全血基因组提取操作步骤

操作步骤((200ul全血))* 第一次使用前请先在15ml漂洗液WB中加入60ml无水乙醇! 1. 取200ul新鲜、冷冻或加入各种抗凝剂的血液,放入1.5ml离心管。对如果全血起始量小于200μl,则用缓冲液BB补足到200μl。如果起始量介于200μl-300μl之间,则后续操作需要按照比例增加试剂用量。如果起始量介于300μl-1毫升之间,则需要先进行红细胞裂解操作(见本说明书后附录)。2. 加入200μl 结合液CB,立刻剧烈颠倒轻摇,充分混匀,再加入20μl蛋白酶K (20mg/ml)溶液,颠倒轻摇充分混匀,70℃放置10分钟,溶液应变清亮(但颜色偏黑色)。3. 加入100μl 异丙醇,剧烈颠倒轻摇,充分混匀,此时可能会出现絮状沉淀。上述各操作步骤中适当力度充分混匀非常重要,混匀不充分严重降低产量,必要时如样品粘稠不易混匀时可以涡旋振荡15秒混匀,但不可用手剧烈振荡,以免剪切DNA。4. 将上一步所得溶液和絮状沉淀都......阅读全文

关于癌症全基因组-我们有了全新的认识

  今日,最新一期《自然》杂志如约上线,而登上封面的“癌症全基因组”则是本期的主题:在本期《自然》杂志上,一共发表了6篇相关的论文。而在Nature Genetics、Nature Biotechnology、以及Nature Communications等子刊上,也有系列论文发表。  那么,是什么

震惊!全基因组测序还能这样用在癌症治疗上?

   近年来,随着全基因组测序所需时间和成本的降低,个体化治疗将造福更多的癌症患者。近日发表于《Nature Medicine》的一项研究表明,开发新的机器学习算法对肿瘤全基因组序列信息进行分析,有助于预测患者的预后,帮助患者选择最佳的治疗方案。  全基因组测序(Whole-genome seque

定位全基因组范围DNA修复的新方法

  北卡罗来纳大学的研究人员近日开发出一种全基因组范围的测序分析,可定位DNA切除修复。这种被称为切除修复测序(XR-seq)的方法发表在新一期的《Genes & Development》杂志上。  这项研究的通讯作者是北卡罗来纳大学医学院生物化学及生物物理系的Aziz Sancar以及芝加哥大学人

世界首个梅花全基因组重测序研究完成

  日前,北京林业大学张启翔教授领衔的国家花卉工程技术研究中心,与青岛华大基因研究院、深圳华大生命科学研究院以及宾夕法尼亚州立大学等单位通力合作完成了首个梅花全基因组重测序研究,构建完成了世界首张梅花全基因组变异图谱,“梅花花部性状的遗传结构”(The genetic architecture of

全基因组测序是癌症诊断的强有力工具

  一位没有明显癌症家族史的妇女却罹患了早发性乳腺癌和卵巢癌,以及与治疗有关的急性髓细胞样白血病。研究人员对这名妇女进行了全基因组测序,所用的是从该患者的皮肤和骨髓中获取的DNA。在许多被怀疑患癌症可能性增加了的病人中,常规性的候选基因测试(如BRCA1  和  BRCA2突变检测)无法显示出有用的

全基因组测序解决虎亚种纷争:6亚种体系

  研究人员运用群体基因组学方法描绘了迄今为止最完整的虎演化史,解析了其自然选择和生态适应性的遗传基础,确认了现存虎应划分为孟加拉虎、马来虎等6亚种,由此解决了数十年以来关于虎亚种划分的争议,奠定了世界虎保护单元策略制定的科学基础。  虎的物种形成时间大约在2-3百万年前,群体基因组学分析将现代虎的

益生乳酸菌全基因组序列测定完成

内蒙古农业大学正式公布,益生乳酸菌的全基因组序列测定分析全部完成,这是我国第一个完成的乳酸菌基因全序列测定。 由内蒙古农业大学“乳品生物技术与工程”教育部重点实验室主持进行的益生乳酸菌的全基因组序列测定Lb.casei Zhang科技项目是经过6年分离、筛选,并进行系统研究开发的具有完全自主知识产

近期全基因组测序研究进展一览

【1】Cell:全基因组测序揭示出自闭症新的基因变异doi:10.1016/j.cell.2017.08.047自闭症有遗传的根源,但是大多数病例并不能够通过当前的遗传测试加以解释。如今,在自闭症儿童中发现的基因组模式---细胞内完整的一套遗传指令---揭示这种出这种疾病的一种新的遗传特征。这种特征

关于全基因组测序的研究结果分析介绍

  ① 全基因组测序的研究结果— NCI-H209细胞系基因组中,共检测到22,910个碱基替换、65个插入缺失(Indels)、58个结构变异;在基因组的编码区,除了发现RB1 和TP53基因发生点突变和MLL2基因由于发生了G>T的颠换,从而产生了pre-stop codon外,有94个点突变直

中国科学家PNAS发布辣椒全基因组测序

  辣椒(Capsicum annuum)是一种重要的经济作物,它在满足人们口腹之欲的同时,还是世界上广为使用的药物。辣椒富含维生素和营养,可以用来生产许多药物、天然染色剂和化妆品。   为了更好的理解辣椒属的进化、驯化和特化,四川农业大学玉米研究所、遵义农科院辣椒研究所、华南农业大学园艺学院

中国洞穴鱼类金线鲃全基因组成功解译

  2016年1月4日,BMC Biology 在线发表了该杂志新年开篇的第一篇论文——来自中国的洞穴鱼类金线鲃全基因组研究。该研究主要由中国科学院昆明动物研究所研究员杨君兴团队和深圳华大基因研究院教授石琼团队合作完成。  洞穴生物是地球上最为神秘的生物类群之一,它们长期生活于黑暗无光的洞穴深处,由

《PLoS生物学》:老鼠全基因组测序图公布

  最新一期的开放存取的《公共科学图书馆·生物学》(PLoS Biology)杂志上,美国、英国和瑞典的研究人员公布了老鼠的全基因组测序图。老鼠成为继人类之后第二个完成全基因组测序的哺乳动物。   在对人类和老鼠的基因测序图进行综合性比较后,研究人员发现两者之间的遗传差异要比人们预想的大得多。老鼠

中国诞生全球首张水稻全基因组育种芯片

  中国中化集团公司下属中国种子集团有限公司联合华中农业大学、北京大学近日共同研制出全球首张水稻全基因组育种芯片,将大幅提高种子真实性检测准确性,有助提高育种效率,杜绝假种子危害。     中种公司生命科技中心喻辉辉博士表示,目前业内判断水稻种子真实性通常采用国标推荐的24个SSR标记检测结果,

张强峰博士Nature解析全基因组蛋白互作

  来自美国哥伦比亚大学,同济大学等处的研究人员发表了题为“Structure-based prediction of proteinCprotein interactions on a genome-wide scale”的文章,提出了一种基于三维结构信息的全基因组蛋白质相互作用计算预测方

全基因组测序可作为一线诊断工具

近日,一项涉及54个国家1000个家庭的研究表明,全基因组测序对未确诊疾病的诊断率比经典遗传诊断方法还高。科学家们呼吁将全基因组测序作为未确诊疾病的一线诊断工具,以给患者带来更好的医疗护理。相关结果以《Clinical exome sequencing: results from 2819 sa

Illumina推出Nextera-DNA-Flex全基因组测序制备产品

  近日,Illumina宣布推出一款全新的全基因组测序(WGS)文库制备产品——Nextera DNA Flex,它让全血和唾液样本省去了样本制备,也让文库制备流程跳过了一些繁琐步骤,比如DNA的机械片段化、定量和归一化。Nextera DNA Flex提供了一个快速、整合的流程,适合广泛的应用,

基因是否表达,做个cfDNA全基因组测序就可揭晓

  8月29日,《Nature Genetics》杂志上的研究表明,血循环游离DNA(cfDNA)可提供线索来预测基因的表达。  全基因组测序就能知道基因是否表达  基因表达(gene expression)是指细胞在生命过程中,把储存在DNA顺序中的遗传信息经过转录和翻译,最后转变成具有生物活性的

美国首次公布全外显子测序参保标准-但对全基因组测序拒保

  日前,美国保险公司Cigna公布了一项关于基因测序的新参保政策,该政策强调全外显子测序(WES)和全基因组测序(WGS)的参保条件等问题。该政策由美国保险公司Cigna与InformedDNA公司的遗传学专家共同制定,是美国国家健康体系首次发布全外显子测序的参保标准。  全外显子测序参保标准  

PNAS:外显子变异检测——全基因组测序比全外显子测序更强大

  目前,全外显子测序和全基因组测序技术在遗传分析和发现导致疾病发生的潜在基因突变方面应用越来越广泛,随着测序技术的不断迭代更新,越来越成熟,昂贵的价格会逐渐降低,那么在排除价格因素之后,全外显子测序和全基因组测序在检测外显子突变方面究竟谁更加强大呢?来自美国的科学家对这一问题进行了相关研究,其研究

版纳园等自主开发出叶绿体全基因组分析比较基因组程序包

  高通量测序(High-throughput sequencing),又称“下一代”测序(Next-generation sequencing),是近年来在测序技术发展史中具有革命性改变的新突破,能一次并行对几十万到几百万条DNA分子同时测序,因此能对物种的转录组和基因组进行比以往较细致全貌的

花生基因组宣称花生二倍体野生种全基因组测序完成

  国际花生基因组计划4月2日在美国弗吉尼亚州亚历山大市宣布,包括中方合作单位在内的多国科研人员已经成功完成花生基因组测序,将为选育更高产、适应性更广的花生品种提供帮助。   国际花生基因组计划宣称,花生全基因组测序取得的重大进展,分别代表花生属A基因组和B基因组的两个二倍体野生种的全基因组测序已

核酸提取仪应用领域

几乎在每个实验室,与生物分子相关的分离纯化工作都是十分重要,且必不可少的。但要对多个样品进行纯化还是相当困难的,不仅需要选择合适的纯化技术,而且工作量也特别大,很难满足当前飞速发展对高通量样品进行提取纯化的需求。磁珠自动核酸提取纯化系统是使用磁珠法技术,可广泛应用于基因组学、疾控医疗、食品安全、法医

全蛋白提取试剂盒的优势及使用注意要点

 全蛋白提取试剂盒可用于从哺乳动物组织和细胞中提取全蛋白,用含有蛋白酶抑制剂的裂解缓冲液匀浆裂解组织或细胞,提取过程简便高效。获得的全蛋白可用于Western Blot、IP等后续研究,但不能用于蛋白激酶及磷酸酶免疫共沉淀的研究。  全蛋白提取试剂盒具有哪些优势?  1.提取的蛋白质包括膜、核、核基

植物基因组DNA-快速提取(50-次)说明书

植物基因组DNA 快速提取(50 次)概述:本方法可用于植物细胞DNA 的快速提取,可提取107 细胞,其质量能够满足各种分子生物学要求。组成:1.溶液A 1.2ml RNase A 10mg/ml。-20℃保存2.溶液B 60ml3.溶液C 180ml4.溶液D 3ml Resin 用时充分混匀5

基因组DNA提取常见问题及解决方案

基因组DNA提取常见问题及解决方案

植物基因组DNA提取、酶切及电泳分析

实验概要掌握植物基因组DNA提取的一般方法及注意事项。大分子量DNA分子的酶切分析。实验原理十六烷基三乙基溴化胺(CTAB)是一种去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中(0.7mol/L  NaCl)是可溶的,当降低溶液盐浓度到一定程度(0.3 mol/L  NaCl)时,从溶液中

土壤基因组DNA提取试剂盒使用说明

本试剂盒提供了从各种来源的土壤中快速简便的提取基因组DNA的方法。土壤样品中存在大量的抑制因子如腐殖酸、金属离子等,这些物质即使微量存在于纯化后的DNA中也会对下游反应,如对PCR、限制性酶切等产生影响。因而纯化土壤DNA的关键在于如何有效的去除土壤中的抑制因子。采用本公司特有的DNA-only硅胶

植物基因组DNA提取、酶切及电泳分析

一、目的  掌握植物基因组DNA提取的一般方法及注意事项。大分子量DNA分子的酶切分析。  二、原理  十六烷基三乙基溴化胺是一种去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中(0.7mol/L NaCl)是可溶的,当降低溶液盐浓度到一定程度(0.3  mol/L

提取的基因组DNA有RNA-污染如何解决?

得到的基因组在进行常规下游实验如,PCR、酶切、分子杂交等生物学实验时如不能顺利进行,主要因为DNA 样品不纯,含有蛋白、有机溶剂和盐类等杂质影响内切酶或DNA 聚合酶的活性。 1)实验过程中没有有效使用RNase A,应严格按照实验要求进行。 2)RNase A失活: RNase A应

水体基因组DNA提取试剂盒使用说明

本试剂盒提供了从各种来源的水体样品中快速简便的提取基因组DNA的方法。水体样品中存在大量微生物,这些微生物被作为重要的生态指示剂被广泛应用。从水体中提取高纯度的基因组DNA是水体环境值检测非常重要的手段。水体样品中含有大量的抑制因子如腐殖酸、金属离子等,这些物质即使微量存在于纯化后的DNA中也会对下