赵要风:“点线面”结合使科研“一加一大于二”

近日,第六届世界动物功能基因组研讨会在意大利召开,与会的科学家讨论了如何利用基因组学等工具研究动物基因功能,以及如何将这些研究结果用于动物品种改良或培育。 在我国,也有一支团队活跃在农业动物功能基因组研究的科学前沿。 他们研发出新产品9个,中试线1条,新技术、新工艺、新材料15项;申请ZL64项,研究制定技术标准1项,完成研究报告、论文239篇,获得国家科技进步奖二等奖1项;培养研究生190人,博士后4人;京粉2号蛋鸡的示范推广面积可达9000万只,湘村黑猪已在湖南省全面推广应用,推广面积可达34万头,西南大学育成审定家蚕新品种2对…… 这就是863计划“主要农业动物功能基因组学研究与应用”项目,自2013年启动以来所取得的成绩。该项目下设七个子课题,共涵盖了猪、鸡、牛、羊、家蚕等五种主要经济动物。 “牵头单位根据项目的任务内容、预期目标按照‘点、线、面’相结合的原则,根据课题承担单位的条件优势和学术专长,对任务进......阅读全文

药物基因组学发展和应用【二】

 药物基因组学为临床医生和临床药师提供了很大程度上改善几百万患者药物治疗效果的机会。但是,这个机会的利用却受到阻碍和挑战,并且新的知识还在不断的更新。    药物代谢酶的基因多态性    一、I相代谢酶    人类细胞色素P450(CYP459)超家族在诸多药物的代谢中发挥着重要作用,CYP

基因组学为生物学家们揭示软体动物神经系统演化的奥秘

  本周的英国《自然》杂志在13日公开的基因学论文中,发表了章鱼的基因组序列,为生物学家们提供了一个机会,得以深入了解这一类神奇生物复杂神经系统的演化过程。  章鱼属于软体动物门头足纲,它的“伙伴”还包括鱿鱼和墨鱼,都是有着丰富而复杂行为的积极捕食者。在无脊椎动物当中,它们拥有多个引人注目的形态特征

条件基因剔除转基因动物

实验概要本文介绍了条件基因剔除转基因动物技术。条件基因剔除转基因动物技术把靶基因的灭活限定于特定时间和某一特定组织细胞内,这将使基因剔除技术具有更大的应用价值。实验步骤1. 条件基因剔除技术    1) 重组酶真核系统所广泛用的4种位点特异重组系统包括:       a. P1噬菌体的Cre/Lox

完全基因剔除转基因动物

实验概要本文介绍了完全基因剔除转基因动物的方法。完全基因剔除(entirely knock-out):又称基因敲除、基因打靶,指应用一段与胚胎干细胞染色体上的一段序列具有高度同源性的外源DNA,通过同源重组直接将靶基因在动物个体中的活性完全消除,来观察靶基因失活、不表达的情况下会对动物个体产

基因组学助力芸薹属抗性基因挖掘与育种

  芸薹属包含许多重要的蔬菜、油料和饲料作物,如白菜、甘蓝、油菜、芥菜等。与其它农作物一样,芸薹属作物在生产中不断受到病毒、细菌和真菌等的侵害,造成巨大经济损失。  近日,《园艺学研究》在线发表了中国农业科学院蔬菜花卉研究所甘蓝课题组方智远院士团队的综述文章。该文针对芸薹属作物主要病害芜菁花叶病毒病

杂交稻基因组学研究获进展

  中科院上海生科院植物生理生态研究所韩斌院士课题组联合中国水稻所杨仕华等团队,在杂交稻基因组学及杂种优势遗传机制研究中获重要进展,2月5日,相关成果在线发表于《自然—通讯》杂志。  据介绍,杂交水稻育种技术的成功是我国近几十年来取得的一项重要科技成就。伴随着汕优63、两优培九等一大批高产杂交稻品种

杂交稻基因组学研究获进展

  中科院上海生科院植物生理生态研究所韩斌院士课题组联合中国水稻所杨仕华等团队,在杂交稻基因组学及杂种优势遗传机制研究中获重要进展,2月5日,相关成果在线发表于《自然—通讯》杂志。  据介绍,杂交水稻育种技术的成功是我国近几十年来取得的一项重要科技成就。伴随着汕优63、两优培九等一大批高产杂交稻品种

高原鱼类进化与功能基因组学科组

  青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii),隶属于鲤科裂腹鱼亚科,是国家二级保护动物,仅分布于典型高原咸水湖泊—青海湖中,是维持青海湖“水-鸟-鱼”生态链稳定的核心物种。青海湖裸鲤是鲤科鱼类中唯一一种适应青海湖高盐碱水环境的自然群体,是研究高原鱼类适应进化的良好素材。青海湖裸鲤

家犬基因组学研究获新进展

  科学界对于家犬的起源和驯化一直争议不断。近日,中科院院士张亚平带领团队发现,家犬中亚起源的假说与基于全基因组重测序数据分析的家犬东亚南部起源模式相冲突。相关成果日前在线发表于美国《国家科学院院刊》。  2015年,美国学者Shannon等人通过分析大量的家犬群体全基因组DNA芯片数据,提出了家犬

Illumina传奇(二):基因组学领域的巨无霸

Illumina的圣地亚哥总部与硅谷的科技园有些相似。走廊上非常明亮,即使是雾天也不例外,空间宽敞可以供员工们工作、喝咖啡和自助用餐,不过食物并不是免费的,这在一定程度上证明了资源被有效利用。高层管理人员与其他人一起在隔间工作,没有专门的办公室。在deSouza担任CEO的第一周,他将行政楼层的隔间

Nature发布比较基因组学研究重要发现

   来自杜克大学医学院、Brigham妇女医院和哈佛医学院的研究人员,发现了一个机制可以解释:一些遗传突变在一种基因组中会致病,而在另一种基因组中则为良性的原因。  在发表于6月29日《自然》(Nature)杂志上的研究论文中,研究人员比较了成千上万的人类致病突变与大约100个动物物种的相似序列。

解决基因组学重要挑战的新工具

  单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术,可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多,但是,仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列,从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前,去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列,还是一个手动和耗时的过程,为了去除污染

基因组学将如何进入日常医学?

  随着大规模的DNA结果越来越多的可供病人和保健提供者使用,医学界在酝酿着一次平静的转换。在一连串的数据当中,医生、顾问和家庭正在梳理如何更好地理解这些信息,并将其用于医疗决策的制定。  最近,在两大儿科医院举行的临床遗传学会议上,来自多家机构的专家提出了他们对于“基因组整合到临床实践”的第一份建

Neogen农业基因组学解决方案(三)

猪的基因组学解决方案GeneSeek 的猪基因组学解决方案为窥探猪的遗传结构打开了一个重要的窗口,包括是否易感染治疗昂贵的疾病以及繁殖中对想要性状的锁定。GeneSeek猪全基因组低密度微珠芯片该微珠芯片提供约 10,000个 SNP,包括经常使用的 USDA血统和身份 SNP、用于识别品种的 SN

Neogen农业基因组学解决方案(二)

遗传异常测试遗传病不仅会导致生产商的经济损失,还会对牲畜造成过大的压力。在接种前的遗传测试可以给生产商提供必要的信息,以做出最佳的接种决定,从而避免遗传病,诸如:•  小腿弯曲(多发性关节硬化症)•  神经性脑积水(NH)•  先天性西昌趾(挛缩性蜘蛛指综合征)•  肺发育不良,并全身水肿(PHA)

2011国际基因组学大会在长春召开

  10月23日,由中科院、吉林省政府主办的2011国际基因组学大会暨中国北方药用物种基因组学转化研究中心成立仪式在吉林省长春市举行。海内外200多名知名专家学者出席大会。   与会专家学者围绕“基因组学时代的机遇与挑战”主题,从“基因组科学”“基因组技术”“基因组信息学与计算生物学”,及“基因组

基因组学推动生命科学大步向前

  2010年下旬,河南安阳曹操墓真伪之辩正酣。而一则来自上海的重磅消息更是引发了多方关注。复旦大学现代人类学教育部重点实验室宣布,向全国征集曹姓男性DNA样本,拟用基因组科学的手段验证出土的头骨是否为曹操本人。   一下子,基因组科学成为热门,这一话题“落入寻常百姓家”。   事实上,伴随着2

美国推动基因组学转向临床医学

  美国政府将用数亿美元积极推动基因组学向临床医学的转化,探索基因组学的新前沿。12月6日,国立卫生研究院(NIH)所属国家人类基因组研究所宣布一项为期4年、资助经费4.16亿美元的新计划经费实施方案,促进该所旗舰项目“大规模基因组测序计划”。该项目致力于探索罕见遗传疾病的起因、加速基因组

研究指出基因组学引领生物育种变革

  记者从近日举行的第五届国际农业基因组会议暨深圳国际食品谷研讨会上获悉,现代农业研究已迈入生物组学大数据时代,特别是基因组学及其衍生技术在生物育种中发挥着重要的引领作用。  基因组学是对生物体所有基因进行集体表征、定量研究及不同基因组比较研究的一门交叉生物学学科。基因组学主要研究基因组的结构、功能

Nature发布单细胞基因组学新技术

  胚胎是如何形成我们肺脏、肌肉、神经和其他组织中的细胞的?一种新的方法可以解码使得胚胎万能细胞能够增殖并转变为机体许多特化细胞类型的遗传指令。   一开始是一团相同的细胞,随着增殖不断地改变形状和功能,最终变为我们肺脏、肌肉、神经和机体所有其他特化组织中的细胞。胚胎拥有这种创造奇迹的能力。  

Neogen农业基因组学解决方案(一)

纽勤农业基因组学: 增强全球食品安全纽勤的子公司GeneSeek 是全球领先的农业基因组学实验室,自1998 年起便开始提供全面的兽医和农业基因组学诊断解决方案。在农产品生产商需要就畜群作出决定时,GeneSeek 可为其提供必要的信息,进而为农场内的食品安全问题提供基因组学解决方案。GeneS

于军:基因组学的未解之谜

  DNA测序技术使我们几乎可以肆无忌惮地获取任何物种和其群体的遗传信息。我们同时也要思考:生物学,尤其是基因组学,还有哪些未解之谜?   “人类基因组计划”开启了诸多前所未有的新学科分支(基因组学、生物信息学、蛋白质组学等),推动了科学研究的平台化和规模化,比如高性能计算和规模化生物学数据获取。

安捷伦科技发布基因组学站式网站

  2010年4月19日,北京 – 安捷伦科技公司(NYSE:A)日前发布了一个全新的的动态基因组学网站,genomics.agilent.com。   此网站将是所有基因组学资源的一站式供应点。用户可在其中找到众多组织有序、易于查找的信息,从最新的科学进展到最热门的产品一应俱全。此网站以一体化网

解决基因组学重要挑战的新工具

  单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术,可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多,但是,仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列,从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前,去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列,还是一个手动和耗时的过程,为了去除污染

协同创新驱动农业基因组学发展

   “作为生物技术领域最基础的学科,农业基因组学研究不仅需要国内外科学家同行的协同创新,更需要与生物技术产业发展需求无缝衔接,才能发挥出农业基因组学的最大潜能。基于这种认识,在国家农业科技创新联盟的框架下,建立农业基因组学的协同创新联盟就显得十分迫切。”中国农科院科技局局长梅旭荣表示。  7月24

英国基因组学研究进展迅速

  随着基因数据的逐渐增多,临床医生能够更好地治疗患者,同时减少医疗事故的发生。英国国家医疗服务体系(National Health Service,NHS)中的许多遗传学中心现在都在使用芯片和外显子测序。  近日,英国卫生大臣Jeremy Hunt和生命科学部长George Freeman将宣布新

转基因动物技术

  从20世纪70年代中期开始,就有人尝试用各种办法向动物体内转移外源基因。如将牛奶成分中特有的基因转移到白鼠体内,这些外来基因在白鼠体内重组后,白鼠分泌的乳汁便含有牛奶成分。这种通过人工方法获得外来基因的白鼠,称为转基因鼠。   转基因动物技术的核心,是把遗传的功能单位──基因转移到动物体内,

宏基因组学技术测序木乃伊的肺结核基因组

  来自华威大学的研究者使用宏基因组学技术发现215年之久的木乃伊的肺结核基因组。   由Mark Pallen带领的研究团队试图用技术来发现组织学标本中的肺结核的DNA。   宏基因组学是一种从样本中检测DNA序列的技术,并且样本不需要培养或扩增。这种方法避免了与细菌培养或DNA扩增

2013国际基因组学大会在青岛召开

  10月29日,由中科院北京基因组研究所、中国遗传学会、中国海洋大学等单位主办的“2013国际基因组学大会”在青岛召开。来自美国、加拿大、德国、瑞士等国家的著名科学家和我国相关领域的知名学者与会,以“基因组学的突破和转化”为主题,交流和研讨基因组学研究的最新进展和成果。  本届大会首次为海洋与水产

美X大奖基因组学挑战赛流产

图片来源:美国国家人类基因组研究所   美国X大奖基金会宣布废止其备受瞩目的奖金为1000万美元的基因组学挑战赛。报名截止时,该比赛仅吸引了两组竞争者参加。不过发言人表示,取消竞赛的决定与参赛人数无关。   7年前,阿康基因组学X大奖高调设立。该奖项旨在通过提供1000万美元奖金,推动医学基因组