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454测序用于美洲奶牛种牛基因组测序项目

一只名为Pawnee Farm Arlinda Chief的种牛和它的儿子Walkway Chief Mark大约有60000个后代,其后代是牛奶生产的主力。最近一项研究中1,科学家通过454全基因组测序,掌握了他们的基因组中控制重要性状的基因,包括抗病能力、牛奶产量,这些性状已通过北美的当代荷兰奶牛育种活动传播到大量用于牛奶生产的奶牛基因组中。 两只公牛基因组分别利用454 GS FLX Titanium进行测序,分别获得了7.3倍和13.5倍基因组覆盖度的数据,约20.5G和37.9G的测序序列,然后用Newbler将超过30G 的碱基序列与参照基因组进行比对,最终超过86%的参考基因组有超过1x的覆盖。 科学家应用一种称为haplotracking的技术,确定了染色体中控制者重要的性状的区域,这些区域在群体进化中受到较大的选择性压力。这项研究揭示了奶牛基因组进化的过程,显示外在因素对这些......阅读全文

454测序用于美洲奶牛种牛基因组测序项目

  一只名为Pawnee Farm Arlinda Chief的种牛和它的儿子Walkway Chief Mark大约有60000个后代,其后代是牛奶生产的主力。最近一项研究中1,科学家通过454全基因组测序,掌握了他们的基因组中控制重要性状的基因,包括抗病能力、牛奶产量,这些性状已通过北美的当

PacBio完成大型基因组测序项目

  什么叫PacBio技术应用到大型基因组测序项目中会大打折扣,在哪个环节大打折扣?提出这个问题的读者几乎都是抱有同样的心态,尽管大多数读者都基本认同了,如果为了得到Finishing Genome,那么PacBio无论技术和成本,理论上都是最低的,但即使这样,客观成本还是高的吓人,而假如将就D

我国完成首个鱼类基因组测序项目

  记者8月5日从深圳华大基因研究院获悉,中国水产科学研究院黄海水产研究所和深圳华大基因研究院已联合完成半滑舌鳎全基因组测序和组装,绘制了半滑舌鳎全基因组序列图谱。这是我国完成的第一个鱼类基因组测序项目和全基因组序列图谱,使半滑舌鳎成为世界上第一个测定了全基因组序列的鲽形目鱼类。  据了解

中国启动世界首个驴基因组测序项目

  10日,世界首个驴基因组测序项目在北京启动,图为山东省农科院,华大基因有限公司和东阿阿胶股份有限公司签署“驴基因组研究协议”。  北京11月10日,驴是世界各国传说和故事中运用颇多的一种动物形象,现代社会中,驴逐渐从农用转为食用和药用。如何繁育出更加“聪明”“实用”的驴?数十名基因学、畜牧学专家

长读长测序技术:拯救基因组组装项目

  随着高精度长读长测序技术的出现,基因组难以组装的状态正在改变。《Nature Methods》杂志上近日发表了一篇文章,介绍了基因组组装项目如何受益于这种技术。  自测序技术问世以来,利用DNA序列的片段来组装人类、动植物或微生物的基因组就一直是难题。许多参考基因组都存在缺陷,如组装错误或存在缺

基因组测序

如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的

基因组所国际合作项目椰枣基因组测序及功能研究获进展

  最近,由中国科学院北京基因组研究所与沙特阿卜杜拉国王科技城(King Abdulaziz City for Science and Technology, KACST)共同启动的合作项目“枣椰 (Phoenix dactylifera L.)基因组计划”获得系列进展,本月初其标志性研究—

解码“基因组学之父”桑格:测序,测序,测序

  “桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’,他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础,彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、   有一天,65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验,转身走出实验室,宣布自己正式退休。那一年是1983

基因组测序仪简介

  基因组测序仪是一种用于生物学领域的分析仪器,于2012年12月19日启用。  技术指标  个体化基因组测序仪主机/ION TORRENT主机。  主要功能  样品处理、快速的运行时间以分析单个或多个样品 支持多重文库,从而实现最大的效率和经济性 可在必要时禁用个别测序通道,以节约试剂用量。

PNAS:甜瓜基因组测序

  甜瓜在世界范围具有很高的经济价值,日前西班牙的九个研究中心通力合作,利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组,科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组,文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。   联合国粮农组织2009年