减少单细胞分析不确定性的新方法

看似相似的细胞往往有显著不同的基因组。这通常也适用于癌细胞,例如,即使在很小的肿瘤样本中,癌细胞也各不相同,因为细胞内的遗传突变,是断断续续地传播。关于单个细胞中这些突变(被称为拷贝数变化)的详细知识,可以帮助医生制定特定的治疗方案。 问题在于,目前获取这方面知识的技术还比较困难,并会产生不可靠的结果。九月七日,美国冷泉港实验室(CSHL)的科学家,发表了一种新的交互式分析程序,称为Gingko,可减少单细胞分析的不确定性,并提供了一种简单的方法,可视化细胞群体之间拷贝数突变的模式。 这个开放源软件是自由在线的,将提高科学家研究这一重要遗传异常的能力,可以帮助医生根据细胞的特定基因突变,更好地制定治疗方案。该软件发表在九月七日的《Nature Methods》。 突变以多种形式出现。例如,在最常见的突变类型中,变异可能存在于个人(或细胞)之间,在一段DNA序列中的某个位置。另一个常见的突变是拷贝数变异(CNV),在这种......阅读全文

《细胞》:人类基因突变“冷热不均”

  人类基因组中并不是所有的碱基都容易发生突变,基因组也会出现“冷热不均”的现象,近期一研究组发现了获取DNA新生突变集群的方法,并指出这种单碱基对变化出现的可能性相差了三个数量级。牛津大学的Chris P. Ponting对此进行了深入评点。   父母生殖细胞形成时所发生的胚系de novo

单细胞基因组突变检测新突破

  爱因斯坦研究人员已经开发并验证了一种准确识别单细胞基因组中突变的方法。这种新方法可以帮助预测癌症是否将在看似健康的组织中发展,在今天的自然方法的在线版本中发表的论文中被描述。相应的作者是Lola和Saul Kramer分子遗传学主席Jan Vijg博士。  在科学家可以分析单个细胞的基因组之前,

哺乳动物细胞基因突变试验

  哺乳动物体外培养细胞的基因正向突变试验常用的测试系统有小鼠淋巴瘤L5178Y细胞,中国仓鼠肺V79细胞和卵巢CHO细胞的三个基因位点的突变,即次黄嘌呤磷酸核糖转移酶(HGPRT)、胸苷激酶(TK)及Na+/K+ATP酶(OUA)位点。HGRPT和Na+/K+ATP酶位点突变可用于上述三种细胞,O

首次全面单细胞分析表明:心力衰竭由不同基因突变引起

  一个国际联盟在《科学》杂志上发表论文称,个体遗传缺陷以不同方式导致心力衰竭。该研究基于对健康和衰竭心脏的心脏细胞进行的首次全面单细胞分析,从而确定导致心肌病患者心力衰竭的分子和细胞机制是由每位患者携带的特定基因变异体决定的。  由来自北美、欧洲和亚洲6个国家的53名科学家共同开展的研究表明,细胞

基因突变

  基因组DNA分子发生的突然的、可遗传的变异现象叫做基因突变。基因突变是变异的主要来源,也是生物进化发展的根本原因之一。从分子水平上看,基因突变是指基因在结构上发生碱基对组成或排列顺序的改变。基因虽然十分稳定,能在细胞分裂时精确地复制自己,但这种稳定性是相对的。在一定的条件下基因也可以从原来的存在

DNA基因突变的过程和结果分析

突变是指生物体、病毒或染色体外DNA基因组核苷酸序列的改变。包括哪怕是只有一个碱基变化的碱基替换、DNA插入、DNA缺失或DNA重复引起的序列的改变  。一些突变是可遗传的,生殖细胞发生的突变可以遗传给后代。发生在非生殖细胞即体细胞的突变,称为体细胞突变,是非遗传的突变。DNA复制过程出错可以导致突

基因突变实例镰刀型细胞贫血症

(1)症状 红细胞由正常的圆饼状变成镰刀型,导致红细胞不能顺利通过毛细血管聚集在一起,红细胞破裂(溶血),造成贫血。(2)病因 基因中的碱基替换。 直接原因:血红蛋白分子结构的改变 根本原因:控制血红蛋白分子合成的基因结构的改变。

-利用肿瘤细胞的基因突变制备癌症疫苗

  个性化疫苗为治疗多对基因突变引发的癌症提供新的选择。  在一个小型临床试验中,利用在肿瘤细胞中的突变蛋白所制备的疫苗成功地引发了机体对癌细胞的免疫应答反应。  该结果是目前致力于研发个性化癌症治疗所得出的最新成果,并公布于4月2日的科学(Science)杂志中。在此次试验中,三位恶性黑色素瘤患者

关于致突变试验—哺乳动物细胞基因突变试验的介绍

  哺乳动物细胞基因突变试验—哺乳动物体外培养细胞的基因正向突变试验常用的测试系统有小鼠淋巴瘤L5178Y细胞,中国仓鼠肺V79细胞和卵巢CHO细胞的三个基因位点的突变,即次黄嘌呤磷酸核糖转移酶(HGPRT)、胸苷激酶(TK)及Na+/K+ATP酶(OUA)位点。HGRPT和Na+/K+ATP酶位点

新算法比较分析可搜索癌症基因突变

  桑福德伯翰医学研究所(Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute,SBP)承担了前所未有的对一个新兴算法类别的比较分析,该算法通过聚焦内部基因结构,在癌症数据库中挖掘遗传信息(即亚基因像素算法),这与专注于基因视其为单个单元的经典方法形成

颅锁骨发育不全及基因突变分析

颅锁骨发育不全(cleidocranial dysplasia,CCD)也称Scheuthauer-Marie-Sainton综合征或颅锁发育不良,1871年由Scheuthauer首先准确地描述该综合征,其特征为发育异常的骨骼及牙齿,是一种常染色体显性遗传疾病。CCD的发生率约为1︰1 000 0

基因定点突变知识

实验原理基因定点突变是指通过聚合酶链式反应(PCR)等方法改变目的基因的序列,包括碱基的插入、缺失、点突变等。基因定点突变是基因研究中比较常用的方法,可以短时间内研究目的DNA所表达的目的蛋白的性状及表征。定点突变需要设计特定的突变引物。引物长度一般为25-45 bp,建议选择30-35bp长度

基因突变竟能阻止细胞氧化!延长寿命!

  大多数老年疾病的发生与一些特定蛋白的激活密切相关,近日,英国研究人员发现了一种可以停止这类蛋白激活,进而预防老年疾病发生的新方法。  英国萨里大学,雷丁大学,科隆大学以及皇家伯克希尔医院的化学家们发现了一种对于老年疾病预防至关重要的多态性单核苷酸。这种特定变异在很大程度上帮助他们的携带者避免了老

基因突变的诱变机制自发突变

所谓自发突变是指未经诱变剂处理而出现的突变。从诱变机制的研究结果来看,自发突变的原因不外乎以下几种。①背景辐射和环境诱变。短波辐射在宇宙中随时都有,实验说明辐射的诱变作用不存在阈效应,即任何微弱剂量的辐射都具有某种程度的诱变作用,因此自发突变中可能有一小部分是短波辐射所诱发的突变,有人估计果蝇的这部

基因突变的诱变机制移码突变

诱发移码突变的诱变剂种类较少,主要是吖啶类染料(图6)。这些染料分子能够嵌入DNA分子中,从而使DNA复制发生差错而造成移码突变。

基因重组和基因突变区别

1、基因突变是基因的从无到有,突变产生新基因。基因重组是原有基因的重新组合,产生的是新基因型。2、发生的时间:基因重组发生的时期是:减数分裂中四分体时期同源染色体的非姐妹染色单体之间的局部交换和减数diyi次分裂后期非同源染色体的而重新组合;基因突变发生的时间是在有丝分裂和减数分裂的间期。

基因突变致蛋白质合成异常分析(五)

   表4-2选择性免疫蛋白缺乏症分型IgA缺乏症选择性IgA缺乏症共济失调-毛细血管扩张症Nezelof综合症慢性皮肤粘膜念珠菌病SIgA(分泌型)缺乏症IgA缺乏症IgA缺乏症选择性IgM缺乏症Wiskott-Aldrich综合征IgE缺乏症IgA-IgM缺乏症IgA-IgG缺乏症L链缺乏症  

基因突变致蛋白质合成异常分析(一)

   蛋白质性质是由DNA分子上碱基数量和顺序决定的。如果DNA分子的碱基数量或顺序发生变化,由它编码的蛋白质结构就发生相应的改变。由于基因突变导致蛋白质分子质和量异常,从而引起机体功能障碍的一类疾病称为分子病(molecular disease)。  分子病种类很多,根据各种蛋白质的功能可将分子病

Nature-genetics:突变基因分析为不治血癌带来新希望

  近日,来自美国斯坦福大学医学院的研究人员在国际学术期刊nature genetics发表了一项最新研究进展,他们在病人基因组中发现了一组可能促进一种罕见免疫细胞癌发生的基因突变。目前这种叫做皮肤T细胞淋巴瘤的疾病仍是一种不治之症,至今还没有发现有效的治疗方法,而这项研究的结果或可为该疾病治疗带来

基因突变致蛋白质合成异常分析(七)

   2.抗凝血因子缺乏症  (1)遗传性抗凝血酶Ⅲ缺乏症:抗凝血酶Ⅲ(antithrombin Ⅲ,ATⅢ)对凝血酶Xa有抑制作用,肝素能加速其对凝血酶的抑制。其次,ATⅢ还有抑制Ⅸ、Ⅺ及Ⅻ的功能。  遗传性抗凝血酶Ⅲ缺乏症(hereditary antithrombin Ⅲ deficiency

基因突变致蛋白质合成异常分析(三)

   2.地中海贫血由于珠蛋白基因缺失或突变导致某种珠蛋的链合成障碍,造成α链和β链合成失去平衡面导致的溶血性贫血称为地中海贫血(thalassemia)。根据合成障碍的肽链不同可把地中海贫血分为α和β地中海贫血两类。此外还有少见的δβ和γβ地中海贫血。  (1)α地中海贫血(α-thalassem

基因突变致蛋白质合成异常分析(六)

   目前已知的DMD基因突变主要为缺失型,约占病例的50%-60%;重复(duplication)次之,约占6%,有两个缺失热区:即5’端的第4-21外显子(占缺失的20%);另一为第45-52外显子(占54%-60%)。内含子44约160-180kb,断裂频率最高,缺失导致移码突变者,多数会引起

基因突变致蛋白质合成异常分析(二)

  (二)血红蛋白病的分类和分子基础  血红蛋白病可分为两大类,即异常血红蛋白病和地中海贫血。  1.异常血红蛋白病 异常血红蛋白(abnormal hemoglobin)是指由于珠蛋白基因突变导致珠蛋白肽链结构异常,如有临床表现者称为异常血红蛋白病或异常血红蛋白综合征。至今全世界已发现异常血红

基因突变致蛋白质合成异常分析(四)

  ②轻型β地中海贫血:患者是β+地贫、β0地贫或δβ0地贫的杂合子,基因型分别为β+/βA、β0/β+和δβ0/βA。这类患者由于还能合成相当量的β链,所以症状较轻,贫血不明显或轻度贫血。本病特点是HbA2升高(可达4%-8%)或(和)HbF升高。  ③中间型β地中海贫血:患者通常是某些β地贫变异

Nature:新型单细胞分析技术揭示干细胞中的复杂突变

  近日,来自波士顿儿童医院等处的研究人员利用新型的单细胞基因分析技术揭示了多能干细胞的多种遗传突变,相关研究刊登于国际著名杂志Nature上,为后期开发治疗疾病的新型再生性疗法提供了一定的帮助和希望。  研究者James Collins表示,在单一细胞之间干细胞群体会包含许多差异,而这在干细胞工程

CALR基因突变阳性的红细胞增多症病例报告

CALR基因突变多见于骨髓增殖性肿瘤(my - eloproliferative neoplasms,MPN)中的原发性血小 板增多症(ET)和原发性骨髓纤维化(PMF)患者, 在真性红细胞增多症(PV)患者中罕有报道。我院 收治 1 例红细胞增多症患者,骨髓基因检测为 CALR基因突变阳性,现报告

基因突变的概念

基因组DNA分子发生的突然的、可遗传的变异现象(gene mutation)。从分子水平上看,基因突变是指基因在结构上发生碱基对组成或排列顺序的改变。基因虽然十分稳定,能在细胞分裂时精确地复制自己,但这种稳定性是相对的。在一定的条件下基因也可以从原来的存在形式突然改变成另一种新的存在形式,就是在一个

基因突变-萨摩耶牙疼

   SCL24A4基因的突变,能导致萨摩耶牙釉质发育不良。美国加州大学伴侣动物健康中心科学家近日将相关论文刊登于开放获取期刊《犬类遗传学与流行病学》。  携带这一突变的狗狗牙齿会褪色、变形,并可能牙齿脱落、牙齿严重侵蚀和牙根感染。于是,研究人员设计了一个检测,让狗育种者可以在育种过程中有选择性地剔

基因突变的特性

  随机性:基因突变的发生是随机的,没有固定的规律可循。  不定向性:基因突变可以影响DNA序列的任何部分,包括编码区和非编码区。  有害性:大多数基因突变对生物体是有害的,可能导致疾病或死亡。只有少数突变对生物体是有益的。  可逆性:一些基因突变是可以逆转的,例如DNA修复机制可以修复某些突变。 

如何检测基因突变?

  PCR扩增和测序:PCR扩增可以快速扩增目标DNA片段,然后通过测序技术对扩增产物进行序列分析,从而检测出基因突变。  基因芯片:基因芯片是一种高通量的基因检测技术,可以同时检测多个基因的突变情况。  毛细管电泳:毛细管电泳是一种分离和分析DNA片段的技术,可以通过比较不同样本的DNA片段长度和