Rloop检测:一种更精确高效的方法
R-loop是一种特殊的染色体结构,由一条RNA:DNA杂合链和一条单链DNA所组成。目前越来越多的证据发现这种独特的染色质结构在原核和真核生物中普遍存在,在很多关键的生物学过程中发挥重要功能,包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等。 R-loop的异常导致多种人类疾病的发生,包括很多神经以及神经退行性疾病【4,5】和癌症的形成【6】。因此,对R-loop的形成以及功能方面的研究有助于于我们对疾病的认识。检测R-loop在基因组中的定位是研究R-loop功能首先要解决的问题。 目前,主要有两种检测R-loop基因组定位的方法。第一种方法依赖于S9.6抗体,S9.6能够识别DNA:RNA杂合双链,这类方法包括DNA:RNA immunoprecipitation (DRIP),以及基于DRIP的改进的方法:bis-DRIP,S1-DRIP和RDIP【7-10】。这类方法应用比较广泛,但实验操作比较剧烈,......阅读全文
R环(Rloop)的结构特点
R环(R-loop),是指当某些基因转录形成mRNA分子难与模版链分离时,会形成RNA-DNA杂交体,这时非模板链与RNA-DNA杂交体共同构成r环结构。
Rloop检测:一种更精确高效的方法
R-loop是一种特殊的染色体结构,由一条RNA:DNA杂合链和一条单链DNA所组成。目前越来越多的证据发现这种独特的染色质结构在原核和真核生物中普遍存在,在很多关键的生物学过程中发挥重要功能,包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等。 R-loop的异常导致多种人类疾病的发
Cell-Reports-|-一种更精确高效检测Rloop的方法
R-loop是生物体在转录过程中形成的特殊的三链核酸结构,转录过程中新合成的RNA链与模板DNA链互补配对,形成的DNA:RNA杂合双链与非模板DNA链一起被称为R-loop【1】。R-loop在生物体内普遍存在,并参与了许多生物学过程,例如转录过程、DNA复制、基因组不稳定性以及染色体重排等【
新技术RChIP特异性识别Rloop并绘制细胞内全基因组图谱。
最新论文研发出了一种新技术R-ChIP,可特异性识别体内形成的R-loop,通过富集和文库的建立与测序,即可绘制细胞内R-loop的全基因组图谱。 当由转录产生的RNA与模板DNA通过碱基互补配对形成杂合链时,另外一条非模板DNA链将处于单链状态,由此形成的三链核酸结构称为R-loop。R-
Nature-Plants文章:精准高通量检测Rloop分布的新方法
来自清华大学生科院,清华-北大生命科学联合中心的研究人员发表了题为“The R-loop is a common chromatin feature of the Arabidopsis genome”的文章,首次报道了精准、高效、高通量检测R-loop的方法,并利用此方法首次揭示模式植物拟南芥
研究揭示RNA甲基化调控Rloop形成及转录终止机制
R-loop是一种由RNA:DNA杂合链和单链DNA组成的特殊核酸结构,在原核和真核生物的基因组中分布广泛且普遍存在。R-loop在很多关键的生物学过程中发挥重要功能,包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等,但其如何被精确调控的机制尚不清楚。m6A修饰作为信使RNA上丰度最高
利用ssDRIPseqRNA揭示甲基化调控Rloop形成及转录终止机制
R-loop是一种由RNA:DNA杂合链和单链DNA组成的特殊核酸结构,在原核和真核生物的基因组中分布广泛且普遍存在。R-loop在很多关键的生物学过程中发挥重要功能,包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等,但其如何被精确调控的机制尚不清楚。m6A修饰作为信使RNA上丰度最高
高分辨光镊仪器助力发现CRISPRCas12a-Rloop复合体形成机制
2020年1月14日,Chemical Communications杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所娄继忠课题组关于CRISPR-Cas12a系统R-loop复合体的分子机制的最新研究成果,题为Direct Observation of the Formation of CRISPR-Ca
分子遗传学词汇R环
中文名称:R环外文名称:R-loop定义:R环(R-loop),是指当某些基因转录形成mRNA分子难与模版链分离时,会形成RNA-DNA杂交体,这时非模板链与RNA-DNA杂交体共同构成r环结构。
细胞化学词汇R环
中文名称:R环外文名称:R-loop定 义:R环(R-loop),是指当某些基因转录形成mRNA分子难与模版链分离时,会形成RNA-DNA杂交体,这时非模板链与RNA-DNA杂交体共同构成r环结构。特 点:R环是间隔基因典型的结构特征。
北京基因组所揭示共转录m6A修饰建立机制及功能
4月2日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)任捷团队和杨运桂团队,在《分子细胞》(Molecular Cell)上在线发表了题为DDX21 mediates co-transcriptional RNA m6A modification to promote transcription
战况激烈,张锋对手获CRISPR新ZL
CRIPSR领域迎来的一个重磅新闻,美国ZL和商标局(USPTO)二月十六日将一项基因编辑ZL授予了CRISPR技术先驱Jennifer A. Doudna的Caribou Biosciences公司。这再次搅浑了原本已经相当复杂的CRISPR知识产权形势。 自CRIPSR系统被开发成研究工具
CRISPR先驱获得新突破:开发更安全的CRISPRCas9基因疗法
人们一直希望用CRISPR-Cas9基因编辑技术治疗甚至治愈复杂的神经疾病。帕金森病、亨廷顿舞蹈病和阿尔茨海默症的现有药物只能缓解症状,无法阻止疾病的发展。“但对于确定了致病基因的疾病来说,基因编辑技术有望永久终止其进程,”加州大学伯克利分校Jennifer Doudna实验室的博士后Brett S
CRISPR先驱发表研究新成果
细菌和古生菌一直在与入侵者做斗争,为此它们演化出了多种防御机制,CRISPR-Cas适应性免疫系统就是其中之一。Cas1-Cas2蛋白复合体会捕获30–40bp的外源DNA,将它们整合到CRISPR的间隔区,形成自己的免疫记忆。如果这种外源DNA再次入侵,细菌就能够及时将其剪切,从而保护自身安全
Realspace-and-realtime-dynamics-of-CRISPRCas9-visualized-by-...(一)
Real-space and real-time dynamics of CRISPR-Cas9 visualized by high-speed atomic force microscopyAbstractThe CRISPR-associated endonuclease Cas9 bind
胚胎发育组织保护干细胞基因组和发育疾病起源机制被揭示
上海交通大学医学院研究员洪登礼团队首次揭示了胚胎发育组织保护其干细胞基因组的机制,并证明该机制与发育疾病(如儿童肿瘤)的发生密切相关,将为进一步研究发育疾病的发病学和预防医学提供重要的理论和实验指导;基于所揭示机制,研发可以预测和预防儿童白血病发生的试剂盒和药品。12月5日,相关研究发表于《自然》杂
拟南芥叶绿体基因组DNA双链断裂修复的全新分子机制
2021年6月16日,清华大学生命学院/清华-北大生命科学联合中心孙前文实验室在Nucleic Acids Research杂志在线发表题为“RNase H1C与单链DNA结合蛋白WHY1/3和重组酶RecA1在拟南芥叶绿体中协作完成DNA损伤修复 (RNaseH1C collaborates
科研人员揭示一种噬菌体抵抗宿主防御的机制
噬菌体是地球上数量最庞大的生物群体,是原核生物的病毒,对维持地球生态系统的有序运行意义重大。在噬菌体和宿主漫长的竞赛中,为抵御噬菌体的入侵,原核生物进化出多种系统进行防御,如限制修饰系统、CRISPR-Cas系统以及近来不断涌现的多种引起流产感染的系统等。其中,CRISPR-Cas系统是已知的唯
生物物理所揭示一种噬菌体抵抗宿主防御的机制
噬菌体是地球上数量最庞大的生物群体,是原核生物的病毒,对维持地球生态系统的有序运行意义重大。在噬菌体和宿主漫长的竞赛中,为抵御噬菌体的入侵,原核生物进化出多种系统进行防御,如限制修饰系统、CRISPR-Cas系统以及近来不断涌现的多种引起流产感染的系统等。其中,CRISPR-Cas系统是已知的唯
中外牛人眼中的生物技术前沿
今年三月Nature Biotechnology就满二十了。该杂志近日推出周年特刊对生物技术领域的发展进行了回顾和展望,还邀请相关领域的五十名杰出研究者,分享他们眼中最激动人心的前沿研究以及最受期待的技术。 秦钧(Jun Qin):蛋白质组学最激动人心的前沿是,从穿刺活检样本鉴定一组蛋白,在3
植物所揭示叶绿体蛋白转运马达新功能
叶绿体是植物进行光合作用的细胞器。正常发育过程受到核基因组和叶绿体基因组在多个层次的协同调控。核质互作的分子机理是叶绿体生物发生的核心科学问题之一。光合膜蛋白复合体的反应中心亚基通常由叶绿体基因编码,而外周蛋白和天线蛋白由核基因组编码。这些核基因组编码的叶绿体蛋白,在细胞质中合成,而后通过叶绿体被膜
研究揭示叶绿体蛋白转运马达新功能
叶绿体是植物进行光合作用的细胞器。正常发育过程受到核基因组和叶绿体基因组在多个层次的协同调控。核质互作的分子机理是叶绿体生物发生的核心科学问题之一。光合膜蛋白复合体的反应中心亚基通常由叶绿体基因编码,而外周蛋白和天线蛋白由核基因组编码。这些核基因组编码的叶绿体蛋白,在细胞质中合成,而后通过叶绿体
Mol-Cell:可爱龙团队开发出高效快速核酸分子诊断工具
CRISPR-Cas 系统是原核生物一种抵御外来入侵核酸的免疫系统,已被广泛用于真核细胞的基因组编辑。目前基于 CRISPR-Cas 的基因编辑技术已广泛应用于遗传育种、新药开发、疾病治疗、动物模型构建、转录调控以及分子诊断等各领域。被誉为在后基因组时代开创了遗传疾病精准治疗的新时代。 CRI
2025蛋白质组学大会之跨物种蛋白质组学研究
2025年10月14日下午,第12届AOHUPO大会、第8届AOAPO大会、π-HuB国际大科学计划第三届全球峰会暨第13届CNHUPO大会“Cross-species Proteomics(跨物种蛋白质组学)”分会场于广州白云国际会议中心国际会堂顺利举行。会议由中国科学院北京基因组研究所 (国
研究发现N6甲基腺苷调节人体细胞RNA:DNA杂交的稳定性
近日,英国诺丁汉大学等科研机构的研究人员在Nature Genetics上发表了题为“N6-methyladenosine regulates the stability of RNA:DNA hybrids in human cells”的文章,发现N6-甲基腺苷可以调节人体细胞RNA:DNA
基因组稳定性驱动的低氧适应研究中取得进展
近期,中国科学院昆明动物研究所研究员赵博团队等在Journal of Experimental & Clinical Cancer Research上发表了题为RETSAT associates with DDX39B to promote fork restarting and resista
PNAS解析CRISPR的DNA基因编辑机制
一个国际科学家小组促使我们朝着更深层次地了解一些酶“编辑“基因的机制迈出了重要一步,从而为纠正患者的遗传疾病铺平了道路。 来自布里斯托大学和立陶宛生物技术研究院的研究人员观察了,一种叫做CRISPR的酶结合和改变DNA结构的过程。 发表在《美国国家科学院院刊》(PNAS)上的这些研究结果,为
汤玮欣/可爱龙团队开发基于IscB的微型基因编辑工具
近年来,刘如谦团队等在CRISPR-Cas系统的基础上,开发了新一代基因编辑系统——碱基编辑(BE)、先导编辑(PE)。其中,碱基编辑能够在基因组靶位点有效地转换单个碱基,而不会引起DNA双链断裂。目前,研究人员已经开发了CBE、ABE、CGBE、AYBE等多种碱基编辑器。 IscB被认为是C
植物着丝粒研究取得进展
基因组测序及解析以及新技术的广泛应用,让人们得以继续探索着丝粒和端粒等染色体上高度重复区域在生命活动中的新功能。植物着丝粒含有丰富的重复序列,如串联重复序列(Satellite)和反转座子(Retrotransposon),参与基因组空间构象和细胞分裂等重要的生物学功能。然而不同物种双着丝粒染色
CRISPR/Cas12a有话说:让基因编辑具有更多可能性
作为一个革命性的基因编辑新工具,自CRISPR技术问世以来,就被广泛应用于各个生物领域的研究中,科学家们亲切的称它为“魔剪”,也正是因为有了这把“魔剪”,科学家们可以随心所欲的操纵基因。 早前,来自美国麻省理工学院的博士后研究员Naama Kanarek及其团队在利用CRISPR/Cas9基因