未解析碎片离子的检索实验——基本方案
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤数据库同样可以检索一个单个肽段及其碎片离子的质量。肽段质量同它的碎片离子质量一起提供了非常具有鉴别力的判断标准，可用于在序列数据库中检索，包括由表达序列标签翻译的序列数据库（图 5.3) 。这一手段已被广泛用于凝胶分离蛋白质酶水斛后产生的肽段鉴定。肽段通常用上文所述的一些方法，在质谱仪气相中被诱导产生碎片离子，例如 PSD-MALDI-MS, 或三级四极质谱及离子阱中的 CID。在这些仪器中，肽段离子断裂的方式具有序列特异性，主要沿肽骨架的肽键断裂，见图 5.4 所示。如果肽离子的正电荷保留在碎片离子的 N 末端，此离子被称为 b 系列离子，用下行数字代表这一碎片离子中的氨基酸残基数目，从 N 末端起为1 。因此， b 离子代表 C 末端缺失， N 未端完整的碎片离子。如果电荷保留在 C 末端，离子被称为 y 系列离子：与 b 系列离子一样有下标数字，但从 C 末端数起）。因此 y 离子代......阅读全文
未解析碎片离子的检索实验——基本方案
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤数据库同样可以检索一个单个肽段及其碎片离子的质量。肽段质量同它的碎片离子质量一起提供了非常具有鉴别力的判断标准，可用于在序列数据库中检索，包括由表达序列标签翻译的序列数据库（图 5.3) 。这一手段已被广泛用于凝胶分离蛋白质酶水斛后产生的肽段鉴定。肽段通常用上
未解析碎片离子的检索实验——方案优化
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤除了人工解析碎片离子谱外，还有两种基本检索手段用于匹配数据库中序列产生的碎片离子谱。第一种方法依靠人工解析部分谱图来鉴别某一特定系列 (b 或v) 离子的连续离子元素（例如鉴别出相互之间相差一个氨基酸残基质量的碎片离子），解析出部分序列信息，再结合以下参数：①
未解析碎片离子的检索实验
实验方法原理 实验材料 蛋白样品仪器、耗材 质谱仪实验步骤 数据库同样可以检索一个单个肽段及其碎片离子的质量。肽段质量同它的碎片离子质量一起提供了非常具有鉴别力的判断标准，可用于在序列数据库中检索，包括由表达序列标签翻译的序列数据库（图 5.3) 。这一手段已被广泛用于凝胶分离蛋白质酶水斛后产生
未解析碎片离子的检索实验
基本方案 方案优化 实验方法原理 实验材料 蛋白样品
肽质量检索实验_基本方案
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤鉴定数据库中已有序列的蛋白质的算法基于以下一些理念：(1) 肽段是由切点专一的试剂水解蛋白质产生的，通常用已知切点专一的蛋白酶。(2) 这些肽段的质量由 MALDI-MS 或 ESI-MS 精确测定。(3) 计符蛋白序列数据库中的每一序列被实验中所用水解试剂水
Mass－Frontier碎片离子检索功能（FISh）在士的宁...（二）
3.3士的宁完整裂解机理LTQ Orbitrap XL的线性离子阱相比传统三维离子阱具有更高的离子容量，故具有优异的多级质谱能力，能够高效的捕获前级离子进行碎裂，并获得高灵敏度的碎片离子信息，在对士的宁母离子的采集过程中，获得了其四级有效质谱信息（MS4）。通过多级质谱解析，总结出士的宁完整裂解
Mass－Frontier碎片离子检索功能（FISh）在士的宁...（一）
Mass Frontier碎片离子检索功能（FISh）在士的宁代谢物鉴定中的应用1.引言 马钱子为马钱科植物马钱Strychnos nux-Vomical L.的干燥成熟种子, 其主要活性成分是生物碱，具有通经络、消肿痛、止痛的功效, 是中医临床常用药物。其中主要有效成分士的宁（strych
肽质量检索实验_其他方案
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤用肽质量数据鉴定蛋白质所控制的实验参数中，最具决定性的参数是肽质量测量的精确度 。质量精确度越高，结果判定越可信。另一决定性参数是所用酶（或化学试剂）的专一性。酶越纯，专一性胞高，检索结果可信。常用的酶是胰蛋内酶。但是要注意的是，即便是高纯度的胰蛋白酶也会在非
离子交换层析实验——基本方案
离子交换层析（Ion Exchange Chromatography简称为IEC）是以离子交换剂为固定相，依据流动相中的组分离子与交换剂上的平衡离子进行可逆交换时的结合力大小的差别而进行分离的一种层析方法。实验材料蛋白质试剂、试剂盒离子交换缓冲液仪器、耗材离子交换层析柱梯度混合器电导表实验步骤1.
核酸序列的检索实验
实验方法原理掌握核酸序列检索的操作方法；熟悉GenBank数据库序列格式及其主要字段的含义；了解EMBL数据库序列格式及其主要字段的含义；熟悉GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存；实验材料电脑仪器、耗材笔记本笔实验步骤1. 使用Entrez信息查询系统检索核酸序列BC0608
肽质量检索实验
基本方案 其他方案 实验方法原理 实验材料 蛋白样品
肽质量检索实验
实验方法原理 实验材料 蛋白样品仪器、耗材 质谱仪实验步骤 鉴定数据库中已有序列的蛋白质的算法基于以下一些理念：(1) 肽段是由切点专一的试剂水解蛋白质产生的，通常用已知切点专一的蛋白酶。(2) 这些肽段的质量由 MALDI-MS 或 ESI-MS 精确测定。(3) 计符蛋白序列数据库中的每一序列被
用质谱数据对肽段从头测序实验
方案一 方案二 方案三 实验方法原理 单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列，即相邻肽段间相差一个氨基酸残基，用质谱分析肽阶梯，通常用 MALD
探索新污染物监测新境界丨高分辨质谱进阶攻略
随着《重点管控新污染物清单（2023版）》的全面实施，新污染物监测的重要性逐渐凸显，引发了社会各界的广泛关注。在当前的实验室环境中，LC/MS检测方案以其稳定可靠的性能，特别是三重四极杆液质检测技术的广泛应用，已成为新污染物检测的主流方式。然而随着检测需求的不断提升，我们面临着新的挑战：如何在常规检
实验室分析仪器质谱分析词汇－碎片离子
碎片离子是由母体分子离子发生碎裂产生。解离出的所有碎片的质量数之和等于母离子的质量数,在指定的条件下,以可预测的方式,断裂相同的内键,分子碎裂方式是可以预测的(碎片离子相同,其相对丰度也相同)。也可参见从具体MRM试验得到的产物(子代)离子。
质谱中常见的碎片离子数据表
质谱中常见的碎片离子数据表包括以下内容：1. 碳氢离子：碳氢离子是最常见的离子碎片，通常用作分子离子的碎片离子。常见的碳氢离子包括M+1、M+2、M+3、M+4等。2. 碳氧离子：碳氧离子是分子中含有羧基和醛基时产生的离子碎片。常见的碳氧离子包括M-1、M-15、M-29等。3. 氮碳离子：氮碳离子
线性离子阱多种解离技术对阿德福韦酯杂质谱的全（二）
结果与讨论 I. 全扫—Top5 HCD dd MS/MS 与“FISh”ADP 杂质谱分析流程由两次连续的LCMS实验构成。分析目标是为杂质鉴定和结构解析收集尽可能多的信息。第一个 MS 实验包括全扫描和后续的 Top5 HCD 数据依赖MS/MS 扫描（图1）。 接下来，数据通过MassFr
Cerno发布新型Rx平台－加速MassWorks普及应用
苹果公司的IOS、谷歌的Android、腾讯的微信，都是我们熟知的平台，它们可以更好地接入和调用第三方的工具，并加速实现各种基于平台的应用。MassWorks软件具有独特的精确质量和谱图准确度校正方法，使人们在使用单四极杆质谱时，也可获得被国际期刊认可的精确质量和元素组成，准确地进行化合物鉴定；
用质谱数据对肽段从头测序实验（一）
实验方法原理单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列，即相邻肽段间相差一个氨基酸残基，用质谱分析肽阶梯，通常用 MALDI-TOF,MS 分析。 MS/MS 测序用的是上文所述用于数据库检索的 CID 谱，但碎片离子由人工完全解析。用于MS 序列分析的肽阶梯是由化学或酶法降解肽段产生，由 C 未端或N未端断
用质谱数据对肽段从头测序实验
实验方法原理 单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列，即相邻肽段间相差一个氨基酸残基，用质谱分析肽阶梯，通常用 MALDI-TOF,MS 分析。 MS/MS 测序用的是上文所述用于数据库检索的 CID 谱，但碎片离子由人工完全解析。用于MS 序列分析的肽阶梯是由化学或酶法降解肽段产生，由 C 未端或N未端
YAC克隆的分析实验——基本方案
YAC带有天然染色体所有的功能元件，包括一个着丝粒，一个DNA复制起点，两个端粒。YAC能够容纳长达几百kb的外源DNA，这是质粒和黏粒办不到的。大片段的插入更有可能包含完整的基因，在染色体步移中每次允许更大的步移距离，同时能够减少完整基因组文库所需的克隆数目。实验材料酵母菌试剂、试剂盒AHCYPD
免疫沉淀实验——基本方案
经典的免疫沉淀是可溶性抗原与其抗体产生可见沉淀反应的血清学试验。后来发展为抗原抗体结合后，用固相化的蛋白A或蛋白G小珠等来吸附分离抗原抗体复合体，达到检测微量抗原或抗体的目的。实验材料蛋白质试剂、试剂盒裂解缓冲液稀释缓冲液SDSTrisTSA仪器、耗材转子离心机实验步骤1. 表面标记或生物合成标记
MALDlMS实验_基本方案
实验方法原理线性 MALDI-MS：MALDI-MS质谱仪恐怕是概念上和设计上都最简单的质谱仪，分子（分析物）经 MALDI 方式离子化，离子的质荷比 (m/z）由飞行时间质分析器检测（见图 5,1) 。 测量的质量精确度与m/z有关， 25ku 以下可达到约 0.01%-0.05% 的精确度，到
定点诱变实验——基本方案
定点突变是指通过聚合酶链式反应（PCR）等方法向目的DNA片段（可以是基因组，也可以是质粒）中引入所需变化（通常是表征有利方向的变化），包括碱基的添加、删除、点突变等。定点突变能迅速、高效的提高DNA所表达的目的蛋白的性状及表征，是基因研究工作中一种非常有用的手段。实验材料DNA试剂、试剂盒TE寡核
线性离子阱质谱仪的使用功能简介
线性离子阱质谱仪的功能简介： 1、可升级的电子转移裂解（ETD)模块可以提供传统裂解方法无法得到的蛋白质翻译后修饰信息； 2、脉冲碰撞能量诱导解离（PQD)功能可以提供低质量端碎片离子信息； 3、高选择MS/MS分析给谱图在数据库和谱库检索更好的匹配，提高了结构确证的可靠性。另外快速极性切换，
岛津GCMSsolution培训笔记（二）
步骤二：单击实时分析助手栏中的调谐图标，单击调谐中的峰监测图标; 步骤三：在峰监测界面里，监视组选择水空气，单击打开灯丝，检查泄漏，检漏结束后关闭灯丝; 步骤四：单击实时分析助手栏中的调谐图标，单击调谐中的自动调谐条件图标，调谐信息窗口弹出，选默认条件并确定，选择
DNA片段的亚克隆实验——基本方案
所谓亚克隆就是对已经获得的目的DNA片段进行重新克隆，其目的在于对目的DNA进行进一步分析，或者进行重组改造等。亚克隆的基本过程包括：(1)目的DNA片段和载体的制备；(2)目的DNA片段和载体的连接；(3)连接产物的转化；(4)重组子筛选。实验材料DNA试剂、试剂盒CIPdNTPDNA聚合酶T4聚
荧光原位杂交实验——基本方案
实验材料样品试剂、试剂盒DNA探针非同位素甲酰胺杂交混合液甲酰胺Triton X-100SSC仪器、耗材相差显微镜盖玻片水浴锅加湿盒滤光片荧光显微镜实验步骤1a. 石蜡切片或细胞的杂交：按石蜡切片或细胞的原位杂交实验的基本方案步骤1~7，对载玻片进行脱蜡、水化、 封闭和脱水处理。将标本晾干（或在干
动脉导管未闭的基本介绍
动脉导管原本系胎儿时期肺动脉与主动脉间的正常血流通道，由于此时肺呼吸功能障碍，来自右心室的肺动脉血经导管进入降主动脉，而左心室的血液则进入升主动脉，故动脉导管为胚胎时期特殊循环方式所必需。出生后，肺膨胀并承担气体交换功能，肺循环和体循环各司其职，不久导管因废用即自选闭合。如持续不闭合而形成动脉导
实验室离心机基本构造解析
实验室离心机由机架、转子、驱动系统、控制系统、制冷系统和安全保护系统等组成。一、机架：机架由箱体、门盖和内胆等组成。箱体和门盖采用钢板材质，内胆采用不锈钢材质。二、转子：转子主要分角转子和水平转子两类。角转子工作时的阻力比水平转子小，宜高速分离，但不宜大容量分离。水平转子工作时的阻力比角转子大，不宜