新技术首次实现以RNA为媒介的基因精准写入
记者9日从中国科学院动物研究所获悉，该所李伟研究员与周琪研究员团队开发的逆转座子基因工程新技术，首次实现以RNA为媒介的基因精准写入，有望为遗传病、肿瘤等疾病带来更高效、更安全、更低成本的全新治疗方式，为新一代创新基因疗法的发展提供了基础。相关研究成果在线发表于《细胞》杂志。基因工程技术是现代生物技术发展的前沿，有着广泛的应用。以CRISPR基因编辑技术为代表的技术进步已经基本实现了单碱基和短序列尺度的精准编辑。“然而，如何针对应用场景的需求，实现大片段基因尺度的DNA在基因组的高效精准整合，仍然是整个基因工程领域亟须突破的难题。”论文共同通讯作者李伟说。针对这一重大技术挑战，多种基因写入技术已被开发，但是这些技术大多以DNA为媒介。在实际医学应用中，DNA媒介面临免疫原性高、在体递送困难、在基因组中具有随机整合风险等诸多挑战。相比之下，RNA媒介具有更低的免疫原性、可被非病毒载体有效递送、在细胞内迅速降解，无随机整合风险等特点......阅读全文
基因组所发表长非编码RNA分类问题综述文章
近日，中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室的“百人计划”研究员章张及其团队，与沙特阿卜杜拉国王科技大学(King Abdullah University of Science and Technology)开展科研合作，对长非编码RNA的分类问题进行了系统综述，相关论文在RN
单细胞RNAseq发现调节干细胞发育的新基因
最近，Wellcome Genome Campus的一项新研究演示了单细胞基因组学的力量，揭示了它如何能帮助科学家了解细胞的早期发育。这项研究发现了参与干细胞调控网络的新基因，以及新 的细胞亚群，可让我们深入了解干细胞多能性——成为几乎所有不同类型细胞的能力。研究人员还为干细胞群落开发了新的资源
水稻金属耐受蛋白及编码基因、RNA干涉片段获发明ZL
6月17日，由中科院华南植物园张美博士等科研人员完成的“水稻金属耐受蛋白OsMPT1及其编码基因和其RNA干涉片段”获得国家发明ZL授权(ZL号：ZL 201110249200.7)。 水稻是世界上最重要的粮食作物之一，是我国第一大粮食作物。工业“三废”的排放造成巨大的环境污染，特别是
北京基因组所发表RNA甲基化新发现
在分子生物学的中心法则中，遗传信息从DNA、RNA最后流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰，这些修饰可以在不改变DNA序列的基础上调控基因的表达，并由此决定细胞的分化和发育情况。实际上，mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。 N6-methyladenosine（m
单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna
深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列，如测序前将dna打成小的片段，测序是从这个片段的两端测的，即会产生两条reads。至于是mapping到基因组还是dna基因组，这要看你做什么了，一般基因组是指生物个体的全基因组。并不是所有测序都要rna反转，这其实要看你想做什么分析，如做转
怎么样在RNA提取时避免基因组的污染
260/280的比值可以判断比较严重的基因组污染。也可以通过跑琼脂糖胶看加样孔里亮不亮作为一个参考依据。其实一般很难保证RNA没有基因组污染的，特别是加入氯仿后的剧烈震荡会促进dna溶解到水相里，后面就很难分离了。有些许的基因组污染的样品也能够满足大部分的实验要求。所以在rt-pcr等试验中才要求设
PLoS－ONE：鹌鹑PIWI基因的克隆及其结合小RNA的鉴定
PIWI 蛋白能通过与多种内源非编码小RNA结合在表观水平和转录后水平调控基因的表达。然而在家禽中，PIWI蛋白的生物学功能及其结合小RNA的作用机制尚不清楚。扬州大学动物科学与技术学院陈国宏教授课题组对该作用机理进行了研究*，研究成果发表在2012年12月刊的PLoS ONE上。
癌症早期发生的关键基因突变改变了RNA“暗物质”
研究人员检查了KRAS基因突变的影响，它是所有癌症中最常见的突变基因之一，包括胰腺癌、肺癌和结肠直肠癌。KRAS被认为是导致癌症形成的初始“驱动”突变，这使得它对了解和检测癌症的早期阶段至关重要。在这项研究中，生物分子工程助理教授Daniel Kim的实验室专注于肺癌中的KRAS突变，以确定它们对R
常兴研究组发现RNA剪接基因编辑的新方法
2018年10月5日，国际知名学术期刊《分子细胞》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院（营养与健康研究院）常兴研究组题为“Genetic modulation of RNA splicing with a CRISPR-guided cytidine deaminase”的最新研究成果。证明可
RNA提取
RNA提取（主要内容如下）Tips for Handing RNA Total RNA IsolationmRNA IsolationrRNA IsolationOthersQ & A posted in the Method Forum Basic Procedures for Handing
RNA降解
新鲜细胞：如果试剂没有问题，且外源性污染也可以排除，那么降解几乎都来自裂解液的用量不足。如 果将裂解液直接加入培养皿中裂解细胞，一定要使裂解液能覆盖住细胞。 2. 新鲜组织：某些富含内源核酸酶的样品(如肝脏，胸腺等)，即使使用电动匀浆器匀浆也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是：在液氮条件下将组织
RNA电泳
RNA Gel (Crawford Lab)Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis.Northern Gel and TransferUsing glyoxal
指导RNA
中文名称指导RNA英文名称guide RNA;gRNA定 义一种小分子RNA，约含60～80个核苷酸，在RNA编辑中起模板作用。其功能是提供核苷酸插入或删除的信息。由小环DNA及大环DNA编码的指导RNA均带有编辑区的序列信息，可介导编辑过程。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调
RNA标记
RNA标记是将标记物（如放射性同位素、荧光素或酶）共价地连接到RNA，通过检测标记物，进而实现对RNA鉴别和检测的目的。RNA标记在分子探针领域应用广泛，在疾病诊断方面也很有前景。 理想的RNA标记方法应符合以下要求： 1. 操作简单，灵敏度高 2. 不影响碱基配对的特异性 3. 不影响RN
RNA标记
RNA labeling (Amersham Pharmacia)For the generation of radiolabelled, single stranded RNA for use as hybridization probes 32P-pCp 3' End-labeling
RNA电泳
· RNA Gel (Crawford Lab)· Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis. · Northern
RNA－电泳
①电泳RNA 所用器械如制胶的模具、梳子、电泳槽等用肥皂粉洗干净后用双蒸水冲洗二遍后在室温晾干备用。②用新的1XTBE 配制1. 2 %琼脂糖凝胶,倒胶时溴化乙锭(E直接加入凝胶中。③制备好的琼脂糖凝胶板放入电泳槽后再加入经高压灭菌过的1XTBE ,液面只能刚好同胶面平齐,缓冲液不要淹过胶面。④点样
RNA－Electrophoresis
Electrophoresis through agarose or polyacrylamide gels is the standard way to separate, identify and purify nucleic acid fragments. The location of th
Quantitating－RNA
RNA quantitation is an important and necessary step prior to most RNA analysis methods. Here we discuss three common methods used to quantitate RNA an
RNA－剪接
中文名称RNA 剪接英文名称RNA splicing定 义在真核细胞核中从RNA初始转录物切除内含子，连接外显子形成成熟的mRNA的过程。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞遗传（二级学科）
RNA干扰相关知识Small－interfering－RNA（siRNA）
Small interfering RNA（siRNA）：是一种小RNA分子（~21-25核苷酸），由Dicer（RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶）加工而成。SiRNA是siRISC的主要成员，激发与之互补的目标mRNA的沉默。
关于小干扰RNA的RNA激活介绍
已经发现dsRNA还可以激活基因表达，这种机制被称为“小RNA诱导的基因激活”或RNAa。已经显示靶向基因启动子的dsRNA诱导相关基因的有效转录激活。使用合成的dsRNA在人细胞中证明RNAa，称为“小活化RNA”（saRNA）。尚不清楚RNAa是否在其他生物体中是保守的。
基因编辑大牛张锋开发出RESCUE技术，可扩大RNA编辑能力
基于CRISPR的工具彻底改变了我们靶向与疾病相关的基因突变的能力。CRISPR技术包括一系列不断增长的能够操纵基因及其表达的工具，包括利用酶Cas9和Cas12靶向DNA，利用酶Cas13靶向RNA。这一系列工具提供了处理突变的不同策略。鉴于RNA寿命相对较短，靶向RNA中与疾病相关的突变可避
病毒基因组DNA/RNA提取试剂盒使用说明
病毒基因组DNA/RNA提取试剂盒一、简介病毒总核酸提取试剂盒适合于从血清、血浆、组织匀浆等样品中提取病毒总核酸。试剂盒基于硅胶柱纯化技术，提取过程中无需使用有毒的酚氯仿抽提，也无需进行耗时的醇类沉淀。该产品已经成功地提取了乙肝A/C、丙肝、以及诺如病毒标准品等的核酸。获得的DNA/RNA可直接用于
基因编辑：经编程后杀死人细胞中RNA病毒的新技术
世界上许多最常见或致命的人类病原体都是RNA病毒，比如埃博拉病毒、寨卡病毒和流感病毒，并且大多数都没有美国食品药品管理局（FDA）批准的治疗方法。在一项新的研究中，来自美国麻省理工学院、哈佛大学和布罗德研究所等研究机构的研究人员将一种CRISPR RNA切割酶转变为一种经编程后检测和破坏人细胞中
HD－公司RNA基因检测标准品获Thermo力荐用于癌症研究检测！
近日，基因检测标准品和基因编辑技术应用全球领导者Horizon Discovery集团公司（伦敦证券交易所：HZD）发布最新合作新闻，宣布Horizon Discovery最新RNA基因检测标准品与Thermo Fisher公司的Ion Ampliseq and Oncomine fusion
Cell：神秘的非编码RNA在基因表达中起重要作用
在细胞中，DNA被转录成RNA，提供给细胞制造蛋白质的分子配方。大多数的基因组被转录成RNA，但实际上只有一小部分的RNA是来自于基因组中的蛋白质编码区域。 宾夕法尼亚大学Perelman医学院Penn表观遗传学研究所主任Shelley Berger博士说：“为什么非编码区能转录？它们的功能一
新方法|用RNA寻找罕见遗传病基因触发器
大约有一半罕见遗传病患者的致病基因仍未找到。其中一个原因是由于人类基因信息量巨大。针对这一问题，信息学和医学领域科学家们联手寻找解决方案。由慕尼黑工业大学和Helmholtz 慕尼黑中心组成的研究小组已开发出一种能显著提高搜索成功率的新方法。不只着眼于DNA，新方法的寻找策略还包括RNA筛查。
Nature子刊：非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破
近日，匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归（Elastic Net regression）的机器学习模型，从1,001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱（long noncoding RNAs, lncRNAs）与265种抗癌药物敏感性数据中，挖掘出了27
上海生科院总结多种基因内部来源的非编码RNA生成机制
10月1日，中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所研究员杨力受邀在WIREs RNA 发表了题为Splicing noncoding RNAs from the inside out 的综述论文，系统总结了多种来自于前体RNA内部序列的非编码RNA分子及其产生机制和潜在功能作用。 真核基