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杨辉团队完成特异性更高、安全性更好的高保真版Cas13系统

CRISPR-Cas13是一类由RNA介导的靶向RNA的基因编辑技术。Cas13蛋白属于2类VI型多结构域单一蛋白RNA内切酶。体外研究表明Cas13蛋白激活后具有切割靶RNA的功能,并能对其周围的任意RNA(bystander RNA)进行非特异性地切割,这一特性用于开发RNA检测。2015年报道Cas13a(c2c2)以来,国内外报道了一批CRISPR-Cas13系统(Cas13b/c/d/X/Y/bt),并证明了其可以在哺乳动物细胞中对靶RNA进行高效且特异性地敲低。相较于Cas9介导的DNA编辑技术,基于Cas13的RNA编辑工具靶向动态转录的RNA,不会对基因组造成永久性改变,且可以通过剂量调整等方式控制RNA编辑效果,具有可逆性,相对来说更安全。 然而,越来越多的证据表明,Cas13a、Cas13b、Cas13d等在哺乳动物细胞中普遍存在旁切活性(collateral activity),会造成严重的脱靶效应。......阅读全文

CRISPR的新前沿:编辑RNA

  基因编辑工具CRISPR令科学家们修改DNA的能力发生了革命性的变化,如今,该工具的一种新的版本能对RNA进行靶向修改。编辑RNA而不是DNA有若干优点,例如,它能减轻与DNA相关的在伦理方面的顾虑,它能为科学家在活体生物中提供更为精确的编辑时间框架(如在关键性的发育期中)。在这里,David

基于CRISPR的新冠病毒快速诊断技术

英国《自然·生物技术》杂志16日公开的一项生物医学研究,美国科学家报告了一种基于CRISPR的诊断工具可以快速检测出新冠病毒。这一诊断工具大概需要45分钟就能给出结果,准确性与传统的RT-PCR检测相当。 之前的疾病大流行告诉人们,快速且易获取的检测方法对于实现有效的公共卫生响应很重要。然而,目

Science:重大进展!揭示功能多样化的V型CRISPR-Cas系统

  古生菌和细菌的CRISPR/Cas系统保护它们的宿主免受噬菌体和其他的可移动遗传元件的影响。根据最新的分类标准,CRISPR/Cas系统可分为两大类:第1类CRISPR/Cas系统和第2类CRISPR/Cas系统。  第1类CRISPR/Cas系统分为I型CRISPR/Cas系统(标签基因为Ca

小巧的Cas14蛋白有望成为新型诊断工具

  CRISPR领军人物、加州大学伯克利分校的Jennifer Doudna研究团队开始探索新型且高效的Cas系统。他们分析了宏基因组数据集,试图确定是否天然存在更小巧的Cas酶。他们最终发现了比Cas9小得多的Cas14。  CRISPR-Cas或许连自己都想不到,如今会变得这么红。它原本只是细菌

化学方法结合CRISPR精准控制RNA变化

  美国科学家在最新一期《自然·通讯》杂志上刊文称,他们将CRISPR基因编辑技术与一种化学过程相结合,能精确控制RNA变化发生的位置和时间,这样的精确度使CRISPR技术更有效,并减少了潜在的副作用,同时也有望为某些疾病(包括癌症)开发出更有效的疗法。   CRISPR基因编辑技术使用一种由RN

小巧的Cas14蛋白有望成为新型诊断工具

  CRISPR-Cas或许连自己都想不到,如今会变得这么红。它原本只是细菌体内的适应性免疫系统,现在却能够编辑几乎任何生物的基因组。近年来几种Cas酶陆续进入人们视线,但这也许只是冰山一角,科学家预测还有许多酶是未知的。  于是,CRISPR领军人物、加州大学伯克利分校的Jennifer Doud

Nature Methods:RNA牛人用CRISPR打造研究利器

  非编码RNA(ncRNA)是指不编码蛋白质的RNA。从上世纪六十年代的tRNA、八十年代的rRNA、到九十年代的microRNA,ncRNA在不断给人们制造惊喜。科学家们也逐渐意识到ncRNA并不是垃圾,而是许多基础生命过程的核心,有着广泛的生物学功能。  为了更好的研究ncRNA功能,哈佛大学

Nature重大突破:CRISPR也可编辑RNA

  一种用来编辑基因组中DNA指令的强大科学工具现在也可以应用于RNA。来自加州大学伯克利分校和劳伦斯伯克利国家实验室的一个研究人员小组,证实借助于一种方法可以编程CRISPR/Cas9蛋白复合物在序列特异性的靶位点识别并切割RNA。这一研究发现有可能改变RNA功能研究的模式,为检测、分析和操控RN

利用I型CRISPR-Cas系统实现大片段基因敲除

  CRISPR-Cas系统是细菌和古细菌中广泛存在的一种由RNA介导抵抗外援病毒或者核酸入侵的“获得性免疫系统”。CRISPR-Cas系统主要分为两大类:I类(Class I)利用多亚基效应复合物来实现对靶标序列的识别和切割过程;而II类(Class 2)则由单一蛋白来执行相关功能,作用机制相对简

PNAS:利用RNA控制CRISPR/Cas9基因编辑

  在过去的几年里,研究人员找到了一种方法利用天然存在的细菌免疫系统CRISPR/Cas9来失活或纠正任何生物体内的特定基因。然而,CRISPR/Cas9持续地发挥基因编辑活性,带来了额外编辑不必要位点的风险。  现在,来自加州大学圣地亚哥医学院、Ludwig癌症研究所和艾希司制药公司(Isis P