关的基因。 5月8日，Nature Medicine杂志在线发表了一篇“大作”，科学家们采
高通量测序中植物样本的制备方法
高通量测序技术已广泛应用于植物研究中，但植物材料中较多的蛋白质、多糖以及酚、脂类等次生代谢物质，提取核酸的难度往往比动物或原核生物样本大，因此如何从植物样本中得到高质量的核酸进行后续的测序，成为在植物高通量测序应用中的首要因素。根据核酸类型，可有如下制备方法可参考： 1. 植物基因组 DNA
活肿瘤组织样本库的应用及意义
玻璃化冻存技术——成功解决活肿瘤组织冻存复苏难题，助力活肿瘤样本库建设和肿瘤精准治疗玻璃化冻存技术成功突破了活肿瘤组织冻存复苏后存活率低的难题，使得冻存的肿瘤细胞可长期保存肿瘤组织活性，组织复苏后可维持与新鲜肿瘤组织几乎相同的形态特征和功能。1、活肿瘤组织样本库的意义活体组织特别是活肿瘤组织，具有重
晚期肿瘤患者可免费测序基因
对于肿瘤，除了传统诊疗方法外，未来还可对患者的基因进行测序，找出容易引发肿瘤的变异基因，再针对该基因选择对应的靶向药物。4月20日，“MATCH中国·测序中心”三方联合实验室在中山大学附属第一医院（以下简称“中山一院”）正式挂牌。该院将借助美国国家癌症研究所NCI-MATCH计划，开展大规模的高
肿瘤测序行业箭在弦上－蓄势待发
21世纪之所以能成为生物学的世纪，这是因为随着百姓生活水平的提高，温饱问题早已解决，并催生了“大健康产业”成为永不落幕的朝阳产业。2012年全世界共新增1400万癌症病例并有820万人死亡，癌症已经成为世界性难题。由于基因突变导致肿瘤形成，人以群分，肿瘤以基因突变分，二代测序为绘制肿瘤基因突变谱
单个循环肿瘤细胞RNA测序结果
由麻省总医院，哈佛大学主持的一项最新研究发现了前列腺癌细胞对一种常见的癌症治疗方法产生抗性的原因，研究人员完成了前列腺癌单个循环肿瘤细胞的RNA测序，其中找到了非经典Wnt信号所起的关键作用。 这一研究成果公布在9月18日的Science杂志上。 Androgendeprivationthe
晚期肿瘤患者可免费测序基因
对于肿瘤，除了传统诊疗方法外，未来还可对患者的基因进行测序，找出容易引发肿瘤的变异基因，再针对该基因选择对应的靶向药物。4月20日，“MATCH中国·测序中心”三方联合实验室在中山大学附属第一医院（以下简称“中山一院”）正式挂牌。该院将借助美国国家癌症研究所NCI-MATCH计划，开展大规模的高
时空分辨单细胞测序技术如何解决临床应用中的样本采集和处理挑战？
为解决时空分辨单细胞测序技术在临床应用中的样本采集和处理挑战，可以考虑以下策略：优化样本采集方法开发专门的采集工具和试剂盒，以确保在最小程度损伤组织完整性的前提下获取样本。对采集人员进行严格培训，规范操作流程，减少人为因素导致的样本质量下降。快速低温保存在样本采集后，立即使用液氮或其他低温保存方法，
时空分辨单细胞测序技术的临床应用中，样本处理的最佳实践方法是什么？
在时空分辨单细胞测序技术的临床应用中，以下是一些样本处理的最佳实践方法：样本采集的及时性尽快采集样本，以减少细胞内基因表达和分子状态的变化。低温保存采集后迅速置于低温环境（如液氮或 -80°C 冰箱）中，抑制酶活性和分子降解。避免机械损伤操作轻柔，减少对细胞和组织的物理损伤，保持其空间结构完整性。无
数字PCR和HRM在肿瘤样本中的应用
摘要：Vogelstein和Kinzler（美国国家科学院院刊，1999年）第一次描述了Digital PCR（dPCR）的概念，一种在微量细胞群中（如原发性肿瘤组织）鉴定突变的方法。通过稀释样品DNA到一个单个分子水平，它可以把PCR自然模拟指数转化为数字信号。当PCR成功的扩增出这些单个
基因组测序助力肿瘤精密治疗
最近，约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心的科学家，在对101例胰腺癌患者的血液和肿瘤进行基因组测序后发现，至少三分之一患者的肿瘤有基因突变，这些突变有朝一日可能帮助指导疾病的精密治疗。他们说，与标准的影像学检查方法相比，血液检测的结果，可以早半年预测到癌症的复发。 约翰斯霍普金斯大学医学院肿
临床样本核酸提取全攻略
¤ 临床检验样本RNA的提取人和动物全血、血清、血浆、脑脊液、人淋巴细胞中提取总RNA或病毒RNA——血液（液体样本）总RNA快速提取试剂盒（离心柱型）货号：RP4001 700元/50次血清、血浆、全血（或其他含病毒的液体）中同时提取病毒基因组和RNA——病毒基因组DNA/RNA快速提取试剂盒(
时空分辨单细胞测序技术的临床应用中，样本处理的质量控制方法有哪些？
在时空分辨单细胞测序技术的临床应用中，样本处理的质量控制方法包括以下几种：细胞活性检测使用台盼蓝染色或荧光染料（如碘化丙啶）结合流式细胞术来评估细胞的活性，确保活细胞比例符合要求。RNA 完整性评估采用琼脂糖凝胶电泳或生物分析仪（如 Agilent Bioanalyzer）检测 RNA 的完整性，观
基因测序仪临床应用
1. 在感染性疾病诊断上的应用 测序技术可以精确的分析碱基序列，通过序列比对，对各种病原体直接进行鉴定、分型和溯源，明确某一感染性疾病对应病原体的基因序列，可以有针对性地用药和预防，提高用药的有效性和安全性。同时基因测序可以用于发现新型病原体，能更好地做好预防工作。 2. 在遗传性疾病诊断
大样本卵巢癌肿瘤标志物研究启动
10月27日，解放军总医院、天津市肿瘤医院等9家大型三甲医院及肿瘤专科医院联合罗氏诊断，在京启动人附睾蛋白4(HE4)多中心、大样本临床研究。 据悉，HE4是一种与卵巢癌有关的新型肿瘤标志物，88%的卵巢癌患者都会出现HE4升高，因此HE4适用于卵巢癌的早期检测、鉴别诊断、治疗监测及预后评
－打造高质量的中国肿瘤生物样本库势在必行
随着对肿瘤研究的日益深入,肿瘤生物样本库的重要性逐渐显现,日益受到各国科研工作者的重视,自20世纪80年代以来，肿瘤生物样本库在世界范围内得到了空前发展。 中国肿瘤生物样本库建设发展迅速 中国人口众多，疾病生物样本资源极其丰富，肿瘤生物样本库的建设在我国起步虽晚，但发展迅速。科研管理
打造高质量的中国肿瘤生物样本库势在必行
随着对肿瘤研究的日益深入,肿瘤生物样本库的重要性逐渐显现,日益受到各国科研工作者的重视,自20世纪80年代以来，肿瘤生物样本库在世界范围内得到了空前发展。 中国肿瘤生物样本库建设发展迅速 中国人口众多，疾病生物样本资源极其丰富，肿瘤生物样本库的建设在我国起步虽晚，但发展迅速。科研管理
NEJM：肿瘤重复测序－结果大不同
哈佛医学院Dana-Farber癌症研究所及其他机构的研究人员日前利用全外显子组测序，发现了两个过去未知的突变。这两个突变似乎引起癌症患者对药物的意外响应以及之后的耐药。 患者是一名57岁的女性，患有转移性甲状腺未分化癌（ATC）。这是一种恶性程度很高的甲状腺癌，通常在5个月内致命。不过，在接
NEJM：利用基因测序谱写“肿瘤进化树”
近几年来，肿瘤产生耐药突变以逃逸靶向治疗的假说已被业内科学家所默认。最近一段时间，几项重要的研究对这一假说进行了充分的证实，肿瘤学家Charles Swanton领导的肺癌癌症进化阻断计划（TRACERx）让耐药逃逸的假说逐渐为更多人所认可。 为了使TRACERx计划能够充分证实部分肿瘤细胞耐
Science公布单个循环肿瘤细胞RNA测序结果
由麻省总医院，哈佛大学主持的一项最新研究发现了前列腺癌细胞对一种常见的癌症治疗方法产生抗性的原因，研究人员完成了前列腺癌单个循环肿瘤细胞的RNA测序，其中找到了非经典Wnt信号所起的关键作用。 这一研究成果公布在9月18日的Science杂志上。 Androgendeprivationthe
基因测序仪在肿瘤诊断上的应用
肿瘤的发生是遗传基因和环境因素共同作用的结果，其中遗传基因是内因，与人体是否具有肿瘤易感基因有关。肿瘤易感基因的检测可以检测出人体内是否存在肿瘤易感基因或家族聚集性的致癌因素，根据个人情况给出人性化的指导方案。