Nature子刊:当前分析方法会遗漏肿瘤中复杂突变

一项新研究表明,当前的基因组分析方法会系统性地错过检测癌症患者肿瘤中某种类型的复杂突变。此外,相当大比例的这些复杂突变存在于可被一些现有药物靶向的、众所周知的癌基因中,这有可能会扩大受益癌症患者的数量。 这项来自华盛顿大学医学院的研究发布在12月14日的《自然医学》(Nature Medicine)杂志上。 这篇论文的资深作者是华盛顿大学McDonnell基因组研究所助理主任、医学副教授丁莉(Li Ding)博士。丁莉博士说:“不必在患者肿瘤中捕捉可靶向的突变是一种毁灭性的想法。我们开发出了一种软件工具来发现在癌症基因组研究中一致错漏的某种遗传错误。我们在一些至关重要的癌基因组鉴别出了大量这样的事件。能够发现这些事件对于癌症研究和临床应用至关重要。” 基因组中的突变以各种方式产生。也许最简单的是DNA密码的单个“碱基”发生改变。更为复杂的突变类型涉及删除或插入一些碱基。在新研究中针对8,000癌症病例,研究人员将焦点放......阅读全文

《Cell》:如何根据癌症基因组图谱分析肿瘤

  时至今日,这一计划已经取得了许多成果,最新Cell杂志公布了泛癌症图谱(Pan-Cancer Atlas),这也是癌症基因组图谱(TCGA)的收官项目,同期Cell杂志介绍了根据癌症基因组图谱分类的肿瘤类型列表,以及相关的一些主要发现(每种肿瘤类型的标记论文)。  生物通报道:2005年美国国立

癌症研究人员联手汇集肿瘤基因组数据

   研究人员希望,数据分享将为利用诸如这些脑部腺癌细胞等肿瘤的基因组信息带来更好的方法。  这是为大型癌症研究中心的很多病人提供的最新希望:“让我们测序你的肿瘤,或许我们能将其同击败这种恶性疾病的药物匹配。”不过,现实是基因组分析仍然仅为癌症病人提供了一小部分帮助。“我们多半时候不知道如何处理这些

-【Cell综述】从癌症基因组到精准肿瘤学

  迅速发展的基因组技术让有限的肿瘤活检材料获得更广泛的分子分析,从而促进更广泛地实施个性化癌症治疗。以基因组为基础通过不同肿瘤的患者分类化目前还不太可能取代在解决临床需要时对组织来源的考虑,包括开发和实施新的合理目标的肿瘤疗法。  1是否要再分类  在本综述的讨论中考虑以基因组为基础的病人分类,要

肿瘤微环境分析指导癌症治疗

  在免疫疗法时代,癌症生物学家依靠新一代工具来了解肿瘤和免疫细胞之间的相互作用是如何影响疾病进程的。  虽然Sean Bendall是一名病理学家,但最近却成了一名图谱制作者,他使用尖端的蛋白质绘图技术来描绘出肿瘤组织的变幻莫测的景观。  这项技术由Bendall在加州斯坦福大学(Stanford

数字PCR技术精确检测癌症基因组扩增

  来自斯坦福大学以及Bio-Rad的研究人员证实,数字PCR系统能够精确测定长期存放的癌组织样本中的癌症基因组扩增。该研究成果发表在《Translational Medicine》杂志上。   某些拷贝数变异(如基因组扩增)可能导致特定癌基因的过表达,推动癌症发展。靶定扩增的癌基因有望实现癌

Nature对儿童癌症基因组分析,有望实现儿童癌症精准治疗

  在一项新的研究中,来自美国圣犹大儿童研究医院等研究机构的研究人员证实患有癌症的儿童和成年人通常具有不同的发生突变的基因来促进疾病产生,这提示着这些患者可能受益于不同的疗法。这一发现强调了对儿童癌症进行精准医疗的必要性。相关研究结果于2018年2月28日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“P

Nature:癌症基因组分析的新浪潮

  肺癌与乳腺癌不一样,与胰腺癌也不一样,然而根据发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)的两项最新研究表明在分子水平上它们具有许多相同之处。同日,Nature网站对这一研究成果进行了即时新闻报道   这项“泛癌症”研究针对12种不同类型的肿瘤3000多个基因组进行了分析,

大型研究为癌症基因组分析奠定基础

  12月9日,国际癌症基因组协会(ICGC)在著名的《Nature Communications》杂志,发表了一篇令人瞠目的文章,它为即将到来的癌症基因组学研究时代,奠定了基础。该项目,是由Centro Nacional de Analisis Genómico (CNAG-CRG)和German

Nature:癌症基因组分析的新浪潮

  肺癌与乳腺癌不一样,与胰腺癌也不一样,然而根据发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)的两项最新研究表明在分子水平上它们具有许多相同之处。同日,Nature网站对这一研究成果进行了即时新闻报道   这项“泛癌症”研究针对12种不同类型的肿瘤3000多个基因组进行了分析,寻找跨

透过大规模基因组分析推出-泛癌症图谱-开启癌症治疗

  【Technews科技新报】美国国立卫生研究院(NIH)资助的研究团队已经完成了一份详细的基因组分析,这个被称为泛癌症图谱(PanCancer Atlas)的研究结果收录了 27 篇论文,并包含了 33 种癌症、1 万多个种不同肿瘤分子和临床讯息的数据资料。   泛癌症图谱主要是针对癌症基因组

循环肿瘤细胞检测新技术,让癌症检测更快、更准

  在癌症诊断与治疗中,医生通常是利用活组织检查来进行确诊并跟踪治疗效果。这种方法不仅会给患者带来创伤,而且价格昂贵。循环肿瘤细胞(Circulating Tumor Cell, CTC)检测打破了这一僵局。CTC是存在于癌症患者血液循环系统中的游离癌细胞,被认为是癌症生长、转移的一个重要因素。近年

肿瘤无创诊断技术在癌症检测中应用

 肿瘤无创诊断技术即液体活检(liquid biopsies)的出现,标志着人类在攻克肿瘤的道路上又前进了一大步。2015年液体活检技术被MIT科技综述杂志(MIT Technology Review)评为年度十大突破技术之一;2017年6月,世界经济论坛与《科学美国人》杂志的专家委员会联合选出的2

肿瘤无创诊断技术在癌症检测中应用

  肿瘤无创诊断技术即液体活检(liquid biopsies)的出现,标志着人类在攻克肿瘤的道路上又前进了一大步。2015年液体活检技术被MIT科技综述杂志(MIT Technology Review)评为年度十大突破技术之一;2017年6月,世界经济论坛与《科学美国人》杂志的专家委员会联合选出的

国际癌症基因组联盟公布逾1万个癌症基因组数据

  国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium,简称"ICGC")近日向科研界公布了超过1万个癌症基因组的数据。这些数据能更好地帮助全世界的癌症研究者从基因方面了解癌症,加快对癌症的研究并帮助更多癌症靶向治疗的发展。   安大略癌症研究所所

ASCO-2014:“肿瘤基因组分析:未来出路或TMI?”

  2014美国临床肿瘤学会(ASCO)年会召开,吸引了世界各地逾25000名肿瘤专业人员参与,精彩不断。汤森路透旗下BioWorld对ASCO 2014进行了跟踪报道,希望为国内关注肿瘤领域的药物工作者带来此重大会议报告中的最新消息。本文为第一篇跟踪报道,后续系列报道将陆续推出。  是否值得投入大

海龟肿瘤类似人类癌症

  本报讯 一项研究发现,海龟肿瘤和人类癌症拥有类似的遗传脆弱性,这意味着人类癌症疗法或可用于治疗海龟肿瘤。 海龟种群目前面临灭绝威胁,海龟纤维性乳突瘤症(一种具有潜在致命性的恶性肿瘤)削弱了人类的保育措施效果。人为造成的栖息地恶化等问题促使这种肿瘤病毒和其他新出现的传染

海龟肿瘤类似人类癌症

  一项研究发现,海龟肿瘤和人类癌症拥有类似的遗传脆弱性,这意味着人类癌症疗法或可用于治疗海龟肿瘤。  海龟种群目前面临灭绝威胁,海龟纤维性乳突瘤症(一种具有潜在致命性的恶性肿瘤)削弱了人类的保育措施效果。人为造成的栖息地恶化等问题促使这种肿瘤病毒和其他新出现的传染病在野生生物中传播扩散。  对于该

癌症蛋白在基因组和肿瘤抑制过程中扮演的关键角色

  近日,一项刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自美国威斯达研究所的科学家们通过研究发现,DNA复制后,ARID1A肿瘤抑制蛋白能够帮助维持端粒的内聚和染色体的分离,相关研究结果表明,ARID1A突变的细胞或会经历与细胞生存不相容的基因组改变,这或许也能够解释

美印药物基因组学与癌症基因组学检测商业化

美国Companiondx实验室拟与健康信息技术服务商Enable Healthcare合作,向医生推广药物基因组学检测;印度癌症医学公司HCG宣布建立一个新的肿瘤基因中心,旨在下代测序技术能够帮助定位肿瘤,从而提高化疗和放疗的效率和响应率  美国药物基因组学检测商业化  Companiondx实验

美研究质疑癌症患者肿瘤基因检测的准确性

  随着基因组测序成本快速下降,许多医生开始根据对肿瘤的基因检测结果来治疗癌症患者。但美国研究人员15日警告说,这种检测会具有误导性,约一半癌症患者的治疗可能不会有效果。  这项发表在美国《科学转化医学》杂志上的研究报告解释说,癌症患者肿瘤中的许多基因突变实际上与癌症并无关联,它们是所谓的生殖系突变

复杂肿瘤全基因组异常的检测难题得以解决

  中国科学技术大学信息科学与技术学院副教授李骜研究组以原创性论文(Original paper)的形式,在Bioinformatics上在线发表了最新研究成果。论文的第一作者是博士生余振华。   基因组异常是多种恶性肿瘤的标志性特征,在肿瘤发病机理、临床诊断和治疗等研究中具有极为重要的作用。传

Cancer-Res:肿瘤细胞与癌症?

  肿瘤中的细胞并不都是一样的,这些肿瘤细胞在生长和患者治疗的整个阶段会产生不同的遗传突变,同时也会表现出不同的特性,这些差异就使得肿瘤非常难以对付,从而往往会产生因许多恶性肿瘤细胞而导致的肿瘤耐药性的发生。近日,发表于国际杂志Cancer Research上的研究论文中,来自莫非特癌症研究中心的研

“癌症”就是恶性肿瘤吗?

一般人们所说的“癌症”习惯上泛指所有恶性肿瘤。癌症具有细胞分化和增殖异常、生长失去控制、浸润性和转移性等生物学特征,其发生是一个多因子、多步骤的复杂过程,分为致癌、促癌、演进三个过程,与吸烟、感染、职业暴露、环境污染、不合理膳食、遗传因素密切相关。

Maintrac分析法检测肿瘤细胞

化疗效果是癌症治疗过程中关键所在,也是令患者和医生都感到困惑的问题。本文介绍了一种创新的Maintrac分析法,能在早期治疗中帮助医生选择适合的个性化治疗方案,以期达到更好的疗效。 德国癌症病患的数量每年都在不断增加,根据罗伯特科赫研究所数据显示:每年约有高达450000人罹患癌症。对患者

肿瘤基因检测及病例分析-(二)

2019年8月29日,取肺部穿刺活检组织送检“圣维尔实体瘤50基因检测”。标本经质控合格,标本最终测序深度为6275X,测序质量评估合格。2019年9月6日出具基因检测结果显示:MET基因14号外显子突变(突变频率14.9%)及FGFR3基因5倍扩增。2019年9月17日开始进行靶向治疗,口服Cap

肿瘤基因检测及病例分析-(一)

前言基因检测是一种通过血液、其他体液或细胞来检测DNA的技术。先从被检测者提取其外周血或组织细胞,然后将里面的基因信息扩增,再通过专业设备检测其中的DNA分子信息,分析基因类型和存在的基因缺陷,也可判断其表达功能是否完整。随着个体化医学的发展和"精准医学"概念的提出,肿瘤基因检测技术发展迅速。传统的

癌症检测

什么是肿瘤标志物  肿瘤标志物是由肿瘤细胞产生的,存在于细胞.组织或体液中,能用化学或免疫方法定量、证明癌肿存在(或在某一脏器存在)、可以监测肿瘤治疗和预后的物质。有的肿瘤标志物在正常人体内不存在,罹忠癌症后才会出现,有的则是罹患癌症后水平会显著高于正常人,因此,肿瘤标志物检查可以检测到早期癌症的踪

Cell年度综述:癌症基因组入选

  Cell杂志创刊于1976年,现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一,并陆续发行了十几种姊妹刊,在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。近期Cell杂志盘点了2013年度最佳综述及最佳论文,其中热门技术CRISPR也登上了榜单,相关论文描述了利用基因调控系统 CRISPR/Cas,一步

Science专题:癌症基因组学

  在2001年完成人类基因组测序后,许多的研究人员立即将目光放到了利用这些信息来更好地了解遗传学上。最近,越来越多的研究确定了表观遗传学在癌症的发生、形成及发展过程中起效应。从鉴别与遗传性癌症相关的单基因变异的前基因组时代转向,测序技术的进步使得研究人员能够利用全基因组方法来检测基因组间的差异,以

Nature公布800个癌症基因组

  来自癌症基因组计划的科学家们近期报告了他们最新的癌症基因组研究成果,他们公布了800个乳腺癌的遗传特征,包括发现了导致乳腺癌最常见的形式的遗传原因,为新的治疗靶点提供线索,并确定乳腺癌和卵巢癌一种亚型之间的分子遗传相似性。   这项研究结果有助于更全面的了解每种乳腺癌亚型背后的分子机制,相关成