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PCRArray简单实用的检测基因表达的高通量方法

简介:什么是PCR芯片?实时定量PCR是检测基因表达最灵敏,最可靠的方法。通过在试验过程中,实时监测荧光染料的信号变化,反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广(能达到5个数量级),因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是,由于实时定量PCR需要制备标准曲线和同时分析内参基因,因此,每次实验只能检测少数几个基因的表达水平,若要检测大量基因,则工作量巨大,耗时长久。通过简单的,经过优化的实时定量PCR体系,如SuperArray的RT2ProfilerTM PCR芯片,研究者可以同时研究大量基因,既可以进行某些特别感兴趣的信号通路的研究,也可以作为验证芯片结果的方法。为了获得理想的实验结果,PCR芯片面临以下挑战:高特异性,高灵敏度和可重复性。高灵敏度或低检出限,在样品的总RNA量少,基因表达量低的情况下,也能检测出目的基因。高特异性,扩增产物严格保证基因特异性,避免非特异性产物,如引物二聚体的产生。......阅读全文

PCR Array 常见问题解答

PCR Array FAQ:任何一台能够做QPCR的仪器据能够做PCRarray吗?QPCR 仪器都可以进行QPCR array的实验。根据仪器采用的96孔或者384孔板,分为以下5种板型(plate format):plate formatInstrument providerQPCR instr

通过qPCR开展基因表达谱分析

  一提起基因表达谱分析,大家马上会想到芯片。然而,并不是每个实验室都具备这个条件。现在,利用每个实验室都有的定量PCR仪,也能开展可靠的基因表达谱分析啦。   QIAGEN推出的RT2 Profiler PCR Array是一种高度可靠且灵敏的基因表达谱分析技术,它利用实时定量PC

RT2 Profiler PCR Arrays新手小技巧及注意事项

RT2 Profiler PCR Arrays新手小技巧及注意事项(做了几百次PCR Array的Matt Finley博士的经验之谈) RNA纯化和分析: 起始RNA样品的质量是成功实验的最重要的因素之一。我强烈推荐使用QIAGEN的RNA纯化试剂盒来进行RNA纯化。RNA样品必须进行柱上DNa

PCR Array——基因表达分析疾病和信号通路的利器(一)

以前只要提到基因表达分析,人们就会想到荧光定量PCR;只要提到高通量基因表达分析,人们会首先想到基因芯片。虽然荧光定量PCR仪几乎每个实验室都有,但是做芯片就不一定每个实验室都具备这个条件了。那么只有一台荧光定量PCR仪是否也能进行高通量的基因表达谱分析呢?QIAGEN 推出的RT2 Profile

快速可靠的甲基化分析,无需亚硫酸氢盐转化

  在甲基化分析中,亚硫酸氢盐转化通常是必经之路。它将未甲基化的胞嘧啶转化成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,之后再结合PCR、测序等技术分析甲基化状态。听上去似乎很简单,但要想获得漂亮的结果,却并非那么容易。转化效率如何?回收率如何?这都是需要考量和优化的因素。   最近,QIAGEN

NALP3炎性体与非感染性炎症疾病及其通路研究工具

  一、NALP3炎性体的结构和分布   NALP3炎性体是一类分子量约为700kDa的大分子蛋白复合体,由核苷酸结合寡聚化结构域样受体(nucleotide-binding oligomerization domain-like receptors,NLRs)家族成员NALP3、衔接蛋白ASC

趋化因子及其受体的功能介绍(四)

5 .5 趋化因子对组织细胞及肿瘤细胞的趋化作用趋化因子除了对免疫细胞有定向趋化作用外,对其它能够表达相应趋化因子受体的组织细胞都具有趋化作用。如前面提到的ELR-CXC类趋化因子对内皮细胞的趋化作用。SDF-1对胚胎期神经细胞的趋化能力使之在中枢神经系统神经网络的发育中起重要作用。长期以

FAO通路通过抑制失巢凋亡促进结肠直肠癌细胞远端转移

   中山大学附属肿瘤医院肿瘤研究所徐瑞华教授长期从事消化道肿瘤个体化治疗及抗癌药物研究。该课题组利用NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array研究发现在非贴壁的结直肠癌细胞中,脂肪酸氧化(FAO)通路被激活。而在转移的肿瘤中,CPT1A表达上调,由CPT1A

FAO通路通过抑制失巢凋亡促进结肠直肠癌细胞远端转移

中山大学附属肿瘤医院肿瘤研究所徐瑞华教授长期从事消化道肿瘤个体化治疗及抗癌药物研究。该课题组利用NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array研究发现在非贴壁的结直肠癌细胞中,脂肪酸氧化(FAO)通路被激活。而在转移的肿瘤中,CPT1A表达上调,由CPT1A介导的

PCR Array——基因表达分析疾病和信号通路的利器(二)

RT2 Profiler PCR Array操作流程 首先将RNA样本反转录成cDNA第一链,作为PCR模板;接着将cDNA模板与合适的即用型PCR预混液混合,等体积加入到已经固定好基因特异性引物的同一个孔板的每个孔中,然后即可运行real-time PCR循

BioTNT PCR Array实验操作介绍

  一.用户需要自备的材料和仪器   Biotnt First Strand cDNA Synthesis Kit:A2010B0B03 ;   Biotnt qPCR Premix Kit: A2010A0112;   RNA 抽提:推荐使用Qiagen RNeasy Mini Kit (

BioTNT PCR Array实验操作介绍

  一.用户需要自备的材料和仪器   Biotnt First Strand cDNA Synthesis Kit:A2010B0B03 ;   Biotnt qPCR Premix Kit: A2010A0112;   RNA 抽提:推荐使用Qiagen RNeasy Mini Kit (

BioTNT PCR Array实验操作(一)

一.用户需要自备的材料和仪器 Biotnt First Strand cDNA Synthesis Kit:A2010B0B03 ;Biotnt qPCR Premix Kit: A2010A0112;RNA 抽提:推荐使用Qiagen RNeasy Mini Kit (50) 74104,RNas

BioTNT PCR Array实验操作介绍

  一.用户需要自备的材料和仪器   Biotnt First Strand cDNA Synthesis Kit:A2010B0B03 ;   Biotnt qPCR Premix Kit: A2010A0112;   RNA 抽提:推荐使用Qiagen RNeasy Mini Kit (

FAO通路通过抑制失巢凋亡促进结肠直肠癌细胞远端转移

   中山大学附属肿瘤医院肿瘤研究所徐瑞华教授长期从事消化道肿瘤个体化治疗及抗癌药物研究。该课题组利用NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array研究发现在非贴壁的结直肠癌细胞中,脂肪酸氧化(FAO)通路被激活。而在转移的肿瘤中,CPT1A表达上调,由CPT1A

Bio-Mark™基因分析系统介绍

美国Fluidigm公司www.fluidigm.com创立于1999年,总部设在美国加州。其创始人是Steve Quake和Gajus Worthington(公司CEO)。Steve Quake是美国斯坦福大学教授,是微液流领域(Microfluidic Technology)的权威专家http

多重等位基因特异性PCR芯片在听力筛查中的应用

       1. Abstract  We demonstrate a new method, using a universal array approach termed multiplex allele-specific PCR-b

PCR Array 简单实用的检测基因表达的高通量方法(二)

PCR芯片的设计和所包含的基因 96孔模式的每种RT2Profiler PCR芯片,含有基因特异性引物,可用于研究84个与某种信号通路或者疾病相关的基因。此外,芯片中还有设置了3个检测实验质量的对照。图2为PCR芯片模式图。由于每种芯片都是根据特别的信号通路或者特定的应用范围设计的,研究者可以用它来

植物miRNA及piRNA的逆转录

miRNA在植物的发育、抗病、和应激反应中发挥着重要作用。一般认为,这些小的非编码RNA通过靶向mRNA剪切,在后转录水平调节植物的基因表达。这些基因表达中的靶向变化由数百个成熟miRNA的差异表达所调控,每个成熟miRNA结合在靶mRNA的特定序列上。因此,对植物的成熟miRNA调控和表达进行分析

PCR Array 简单实用的检测基因表达的高通量方法

 简介:什么是PCR芯片?实时定量PCR是检测基因表达zui灵敏,zui可靠的方法。通过在试验过程中,实时监测荧光染料的信号变化,反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广(能达到5个数量级),因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是,由于实时定量PCR需要制备

中国科学家Nature Genetics发表淋巴瘤研究新成果

上海交通大学领衔的系统生物医学协同创新中心联合来自我国血液/肿瘤临床多中心研究机构(M-HOPES)的17家医院,最近在淋巴瘤发病原理和临床预后研究方面获得了重要的标志性成果,充分体现了多中心多学科协同创新、造福患者的宗旨。自然杀伤/T细胞淋巴瘤(natural killer T-cell ly

tRNA相关研究背景介绍

  A. 概述   转运RNA(Transfer Ribonucleic Acid,tRNA)是生物体内含量最为丰富的短链非编码RNA分子。它携带并转运氨基酸,参与蛋白翻译,是连接mRNA与蛋白质的重要桥梁。尽管tRNA广泛存在于生物体内,但不同机体基因组对于特定密码子的偏好性不同,从而导致tRN

tRNA相关研究背景介绍

  A. 概述   转运RNA(Transfer Ribonucleic Acid,tRNA)是生物体内含量最为丰富的短链非编码RNA分子。它携带并转运氨基酸,参与蛋白翻译,是连接mRNA与蛋白质的重要桥梁。尽管tRNA广泛存在于生物体内,但不同机体基因组对于特定密码子的偏好性不同,从而导致tRN

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A. 概述转运RNA(Transfer Ribonucleic Acid,tRNA)是生物体内含量最为丰富的短链非编码RNA分子。它携带并转运氨基酸,参与蛋白翻译,是连接mRNA与蛋白质的重要桥梁。尽管tRNA广泛存在于生物体内,但不同机体基因组对于特定密码子的偏好性不同,从而导致tR

LncRNA-DILC阻碍肝癌干细胞更新和增殖

   中国工程院院士、第二军医大学王红阳教授课题组长期从事恶性肿瘤的基础与临床研究,对肿瘤发生发展的分子病理机制和细胞信号转导有重要建树。近期,该实验室使用Arraystar LncRNA芯片发现了与肝癌干细胞的自我更新相关的分子--Lnc-DILC。高表达的Lnc-DILC可以竞争性结合IL-6,

tRNA相关研究背景介绍

  A. 概述   转运RNA(Transfer Ribonucleic Acid,tRNA)是生物体内含量最为丰富的短链非编码RNA分子。它携带并转运氨基酸,参与蛋白翻译,是连接mRNA与蛋白质的重要桥梁。尽管tRNA广泛存在于生物体内,但不同机体基因组对于特定密码子的偏好性不同,从而导致tRN

脂肪代谢基因通路介绍

(Mouse)脂类主要包括脂肪、磷脂、鞘脂和胆固醇脂,其吸收代谢有两种情况: 中链、短链脂肪酸构成的甘油三酯乳化后即可吸收——>肠粘膜细胞内水解为脂肪酸及甘油——>门静脉入血。长链脂肪酸构成的甘油三酯在肠道分解为长链脂肪酸和甘油一酯,再吸收——>肠粘膜细胞内再合成甘油三酯,

LncRNA-DILC阻碍肝癌干细胞更新和增殖

中国工程院院士、第二军医大学王红阳教授课题组长期从事恶性肿瘤的基础与临床研究,对肿瘤发生发展的分子病理机制和细胞信号转导有重要建树。近期,该实验室使用Arraystar LncRNA芯片发现了与肝癌干细胞的自我更新相关的分子--Lnc-DILC。高表达的Lnc-DILC可以竞争性结合IL-6,阻

PCR Array——基因表达分析疾病和信号通路的利器(三)

RT2 PCR Profiler Arrays可用于生物学和医学研究的各个领域,包括:癌症研究、炎症和细胞因子分析、干细胞研究、神经生物学、信号转导通路研究、细胞黏附和细胞迁移、生物标记分子筛选和验证截止目前,QIAGEN 拥有专利申请的PCR Ar

生物芯片在聋病分子检测中的应用

1. 什么是生物芯片?  在20世纪科技史上有两件事影响深远:一是微电子芯片,它是计算机和许多家电的“心脏”,它改变了我们的经济和文化生活,并已进入每一个家庭;另一件事就是生物芯片,它将改变生命科学的研究方式,革新医学诊断和治疗,极大地提高人口素质和健康水平。这是美国《财富