简并PCR
简并PCR就是引物合成的时候在某个位置用两种以上的碱基代替原来的单碱基渗入oligo链合成的是一堆混和物实际上能够起做用的在其中占一定比例这个比例一般用简并度表示比如agctN合成的时候最后一位用4种碱基反应真正用的agctc,占总数的1/4agctNN其中agctCC就占1/16一般公司推荐3‘端尽可能少的简并而且有效引物在总数中不能低于一定比值简并太多宁可多设计几条引物也有用次黄代替AGCT四种的,不过价格昂贵,一般很少用......阅读全文
基于简并腔中涡旋光子的拓扑量子模拟实现
中国科学技术大学郭光灿院士团队李传锋、许金时、韩永建等人将携带不同轨道角动量的光子(又称为涡旋光子)束缚在简并光学谐振腔内,通过引入光子的自旋轨道耦合人工合成了一维的拓扑晶格,为拓扑量子模拟开创了一种新的方法。研究成果4月19日发表于《自然-通讯》。实验装置与理论模型示意图:a. 简并光学谐振腔b.
PCR的引物
特异性的引物决定了所扩增的DNA片段,引物(primer)本质上是人工合成的小片段寡聚核苷酸片段,一般不超过50个碱基(通常18-25个),它们与所要扩增的DNA片段的正链与负链的末端完全互补。在“退火”时引物结合于DNA模板的起始和终止点,DNA聚合酶结合到这两个位置,开始合成新的DNA链。
降落PCR(Touchdown-PCR)的原理?
Touchdown PCR是指每隔一个循环降低1°C反应退火温度,直至达到“Touchdown”退火温度,然后以此退火温度进行10个左右的循环。该方法最初出现是为了避开确定最佳退火温度而进行的复杂的反应优化过程。正确和非正确退火温度之间的任何差异将造成每个循环PCR产物量的两倍差异(每摄氏度造成
降落PCR(Touchdown-PCR)的原理
Touchdown PCR是指每隔一个循环降低1°C反应退火温度,直至达到“Touchdown”退火温度,然后以此退火温度进行10个左右的循环。该方法最初出现是为了避开确定最佳退火温度而进行的复杂的反应优化过程。正确和非正确退火温度之间的任何差异将造成每个循环PCR产物量的两倍差异(每摄氏度造成4倍
宁波大榭检验检疫局汉坦病毒群检测试剂获发明ZL
日前,宁波大榭检验检疫局自主研发一种汉坦病毒群的简并RT-PCR检测试剂及试剂盒获得了国家知识产权局的国家发明ZL授权,这也是大榭局建局十年来首次获得的国家发明ZL。 该发明是一种灵敏性较高,对汉坦病毒群特异性好的通用的汉坦病毒群的简并RT-PCR检测试剂及试剂盒。利用该试剂盒可以扩增检测
PCR产物测序结果分析
pcr产物测序的最大风险是有在凝胶上看起来的一个条带,实际上有多个分子。也就是说长度相似的分子有可能在电泳的时候只有一条带。如果只是进行pcr产物回收,没有进行凝胶分离的过程的话,东西可能更多了。问题就在于,如果出现双峰或者多峰,这个样品就白送了,什么也结果也没有。特别你现在用的还是简并引物,本身目
Raf-蛋白-Ras-结合结构域的简并进化库合成
实验材料寡核苷酸引物Tag 聚合酶BL21 电转感受态细胞试剂、试剂盒氨苄青霉素卡那霉素仪器、耗材琼脂糖凝胶实验步骤3.1 概论3.1.1 PCA 对空间排列的要求PCA 片段的三维朝向对于 PCA 报告蛋白是否能正确折叠至关重要,它取决于形成复合体的目的蛋白 N 端或 C 端的朝向(图 15.1
mRNA-的-PCR-差异显示实验
实验方法原理 实验材料 人的细胞总 RNA 或 poly(A)+ RNA试剂、试剂盒 人胎盘 RNase 抑制剂DNase ITris·ClKClMgCl23:1 (V V) 苯酚 氯仿乙酸钠乙醇DEPC 处理的水简并锚定 oligo(dT) 引物组合MoMuLV 逆转录酶缓冲液DTT4dN
mRNA-的-PCR-差异显示实验
对应于 mRNA 的 DNA 序列,可以被回收、克隆、测序,可以用作杂交或筛库的探针。来源:《精编分子生物学实验指南(第五版)》实验材料人的细胞总 RNA 或 poly(A)+ RNA试剂、试剂盒人胎盘 RNase 抑制剂DNase ITris·ClKClMgCl23:1 (V V) 苯酚 氯仿乙酸
mRNA-的-PCR-差异显示实验
实验方法原理 实验材料 人的细胞总 RNA 或 poly(A)+ RNA 试剂、试剂盒
PCR产物弥散-扩不出来-怎么回事
在引物没有试验过,PCR条件没确定的情况下,建议用梯度PCR仪确定退火温度。2.有阳性模板的情况下设立阳性对照。(成功的pCR结果,稀释1000倍就可以)建议每次都设立。3.模板的问题。(和样品有关,有一定的可能)4.引物设计和模板不匹配。因为引物可能是简并引物,特异性较差。或分离的菌株同标准菌株的
全基因组扩增技术介绍
研究人员通常会在下游分析中遭遇DNA样本量有限或不足的问题。QIAGEN的全基因组扩增技术通过以包括单细胞在内的小量样本或珍贵样本扩增获得基因组DNA,解决此类难题。REPLI-g Kit能够准确地复制原始DNA样本,不会造成偏差,扩增后的DNA可以直接应用于广泛的遗传学分析。什么是全基因组扩增(w
中国科学家发现新型费米子——三重简并费米子
在国家重点研发计划“大科学装置前沿研究”重点专项等的支持下,中国科学院物理研究所的研究团队首次发现了突破传统分类的新型费米子——三重简并费米子。这是继“拓扑绝缘体”、“量子反常霍尔效应”、“外尔费米子”之后,中国科学家在拓扑物态研究领域的又一项重大突破。该项研究成果在《自然》(Nature)杂志
Raf-蛋白-Ras-结合结构域的简并进化库合成以及
Raf 蛋白 Ras 结合结构域的简并进化库合成以及利用片段互补法快速筛选二氢叶酸还原酶的快速折叠且稳定的克隆 实验材料 寡核苷酸引物
合肥研究院发现新的三重简并拓扑半金属
近日,中国科学院合肥物质科学研究院强磁场科学中心研究员田明亮课题组在拓扑半金属材料研究中取得新进展。研究人员通过对层状结构的PtBi2在40特斯拉高磁场下的量子输运特性测量及第一性原理能带计算研究,发现层状结构的PtBi2是新一类三重简并拓扑半金属,相关研究成果在线发表在《自然-通讯》(Natu
递减聚合酶链式反应的简介
递减PCR,亦称降落PCR(touchdown PCR)是一种PCR(聚合酶链式反应)方法,用来避免非特异性序列的扩增。PCR中引物的黏合温度(annealing temperature)决定了黏合的特异性,温度越高特异性越强,但过高则不能实现引物和模板的结合,而过低会产生大量非特异性产物。因此
Troubleshooting-for-PCR-and-multiplex-PCR
Troubleshooting discussion is based on the PCR protocol as described in the table below. All reactions are run for 30 cycles.COMPONENTVOLUMEFINALCONCE
PCR简介/PCR仪
PCR的要素基本的PCR须具备PCR仪图册1.要被复制的DNA模板 Template2.界定复制范围两端的引物Primers.3.DNA聚合酶Taq. Polymearse4.合成的原料(四种脱氧核苷酸)及水。 PCR仪工作原理利用升温使DNA变性,在聚合酶的作用下使单链复制成双链,进而达到基因复制
多重PCR(Multiplex-PCR)
一般PCR仅应用一对引物,通过PCR扩增产生一个核酸片段,主要用于单一致病因子等的鉴定.多重PCR(multiplex PCR),又称多重引物PCR或复合PCR,它是在同一PCR反应体系里加上二对以上引物,同时扩增出多个核酸片段的PCR反应,其反应原理,反应试剂和操作过程与一般PCR相同. 多
多重PCR(Multiplex-PCR)
一般PCR仅应用一对引物,通过PCR扩增产生一个核酸片段,主要用于单一致病因子等的鉴定.多重PCR(multiplex PCR),又称多重引物PCR或复合PCR,它是在同一PCR反应体系里加上二对以上引物,同时扩增出多个核酸片段的PCR反应,其反应原理,反应试剂和操作过程与一般PCR相同. 多
重叠PCR—overlap-PCR
1、简介 重叠PCR也是基本的PCR原理:变性-退火-延伸。不同的是在重叠PCR过程是两个或者几个片段重叠延伸之后,再进行指数扩增的PCR过程。 2、基本原理*步:PCR产生两个或者几个片段,这几个片段之间必须有重叠区。 第二步:以两个片段为例,见上图,*步产生的两个片段,A D链之间有互补,B
普通PCR梯度PCR-原位PCR-荧光定量PCR仪的区别
普通PCR仪: 一般把一次PCR扩增只能运行一个特定退火温度的PCR仪,称之为普通PCR仪,也就是传统的PCR仪。如果要用它做不同的退火温度则需要多次运行。如;(ABI 2720) 梯度PCR仪: 一次性PCR扩增可以设置一系列不同的退火温度条件(通常12种温度梯度)的称
PCR使用技巧
基本PCR引物设计参数 引物设计的目的是在两个目标间取得平衡:扩增特异性和扩增效率。特异性是指发生错误引发的频率。特异性不好或劣等的引物会产生额外无关和不想要的PCR扩增子,在EB染色的琼脂糖凝胶上可见到;引物效率是指在每一PCR循环中一对引物扩增的产物与理论上成倍增长量的接近程度。 ①引物长度;
寡核苷酸的优化设计
关键词:寡核苷酸;优化设计中图分类号:Q524 在核酸分子杂交、DNA序列测定和通过PCR放大DNA片段等实验中,都需要使用寡核苷酸作为探针或引物,而对这些反应的质量起最重要影响作用的,就是这些寡核苷酸探针或引物。用优化的寡核苷酸进行实验能够很快得到好的结果,而用不够合适的寡核苷酸时,常常得
实时荧光Taqman-探针设计的几个要点
实验室很多同学都要做Real time PCR实验,实验室的师兄师姐都会有很多宝贵意见,不过也有实验室前没有做过的,查找了下资料和大家分享下关于实时荧光 Taqman 探针设计、实时荧光PCR探针的选择、引物的设计及评价。荧光探针法是用序列特异的荧光标记探针来检测产物,探针法的出现使得定量PCR技术
反转录PCR(RTPCR,-Reversed-Transcript-PCR)
1 原理 RT—PCR是一种将cDNA合成与PCR技术结合分析基因表达的快速灵敏的方法,主要用于对表达信息进行检测或定量分析,还可以用来检测基因表达差异而不必构建cDNA文库克隆cDNA。RT-PCR的模板可以为总RNA或poly(A)+选择性RNA。逆转录反应可以使用逆转录酶,以随机引物、ol
直接原位PCR(In-situ-PCR)
原位PCR是原位杂交细胞定位和PCR的高灵敏度相结合的技术,使得靶基因检测有了极大的改进。此技术是在细胞(爬片、甩片或涂片)或组织(石蜡、冰冻切片)上直接对靶基因片段进行扩增,通过掺入标记基团直接显色或结合原位杂交进行检测的方法。一、组织切片和细胞样品的制备试剂与配置10%福尔马林;二甲苯;PBS操
直接原位PCR(In-situ-PCR)
原位PCR是原位杂交细胞定位和PCR的高灵敏度相结合的技术,使得靶基因检测有了极大的改进。此技术是在细胞(爬片、甩片或涂片)或组织(石蜡、冰冻切片)上直接对靶基因片段进行扩增,通过掺入标记基团直接显色或结合原位杂交进行检测的方法。一、组织切片和细胞样品的制备试剂与配置10%福尔马林;二甲苯;PBS操
反向PCR-(inversePCR)
利用反向PCR可对未知序列扩增后进行分析,探索邻接已知DNA片段的序列,并可将仅知部分序列的全长cDNA进行分子克隆,建立全长的DNA探针。可用于:(1)基因游走研究;(2)转位因子研究;(3)已知序列DNA旁侧病毒整合位点分析等研究。实验方法原理反向PCR可用于研究与已知DNA区段相连接的未知染色
菌落PCR(Colony-PCR)方法
菌落PCR(Colony PCR)可不必提取基因组DNA,不必酶切鉴定,而是直接以菌体热解后暴露的DNA为模板进行PCR扩增,省时少力。建议使用载体上的通用引物。通常利用此方法进行重组体的筛选或者DNA测序分析。最后的PCR产物大小是载体通用引物之间的插入片断大小。具体方法:1、PCR混合物的制备T