揭示特殊的非编码RNA或是联系干细胞和癌症的标志物
近日，刊登在国际杂志Genome Biology上的一篇研究论文中，来自圣劳伦学院的研究者阐述了其在疾病系统生物学方面的研究成果。研究者在文中发现，一种名为vlincRNAs(较长基因间非编码RNAs，very long intergenic， non-coding RNAs)的人类基因组非编码部分可以被一种古老的病毒所触发，其可以参与干细胞的生物学过程以及癌症的发育，更为重要的是研究者也发现 vlincRNAs的去除可以引发癌细胞的死亡。 研究者Philipp Kapranov表示，理解此前被忽视的人类基因组以及其在发育过程中扮演的角色将为我们研究疾病的发展以及开发相应疗法提供思路和帮助，未来对vlincRNAs的深入研究姜维进行靶向诊断检测以及更多的精确癌症疗法提供希望。 98%以上的人类基因组物质都被认为是垃圾的或者暗物质类别的非编码DNA，而且科学家也很少去研究这些非编码的DNA，这些......阅读全文
TYMS与癌症相关的基因编码功能描述
胸苷酸合成酶利用5,10-亚甲基四氢叶酸（亚甲基四氢叶酸）作为辅因子催化脱氧尿苷酸甲基化为脱氧胸苷酸。此功能维持DNA复制和修复的关键DTMP（胸腺嘧啶-5-一磷酸素）池。这种酶作为肿瘤化疗药物的靶点一直备受关注。它被认为是5-氟尿嘧啶、5-氟尿嘧啶-2-原脱氧尿苷和一些叶酸类似物的主要作用部位。该
EREG与癌症相关的基因编码功能描述
该基因编码一种分泌肽激素和表皮生长因子（egf）蛋白家族成员。编码蛋白是表皮生长因子受体（egfr）和结构相关的erb-b2受体酪氨酸激酶4（erbb4）的配体。编码蛋白可能参与多种生物学过程，包括炎症、伤口愈合、卵母细胞成熟和细胞增殖。此外，编码蛋白可能促进各种人体组织癌症的进展。This gen
CIC与癌症相关的基因编码功能描述
该基因编码的蛋白质是果蝇黑胃管Capicua基因的一个同源基因，是转录抑制因子的高迁移率群（HMG）盒超家族成员。该蛋白包含一个参与DNA结合和核定位的保守HMG结构域和一个保守的C端。研究表明，这种蛋白的N末端区域与ATXN1（geneid:6310）相互作用，形成转录抑制复合物，体外研究表明，A
AURKA与癌症相关的基因编码功能描述
该基因编码的蛋白是一种细胞周期调节激酶，在染色体分离过程中似乎与纺锤体极的微管形成和/或稳定有关。编码蛋白存在于有丝分裂的间期细胞的中心体和纺锤体两极。该基因可能在肿瘤的发展和进展中起作用。在1号染色体上发现一个经过加工的假基因，在10号染色体上发现一个未经加工的假基因。已发现该基因的多个编码相同蛋
KIT与癌症相关的基因编码功能描述
KIT基因编码的蛋白是干细胞因子受体SCFR，也被称为原癌基因c-kit或酪氨酸蛋白激酶kit或CD117，是一种受体酪氨酸激酶，这个基因突变与胃肠道间质瘤，肥大细胞病，急性髓性白血病有关。
Nat－Commun：人工智能帮助找到导致胃癌的基因突变！
在一项开创性研究中，来自新加坡基因组研究所（GIS）科技研究局的研究人员开发了一种全新的机器学习计算机模型（一种人工智能模型，AI）来准确寻找肿瘤突变。他们还发现了一个非编码DNA的新基因突变可能导致了胃癌。这项研究开发出的新技术将在未来帮助研究人员探索其他肿瘤中非编码DNA突变的影响。图片来源
Nature:新方法“重启”肿瘤抑制因子
新加坡癌症科学研究中心和哈佛干细胞研究中心的科学家发现一种新型非编码RNA能够"重启"癌细胞中被抑制的癌症抑制因子。 该研究是由Daniel Tenen博士领导完成的，该研究首次揭示了DNA甲基化过程中的关键酶DNMT1(DNA methyl transferase 1)与RNA的关系
Nature子刊：基因外的DNA突变会引起癌症
随着对癌症机理认识的不断加深，我们已经找到了许多会导致癌症的基因突变，为患者带来了生命的希望。但在一个人的基因组里，只有2%的DNA是编码蛋白质信息的“基因”。剩下98%的DNA对癌症究竟有没有作用，有怎样的作用，至今依然没有一个定论。 今日，加州大学圣地亚哥分校（UCSD）的研究人员在《自然
DNA检测将替代常用癌症检测方法
巴氏涂片检查方法(Pap smear)是公共卫生一种广泛使用的金标准检查方法，这种方法主要针对子宫颈癌等疾病，能有效的检测出人类乳头瘤病毒(HPV)细胞的异常变化。然而近期美国食品药品管理局(FDA)批准了一种以DNA为基础的病毒检测方法。 1943年，Papanicolaou和Tra
神秘DNA提供新的癌症检测法
最近，美国弗吉尼亚大学的研究人员发现，存在于染色体外面的奇特环状DNA，根据产生它们的细胞类型，而有所差异。这一研究结果增加了一种诱人的可能性，即，这些环状DNA可以作为不同类型癌症的生物标志物。相关研究结果发表在最近的《Cell Reports》。 MicroDNAs，是一类已被命名的新DN
癌症“照妖镜”——游离DNA助力肿瘤早期探查
“人体细胞也有生命周期。细胞衰老凋亡后，细胞内的物质会渗透出来。其中，DNA会随之‘崩裂降解’，进入血液，成为游离DNA。”中国医学科学院肿瘤医院防癌科副主任张凯教授告诉科技日报记者，“肿瘤细胞的游离DNA和正常细胞的游离DNA有所不同，这就给了我们探测肿瘤细胞的机会。”随着分子检测技术的发展，科研
检测癌症相关DNA修饰新测序方法
牛津Ludwig癌症研究所助理成员Chunxiao Song和Benjamin Schuster-Boeckler领导的这项研究表明，他们开发的新方法，TET辅助吡啶硼烷测序（TET-assisted pyridine borane sequencing，TAPS）是一种比亚硫酸氢盐测序（bis
－DNA甲基化：癌症共有的“指纹”
8月26日在线发表在Genome Medicine上的一篇文章中，研究人员说他们发现了多种癌症中都存在的普遍特异性变化，DNA甲基化标记，它们帮助控制基因的开、关以及最终细胞的行为。这种DNA上可逆的化学标记就是表观遗传学。 约翰霍普金斯医学院的Andrew Feinber
DNA修复机制如何帮助抵御癌症
2015年的诺贝尔化学奖颁发给了细胞DNA修复机制的相关研究，而理解细胞如何修复损伤的DNA对于开发有效的抗癌疗法或许非常重要。通过揭示机体细胞如何自发地修复引发疾病的DNA突变，研究者或许就可以帮助开发改善治疗癌症的化疗方法的有效性。 研究者Nora Goosen表示，我们可以利用知识来战胜
DNA编码分子库为药物发明提供便利
随着DNA编码分子库持续扩大以及新的筛选方法不断开拓未知生物学领域，DNA编码分子库将成为制药行业研发新药的支柱之一。 在美国马萨诸塞州沃尔瑟姆市一座混凝土建筑的二楼，一台普通实验室冰箱的塑料盒子里放着一根透明试管，里面则含有天文数字尺度的混合物。这个分子库里冷冻的是由总部位于英国伦敦的制药公
DNA编码化学库新技术助推药物研发
科技日报讯 （记者张梦然）近年来，科研人员虽然在分子疗法开发方面取得了重要进展，但新发现的活性物质数量依然不足。现在，美国哈佛大学和瑞士苏黎世联邦理工学院共同开发的DNA编码化学库（DEL）技术提供了新的解决方案。该技术能在几周内自动化合成并测试数十亿种化合物，还能用于生产更大的药物分子，这类药物将
北京生科院发表环形非编码RNA识别新技术
2月28日，国际学术期刊Briefings in Bioinformatics 发表了中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队题为Circular RNA identification based on multiple seed matching 的最新研究成果。因为目前在环形RNA识别方面存
我国学者发现新型非编码核糖核酸
中国科学技术大学单革教授实验室近期发现了一种新型的环状非编码核糖核酸（RNA），为进一步揭示人类生命原理，以及未来解释并防治一些重大疾病提供参考。该研究成果日前发表在国际知名杂志《自然－结构和分子生物学》上。 核糖核酸（RNA）是存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体，而非编码R
Nature：像海绵一样的非编码RNA
一种称为RsmZ的小分子RNA具有特殊的功能：屏蔽细菌中抑制翻译的蛋白的作用，最新一项研究揭示了这种RNA如何能完成其功能的分子机制，指出RsmZ像海绵一样能吸收多种阻遏蛋白（repressor proteins）。 小 RNA（small RNAs 或 sRNAs）是一类长度为40-400个
长链非编码RNA:－从科研到临床（一）
概述长链非编码RNA (LncRNA)是一类真核生物中长度大于200 nt的非编码RNA分子；根据其与邻近基因的位置可以分为反义lncRNA、增强子lncRNA、基因间lncRNA、双向lncRNA、和内含子lncRNA；它具有多种作用机制，比如在细胞核中作为分子支架、协助可变剪接、调节染色体结
【盘点】长链非编码RNA的研究进展
非编码RNA在生命调控过程中扮演着重要角色，近年来的研究成果常入选CNS年度十大科学突破。人类基因组转录区高达76％，但转录产物中只有不到2％是编码蛋白质的mRNA，其他均为非编码RNA，其中microRNA (miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA（circRNA）等调控
Nature里程碑研究：新型非编码反义RNA
在研究帕金森氏病的过程中，一个国际研究小组获得了一个可以提高工业蛋白质合成用于治疗用途的新发现。他们设法了解了非蛋白质编码RNA的一个新功能：借助这类称作“反义”的非编码RNA的活性可以提高编码基因的蛋白质合成活性。相关成果发表在10月14日的《自然》(Nature)杂志上。 为了合成蛋白
关键非编码RNA分子促进皮肤癌恶化
在最近一项研究中，图尔库大学中心医院和西方癌症中心（FICAN West）的研究人员发现了一种新的RNA分子PRECSIT，它参与调节了皮肤鳞状细胞癌的生长和侵袭过程。将来，PRECSIT可能会成为检测快速进展或扩散的鳞状细胞癌的新标志物，以及有可能成为新疗法的靶标。 皮肤癌是世界上最常见的癌
Cell:长期被误解－非编码RNA存在“认知黑洞”
在人类基因组中95%的基因并不编码蛋白质，其他物种也有大量的非编码基因。这些DNA不会被编码成蛋白质，却又会转录出非编码RNA，它们对生命活动起什么作用？是进化的冗余还是神秘的缓存？ 《细胞》杂志近日刊登中国工程院院士曹雪涛团队的研究论文，他们发现一种全新非编码RNA分子。该分子能够调控免疫
eLife：首次发现促癌非编码RNA因子—LAST
中国科学技术大学吴缅教授研究组发现一条受c-Myc转录激活的长非编码RNA。 中国科学技术大学吴缅教授研究组发表了题为“LAST, a c-Myc-inducible long noncoding RNA, cooperates with CNBP to promote CCND1 mRNA
非编码RNA－Nfi调控水稻固氮酶活性
近日，生物所微生物功能基因组创新团队林敏课题组在水稻根际联合固氮施氏假单胞菌中发现新型非编码RNA参与协同调控固氮酶活性，为进一步揭示生物固氮网络调控机制奠定了重要理论基础。该成果发表在最新一期的经典微生物学杂志《应用环境微生物学（Applied and Environmental Micro
长链非编码RNA:－从科研到临床（三）
肾脏疾病与糖尿病 糖尿病经常伴随着肾病的发生[5]. 比如基因间lncRNA PVT1与二类疾病都紧密关联。研究人员在II型糖尿病人的晚期肾病进程中发现了PVT1的基因变异。高糖处理可以诱导人的肾间质细胞中PVT1和纤连蛋白1、IV型胶原蛋白、TGF β1、PAI 1等因子的高表达。相反，敲除P
JCI：促发儿童骨肿瘤的非编码RNA
尤文氏肉瘤是骨或其周围软组织癌症，主要影响儿童和年轻成人。尤文氏肉瘤的特点是易位事件的发生，即RNA结合蛋白——EWS与转录因子如FLI1的融合。 以前的研究工作表明，该融合蛋白EWS-FLI1通过改变基因表达，促进癌症，但融合蛋白作用的靶基因是未知的。 发表在Journal of Clin
出人意料的新才能：非编码RNA
在《来自基因组暗物质的lncRNA、ciRNA和miRNA》一文中我们提到：人类基因组中也存在大量被称为基因组“暗物质（dark matter）”的非编码序列，包括基因间非编码序列、内含子非编码序列等。所谓基因组“暗物质”，其实就是基因组中的非编码RNA——不包含用于制造蛋白质的版图，构成了超过
曹雪涛院士Science揭示重要非编码RNA
来自第二军医大学、中国医学科学院和浙江大学医学院的研究人员，发现一种名为lnc-DC的长链非编码RNA控制了人类树突状细胞的分化。 领导这一研究的是我国著名的免疫学家曹雪涛(Xuetao Cao)院士。其现任职第二军医大学、中国医学科学院和浙江大学医学院，主要从事肿瘤免疫治疗和分子免疫