DNA双链断裂检测——变压场凝胶电泳(GFGE)
DNA双链断裂与细胞死亡的关系更为密切。变压场凝胶电泳是采用将细胞包埋在低熔点琼脂糖凝胶中,通过蛋白酶、去污剂等渗入凝胶中融解细胞、去蛋白,纯化细胞DNA,再通过梯增电压进行琼脂糖凝胶电泳,结合DNA解旋荧光测定(FADU)法和检测DNA双链断裂。 1、主要试剂及配制方法: (1)蛋白酶K,SDS,低熔点琼脂糖。 (2)配制方法: 细胞缓冲液(A液)。0.25mol/L NaCl + 10mmol Na2HPO4 + 1mmol/L MgCl2,pH7.2. 细胞裂解液(B液)。9mol/L脲 + 10mmol/L NaOH + 2.5mmol/L环烷二胺四乙酸 + 0.1%SDS。 碱性变性液I(C液)。B液 + 0.2mol/NaOH,体积比为45:55. 碱性变性液I(D液)。B液 + 0.2mol/NaOH,体积比为40:60. 抗变性液(F液)。1ug/L溴化乙锭 + 13.3mmol/......阅读全文
同济大学毛志勇教授发表Cell-Death--Differentiation文章
基因组稳定性下降是生物体衰老发生极其重要的一个标志。细胞长期在各种因素的影响下,DNA遭受着多种损伤,若这些损伤不被及时准确地修复将诱发基因组稳定性的下降,进而影响细胞的正常生命活动。这些损伤中,DNA双链断裂(DSBs)是最为严重的基因组损伤之一。近年来,虽然关于DNA DSBs修复与衰老发
DNA损伤的改变类型介绍
点突变(point mutation)指DNA上单一碱基的变异。嘌呤替代嘌呤(A与G之间的相互替代)、嘧啶替代嘧啶(C与T之间的替代)称为转换(transition);嘌呤变嘧啶或嘧啶变嘌呤则称为颠换(transvertion)。缺失(deletion)指DNA链上一个或一段核苷酸的消失。插入(in
DNA损伤的改变类型
点突变(point mutation)指DNA上单一碱基的变异。嘌呤替代嘌呤(A与G之间的相互替代)、嘧啶替代嘧啶(C与T之间的替代)称为转换(transition);嘌呤变嘧啶或嘧啶变嘌呤则称为颠换(transvertion)。缺失(deletion)指DNA链上一个或一段核苷酸的消失。插入(in
研究揭示植物调控同源重组修复的新机制
近日,华中农业大学生命科学技术学院教授严顺平团队在国际学术期刊PNAS在线发表成果。该研究不仅揭示了植物调控同源重组修复的新机制,也为利用同源重组修复机制提高植物基因打靶效率提供了新思路。同时,该研究还首次揭示了植物调控SOG1蛋白稳定性的机制,具有重要的科学意义。所有生物都需要把正确的遗传信息(D
新研究揭示儿童早衰症患者心脏病变机制
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512892.shtm11月16日,同济大学生命科学与技术学院、附属第一妇婴保健院教授毛志勇团队和同济大学生命科学与技术学院、附属东方医院教授魏珂团队在美国《国家科学院院刊》发表论文,揭示了早衰小鼠心肌中
关于DNA损伤的基本介绍
DNA损伤是复制过程中发生的DNA核苷酸序列永久性改变,并导致遗传特征改变的现象。情况分为:substitutation (替换)deletion (删除)insertion (插入)exon skipping (外显子跳跃) 1、点突变(point mutation) 指DNA上单一碱基的
潘学文博士Nature解析DNA修复
生物通报道:来自贝勒医学院的研究人员指出了一种核小体重构因子:Fun30在DNA双链端粒末端切除过程中扮演的重要角色,为进一步解析DNA双链断裂修复过程提供了新思路,相关成果公布在Nature杂志上。 文章的通讯作者之一是华裔科学家潘学文博士(Xuewen Pan,生物通音译),其早年
单细胞凝胶电泳的-的操作方法
SCGE操作方法被认为是经典的操作方法。其主要步骤有:将混有待测细胞的琼脂糖铺于载玻片上,凝固后浸入冷溶解液中使细胞裂解,在电泳液中解链后水平电泳,洗涤后用DNA 结合荧光染料染色,在荧光显微镜下观察玻片上细胞的荧光图像,评价DNA 的损伤程度。改变相关的实验条件,可以检测DNA 不同类型的损伤,这
LIG4基因突变与药物因子介绍
该基因编码的蛋白质是一种DNA连接酶,在ATP依赖的反应中连接双链聚脱氧核苷酸中的单链断裂该蛋白是v(d)j重组和dna双链断裂(dsb)修复的关键。该蛋白与X射线修复交叉互补蛋白4(XRCC4)形成复合物,并进一步与DNA依赖性蛋白激酶(DNA-PK)相互作用已知NHEJ需要XRCC4和DNA-P
LIG4基因编码功能及结构描述
该基因编码的蛋白质是一种DNA连接酶,在ATP依赖的反应中连接双链聚脱氧核苷酸中的单链断裂该蛋白是v(d)j重组和dna双链断裂(dsb)修复的关键。该蛋白与X射线修复交叉互补蛋白4(XRCC4)形成复合物,并进一步与DNA依赖性蛋白激酶(DNA-PK)相互作用已知NHEJ需要XRCC4和DNA-P
抗双链dna抗体正常值是多少
健康人血清1∶10稀释为阴性(绿蝇短膜虫法). 健康人结合率≤20%(放射免疫分析法Farr试验). 一般以待测血清A值/阴性对照A值(P/N)≥2.1为阳性,正常人P/N值
抗双链dna抗体正常值是多少
健康人血清1∶10稀释为阴性(绿蝇短膜虫法). 健康人结合率≤20%(放射免疫分析法Farr试验). 一般以待测血清A值/阴性对照A值(P/N)≥2.1为阳性,正常人P/N值
随机引物合成法双链DNA探针标记法
随机引物合成双链探针是使寡核苷酸引物与DNA模板结合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探针。合成产物的大小、产量、比活性依赖于反应中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,产物平均长度为400-600个核苷酸。利用随机引物进行反应的优点是:(1)Klenow片段没有5'→3'外切酶活
免疫学实验抗双链DNA抗体介绍
抗双链DNA抗体介绍: 抗双链DNA抗体(抗ds DNA)是抗DNA抗体中的一种。其反应位点位于DNA脱氧核糖磷酸框架上。抗ds DNA主要出现于SLE患者的血清中,对SLE患者的组织器官损伤有致病作用。在SLE患者血循环中,大分子的DNA浓度显著高于正常人,DNA还可与多种器官的微血管结构包
DNA复制时双链是如何解开的
DNA复制是双链解开过程:1.拓扑异构酶通过对链进行切割改变DNA双链拓扑结构,使得DNA双链易于解链;2.解链酶作用于氢键使得DNA分为两条单链;3.单链结合蛋白(SSB)结合单链使模板处于单链状态并保护单链的完整.这三点和引物酶合成引物之后,才开始进行DNA复制过程(这时用到DNA聚合酶).
概述抗双链DNA抗体的临床意义
抗双链DNA抗体是系统性红斑狼疮的特异性抗体(60%~90%),活动性标志。抗dsDNA抗体与SLE的关系密切,且随疾病的活动度而升降,病情好转者其滴度多下降甚或转阴。 因为抗ds-DNA抗体检测方法的特异性都不是100%的,所以对抗ds-DNA抗体的检测结果应结合临床分析,必要时应动态观察。
科学家以RNA为模板首次在植物中实现同源重组修复
日前,中国农业科学院研究人员与美国加州大学圣地亚哥分校合作,使用RNA作为同源重组修复的模板,并分别利用核酶自切割和具有RNA/DNA双重切割能力的基因编辑系统,获得后代无转基因成分的抗ALS抑制剂类除草剂水稻植株。该研究在植物中首次利用RNA作为同源重组修复模板,开辟了利用植物RNA作为同源供
中科院Cell-Res揭示DNA修复新机制
来自中科院北京基因组研究所、清华大学的研究人员证实,Ago2通过同源重组促进了Rad51招募以及DNA双链断裂修复。这一研究发现发表在3月25日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。 中科院北京基因组研究所的杨运桂 (Yun-Gui Yang)研究员和清华大学的戚益军(Y
我国出口冷冻鱿鱼因温控不良—冷链断裂被通报
据欧盟食品饲料类快速预警系统(RASFF)消息,2019年5月27日,西班牙通过RASFF通报我国出口冷冻鱿鱼不合格。 具体通报信息如下:通报时间通报国通报产品编号通报原因销售状态/采取措施 通报类型2019-5-27西班牙冷冻鱿鱼2019.1937温控不良—冷链断裂产品未在市场销售/未被授权
抗双链DNA抗体(aniDNA)的注意事项及检查过程
注意事项 检查时要求:一般认为抗双链DNA的效价与病情相平行,即病情活动时,抗DNA抗体效价升高,病情缓解时,效价降低。由于各地测定的方法不同,所以正常值也不同,一般来说,结合率要大于20%以上才有临床意义。 检测技术的特异性都不是100%的。例如,绿蝇短膜虫动基体中虽不含ssDNA,但可能
大肠杆菌-DNA--I-Klenow-片段及单链-DNA-模板进行双脱氧实验
试剂、试剂盒 dATP 去离子蒸馏水 EDTA 延伸 终止混合液 和示踪混合液 甲酰胺上样缓冲液 Tris-Cl
抗双链DNA抗体(aniDNA)的临床意义及注意事项
临床意义 阳性或增高: 可能为系统性红斑狼疮,还可见于其他结缔组织病、慢性活动性肝炎等。 结果阳性可能疾病: 系统性红斑狼疮 、 系统性红斑狼疮性关节炎 、 系统性红斑狼疮所致脊髓病。 注意事项 检查时要求:一般认为抗双链DNA的效价与病情相平行,即病情活动时,抗DNA抗体效价升高,
抗双链DNA抗体(aniDNA)的临床意义及注意事项
临床意义 阳性或增高: 可能为系统性红斑狼疮,还可见于其他结缔组织病、慢性活动性肝炎等。 结果阳性可能疾病: 系统性红斑狼疮 、 系统性红斑狼疮性关节炎 、 系统性红斑狼疮所致脊髓病。 注意事项 检查时要求:一般认为抗双链DNA的效价与病情相平行,即病情活动时,抗DNA抗体效价升高,
抗双链DNA抗体(aniDNA)的正常值及临床意义
正常值 Farr法结合活性小于或等于20%。 间接免疫荧光法阴性。 斑点免疫结合试验小于1:40(阴性)。 (注具体参考值请根据各实验室而定。) 临床意义 阳性或增高: 可能为系统性红斑狼疮,还可见于其他结缔组织病、慢性活动性肝炎等。 结果阳性可能疾病: 系统性红斑狼疮 、 系
核糖体蛋白RPL6以PARP依赖的方式参与DNA损伤修复的调控
研究发现核糖体蛋白RPL6在核糖体作为翻译机器以外的新功能,证明它依赖于ADP核糖基化聚合酶PARP,通过与组蛋白H2A相互作用来调控DNA损伤应答(DDR)的分子机制。 北京大学郑晓峰研究组近日在学术期刊Journal of Biological Chemistry (2019,294(8)
RAD54L基因的结构特点和生理作用
该基因编码的蛋白质属于类死亡螺旋酶超家族,与酿酒酵母rad54相似,后者参与dna的同源重组和修复。该蛋白在dna双链断裂的同源重组修复中起着重要作用。这种蛋白质与双链dna的结合引起dna拓扑结构的改变,这被认为有助于同源dna的切割,并刺激dna重组。选择性剪接导致编码相同蛋白质的多个转录变体。
电离辐射引起核内染色质结构调控的新证据
染色质是真核生命遗传物质DNA在细胞核内的存在形式,染色质根据细胞的活动状态和响应过程,如DNA复制、基因转录、DNA损伤响应和修复等,进行结构调节.染色质结构受电离辐射发生双链断裂(DSB)后的解聚现象已有报道,但是学界缺乏关于核内原位的染色质结构改变的证据支持,DNA发生双链断裂后,损伤响应
MUS81基因编码功能及结构描述
该基因编码一种结构特异性核酸内切酶,属于xpf/mus81核酸内切酶家族,在dna链间交联、复制叉折叠和dna双链断裂后修复过程中对重组中间产物的分解起着关键作用。编码的蛋白质与两个密切相关的必需的减数分裂内切酶蛋白(eme1或eme2)中的一个结合,形成一个处理dna二级结构的复合物。它包含一个N
MUS81基因突变与药物因子介绍
该基因编码一种结构特异性核酸内切酶,属于xpf/mus81核酸内切酶家族,在dna链间交联、复制叉折叠和dna双链断裂后修复过程中对重组中间产物的分解起着关键作用。编码的蛋白质与两个密切相关的必需的减数分裂内切酶蛋白(eme1或eme2)中的一个结合,形成一个处理dna二级结构的复合物。它包含一个N
APOBEC3介导的DNA修复在CRISPR/Cas9基因编辑中突变新机制
中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所杨力研究组与上海科技大学陈佳研究组、南京医科大学沈彬研究组合作研究揭示了胞嘧啶脱氨酶(APOBEC)在CRISPR/Cas9引发的DNA断裂修复过程中产生突变的新机制,为进一步提高基因组编辑保真度提供了新思路。