流感疫苗是否有效，接种前测测基因表达
流感似乎不是一种很严重的病，但每年会造成25-50万例死亡。预防这种疾病的最有效方法是接种疫苗。不过，尽管流感疫苗接种在整体上很成功，但许多人却未能诱发有效的抗体应答。近日，一项新研究表明，血液中的基因表达谱也许能够预测流感疫苗接种后的应答。 人类免疫学项目联盟（HIPC）和人类免疫学中心的研究人员最近利用基于芯片的基因表达谱分析和RNA测序来追踪一些个体在接种流感疫苗之前和之后的基因表达模式。他们在《Science Immunology》上发表了结果，强调有十几个基因和三个相互关联的基因模块与35岁以下个体的疫苗接种应答相一致。 有意思的是，对于60岁以上的老年人而言，一些相同基因（包括参与炎性免疫的基因）的表达增强却预示着接种疫苗后的抗体应答较差。“我们发现，年轻人和老年人之间的基因和模块水平的基线差异是负相关的，”文章的通讯作者、耶鲁大学的研究人员Steven Kleinstein如是说。 在这项研究中，研究人员......阅读全文
痘苗病毒系统基因表达实验（一）
本节介绍依赖于在哺乳动物细胞质合成噬菌体 T7 RNA 聚合酶的瞬时细胞质表达系统。首先，将感兴趣的基因插入质粒中，使其位于 T7 RNA 聚合酶启动子（PT7）的控制下。应用脂质体转染，重组质粒进入感染了 vTF7-3 的细胞质中，而 vTF7-3 是一种能编码噬菌体T7 RNA聚合酶的重组痘苗病
小鼠βactin基因的克隆表达（4）
实验步骤：（1）诱导靶蛋白表达分别挑取对照菌和重组菌1~2个菌落，接入5ml含Amp（30μg/ml）的LB培养液，37℃振荡培养过夜。取5ml过夜培养物接入500ml含Amp（30μg/ml）的LB培养液，37℃振荡培养2h以上，至对数中期（A550=0.5~1.0）。向诱导管中加入IPTG使其浓
基因表达系列分析实验（SAGE）（三）
58. 用 1：10 000 的 SYBR Green I 染 15 min。在 UV 盒上观察，分出感兴趣的区带。59. 把每一块凝胶放入底部有约 0.5 mm 小洞的 0.5 ml 微量离心管中（用 21-G 针头刺的）。60. 把 0.5 离心管连同凝胶块放入 2.0 ml 的硅烷化的离心管里
基因表达转录调控的主要途径
基因表达转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。
小鼠βactin基因的克隆表达（2）
实验步骤： （1）目的基因与表达载体的连接反应： ①表达载体和目的片段的酶切 管号 ① ② pGEX 4T-1
药物使沉默基因恢复表达
密歇根大学综合性癌症中心研究人员报道，利用药物将一个与癌细胞发育有关基因打开，为治疗癌症带来新的希望。研究结果刊登于在线版《Oncogene》杂志。 Herceptin和Gleevec等流行新药的靶标是引发癌症的遗传突变，但因为控制生长的基因被关闭了，癌症还会复发。即便研究人员可以利用这些关闭的基
基因表达调控的基本规律
过表达，即表达过度，当基因表达（转录）的严格控制被打乱时，基因可能不恰当被“关闭”，或以高速度进行转录。高速转录导致大量mRNA产生，大量蛋白质（protein）产物出现。在RNA聚合酶的催化下，以DNA为模板合成mRNA的过程称为转录。在双链DNA中，作为转录模板的链称为模板链或反义链；而不作为转
基因表达系列分析实验（SAGE）（一）
实验方法原理 实验材料 感兴趣的细胞或组织试剂、试剂盒 糖原EDTA缓冲液SDSBSATween 20连接子T4 DNA 连接酶BsmFIPC8SeeDNA乙酸钠乙醇DMSOPCR引物乙酸铵DNA ladder 聚丙烯酰胺 TBE凝胶DNA参照pZErO-1 质粒TE缓冲SOC培养液Tris · C
RSV感染的基因表达谱分析
发表在11月12日的PLOS Medicine杂志上的一项研究，采用全血基因表达谱分析估测了儿童RSV感染的发病机制和疾病严重程度，揭示了在儿童中由RSV感染引起的免疫反应的系统学调节异常，表明分子标记能够用来预测疾病的严重程度。 呼吸道合胞体病毒(RSV，Respiratory sy
陈鹏博士PNAS基因的表达调控
魔法师的学徒开启了一个输水系统，但是却不能够停止它，很快水浸没到了他的脖子，他陷入到困境中。不同于这个无能的学徒，活细胞具有更好的设计：当它们激活一种基因时，它们就会将一种系统留作备用来关闭基因。细胞不想浪费能源来生成它们不再需要的蛋白。康奈尔大学的研究人员在新研究中确定了细胞利用的两种机制，并
小鼠βactin基因的克隆表达（1）
动物组织RNA的提取实验目的：掌握由动物组织中提取总RNA的方法实验原理：Trizol试剂是一个包含酚、异硫氰酸胍和SDS的单相酸性溶液，其在裂解细胞的同时抑制RNase的活性，随后加入氯仿，酚会大量的溶解在氯仿中。由于DNA和RNA在酸性酚中的溶解性不同，造成DNA分布在下层的氯仿酚溶液中，RNA
TaqMan探针基因表达分析全面升级
TaqMan探针对于大家来说不是什么新名词了，然而你知道吗，对于部分降解的RNA，如福尔马林固定、石蜡包埋（FFPE）样品中的RNA，TaqMan引物探针的设计有更多的讲究，你知道这是为什么吗？FFPE样本在固定时导致核酸相互交联且片段化，RNA片段的大小在50-300 nt，大部分片段在100 n
基因表达调控的定义和方式
基因表达调控是生物体内基因表达的调节控制，使细胞中基因表达的过程在时间、空间上处于有序状态，并对环境条件的变化作出反应的复杂过程。基因表达的调控可在多个层次上进行，包括基因水平、转录水平、转录后水平、翻译水平和翻译后水平的调控。基因表达调控是生物体内细胞分化、形态发生和个体发育的分子基础。
通过qPCR开展基因表达谱分析
一提起基因表达谱分析，大家马上会想到芯片。然而，并不是每个实验室都具备这个条件。现在，利用每个实验室都有的定量PCR仪，也能开展可靠的基因表达谱分析啦。 QIAGEN推出的RT2 Profiler PCR Array是一种高度可靠且灵敏的基因表达谱分析技术，它利用实时定量PC
关于基因表达的折叠的介绍
刚从mRNA序列翻译过来的蛋白质都是未折叠或无规卷曲的多肽,没有任何的三维结构。氨基酸彼此相互作用使得多肽从无规卷曲折叠成其特征性和功能性三维结构。氨基酸序列决定l了蛋白质的三维结构,且正确的三维结构对于功能至关重要,尽管功能蛋白的某些部分可能仍未展开。伴侣蛋白的酶有助于新形成的蛋白质获得折叠,
关于LacZ基因的时空表达介绍
转基因小鼠实验系统已被广泛用于单一基因功能的研究，如组织特异表达和发育程序的调控。产生转基因小鼠最普遍的方法是将DNA通过显微注射注入受精卵的原核中。在研究小鼠胚胎发育过程中外源基因的时空表达方面，将融合基因注射进入小鼠受精卵原核中更是一条行之有效的途径。 通过上述方法，将SV40早期启动子和
基因表达量变化差值是什么
差值是△CT，即是相对于某个内参基因的相对表达量，而不是绝对表达量；在此基础上再进行比值，即△△CT，是（某两个处理之间的）差异表达倍数。
痘苗病毒系统基因表达实验（二）
实验方法原理含有 pT7 控制的外源基因（本实验「重组痘苗病毒（VTF7-3）感染后的脂质体转染」）的重组质粒，通过同源重组可整合到痘苗病毒中,并制备重组病毒储液。将此病毒储液与 vTF7-3 共同感染贴壁或悬浮细胞，在培养过程中，外源基因被高效的 T7 RNA 聚合酶转录，并在感染细胞的细胞质完成
基因表达之RTPCR之我见
在论坛上看到不停地有人在问RT-PCR的问题，实际上在以前的帖子中各位香主和eeflying（我为什么总是提他们？因为还是很佩服的哦，生怕自己说错了，被他们指出来哦）都谈到了很多，鄙人也充大头答了一些问题，但是还是有各种问题，由于的基因表达还有点实战经验（但也技止此而），所以想些点东西给大家参考，计
关于基因表达顺式作用的介绍
顺式作用是生物体进行基因表达调节的方式之一，与“反式作用”相对。顺式作用指的是，调节因子是与被调节基因同处于一条DNA链上的另一端DNA片段而进行的调节。 以二倍体生物为例，对于某一位置的基因，两条同源染色体上会有一对等位基因和一对相应的顺式调节因子。如果其中一个顺式调节因子发生突变而产生
小鼠βactin基因的克隆表达（3）
（2）质粒的提取及酶切鉴定分析 质粒的提取按照质粒提取试剂盒的操作步骤进行，然后进行双酶切鉴定。 管号 ① ② 质粒DNA
基因表达系列分析实验（SAGE）（四）
83. 用作测序的 2 ul PCR 产物（所需的确切用量取决于测序的方案，并应当优化）用下述方法处理：0.1 ul 外切核酸酶 I0.1 ul 虾碱性磷酸酶1.8 ul 50 mmol/L Tris·Cl，pH 8. 0加 2 ul 消化混合液到 2 ul DNA 中。84. 在热循环仪上进行反应
原核表达之目的基因克隆
1. 了解实验课题对目的蛋白的要求包括：目的蛋白分子量有多大，表达目的（是蛋白结晶、药剂结合还是制备抗体，不同目的对蛋白要求不同）；是否要其可溶；是胞内表达还是分泌表达，是组成型表达还是诱导型表达；另外，还要了解蛋白表达后需要采用什么样的方式进行纯化，纯化标签有多大，蛋白纯化后是否需要将标签去除（即
基因表达调控的方式有哪些
基因表达调控分为很多水平：1.DNA和染色体水平：基因丢失、基因修饰、基因重排、基因扩增、染色体结构变化.2.转录水平调控(主要调控方式）：转录起始、延伸、终止均有影响.原核生物借助于操纵子,真核生物通过顺式作...
基因表达调控的方式有哪些
基因表达调控分为很多水平：1.DNA和染色体水平：基因丢失、基因修饰、基因重排、基因扩增、染色体结构变化.2.转录水平调控(主要调控方式）：转录起始、延伸、终止均有影响.原核生物借助于操纵子,真核生物通过顺式作...
优化基因表达的关键因素
在基因表达研究中，研究者比较注意选择合适的表达载体和宿主系统，而往往忽视基因本身是否与载体和宿主系统为最佳匹配这样一个实质性问题。基因的最佳化表达可以通过对基因的重新设计和合成来实现，如消除稀有密码子而利用最佳化密码子，二级结构最小化，调整GC含量等。以下就密码子最佳化、翻译终止效率和真核细胞
p53基因结构及表达
P53基因在人类、猴、鸡和鼠等动物中相继发现后，对其进行了基因定位，人类 P53基因定位于17P13.1，鼠P53定位于11号染色体，并在14号染色体上发现无功能的假基因，进化程度迥异的动物中，P53有异常相似的基因结构，约20Kb长，都由11个 外显子和10个内含子组成，第1个外显子不编码，外
Nature重要论文：大型基因表达图谱
来自艾伦脑科学研究所的科学家们在最新出版的《自然》（Nature）杂志上报告称证实人类大脑具有一致的遗传蓝图，且拥有巨大的生物化学复杂性。这些研究结果来自于对“艾伦人脑图谱库”(Allen Human Brain Atlas)公开提供的大量数据集的首次深入大规模分析。 这项研究的结果是基于对“艾
是什么在控制基因的表达
在生物体的每一个细胞中都含有该生物体的所有遗传物质，但在细胞中并不是所有基因都会成功表达而是在由受精卵发育而来时细胞分化过程中基因中的片段有目的的进行隐藏和表现从而形成不同的组织，形成各自不同的功能特点。遗传物质存在于外显子部分，内含子的作用不明但其所包含的遗传信息几乎没有，如在基因重组工程中为了得
SeqScope剖析所有基因表达
研究潜在疾病基因的研究人员一直受到限制，因为传统的成像技术一次只能研究少数几个基因。 图片来自于论文 组成人类基因组的大约30,000 个基因中包含了对生命至关重要的指令。然而，我们的每个细胞在其日常功能中仅表达这些基因的一部分。例如，心脏细胞和肝细胞之间的差异取决于表达哪些基因——基因