Nature里程碑研究:新型非编码反义RNA

在研究帕金森氏病的过程中,一个国际研究小组获得了一个可以提高工业蛋白质合成用于治疗用途的新发现。他们设法了解了非蛋白质编码RNA的一个新功能:借助这类称作“反义”的非编码RNA的活性可以提高编码基因的蛋白质合成活性。相关成果发表在10月14日的《自然》(Nature)杂志上。 为了合成蛋白质,DNA需要RNA分子充当遗传信息的短“短转录本”。所有这些RNA分子集合就称作“转录组”。在人类转录组中,有大约2.5万个编码RNA序列(例如参与合成过程的序列),还存在更大数量的非编码RNA序列。这些RNAs中有一些被称作“反义”是因为它们与称作“正义”的编码 RNA序列互补(一条正义和一条反义RNA配对可被看作一根拉链)。 日本横滨RIKEN Omics科学中心曾发现许多蛋白质编码基因具有相应的反义RNAs。发表在Nature杂志上的这项由意大利国际高等研究院. (SISSA)研究小组负责的新研究现在发现一种特异......阅读全文

非编码小RNA的结构和功能

中文名称非编码小RNA英文名称small non-messenger RNA;snmRNA定  义细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科生物化学与分子生

长链非编码-RNA(lncRNA)研究策略

长链非编码 RNA(long noncoding RNA,lncRNA)指的是转录本长度在 200-100000 nt 之间的 RNA 分子,它们不编码蛋白,位于细胞核或胞质内,具有保守的二级结构。研究显示,lncRNA 并非以前所认识的那样没有功能,它可与蛋白质、DNA 和 RNA 相互作

非编码小RNA的基本信息

中文名称非编码小RNA英文名称small non-messenger RNA;snmRNA定  义细胞中一大类由几十核苷酸到几百核苷酸组成的、不编码蛋白质的RNA。本身或与蛋白质结合形成的复合体有生物学功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干扰小RNA、时序小RNA等。应用学科生物化学与分子生

长链非编码-RNA-测序案例分析

背景:人类寿命的延长伴随着神经退行性疾病的发病几率的增加,因而价格不贵的血液诊断的发展迫在眉睫。通过 RNA-seq 分析血液细胞的转录本是发现新的生物标志物的非常高效的途径。 目的:利用 Illumina 测序平台对帕金森病人白血球中 lncRNAs 进行分析,探讨其对 mRNA 选择性剪接的

非编码RNA为癌症研究提供新思路

  澳大利亚纽卡斯尔大学和中国科技大学等机构合作完成的两项最新研究表明,非编码RNA(核糖核酸)在癌症治疗方面存在巨大潜力,有助于开发出新型的癌症靶向治疗方法。  非编码RNA是指不编码蛋白质的RNA。长期以来,全球各地开展的癌症研究主要针对能编码蛋白质的基因,这些基因只占人类基因组的2%。  发表

深入研究非编码RNA的新工具

  最近,加拿大多伦多大学Donnelly中心的一个研究小组,开发出了一种方法,可使科学家们能够深入探索“ncRNAs在人类细胞内做了什么”。  这项研究发表在5月19日的《Molecular Cell》杂志,同一天,来自新加坡基因组研究所的Yue Wan研究组与斯坦福大学的Howard Chang

出人意料的非编码RNA调控

  为了将六英尺多的DNA塞进细胞核里,细胞将基因组紧紧缠绕在组蛋白核心上形成核小体,并最终将其包装成紧密的染色质。DNA转录的时候需要打开核小体,而胚胎干细胞的染色质重塑复合体esBAF可以做到这一点。它不仅会打开需要转录的DNA,还暴露了促进转录的启动子和增强子。  基因组测序研究最近显示,增强

如何揭开长非编码RNA的神秘面纱

  长非编码RNA(lncRNA)长达两百个核苷酸以上的转录本,但并不编码任何蛋白质。尽管如此,长非编码RNA在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,说明lncRNA的调控具有重要的生物学意义。细胞中绝大多数lncRNA(也称lincRNA)位于细胞核,它们对应的DNA区域有的与蛋白编码基因重叠,

长链非编码RNA:-从科研到临床

   长链非编码RNA (LncRNA)是一类真核生物中长度大于200 nt的非编码RNA分子;根据其与邻近基因的位置可以分为反义lncRNA、增强子lncRNA、基因间lncRNA、双向lncRNA、和内含子lncRNA;它具有多种作用机制,比如在细胞核中作为分子支架、协助可变剪接、调节染色体结构

长期被误解-非编码RNA存在“认知黑洞”

  在人类基因组中95%的基因并不编码蛋白质,其他物种也有大量的非编码基因。这些DNA不会被编码成蛋白质,却又会转录出非编码RNA,它们对生命活动起什么作用?是进化的冗余还是神秘的缓存?   《细胞》杂志近日刊登中国工程院院士曹雪涛团队的研究论文,他们发现一种全新非编码RNA分子。该分子能够调控免疫

智力障碍相关非编码基因突变发现

科技日报北京6月6日电 (记者张梦然)新一期《自然·医学》发表的一项大规模遗传学研究结果显示,相比目前已知的其他任何非性别相关基因,RNU4-2基因的罕见突变,可能是更多临床诊断智力障碍病例的一个促进因素。新发现有望促进对特定神经发育疾病的诊断和治疗。智力障碍是一种神经发育疾病,其特征为智力功能以及

Cell封面故事:抗癌向着非编码RNA开炮

  一种常见儿童血癌中对触动及推动肿瘤生长和进展的因子开展大型遗传分析,来自纽约大学Langone医学中心的研究人员报告称,他们鉴别出了一个可能的、治疗这种疾病的新药物靶点。  T细胞急性淋巴母细胞性白血病(T-cell acute lymphoblastic leukemia)是一种最常见且具有侵

单革:非编码RNA的探索者

  日前,国际知名杂志《自然·结构和分子生物学》刊发了中国科学技术大学单革教授的一篇文章,他的实验室发现了一类新型环状非编码RNA,并揭示了其功能和功能机理,相关成果得到了新华社、中科院官网等媒体关注。  记者了解到,在2012年9月,《自然·通讯》也在线发表了单革的研究成果,那次他发现了曾被认为是

非编码RNA的功能引发国际研究热潮

  由1962年诺贝尔生理学或医学奖获得者英国科学家克里克和美国科学家沃森提出的分子生物学中心法则认为,遗传信息是从DNA(脱氧核糖核酸)传递给mRNA(信使核糖核酸),再从mRNA传递给功能蛋白质,由此来完成遗传信息的转录和翻译过程的。   根据这一中心法则,mRNA似乎只有唯一的

Science首次证实全新基因的非编码来源

  在过去的几年里,科学家们已逐渐认识到基因组中本来是非编码的区域,确实有可能形成新基因。事实上,相关物种基因组的比较也甚至指出,这种从头形成基因的方式也许是一种普遍模式。   来自加州大学戴维斯分校的研究人员近期发现了在6种果蝇株系中全部或部分表达的142个转录子,对应于果蝇参考基因组(refe

中国科大发现新型非编码RNA

  最近,中国科学技术大学单革教授实验室在国际知名杂志《自然-结构和分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)发表研究性论文,报导了其实验室发现的一类新型非编码RNA以及此类非编码RNA的功能和功能机理。  非编码RNA是一大类不编码蛋白质而在细胞中起

长期被误解-非编码RNA存在“认知黑洞”

在人类基因组中95%的基因并不编码蛋白质,其他物种也有大量的非编码基因。这些DNA不会被编码成蛋白质,却又会转录出非编码RNA,它们对生命活动起什么作用?是进化的冗余还是神秘的缓存? 《细胞》杂志近日刊登中国工程院院士曹雪涛团队的研究论文,他们发现一种全新非编码RNA分子。该分子能够调控免

带你走进神秘的长链非编码RNA

长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子,它们并不编码蛋白,而是以RNA的形式在多种层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达水平。lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”,是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能。然而,近年来的研究

长链非编码RNA与淋巴瘤

  类基因组中仅有1.5%~2.0%编码蛋白的基因得以稳定转录,而剩余的绝大多数RNA无编码蛋白的功能。长链非编码RNA(lncRNA)是一类异质性的非编码RNA,根据lncRNA的功能,可将其分为信号分子、诱饵分子、引导分子和骨架分子4类。人们以往仅将这些不具编码功能的RNA视为进化过程中产生的废

可以促进癌细胞生长的非编码RNA

国际著名学术期刊《美国国家科学院院刊》发表西奈山伊坎医学院教授Benjamin Greenbaum的一篇研究文章。研究人员在癌细胞中发现了一组可以激发免疫反应的非编码RNA分子,它们具有与病原体相似的一些特征。由于这些分子在癌细胞中表达并扩增,它们造成的免疫反应有可能影响癌细胞的生长。 研究

非结核分枝杆菌的基因组中可能含有哪些与糖代谢途径相关的酶编码基因?

  糖酵解途径相关酶编码基因:NTM的基因组中可能含有许多糖酵解途径相关酶编码基因,如葡萄糖激酶(GK)、磷酸果糖激酶(PFK)、丙酮酸激酶(PK)等。这些酶催化葡萄糖或其他糖类物质的初步分解,生成丙酮酸等中间产物。  糖异生途径相关酶编码基因:NTM的基因组中可能含有许多糖异生途径相关酶编码基因,

蛋白质的非变性-PAGE-实验

实验材料蛋白溶液或块状细胞蛋白试剂、试剂盒丙烯酰胺过硫酸铵电泳缓冲液5X样品缓冲液分离胶缓冲液浓缩胶缓冲液仪器、耗材微量注射器移液器吸头或凝胶上样吸头实验步骤1.安装凝胶灌制模具、灌制凝胶、开始电泳,以及对凝胶进行的操作、保存、染色等步骤均与方案 1 中所述一致。2.若要通过检测生物学活性来确定蛋白

Science:宏基因组研究挑战DNA编码规则

  人们一直认为DNA编码的指令是所有生命通用的,例外情况极少。但本期Science杂志上的一项新研究显示,自然界中的生物又一次打破了既定的规则。  美国能源部联合基因组研究所的Edward Rubin领导研究团队,获得来自1776种环境(包括17个人体区域)的微生物宏基因组数据,以便在其中寻找重编

基因组重编码生物体“赭石”诞生

美国耶鲁大学合成生物学家创建了一种新型基因组重新编码生物体(GRO),并命名为“赭石”(Ochre),实现了对生物体遗传密码的重写。这一成果发表在最新一期《自然》杂志上,不仅促进了人类对遗传密码可塑性的理解,也为未来合成生物学的应用提供了更多可能。在这项研究中,科学家成功将DNA或RNA中的冗余密码

北京生科院发表环形非编码RNA识别新技术

   2月28日,国际学术期刊Briefings in Bioinformatics 发表了中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队题为Circular RNA identification based on multiple seed matching 的最新研究成果。因为目前在环形RNA识别方面存

JCI:促发儿童骨肿瘤的非编码RNA

  尤文氏肉瘤是骨或其周围软组织癌症,主要影响儿童和年轻成人。尤文氏肉瘤的特点是易位事件的发生,即RNA结合蛋白——EWS与转录因子如FLI1的融合。  以前的研究工作表明,该融合蛋白EWS-FLI1通过改变基因表达,促进癌症,但融合蛋白作用的靶基因是未知的。  发表在Journal of Clin

Nature:像海绵一样的非编码RNA

  一种称为RsmZ的小分子RNA具有特殊的功能:屏蔽细菌中抑制翻译的蛋白的作用,最新一项研究揭示了这种RNA如何能完成其功能的分子机制,指出RsmZ像海绵一样能吸收多种阻遏蛋白(repressor proteins)。  小 RNA(small RNAs 或 sRNAs)是一类长度为40-400个

Cell:长期被误解-非编码RNA存在“认知黑洞”

   在人类基因组中95%的基因并不编码蛋白质,其他物种也有大量的非编码基因。这些DNA不会被编码成蛋白质,却又会转录出非编码RNA,它们对生命活动起什么作用?是进化的冗余还是神秘的缓存?  《细胞》杂志近日刊登中国工程院院士曹雪涛团队的研究论文,他们发现一种全新非编码RNA分子。该分子能够调控免疫

非编码RNA-Nfi调控水稻固氮酶活性

   近日,生物所微生物功能基因组创新团队林敏课题组在水稻根际联合固氮施氏假单胞菌中发现新型非编码RNA参与协同调控固氮酶活性,为进一步揭示生物固氮网络调控机制奠定了重要理论基础。该成果发表在最新一期的经典微生物学杂志《应用环境微生物学(Applied and Environmental Micro

我国学者发现新型非编码核糖核酸

  中国科学技术大学单革教授实验室近期发现了一种新型的环状非编码核糖核酸(RNA),为进一步揭示人类生命原理,以及未来解释并防治一些重大疾病提供参考。该研究成果日前发表在国际知名杂志《自然-结构和分子生物学》上。   核糖核酸(RNA)是存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体,而非编码R