RTPCR一些心得

从RNA到电泳鉴定一、RT-PCR原理:提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA 作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。再以cDNA 为模板,用VI 型胶原蛋白的α1 链的编码序列的特异性引物进行PCR 扩增,而获得目的基因或检测基因表达。RT-PCR 使RNA 检测的灵敏性提高了几个数量级,使一些极为微量RNA 样品分析成为可能。该技术主要用于:分析基因的转录产物、获取目的基因、合成cDNA 探针、构建RNA 高效转录系统。 1)随机六聚体引物:当特定mRNA 由于含有使反转录酶终止的序列而难于拷贝其全长序列时,可采用随机六聚体引物这一不特异的引物来拷贝全长mRNA。用此种方法时,体系中所有RNA 分子全部充当了cDNA 第一链模板,PCR 引物在扩增过程中赋予所需要的特异性。通常用此引物合成的cDNA 中96%来源于rRNA。 2)Oligo(dT):......阅读全文

RTPCR实验步骤

一、组织抽提:1.       取组织块50-100㎎用液氮在研钵中研磨成粉末2.       移入玻璃匀浆器加入1ml Trizol 抽打匀浆3.       移入1.5ml新离心管用5 ml针头抽打4.       冰上孵育5分钟5.       离心12,000g  4℃  5分钟 取上清液移

RTPCR实验步骤

实验材料:水稻叶片的 RNA 。实验原理:目前 PCR 技术只能扩增 DNA 模板,对 RNA 模板不能直接扩增。mRNA反转录生成的 cDNA 可作为 PCR 的模板进行扩增,这种在 mRNA 反转录后进行的 PCR 扩增称为 RT-PCR 。 RT-PCR 比 Northern 杂交更灵敏,对

RTPCR技术1

目前已有多种方法用来研究有关细胞和组织中,基因表达产物方面的内容,这些方法主要有Northern印迹、RNase保护分析法、原位杂交、点印迹、S1核酸酶分析法及反转录与PCR扩增串联的RT-PCR技术等。在这些方法中RT-PCR技术具敏感度高和应用范围广的特点,该技术提供给研究人员有效的进行测定转录

实时-RTPCR-实验

            试剂、试剂盒 RNA 模板 DNA 酶缓冲液 DNA 酶 I DEPC 处理的水 oligo(dT) MgCl2 dNT

实时-RTPCR-实验

本方法使用Superscription反转录系统合成cDNA。进行实时PCR时,FAM或JOE荧光基团既可以标记正向引物,也可以标记反向引物。可以用Trizol试剂提取RNA或按第10章描述的方法提取RNA。样品中的基因组DNA用DNaseI消化掉(参照第10章)。本实验来源于PCR实验指南(第二版

RTPCR经验浅谈

做RNA病毒基因的RT-PCR成败的关键首先在于RNA模板的制备。本人三年前做过一个正链RNA病毒全基因组分段扩增,设计方案是将全基因组分成7个片段,0.6kb-3.3kb不等,分别进行RT-PCR扩增,刚开始的三个月,我们课题组三个人辛辛苦苦,什么招都想过了,结果连一个片段都没有拿到。后来有一个周

RTPCR技术2

三:操作1:反转录反应按下表准备反应液样品 体积 终浓度5×反应缓冲液 10μl 1×dNTP混合液 1μl 0.2mM下游引物 50pmol* 1μm上游引物 50pmol* 1μm25mM MgSO4 2μL 1mMAMV反转录酶 1μl 0.1μ/μlTflDNA聚合酶 1μl 0.1μ/μl

我的实战酶切心得

几个小技巧:1:在做多个同类酶切反应预混液时,水要多加1-5微升(当然不能超过预混液总体积的5%),以防止最后一管酶液不够的尴尬局面.2:记住所用酶的特性,不光体现BUFFER的选择上。也体现记住不同限制酶稳定性上。比如BamHI5小时内稳定(37度),而BglII16小时内都保留100%的活性;那

细胞增殖检测:MTT法心得

MTT实验是检测细胞活力的实验方法,由于细胞活力与细胞数呈正相关,因此也常常用来检测细胞的增殖情况。一、MTT的原理活细胞有琥珀酸脱氢酶,将MTT还原成棕褐色沉淀。由于一般介绍园子里已经很多,笔者将自己的心得按照实验流程与大家交流交流。二、MTT法检测细胞增殖实验的注意事项1、培养好细胞点板养细胞没

胃下垂辨证辨病心得

  胃下垂属“胃缓、胃痛”等范畴,病因或为饮食不节、暴饮暴食、过度思虑等,日久损伤脾胃,中气下陷,胃肌无力,致使胃下垂;或劳倦内伤,感受外邪等,使胃失和降,纳化异常,渐渐形体虚损,脾虚下陷,而导致胃下垂;或为情志内伤,肝气犯脾,升运无力,导致胃下垂;或为常因饱食,食后剧烈运动,或开车上下颠簸,久

色谱柱维护保养心得

如何清洗和保存反相色谱柱?怎样处理新买来的色谱柱?用水来冲洗色谱柱有什么后果?分析结束后如何冲洗?这些问题是HPLC分析人员常常要面对的。本文就这些问题介绍一些色谱柱的维护和保养经验。 新色谱柱的处理 对于新购买的色谱柱,首先应该做些什么呢?几乎所有的色谱柱在出厂时都保存在它们测试时的

难治性腹水的治疗心得

  腹水的形成是腹腔内液体的产生和吸收失去动态平衡的结果。引起腹水的病因很多,无论是腹水呈漏出性还是渗出性,均可因多种疾病而引起,为了减轻大量腹水引起的症状(包括腹胀、呼吸受限等),可采取必要的对症治疗。以下是本人临床中总结的治疗腹水的经验。    一、1克Na可潴留200ml的水,故出现腹水时,应

阿司匹林的临床应用心得

  阿司匹林    阿司匹林与青霉素、安定一起被认为是医药史上三大经典杰作。我们老祖宗早就发现嚼柳树皮可以退烧和止痛,而到了19世纪,欧洲科学家发现柳树皮的有效成分是水杨酸,成功提取出来但是对胃**太大。1897年,德国化学家霍夫曼成功将水杨酸乙酰化合成为乙酰水杨酸,保持了原来药效但副作用大大减

MTT实验两年心得

MTT实验是检测细胞活力的实验方法,由于细胞活力与细胞数呈正相关,因此也常常用来检测细胞的增殖情况。MTT的原理:活细胞有琥珀酸脱氢酶,将MTT还原成棕褐色沉淀。由于一般介绍园子里已经很多,笔者将自己的心得按照实验流程与大家交流交流。1、培养好细胞点板。养细胞没啥好说的,如果不知道细胞如何养,那就看

关于药物分析降解实验心得

今天我们说说5种条件下的降解实验及深入的讨论降解实验,是否可以参照破坏试验?破坏试验的目的是什么?实验条件的设置要注意什么?等等问题。 降解实验也就是通过高温、酸、碱、氧化等实验条件对其产品进行产物降解,也属于破坏性实验,主要看都能产生哪些杂质。 1、酸降解试 一般选择0.1N的盐酸,在

RTPCR引物的选择

随机引物 适用于长的或具有发卡结构的RNA。适用于rRNA、mRNA、tRNA 等所有RNA的反转录反应。主要用于单一模板的RT-PCR反应。 Oligo dT 适用于具有PolyA尾巴的RNA。(原核生物的RNA、真核生物的 Oligo dT rRNA和tRNA不具有PolyA尾巴。)由

RtPCR经验总结

Rt-PCR实验步骤一、实验器具与材料:1、移液枪:1ml、200μl、20μl、10μl、2μl2、吸头:1ml、200μl、20μl3、匀浆管:5ml4、吸头台:放置1ml吸头的一个,放置20μl吸头的一个5、EP管:1.5ml、0.2ml、100μl6、试剂瓶:2个60ml的棕色试剂瓶(广口,

RTPCR引物的选择

 对靶序列中潜在的引物位点进行分析, 这些位点应该不会形成同源多聚体结构,也没有明显的形成二级结构的趋势,不会自身互补,与基因组中的其他序列无显著的同源性。    (1)依据寡核苷酸引物与其靶序列形成杂合分子的熔解度的计算中提供的公式计算各引物的熔解温度。    (2)选择一对匹配完好的正向和反向引

基因表达-RTPCR之我见

 本文讨论的范围包括RNA酶保护分析,northernblot,原位杂交,半定量RT-PCR和定量RT-PCR。本文不谈具体protocol,是因为各种书籍和kit说明书上都有,主要说一些原则,而且大部分是失败和成功的经验,还有小组讨论结果以及各种书里七零八落看的内容,希望对大家有用。基因表达的定义

RNA提取和RTPCR

真核生物的基因组是DNA,为什么不直接从DNA PCR得到我们需要的基因呢?因为真核生物的基因含有大量的非编码区,称为内元(intron),真正编码蛋白的区段是被这些内元隔开的,这些编码区叫做外元(exon)。真核生物的DNA转录成为RNA之后,经过剪切和拼接,去掉这些非编码区,才形成成熟的mRNA

RTPCR技术的简介

  RT -PCR首先经反转录酶的作用以RNA合成 cDNA,再以cDNA为模板,扩增合成目的片段。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平、细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。作为模板的RNA可以是总RNA、mRNA或体外转录的RNA产物。无论使用何种RN

RTPCR实验方法

RT-PCR定义:是指对组织或细胞的总RNA进行抽提,把RNA反转录为cDNA,然后设计目的基因引物进行PCR,琼脂糖电泳并数码拍照,分析电泳条带灰度值,判断目的基因mRNA转录水平的相对量的变化。 RT-PCR流程简介 一、抽提RNA: 1、防止RNA酶污染 180℃的高温下

RNA提取与RTPCR

 1.RNA的提取  RNA的提取其实原理很简单:通过变性剂破碎细胞或者组织,然后经过氯仿等有机溶剂抽提RNA,再经过沉淀,洗涤,晾干,zui后溶解。但是由于RNA酶无处不在,随时可能将RNA降解,所以实验中有很多地方需要注意,稍有疏忽就会前功尽弃。  1.1分离高质量RNA  成功的cDNA合成来

RTPCR技术的定义

RT-PCR,反转录·聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)是将RNA的反转录(reverse transcription )和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。

RTPCR技术的简介

RT—PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。首先经反转录酶的作用,从RNA合成cDNA,再以cDNA为模板,在DNA聚合酶作用下扩增合成目的片段。RT—PCR

RTPCR的反应体系

一:25UL 体系的量如下:无RNA酶水 ?5*buffer 5.0ULDNTP Mix 1.0ULEnzyme Mix 1.0ULprimer A ?(0.6M)Primer B ?(0.6M)RNA模板 ?(不大于1UL)Q (RNA酶抑制剂) 可加可不加二:虽说有几个试剂未知其量,但都是需要算

RNA提取和RTPCR

在做Northern等杂交实验、构建cDNA文库、获取能够编码真核生物蛋白的基因、获得RNA病毒基因时,会用到RNA提取和RT-PCR技术。真核生物的基因组是DNA,为什么不直接从DNA PCR得到我们需要的基因呢?因为真核生物的基因含有大量的非编码区,称为内元(intron),真正编码蛋白的区段是

RTPCR引物的选择

随机引物             适用于长的或具有发卡结构的RNA。适用于rRNA、mRNA、tRNA 等所有RNA的反转录反应。主要用于单一模板的RT-PCR反应。                                                   Oligo dT        

悬浮细胞培养方法求心得

悬浮细胞一般几天离心一次,觉得好难养啊!求心得?丁香园网友goingba认为:你养的是什么细胞,原代吗?我觉得悬浮细胞最好养了,不用消化,关于几天离一次心,要看你的细胞生长状态了,我养过血液肿瘤细胞,增值比较快,我一般是第二天半量换液(加等量培养基后一分二),第三天若长得比较满,就离心换液。若你不想

液相色谱柱使用心得

 液相色谱柱使用心得  柱头类型和不锈钢毛细管接头的匹配  色谱柱是消耗品,不是仪器原配的情况很多,如果接头和柱头深度匹配将会产生漏液或者死体积过大的现象。接头比柱头深度长,不易拧紧而漏液;接头比柱头深度短,柱头内留有空隙而产生死体积,使谱带展宽和峰拖尾。  溶剂的匹配转换  色谱柱内保存溶剂和仪器