科学家开发新的人类基因组组装方法
最近，美国杨百翰大学的研究人员，开发出了一种新的人类基因组组装方法，并无意中发现了一种新的方法，可识别几种常见遗传病中难以捉摸的标记。 这种新方法依赖于研究人员开发的一种新算法，这种方法对于DNA序列中特定类型的变异，更为敏感。 本文第一作者、计算机科学博士Paul Bodily指出：“这需要坚持不懈，结果并不是我原本打算调查的。我只是继续沿着一条路，不知道它将要去哪里，直到我发现有闪亮的东西出现。” 每个人在其每个细胞中都有各自基因组的2个拷贝，每个拷贝都来自亲本一方。两个拷贝的序列是相同的，但有时也有一段序列被反转，称为倒位（inversion）。 倒位往往是有生物学意义的。以前的研究已经表明，倒位和精神发育迟滞、糖尿病、癫痫，精神分裂症和自闭症之间存在一种关联。 该研究结果发表在国际生物信息学权威杂志《Bioinformatics》上，详细介绍了这种新算法的性能如何优于其他方法，并意外发现了这种新算法检测倒位......阅读全文
扣件组装动态疲劳试验方法
适用范围：适用于铁路干线60、75kg/m钢轨轨道结构，曲线半径不小于250m，机车车辆zui大轴重250KG条件下使用的混凝土枕扣件的组装疲劳试验。基本原理：用被试扣件把两根短轨组装在一根轨枕上，通过特制加力架向两根短轨轨头施加脉冲垂直力和横向力，以检验扣件抗横向力及保持轨距的能力。试验载荷为14
Nat－Biotechnol：开发出混合宏基因组装配器OPERAMS
通过高通量宏基因组测序已实现了对微生物组的表征。然而，现有方法并不是将来自短读取技术和长读取技术的读取片段结合在一起。 在一项新的研究中，来自新加坡国立大学、新加坡基因组研究院、新加坡陈笃生医院、南洋理工大学和克罗地亚萨格勒布大学的研究人员开发出一种称为OPERA-MS的混合宏基因组装配器，它
象腿蕉染色体级别基因组组装研究获进展
象腿蕉（Ensete glaucum）是芭蕉科中耐寒的蕉类植物，原产于中国云南和东南亚地区，具有观赏、饲用和药用价值。中国科学院华南植物园教授John Seymour Heslop Harrison带领的研究团队，采用单分子纳米孔、Illumina测序策略，结合染色体构像捕获技术，发表了首个象腿蕉染
研究揭示海湾扇贝两个亚种基因组测序和组装
日前，青岛农业大学在扇贝育种研究方面再次取得重要进展，海洋科学与工程学院教授王春德课题组与合作单位成功完成海湾扇贝北部亚种和南部亚种基因组测序和分析，相关研究成果在线发表于《自然》旗下开源期刊Scientific Data。 此前，王春德课题组已完成紫扇贝基因组测序和组装，紫扇贝和海湾扇贝两个
象腿蕉染色体级别基因组组装研究获进展
中国科学院华南植物园海外知名学者John Seymour Heslop Harrison教授领导的研究团队，在象腿蕉染色体级别基因组组装研究方面取得新进展。相关研究发表于Gigascience。王梓维为该文第一作者，John Seymour Heslop Harrison和刘青副研究员为通讯作者，华
研究人员完成枣和酸枣单倍型基因组组装
近日，西北农林科技大学林学院红枣团队黄建研究员课题组以我国制干枣主栽品种‘骏枣’和著名“秦药”代表清涧酸枣为研究材料，整合了PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C等多种先进测序技术以及多种组装策略完成了枣和酸枣T2T gap-free和T2T gap-free单倍型基因组的组
“六谷”丰登？——首个染色体水平基因组组装完成
中国菰 中国农科院供图 中国菰 （Zizania latifolia） 原产于中国，属于禾本科稻族菰属，主要分布于中国、韩国、日本和印度等国家。中国菰的颖果为菰米，在我国古代是重要的“六谷”之一。 近日，中国农业科学院烟草研究所烟草功能成分与综合利用创新团队与中国水稻研
国际首例猪T2T全基因组组装成功
2月8日，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所张龙超研究员、黑龙江省农业科学院畜牧研究所刘娣研究员、重庆市畜牧科学院王金勇研究员、岳麓山实验室印遇龙院士、四川农业大学李明洲教授联合发布消息，国际首个猪T2T全基因组组装——民猪完整全基因组构建成功完成，标志着猪基因组研究迈入“完整解析”时代，为我国养殖业
中国科学家开发出高质量基因组组装软件
高质量基因组序列对于研究一个物种基因组的结构、功能、进化、基因定位和克隆等都至关重要。目前单分子测序技术的发展，已使得构建高质量基因组草图越来越容易。然而，这些草图序列仍然存在着由于组装序列碎片化而导致的多种错误，比如不完整的基因序列、排列到染色体上之后的片段遗漏、排列顺序错误和方向错误等。这些
PacBio技术助力两种水生生物的基因组组装
对于吃货而言，水生动物是餐桌上的美味。对于科学家而言，它们则具有重要的研究价值。了解它们如何适应不同的环境条件，对水产养殖业而言具有重大意义。为此，科学家们近日对两种水生动物进行了基因组组装。 章鱼一向给人一种聪明的感觉。凭借其复杂的大脑、感觉器官和神经系统，章鱼可以带给我们一些关于学习、记忆
微量移液器之拆解与组装方法步骤
微量移液器 （micropipet） 是进行生化实验或分子生物学实验的必备工具，然而使用方法的正确与否，以及微量移液器的准确性，都直接影响了实验结果的正确性，故请对你持有之微量移液器作深入的认识。本实验室所使用的微量移液器为Gilson Pipetman P系列，包括P1000, P200, P
微量移液器之拆解与组装方法步骤
微量移液器之拆解与组装方法步骤点击次数：523 发布时间：2010-12-13微量移液器之拆解与组装方法步骤 微?移液器 （micropipet） 是进?生化实验或分子生物学实验的*工具，然而使用方法的正确与否，以及微?移液器的准确性，?直接影响?实验结果的正确性，故请对你持有之微?移液器作深
电泳槽部件组装操作方法
电泳槽清洗部件：电泳槽部件组装前要彻底清洗干净。尤其是玻璃板及凹形带槽橡胶框，必须用泡沫海绵沾少许肥皂粉或洗涤剂彻底清洗干净。清洗后的玻璃板应放在玻璃板支架上晾干水后方能使用。A组装电泳槽1、将四只固定螺杆插进一只贮液框(半上槽)的相应孔洞中，然后将贮液框仰放在桌上。左手拿凹型槽橡胶模框，右手的拇指
电泳槽部件组装操作方法
电泳槽清洗部件：电泳槽部件组装前要彻底清洗干净。尤其是玻璃板及凹形带槽橡胶框，必须用泡沫海绵沾少许肥皂粉或洗涤剂彻底清洗干净。清洗后的玻璃板应放在玻璃板支架上晾干水后方能使用。A组装电泳槽1、将四只固定螺杆插进一只贮液框(半上槽)的相应孔洞中，然后将贮液框仰放在桌上。左手拿凹型槽橡胶模框，右手的拇
磷酸铁锂电池组装方法
1、选用合适的电芯，电芯类型，电压，内阻需要匹配，组装前请对电芯做好均衡。剪切电极并打孔。2、依据孔计算好距离，裁制绝缘板。3、上好螺丝，请使用法兰螺母，防止螺帽脱落，上好螺丝连接好，就可以固定住磷酸铁锂电池组了。4、连接并焊线，连接电压采集线（均衡线）的时候，不要外接保护板，避免保护板意外烧坏。5
首个豆科绿肥作物染色体水平基因组组装完成
紫云英 中国农科院供图近日，中国农业科学院农业资源与农业区划研究所肥料及施肥技术团队完成了首个豆科绿肥作物——紫云英的染色体水平参考基因组组装，并利用比较基因组学解析了紫云英共生结瘤的遗传基础。该研究填补了豆科绿肥作物基因组学研究的空白，为豆科植物与根瘤菌共生提供了新的见解。相关研究成
科学家改良基因组组装工艺流程－提高成本效益
近日，美国能源部联合基因组研究所(DOE JGI)、太平洋生物科学公司(PacBio)与华盛顿大学合作，开发出一种改良的基因组组装工艺流程，生成的读取片段达到数万个核苷酸长度，最终的组装序列准确率大于99.999%。以往的桑格技术(Dideoxy termination method)只
中国科研团队研发出精准检测评估基因组组装新工具
近年来，随着基因测序技术和算法不断发展，大量物种基因组被陆续测序和组装，为相关研究和应用提供重要遗传信息。因此，如何精准检测评估基因组组装质量高低、避免组装错误等非常关键，也备受关注。 记者19日从中国科学院植物研究所获悉，该所焦远年研究团队最新研究开发出一种不依赖参考基因组的组装质量评估新工
马铃薯单倍型DM基因组全序列完成图组装成功
中国农业科学院蔬菜花卉研究所马铃薯遗传育种与栽培创新团队和蔬菜分子设计育种创新团队，对马铃薯单倍型DM的基因组进行了全序列组装，获得了包含24个端粒和12个着丝粒完整序列的马铃薯单倍型DM的端粒到端粒（T2T）的基因组完成图（DM8.1），并在之前马铃薯基因组未能完整组装的高度重复序列区域中，发现了
“六谷”之一菰米首个染色体水平基因组组装完成
中国菰 中国农科院供图 中国菰 （Zizania latifolia） 原产于中国，属于禾本科稻族菰属，主要分布于中国、韩国、日本和印度等国家。中国菰的颖果为菰米，在我国古代是重要的“六谷”之一。 近日，中国农业科学院烟草研究所烟草功能成分与综合利用创新团队与中国水
蒲瓜基因组组装和果实生长发育调控研究获进展
广东省农业科学院蔬菜研究所瓜类研究一室与北京市农林科学院研究员左进华团队合作，在广东省农业科学院科技创新战略专项资金（高水平农科院建设）项目等的资助下，研究揭示了蒲瓜基因组组成和进化关系及果实生长发育的分子调控机制。相关成果近日在线发表于《园艺研究》（Horticulture Research）。广
华南植物园在报春苣苔属叶绿体基因组装研究取得进展
报春苣苔属是典型的喀斯特岩溶洞穴植物，具有非常丰富的物种多样性和特有性，是研究喀斯特植物适应性进化和物种形成的理想模式。图1. 报春苣苔属叶绿体基因组一致性圈图 中科院华南植物园植物科学研究中心冯超博士等人在康明研究员的指导下，以报春苣苔属植物为材料，率先搭建了该属三个完整的叶绿体基因组并进行
水稻近缘种北美沼生菰首个近完整基因组组装完成
近日，中国农业科学院烟草研究所烟草功能成分与生物合成创新团队联合院华东中心等单位，完成首个北美沼生菰接近完整基因组的组装，为菰属作物遗传改良、功能基因解析和关键生物过程研究提供了宝贵的资源。相关研究成果发表在《作物学报》（The Crop Journal）上。作为栽培稻的重要野生近缘种，北美沼生菰是
中国科学家国际上首次完成仿刺参基因组测序组装
近日，记者从中国科学院海洋研究所获悉，我国科学家正式完成仿刺参基因组测序和组装，这在国际上尚属首次。该研究成果对刺参生物学和遗传育种研究具有重要科学意义，对我国刺参产业发展将产生重要推动作用。 据了解，该项研究得到了国家科技部973 、863计划，国家基金委，中国科学院和山东省科技厅、青岛市
节瓜基因组组装和强雌性状基因挖掘研究获新进展
近日，广东省农业科学院蔬菜研究所瓜类研究一室与中国水稻研究所副研究员鲁宏伟合作，在节瓜基因组组装和强雌性状基因挖掘研究方面取得新进展。相关成果发表于《园艺研究》（Horticulture Research）。节瓜A36基因组组装。研究团队供图节瓜属葫芦科冬瓜属冬瓜种，是华南特色蔬菜作物，其营养丰富，
新方法可让“超材料”实现自我组装
据美国物理学家组织网11月2日报道，美国科学家在最新一期德文版的《应用化学》杂志上指出，他们最新研制出的纳米制造技术可让自然界中并不存在的“超材料”自我组装而成。由此得到的“超材料”有些具有非比寻常的光学特性，有助于制造能给蛋白质、病毒、DNA(脱氧核糖核酸)等摄像的“超级镜头”以及隐形斗篷;而
青岛农大等团队完成海湾扇贝两个亚种基因组测序和组装
日前，青岛农业大学在扇贝育种研究方面再次取得重要进展，海洋科学与工程学院教授王春德课题组与合作单位成功完成海湾扇贝北部亚种和南部亚种基因组测序和分析，相关研究成果在线发表于《自然》旗下开源期刊Scientific Data。 此前，王春德课题组已完成紫扇贝基因组测序和组装，紫扇贝和海湾扇贝两个
中国科研团队研发出新工具，精准检测评估基因组组装质量
京10月19日电 (记者 孙自法)近年来，随着基因测序技术和算法不断发展，大量物种基因组被陆续测序和组装，为相关研究和应用提供重要遗传信息。因此，如何精准检测评估基因组组装质量高低、避免组装错误等非常关键，也备受关注。 记者19日从中国科学院植物研究所获悉，该所焦远年研究团队最新研究开发出一种
科学团队研究组装无患子染色体级别高质量基因组
近日，中国林业科学研究院亚热带林业研究所林木种质资源研究团队在《经济作物和产品》（Industrial Crops & Products）上发表了研究论文。该研究组装了无患子的染色体级别高质量基因组，分析挖掘了油脂合成候选基因，开发验证了一套特异分子标记，为无患子基因组学研究和种质遗传改良及鉴定评价
Cell：染色体水平油松基因组组装和甲基化研究取得进展
近期，北京林业大学生物科学与技术学院联合安诺优达在国际知名期刊Cell（IF：41.582）在线发表了题为“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章，研究者对油松进行了