宏基因组研究新突破,复旦最新研究发Nature
近年来伪狂犬、猴痘等病毒从动物向人类外溢引发新发传染病甚至全球大流行的频率正在显著增加如何精准预测和预报动物源新发传染病是关系绿色健康养殖与公共卫生防控的重要科学问题复旦大学公共卫生学院粟硕教授团队与合作者运用前沿交叉研究方法揭示多种哺乳动物宏基因组数据中的病毒基因组组成、生态学特征与跨物种传播规律在“同一健康”理念下为构建人-动物-环境一体化多维度新发传染病预测预警体系奠定重要数据基础成果于北京时间9月4日以题为“Farmed fur animals harbor viruseswith zoonotic spillover potential”的研究长文在《自然》杂志(Nature)发表聚焦养殖哺乳动物发现潜在“风险”病毒21世纪以来,人类多次经历由动物源新发传染病原引发的大流行疫情。2014年西非埃博拉病毒疫情、2015年寨卡病毒在南美暴发并蔓延全球,以及近期起源非洲的猴痘疫情等,接连不断地给全球公共卫生体系带来严峻挑战。......阅读全文
复旦叶丹、熊跃Nature亮点推荐癌症表观遗传重要成果
现任职复旦大学和北卡罗纳大学的熊跃(Yue Xiong)教授主要研究领域为肿瘤和干细胞周期调控、乳腺癌小鼠动物模式和蛋白泛素化。复旦大学的叶丹(Dan Ye)研究员则主要围绕”代谢与人类疾病”,开展”乙酰化调控代谢酶分子机制”和”代谢中间物参与表观遗传调控分子机制”两方面的研究。 8月17日,
Nature-Genetics:复旦参与发现前列腺癌风险的影响机制
来自芬兰、瑞典和中国的一个研究团队,在2014年1月份的《自然遗传学》(Nature Genetics)上发表的一项研究中,发现了与一种转录因子相关的前列腺癌风险影响机制,这种转录因子能够更强地结合到一个特殊的SNP变异上,从而启动一种遗传学程序,增强前列腺癌的增生和转移。这项研究由芬兰科学
复旦大学马兰教授Nature子刊文章:成瘾行为可以遗传
来自复旦大学脑科学研究院、医学神经生物学国家重点实验室的研究人员发表了题为“Drug-seeking motivation level in male rats determines offspring susceptibility or resistance to cocaine-seekin
复旦的新衣再登Nature!可穿戴技术领域新里程
今天,一件来自中国的衣服登上了Nature。 没看出有什么特别?别眨眼,下一秒神奇的事情就发生了(注意那个手机)。 没错,这件衣服正在给手机无!线!充!电! 不是把充电宝缝进了衣服里,而是这件可以正常折叠、水洗的衣服,本身就是一块电池! 这项最新研究来自复旦大学彭慧胜教授团队,也是该
《Nature》:人类基因组中有史以来研究最多的十大基因
奥地利维也纳大学的Peter Kerpedjiev是一位曾进行生物信息学培训的软件工程师,目前正在攻读博士学位,他表示需要一个遗传学速成课程,因为他认为这样有助于了解生物学的一些基础知识,“如果我想和其他科学家进行有效的交流,那么我需要了解哪些基因?”他希望能得到答案。 为此,Kerpedji
浙大教授Nature子刊:水稻基因组重测序及群体遗传学研究
浙江大学农业与生物技术学院作物科学研究所,中国水稻研究所的研究人员发表了题为“Genomic variation associated with local adaptation of weedy rice during de-domestication” 的文章,以杂草稻群体为材料,通过基因组
Cell,Nature,Science三大顶级杂志发表功能基因组研究成果
由华盛顿大学领导的一个研究小组在新研究中确定了控制机体内不同的基因何时、何处及如何开启和关闭的百万DNA“开关”的位置。基因只占人类基因组的2%,且易于识别,然而控制这些基因的on/off开关却被加密保存在余下的98%的基因组中。 然而,当前的技术只允许这样的蛋白一次研究一个。它们也缺
汉字首登Nature-农科院等完成亚洲栽培稻基因组变异研究
水稻是全世界最重要的粮食作物之一,对水稻全球品种进行基因组研究,对于挖掘有利等位基因和指导基于全基因组信息的分子育种具有重大的理论和实践意义,是关系着国家乃至全球粮食安全的重大战略问题。 2011年9月,全球3000份水稻核心种质资源基因组项目(3K Rice Project)正式启动,该项目
JBC:张宏研究组解析细胞自噬基因
来自北京生命科学研究所等处的研究人员发表了题为“Differential function of the two Atg4 homologues in the aggrephagy pathway in C. elegans”的文章,发现了线虫中的Atg4的两个同源基因在细胞自噬过程中表
Nature成功实现干细胞靶向基因组编辑
来自意大利San Raffaele科学研究所的研究人员,在人类造血干细胞(HSC)成功实现了靶向基因组编辑,这一突破性的成果发表在5月28日的《自然》(Nature)杂志上。 基因治疗为一些因基因缺陷引起的遗传性疾病提供了良好的治疗效果。然而传统的方法是采用一种遗传工程载体将突变基因的一个功能
Nature新文章绘制油棕榈基因组图谱
一个由多国科学家组成的研究小组,确定了一种称之为Shell的基因调控了油棕榈树的产量。油棕榈的果实和种子是全球近一半食用植物油的供应源,并且是最有前景的生物燃料来源之一。 新研究为我们提供了高质量的油棕榈全基因组图谱,并且还搜索了对于科学和工业均极为重要的基因序列。这一付诸多年努
Nature-Methods发布宏基因组测序新工具
微生物几乎是无所不在的,它们对生态环境和人体健康起到了不容忽视的作用。然而人们对微生物的了解还相当匮乏,因为许多微生物是无法在实验室中培养的。宏基因组学是了解这些微生物的重要途径,但宏基因组测序并不是一件容易的事儿,就像是把许多拼图拆散混在一起,然后在毫无参考的情况下拼接。 最近Nature
Nature-Genetics:全基因组测序的诊断价值
根据《Nature Genetics》上发表的一项新成果,全基因组测序有望用于临床上的遗传病诊断。这项研究评估了影响全基因组测序在临床诊断中取得成功的因素。 这个国际研究小组由英国的研究人员领导,对156个病例或家庭开展了临床基因组测序。这些病例有着遗传疾病的特征,但无法通过之前的筛查检测来
Nature:12个肿瘤类型的基因组“景观”
作为“癌症基因组图谱”之Pan-Cancer项目的一部分,本文作者发表了对来自超过3000个肿瘤、代表12个肿瘤类型的点突变和小“得失位”所做的数据分析。他们的发现包括127个显着突变的基因,它们来自与癌症有已经确定的联系和新发现联系的细胞过程。他们还发现,肿瘤形成所需的驱动突变的数量是相对较小
Nature,Science子刊:肺癌的基因组分类
两项最新的研究显示,如何根据肿瘤的遗传结构来特别定制肺癌的治疗,这可能会最终改善现有的治疗方法,甚至有助于发现新的治疗方法。 第一项研究发表在Science Translational Medicine杂志上,研究者们发现了一种根据其遗传组成将肺癌肿瘤进行分类的方法,能够为一些患者治疗
Nature:基因组编辑新技术-或超越CRISPR
能够将缺陷基因的功能性拷贝插入到患者的基因组中,对于许多从事遗传疾病治疗的临床医生来说是一个诱人的目标。现在,斯坦福大学医学院的研究人员设计出了一种新方法来实现这种遗传技能。他们的研究论文“Promoterless gene targeting without nucleases amelior
Nature子刊:用CRISPR操控表观基因组
杜克大学的研究人员开发出了一种新方法,可以精确地控制基因开启及激活的时间。借助这一新技术研究人员可通过化学操控包装DNA的蛋白,来开启特异的基因启动子和增强子——控制基因活性的基因组片段。 研究人员说,拥有操控表观基因组的能力将有助于他们探究特殊启动子和增强子在细胞命运或遗传病风险中所起的作用
Nature-Methods:超快速的基因组分析工具
近年来,测序市场呈现出百花齐放的美好局面。这使得测序的成本不断下降,但同时也带来了数据分析的难题。经济而又高效地处理全基因组测序的数据,相信是每个人的愿望。如今,一个开源的基因组分析平台也许能满足你的愿望。 这个平台被称为SpeedSeq,由华盛顿大学医学院等机构的研究人员开发。它利用低成本的
Nature新闻:逆境对儿童基因组的影响
科学家们对九岁的儿童进行研究发现,贫穷和不稳定的家庭环境会缩短他们染色体上的保护结构——端粒。Nature网站专门刊发文章对这项研究进行了报道。 一项针对非裔美国男孩的研究显示,在紧张而充满压力的社会环境中成长,会给儿童染色体留下持久的印迹。端粒是保护染色体末端免遭磨损的重复性DNA序列,
Nature首次解密肚子里的基因组密码
我们身体里含有大量的微生物基因组,数量比我们本身的基因组多得多,一项最新研究表明,我们肚子肠道里的微生物基因组,就如同人类DNA个体之间存在差异一样,也是大不相同。 这项研究是第一个分类记录肠道微生物遗传变异的研究成果,肠道是我们人类摄取营养成分,合成维生素,防止感染,以及生产天然降低炎症
Nature封面文章:测序长臂猿基因组
在完成了对长臂猿(gibbon)基因组的测序和分析之后,科学家们现在更多地了解了这一小型猿类具有快速染色体重组率的原因,提供的一些信息拓宽人们了对于染色体生物学的理解。染色体是细胞功能以及遗传信息跨代传递的基础。染色体结构和功能也与许多的人类遗传疾病,尤其是癌症密切相关。 来自俄勒冈健康与科学
Nature:癌症基因组分析的新浪潮
肺癌与乳腺癌不一样,与胰腺癌也不一样,然而根据发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)的两项最新研究表明在分子水平上它们具有许多相同之处。同日,Nature网站对这一研究成果进行了即时新闻报道 这项“泛癌症”研究针对12种不同类型的肿瘤3000多个基因组进行了分析,寻找跨
Nature:癌症基因组分析的新浪潮
肺癌与乳腺癌不一样,与胰腺癌也不一样,然而根据发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)的两项最新研究表明在分子水平上它们具有许多相同之处。同日,Nature网站对这一研究成果进行了即时新闻报道 这项“泛癌症”研究针对12种不同类型的肿瘤3000多个基因组进行了分析,寻找跨
Nature:饮食快速改变人类“第二基因组”
如果你打算由吃素食转变为吃肉,反之亦然,你的肠道菌群组成也会发生重大的改变。发表在12月11日《自然》(Nature)杂志上的一项新研究表明,在一日之内由正常饮食转变为只吃动物性食物或植物性食物,也会改变细菌的数量和种类,甚至是细菌的行为方式。 “不仅不同细菌的丰度会发生改变,它们表达的基
Nature文章:惊人的基因组相似性
蝙蝠和海豚独立地进化出各自的回声定位系统。尽管它们的声呐感官系统起源及机制不同,但似乎有一些相似的基因参与其中。现在发表于9月4日《自然》(Nature)杂志上的一项新研究证实蝙蝠和海豚基因组有一些相似的序列改变,表明这样的遗传趋同(genetic convergence)其范围远比原以为的
Nature-Genetics:全基因组测序的诊断价值
根据《Nature Genetics》上发表的一项新成果,全基因组测序有望用于临床上的遗传病诊断。这项研究评估了影响全基因组测序在临床诊断中取得成功的因素。 这个国际研究小组由英国的研究人员领导,对156个病例或家庭开展了临床基因组测序。这些病例有着遗传疾病的特征,但无法通过之前的筛查检测来解
Nature:全基因组测序重新定义癌症之王基因组突变蓝图
近日,一项发表于国际著名杂志Nature上的研究论文中,来自英国和澳大利亚的研究人员对100位胰腺癌患者癌症组织的基因组进行了深入分析,结果发现了4种不同的亚型,这或许可以帮助后期开发治疗胰腺癌患者的新型疗法。文章中研究人员利用全基因组测序技术揭示了肿瘤基因组结构性改变的光谱模式,该技术可以帮助
Nature-Biotechnology定义病毒基因组标准:何谓高质量基因组
据说,地球上的微生物总量超过了银河系中的恒星数量,而且病毒总量也要比之前预计的多得多。 在最新的Nature Biotechnology杂志上,美国能源部(DOE)联合基因组研究所(JGI)构建了重要的病毒序列数据库,同时提出了病毒基因组标准,指出了三类基因组质量的分级。 目前虽然许多病毒未
复旦大学修发贤Nature:发现三维量子霍尔效应!
量子霍尔效应研究的重要性 量子霍尔效应是20世纪以来凝聚态物理领域最重要的科学发现之一,迄今已有四个诺贝尔奖与其直接相关。但一百多年来,科学家们对量子霍尔效应的研究仍停留于二维体系,从未涉足三维领域。 给电子“定规矩”三维量子霍尔效应真的存在吗? 农贸市场往往热闹非凡,熙熙攘攘的人群四处拥
复旦大学最新Nature文章:癌症与糖尿病之间新通路
近年来临床研究发现,糖尿病患者患癌症的比率已明显高于非糖尿病患者,而治疗糖尿病的药物二甲双胍也在降低癌症风险上展现出优良成效。在糖尿病和癌症这两种疾病之间,是否存在着某种仍未被科学研究发现的联系?为何防治糖尿病的药物二甲双胍也能够在预防癌症的舞台上大显身手? 最近,来自复旦大学生物医学研究院,