研究人员基于FFPE样本构建甲基化图谱预测癌症原发部位
9月14日，《自然-通讯》（Nature Communications）在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心石建涛组完成的最新合作研究成果（DNA methylation profiling to determine the primary sites of metastatic cancers using formalin-fixed paraffin-embedded tissues）。 该研究开发了新方法，即利用医学病理学中常用的福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本，构建DNA甲基化信息图谱，并结合机器学习方法，准确预测转移性癌症的原发部位。 识别癌症的原发部位对于癌症诊断和后续治疗至关重要。过去二十年中，针对肿瘤抗原的免疫组织化学（IHC）被视为“金标准”（能够判定50-65%的转移癌的原发部位）。然而，约3-9%的转移癌在临床上无法确定其原发部位，被称为原发灶不明肿瘤（CUP）。开发精准的CUP组织溯源方......阅读全文
再创纪录！AI系统可诊断近100种脑癌
今日，《自然》杂志再出人工智能重磅成果。来自美国、德国、意大利等100多个实验室的近150位科学家通力合作，联合在顶级期刊《自然》发表了这篇文章，他们开发了一个超级AI系统，该系统基于肿瘤组织DNA的甲基化数据，可以准确区分近100种不同的中枢神经系统肿瘤。更厉害的是，这个AI系统还能自学成才，发现
Nat－Med：恶性胶质瘤表观遗传学分析取得突破
胶质瘤的特点之一就是广泛的遗传学和转录学异质性，但是迄今为止科学家们对表观遗传学在脑胶质瘤疾病进展过程中发挥的作用知之甚少。为此，来自澳大利亚科学院等机构的研究人员使用通过国家患者登记表选择的高度注释的临床队列的数据对原发和对应复发脑胶质瘤的全基因组DNA甲基化图谱进行了描述，相关研究成果与近日
Nat－Med：恶性胶质瘤表观遗传学分析取得突破
胶质瘤的特点之一就是广泛的遗传学和转录学异质性，但是迄今为止科学家们对表观遗传学在脑胶质瘤疾病进展过程中发挥的作用知之甚少。为此，来自澳大利亚科学院等机构的研究人员使用通过国家患者登记表选择的高度注释的临床队列的数据对原发和对应复发脑胶质瘤的全基因组DNA甲基化图谱进行了描述，相关研究成果与近日
ELISA不常见样本的处理方法——唾液样本
ELISA（酶联免疫吸附剂测定）是一种快速、灵敏、准确可靠的一种定量分析方法，样本的处理对于ELISA实验的成功有着举足轻重的作用。 利用ELISA进行检测的样本类型包括常见的血液（血清、血浆），组织匀浆、细胞裂解液、细胞培养上清以及不常见的皮肤组织、尿液、粪便、肺泡灌洗液、唾液、脑脊液、胸
ELISA常见样本的处理方法—细胞样本
ELISA（酶联免疫吸附剂测定）是一种快速、灵敏、准确可靠的一种定量分析方法，样本的处理对于ELISA实验的成功有着举足轻重的作用。 利用ELISA进行检测的样本类型包括常见的血液（血清、血浆），组织匀浆、细胞裂解液、细胞培养上清以及不常见的皮肤组织、尿液、粪便、肺泡灌洗液、唾液、脑脊液、胸腹水、前
利用基因芯片检测尿液游离DNA样本
膀胱尿路上皮癌具有复杂多样的特征，其中一部分原因是基因组多样化所致。1,2Togneri等在《European Journal of Human Genetics》上发表的文章中称，尿液样本上清液中的游离DNA（cfDNA），与从制成颗粒的尿液细胞材料或传统肿瘤组织样本中获得的DNA相比，检测基
Naica自动化微滴芯片数字PCR系统在HPV检测的应用
人类DNA中HPV16和HPV18的灵敏度和特异性检测 全世界有超过5％的癌症是因人乳头瘤病毒（HPV）导致的，它主要通过性传播的方式感染[1]。十多种HPV亚型由于其在细胞转化中的作用以及宫颈癌和口咽癌发病率的增加而被认为是高风险的。在这些亚型中，HPV16和HPV18是最普遍的，在大约70％的宫
赛默飞推出一系列临床研究的产品
一年一度的美国分子病理学会（AMP）年会于11月5-7日举行。赛默飞世尔也将在此次会议上推出一系列临床研究的产品，让研究人员去发现有意义的遗传信息，以便更好地了解疾病。早前，在美国人类遗传学协会年会上，它也是推出多款重量级产品。 实体瘤分析 对于临床研究人员而言，FFPE样本是宝贵的资源，它
RNA提取纯化的注意事项
由于RNA酶的广泛存在与难以灭活的顽固特性。使得RNA的提取纯化和后续工作变得非常困难。关于 RNA and RNases，你应该了解些什么？RNases 是非常稳定和活跃的一种酶，一般不需要辅助因子的功能，因而在实验室内 RNA 很容易被降解如果不预先消除可能的 RNase 污染，请不要使用任何塑
基因组DNA提取纯化的注意事项
大多数动物组织可以用裂解缓冲液和蛋白酶/蛋白酶 K 进行高效裂解。在加入裂解液之前需要将组织切成小块，有条件的话建议使用 TissueLyser 或研钵等提前进行均质化。骨骼肌，心脏，皮肤等组织含有收缩蛋白，结缔组织和胶原蛋白，所以利用蛋白酶 / 蛋白酶 K 进行充分消化是必须的。FFPE
Covaris参加ASMS－2024，展示最新蛋白质样品制备技术
作为DNA片段化领域的行业领导者，Covaris将在ASMS 2024展示其前沿技术和解决方案。本次会议将于2024年6月4日至6日在美国举行，Covaris将在展位#234为与会者提供丰富的互动和学习机会。创新技术亮相ASMS 2024Covaris以其自适应聚焦声波（AFA®）技术而闻名，该技术
样本的处理
ELISA检测的目的是为实验提供准确可靠的定量分析实验依据。为了保证实验数据的可靠性，在实验过程中必须坚持全面质量控制和全过程质量控制。在收集标本前都必须有一个完整的计划。上海劲马设备有限公司来告诉你。 注意事项： 1.每个标本量收集体积＝100ul×检测种类，如要做复孔，标本
样本的物种
应选择物种相同或有交叉反应的抗体，抗体可能与不同物种的同种靶蛋白有交叉反应，因其氨基酸序列同源性较高，如果样本的种类未列入抗体说明书上的交叉反应种属表中，并不意味着该抗体不适用于检测该物种的蛋白，而只是表示该物种尚未用此抗体检测验证过，应通过序列比对的方法来预测交叉反应，可应用Expasy 和 NC
罗氏甲基化捕获试剂创新甲基化研究方法
自2004年美国批准Vidaza (azacitidine)可用于血液疾病( 如MDS)的治疗以来，通过改变致病基因的表观遗传学特征进行疾病治疗的方法，为人们带来了疾病的新治疗策略。然而，由于表观遗传检测方法的局限，要确定基因的碱基在何处以何种程度被甲基化一直以来困扰着研究者，从而难以确定基
DNA甲基化分析
The influence of methylation on the promoter activity and gene expression and the involvement of DNA methylation in carcinogenesis caused an extensive
RNA甲基化研究
近期华人科学家辛辛那提大学陈建军教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修饰在正常和恶性造血过程中的重要作用，表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信号轴在髓系分化以及白血病发生过程中的作用。该研究于2018年1月发表在干细胞顶级期刊《Cell Steam Cell》（影响因子：
什么叫甲基化
甲基化（Methylation）指向底物引入甲基的过程,一般是以甲基取代氢原子.在生物系统内,甲基化是经酶催化的,这种甲基化涉及重金属修饰、基因表达的调控、蛋白质功能的调节以及核糖核酸(RNA)加工.重金属修饰可以在生物系统外发生.组织样本的化学甲基化也是组织染色的方法之一.甲基化是蛋白质和核酸的一
甲基化的概念
甲基化，是指从活性甲基化合物上将甲基催化转移到其他化合物的过程，可形成各种甲基化合物，或是对某些蛋白质或核酸等进行化学修饰形成甲基化产物。在生物系统内，甲基化是经酶催化的，这种甲基化涉及重金属修饰、基因表达的调控、蛋白质功能的调节以及核糖核酸加工。
什么是甲基化？
甲基化是指从活性甲基化合物(如S-腺苷基甲硫氨酸)上将甲基催化转移到其他化合物的过程。可形成各种甲基化合物，或是对某些蛋白质或核酸等进行化学修饰形成甲基化产物。在生物系统内，甲基化是经酶催化的，这种甲基化涉及重金属修饰、基因表达的调控、蛋白质功能的调节以及核糖核酸(RNA)加工。
DNA甲基化预测
实验概要本实验分别对DNA片段、基因、启动子和外显子进行了甲基化的计算预测，并且随机选择了1000甲基化的和1000未甲基化的个体进行预测。用于甲基化预测的特征有：GC相关特征、四联体频率、转录因子结合位点(TFBSs)。所有预测方法均采用Weka提供的软件进行。实验步骤1. DNA甲基化数据本研究
什么是甲基化
甲基化是指从活性甲基化合物(如S-腺苷基甲硫氨酸)上将甲基催化转移到其他化合物的过程。可形成各种甲基化合物，或是对某些蛋白质或核酸等进行化学修饰形成甲基化产物。在生物系统内，甲基化是经酶催化的，这种甲基化涉及重金属修饰、基因表达的调控、蛋白质功能的调节以及核糖核酸(RNA)加工
什么是甲基化？
甲基化，是指从活性甲基化合物上将甲基催化转移到其他化合物的过程，可形成各种甲基化合物，或是对某些蛋白质或核酸等进行化学修饰形成甲基化产物。在生物系统内，甲基化是经酶催化的，这种甲基化涉及重金属修饰、基因表达的调控、蛋白质功能的调节以及核糖核酸加工。
RNA甲基化测序
1、NSUN2影响m5C在HEK293细胞中整体分布情况NSUN2被报道是RNA甲基转移酶，能使tRNAs和mRNA发生m5C甲基化修饰。为了探究NSUN2对HEK293细胞mRNA m5C甲基化修饰的影响。作者利用CRISP/Cas9技术敲减NSUN2（NSUN2-/-HEK293细胞）后进行
TaqMan探针基因表达分析全面升级
TaqMan探针对于大家来说不是什么新名词了，然而你知道吗，对于部分降解的RNA，如福尔马林固定、石蜡包埋（FFPE）样品中的RNA，TaqMan引物探针的设计有更多的讲究，你知道这是为什么吗？FFPE样本在固定时导致核酸相互交联且片段化，RNA片段的大小在50-300 nt，大部分片段在100 n
表观遗传学测序技术助力三阴性乳腺癌患者分层
一组澳大利亚的研究员使用甲基化特异性测序技术发现了三阴性乳腺癌中某些甲基化的差异，这些差异可能具有预后价值。 如果患者缺乏雌激素、孕激素受体，并且HER2基因没有过表达或者扩增，则认为乳腺癌是“三阴性”的。具有三阴性乳腺癌（或TNBC）的患者，可以分成两部分，即癌症进展非常迅速或者进展非常缓慢
核酸纯化仪在基因组学、CDC和分子诊断方面的应用
基因组学 天隆 NP968磁珠提取纯化系统，非常适合于基因组学的研究。无论提取样本的来源是微生物、动物、植物或是病毒，结合特别针对TIANLONG NP968磁珠提取纯化系统优化的TIANLONG全血基因组DNA提取试剂盒、白细胞层全血基因组提取试剂盒、动物组织/细胞基因组DNA提取试剂盒，可
甲基化特异性－PCR－确定－DNA－甲基化的模式
用 PCR 来分析 DNA 甲基化的方法可以运用于：（1）对基因组中任何位置的 CpG 甲基化的分析；（2）检测肿瘤患者的基因改变以及介人被印的基因的固定遗传障碍的研究。实验方法原理DNA甲基化（DNA methylation）是最早发现的修饰途径之一，大量研究表明，DNA甲基化能引起染色质结构、D
lncRNA启动子DNA甲基化/羟甲基化测序分析
技术优势：● 专注非编码RNA领域，完善的lncRNA启动子分析流程● 可与lncRNA表达谱芯片联合应用，实现平台间无缝对接● 可视化数据展示，提供paper级结果图表● 优化的IP实验方法，可信赖的检测平台及数据结果 介绍： 人类基因组中仅有约2%的DNA序列最
生物样本采样新方法，DMS－攻克样本存储难关
实验室的样本存储一直是一大难题，大多数生物样本都需要在严格的低温条件下保存，例如：一般 DNA 或者蛋白质等生物活性物质的短期保存需要在零下 20 摄氏度，而对于 RNA 或者活性物质长期保存更需要零下 80 甚至零下 150 摄氏度。如普通冷藏设备内部的温度不够低，便无法阻止降解酶发生作用。除了在
NGS文库制备新品实现5hmC分析
近年来，新一代测序(NGS)平台在甲基化研究中开始崭露头角。它们带来了非常灵敏的DNA甲基化图谱，以单分子分辨率覆盖整个CpG岛。然而，对于时下热门的5-hmC研究，似乎还缺乏专门的样品制备工具。为此，Zymo Research公司近日推出两款新的NGS文库制备试剂盒，适用于全基因组范围的5