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SageScience核酸片段回收系统在RADseq中的应用(二)

4.RAD-seq 文库构建过程中,DNA片段大小筛选的重要意义?酶切可以将基因组简化为很多DNA片段。而片段大小筛选步骤可以进一步减少需要进行基因分型的基因位点。筛选潜在的特征性基因座位,主要依赖于两酶切位点距离。不同测序文库间片段筛选的一致性,对产生不同样本间可对比的基因座位至关重要,进而直接影响后续的生物信息分析和应用。片段筛选的方式有直接筛选和间接筛选。直接筛选包括手工切胶,磁珠筛选和pippin,但不同的技术手段,其精确性不同。下图为不同技术手段的简单比较。手工切胶是根据最左边的marker对照切割,即使是同一个人操作,也很难保证每个泳道,每个样品目的范围的一致性。磁珠纯化的片段范围过于宽泛,无法进行聚焦。相比于手工切胶和磁珠纯化,pippin自动化片段回收的一致性和准确性更高,重复性和精确度均达到95%以上。在ezRAD,ddRAD文库构建过程中,pippin片段回收的一致性,是实验成功的关键因素,ddRAD的创始人......阅读全文

Sage Science核酸片段回收系统在RADseq中的应用(二)

4.RAD-seq 文库构建过程中,DNA片段大小筛选的重要意义?酶切可以将基因组简化为很多DNA片段。而片段大小筛选步骤可以进一步减少需要进行基因分型的基因位点。筛选潜在的特征性基因座位,主要依赖于两酶切位点距离。不同测序文库间片段筛选的一致性,对产生不同样本间可对比的基因座位至关重要,进而直接影

Sage Science核酸片段回收系统在RADseq中的应用(一)

1.什么是RAD-SEQ?RADseq(Restriction-site associated DNA sequencing,限制性酶切位点相关的DNA测序)是通过对基因组进行酶切,并针对带有酶切位点的DNA相关片段进行测序,这项技术能够低成本的开发大量SNP标记,不受有无参考基因组和染色体倍型

SageHLS靶向捕获大片段DNA在测序解析神经精神疾病CNVs结...

SageHLS靶向捕获大片段DNA在测序解析神经精神疾病CNVs结构研究的应用在2020年的美国AGBT(基因组生物学与技术进展)大会上,由斯坦福大学实验室的Alexander Urban和Hanlee Ji主导的一项国际合作项目中,研究人员使用SageHLS超大片段核酸回收系统在结构复杂的人类染色

脉冲场凝胶中浓缩DNA片段的回收

低熔点琼脂糖切片中的 DNA 首先通过电泳浓缩进入高百分比琼脂糖凝胶中,然后用琼脂糖酶处理而分离。最终 DNA 制备通过微透析纯化。这种方法在把分离的 DNA 注入小鼠受精卵(Schedl et al. 1993) 或转染鼠胚胎干细胞(Choi et al. 1993) 时是非常有效的。本实验来源「

脉冲场凝胶中浓缩DNA片段的回收

            实验方法原理 低熔点琼脂糖切片中的 DNA 首先通过电泳浓缩进入高百分比琼脂糖凝胶中,然后用琼脂糖酶处理而分离。最终 DNA 制备通过微透析纯化。这种方法在把分离的 DNA 注入小鼠受精卵(Schedl et al. 1993) 或转染鼠

脉冲场凝胶中浓缩DNA片段的回收

实验方法原理 低熔点琼脂糖切片中的 DNA 首先通过电泳浓缩进入高百分比琼脂糖凝胶中,然后用琼脂糖酶处理而分离。最终 DNA 制备通过微透析纯化。这种方法在把分离的 DNA 注入小鼠受精卵(Schedl et al. 1993) 或转染鼠胚胎干细胞(Choi et al. 1993) 时是非

DNA片段的回收实验

树脂回收法 微量柱法 液氮冻融法 常规方法             实验方法原理 本方法特别适合于PCR片段的回收,具有纯度高、操作简洁等特点,经此方法

DNA片段的回收实验

实验方法原理 本方法特别适合于PCR片段的回收,具有纯度高、操作简洁等特点,经此方法回收的片段可有效的用于重组载体构建。通过15分钟的纯化过程,PCR产物即能被有效地从含引物二聚体、非特异性扩增引物片断等混合物中分离出来,成为高度无盐的、不含其他大分子成分的纯化片断。在较宽的分子量范围内有较高的回收

DNA片段的回收实验——树脂回收法

目的DNA片段的回收技术是重组DNA中的关键技术,回收是指从电泳介质中纯化出目的片断。实验方法原理本方法特别适合于PCR片段的回收,具有纯度高、操作简洁等特点,经此方法回收的片段可有效的用于重组载体构建。通过15分钟的纯化过程,PCR产物即能被有效地从含引物二聚体、非特异性扩增引物片断等混合物中分离

脉冲场凝胶中DNA片段的直接回收

低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 DNA 可以用限制酶酶切产生高分辨率酶切图谱或产生用于插入噬菌体或质粒载体的片段。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理低熔点琼脂糖制备规模的 PFGE 经常被用于 DNA 片段的分离。不同大小的 D