lncRNAROR染色体构象调控葡萄膜黑色素瘤发生新机制

最近美国基因和细胞治疗学会官方期刊Molecular Therapy发表上海交通大学医学院附属第九人民医院范先群教授团队研究成果“A Cohesin-Mediated Intrachromosomal Loop Drives Oncogenic ROR lncRNA to Accelerate Tumorigenesis”。该研究揭示了长链非编码ROR(lncRNA-ROR)通过形成染色体内环构象,激活内源性表达,从而促进葡萄膜黑色素瘤(Uveal Melanoma ,UM)发生发展的新机制。UM是成人最常见的眼内恶性原发性肿瘤,恶性程度高,极易通过血行转移至全身重要器官尤其是肝脏,死亡率高,严重威胁患者视力和生命安全。范先群教授团队长期从事眼内恶性肿瘤发生机制研究,2015年12月课题组首次在国际著名学术期刊《Genome Biology》提出UM发生中基于长链非编码ROR(lncRNA-ROR)的陷阱修饰学说,被F1000评......阅读全文

lncRNA-ROR染色体构象调控葡萄膜黑色素瘤发生新机制

最近美国基因和细胞治疗学会官方期刊Molecular Therapy发表上海交通大学医学院附属第九人民医院范先群教授团队研究成果“A Cohesin-Mediated Intrachromosomal Loop Drives Oncogenic ROR lncRNA to Accelerate Tu

上海交大LncRNA研究刊登国际期刊

  长非编码RNA(lncRNA)不编码蛋白质,最初被认为是基因组“暗物质”的一部分。最近,有研究表明,lncRNAs在染色质修饰复合物的招募过程中发挥作用,并能影响基因的表达。然而,是否lncRNAs以类似的方式在癌症中发挥作用,尚不明确。延伸阅读:中美学者JBC解析lncRNA在EMT中的作用。

这篇研究前列腺癌的SCI论文竟有女性样本?

  2019年3月,山东省邹城市人民医院Meng F.M团队在European Review for Medical and Pharmacological Sciences 在线发表题为“Mechanism of LncRNA ROR promoting prostate cancer by re

某医院SCI发文竟然在女性中研究前列腺癌-牵出更多内幕

  2019年3月,山东省邹城市人民医院Meng F.M团队在European Review for Medical and Pharmacological Sciences 在线发表题为“Mechanism of LncRNA ROR promoting prostate cancer by re

【盘点】长链非编码RNA的研究进展

   非编码RNA在生命调控过程中扮演着重要角色,近年来的研究成果常入选CNS年度十大科学突破。人类基因组转录区高达76%,但转录产物中只有不到2%是编码蛋白质的mRNA,其他均为非编码RNA,其中microRNA (miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)等调控

调控免疫的lncRNA

当过度活化或脱靶时,免疫系统中正常对抗感染的一些细胞会转而攻击个体自身的组织。这一过程会推动作为自身免疫性疾病组成部分的炎症。现在,来自纽约大学Langone医学中心的一项新研究揭示出了抑制这些机制的一种新方法,有可能会影响未来的药物设计。相关论文    发布在12月16日的《自然》(Natur

新发现,调节淋巴样细胞发育的RORγ天然配体

  近日,著名国际代谢类杂志cell metabolism刊登了纽约大学医学院研究人员的一项最新研究成果,他们通过实验证实了核激素受体RORγt的天然配体是胆固醇合成过程中的中间产物,并且发现了RORγt配体影响淋巴细胞发育的具体机制。  研究人员指出,核激素受体RORγt缺失小鼠会出现胸腺细胞,淋

Sci Adv:科学家成功鉴别出诱发黑色素瘤的关键分子

  最近,一项发表在国际杂志Science Advances上的研究报告中,来自桑福德Burnham Prebys医学发现研究所的研究人员通过研究解开了一种名为SPRIGHTLY的分子的奥秘,此前该分子被认为能够参与多种癌症的发生,比如结直肠癌、乳腺癌和黑色素瘤等,基于本文研究,研究者发现,SPRI

肿瘤抑制子HIC1通过影响下游lncRNAnumb进而影响葡萄膜黑...

肿瘤抑制子HIC1通过影响下游lncRNA-numb进而影响葡萄膜黑素瘤(UM)激活过程研究背景葡萄膜黑素瘤(UM)是一种最常见的眼内肿瘤,占据了黑色素瘤的5%左右。大约有一半的原发UM患者有发生肝转移的风险,但是目前对于分子层面的精确诊断和治疗还不完善。先前的研究表明,基因组拷贝数变异与UM的转移

肿瘤抑制子HIC1通过影响ncRNAnumb葡萄膜黑素瘤-激活过程

  葡萄膜黑素瘤(UM)是一种最常见的眼内肿瘤,占据了黑色素瘤的5%左右。大约有一半的原发UM患者有发生肝转移的风险,但是目前对于分子层面的精确诊断和治疗还不完善。先前的研究表明,基因组拷贝数变异与UM的转移风险有关。GNAQ,GNA11,BAP1的基因突变也与UM相关。现有研究表明,转录组长链非编

Nature重大发现:让癌症上瘾的lncRNA

  与比利时根特大学的研究人员合作,来自VIB/鲁汶大学的科学家们揭示出了恶性黑色素瘤与非编码RNA基因SAMMSON之间不同寻常的联系。SAMMSON基因特异地表达于人类恶性黑色素瘤中,并且引人注目地是,侵袭性皮肤癌的生长高度依赖于这一基因。研究结果有可能为改进诊断工具及皮肤癌的治疗铺平道路。  

长链非编码RNA:-从科研到临床(一)

概述长链非编码RNA (LncRNA)是一类真核生物中长度大于200 nt的非编码RNA分子;根据其与邻近基因的位置可以分为反义lncRNA、增强子lncRNA、基因间lncRNA、双向lncRNA、和内含子lncRNA;它具有多种作用机制,比如在细胞核中作为分子支架、协助可变剪接、调节染色体结

lncRNA研究策略与技术

研究背景:长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类不编码蛋白的RNA分子,长度在200 bp以上,起初被认为是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能;近期的研究表明lncRNA具有保守的二级结构,可以与蛋白、DNA和RNA相互作用,参与多种生物学过程的调控

lncRNA功能机制研究(二)

实验路线(1)LINC00346调控胃癌发展的上游机制结果:转录因子KLF5和MYC可与LINC00346启动子结合,并增强其表达a. 转录因子MYC、KLF5和 LINC00346的Oncoprint分析;b. 在含有或未含有胃癌KLF5/ MYC / LINC00346 SCNAs的转录因子

lncRNA功能机制研究(一)

文章导读LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA,在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合,并在转录或转录后水平调控基因表达,而且lncRNA也可以作为诱饵,吸附miRNA,调节miRNA调控的靶基因表达。但是,目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱和生物学功能

eLife:lncRNA调控癌症关键基因

  Salk研究所的科学家们发现,一种长非编码RNA(lncRNA)是癌症发展过程中的一个关键基因开关。这项研究于四月二十九日发表在eLife杂志上,为相关癌症的治疗提供了一条新的途径。   研究人员将这种lncRNA命名为PACER(p50-associated COX-2 extragenic

lncRNA的概念及形成过程

 lncRNA,即Long non-coding RNA,你可以把它理解为不表达蛋白的mRNA。它的很多特征与mRNA很类似。比如,它与mRNA一样有启动子、有polyA尾巴、有不同剪接、有动态表达水平。除了不表达蛋白这一点以外,仅从核苷酸水平上来看,可以说它与mRNA并无实质分别。所以对于设计PC

如何快速查找LncRNA序列

  查找LncRNA序列的网站有很多,包括Genebank,Ensembl,RefSeq,UCSC数据库等。今天,小编就给大家讲讲如何通过LncRNA ID号查找LncRNA的序列。    一.根据LncRNA来源数据库,进入相应链接。   1. Genebank:https://www.ncb

如何快速查找LncRNA序列?

查找LncRNA序列的网站有很多,包括Genebank,Ensembl,RefSeq,UCSC数据库等。今天,小编就给大家讲讲如何通过LncRNA ID号查找LncRNA的序列。一.根据LncRNA来源数据库,进入相应链接。 Genebank:https://www.ncbi.nlm.nih.gov

lncRNA表达与RNA的延伸

LncRNA的火热研究已经有几年的时间了,关于lncRNA总归是有说不完的话题。目前对lncRNA的基础分析都已形成了一定的模式。然后,今年来lncRNA的相关文章依然如雨后春笋。  长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RN

lncRNA甲基化如何研究?

lncRNA分子通过海绵机制结合microRNA发挥生物学功能,这个ceRNA机制已经让大家心生厌倦了。可大牛就是大牛,引入甲基化就能轻松的变废为宝,竟然能让lncRNA的ceRNA思路变得瞬间高大上发表10分以上的文章,你一定和小编我一样很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化,作为最新的国自然热点受到

lncRNA助力叶酸研究新成果

LncRNA研究发表的成果五花八门,然而借助于lncRNA芯片,挖掘其中的高通量数据,发表5分影响因子的文章,还是可行的。本研究是以叶酸处理肥胖模型为基础,让我们来看看到底怎么样就可以在《Cellular Physiology and Biochemistry》(IF=5.104)上发表。研究背

Nature重要发现:调控免疫的lncRNA

  当过度活化或脱靶时,免疫系统中正常对抗感染的一些细胞会转而攻击个体自身的组织。这一过 程会推动作为自身免疫性疾病组成部分的炎症。现在,来自纽约大学Langone医学中心的一项新研究揭示出了抑制这些机制的一种新方法,有可能会影响未来 的药物设计。相关论文发布在12月16日的《自然》(Nature)

研究发现Setd2对3型天然淋巴细胞和肠道免疫的调控作用

  Cell Reports在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所邱菊研究组与上海交通大学合作,完成了题为Setd2 determines distinct properties of intestinal ILC3 subsets to regulate intestinal immunity的

新型RORγ抑制剂克服前列腺癌临床耐药性问题

  近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院许永课题组针对前列腺癌临床耐药研发出新型RORγ抑制剂XY101。该研究成果在线发表于药物化学国际期刊Journal of Medicinal Chemistry上。  在全球范围内,前列腺癌(PC)是男性中第二大最常见的癌症类型,仅次于肺癌。据估计,在2

Cell重要发现:调控免疫的lncRNA

  由麻省大学医学院Katherine A. Fitzgerald领导的研究小组证实,一种长链非编码RNA lincRNA-EPS发挥转录刹车作用限制了炎症。这一重要的研究发现发布在6月16日的《细胞》(Cell)杂志上。  细胞类型特异性的调控回路以复杂、动态和短暂调节的方式控制着基因表达。了解这

LncRNA芯片应用于胃癌研究

     研究背景      在全世界分范围内,每年因肝癌死亡的病例超过50万人,是主要的致死恶性肿瘤之一。在过去的十年中,随着影像学的进步以及健康体检的普及,越来越多的肝癌病人在患病早期被发现。但由于肝脏捐赠者的短缺,外科肝脏切除术仍然是治疗早期肝癌病人的最主要方法。目前对于术后患者缺乏准确

LncRNA芯片应用于胃癌研究

上海交通大学附属仁济医院房静远教授主要从事消化系统肿瘤发生的分子机制、早期诊断和分子治疗等相关研究。近期,该课题组应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片分析了胃癌组织的lncRNAs表达情况,筛选到可预测胃癌发生的分子标志物GClnc1,并且阐明了GClnc1在胃癌的发生和发展中是如何发挥

国际知名学者综述:LncRNA分类

  美国St. Laurent Institute的Philipp Kapranov教授,是基因组学与系统生物学领域具有重要国际影响的专家,长期从事系统生物学和基因组功能方面的研究,其发现人类基因组能够产生大量的有功能作用的非编码RNA,在概念层次上重新定义了“基因”,这一发现被Science选为最

新型药物组合或能有效抵御葡萄膜黑色素瘤

  葡萄膜黑色素瘤(uveal melanoma)是一种影响眼睛的恶性黑色素瘤,这是一种非常罕见的疾病,每年在美国大约会有2500人被诊断患有这类黑色素瘤,而且大约有一半的葡萄膜黑色素瘤患者会发生癌症转移,癌细胞会侵袭到机体其它部位,主要是肝脏中;转移性葡萄膜黑色素瘤患者的预后较差,而且平均生存期也