RNAi:制备siRNAs的方法

越来越多的研究人员开始采用小分子干扰RNA(small interfering RNAs,siRNAs)来抑制特定的哺乳动物基因表达。siRNA是一种短片断双链RNA分子,能够以同源互补序列的mRNA为靶目标降解特定的mRNA,这个过程就是RNA干扰途径(RNA interference pathway)。RNAi的应用包括功能基因组学,药物靶筛选,细胞信号传导通路分析等等。目前为止较为常用的5种制备siRNAs的方法包括· 化学合成· 体外转录· 长片断dsRNAs经RNase III 类降解 (e.g. Dicer, E. coli, RNase III)· siRNA表达载体或者病毒载体在细胞中表达siRNAs· PCR制备的siRNA表达框在细胞中表达前面3种方法包括体外制备siRNAs然后经过转染或者电转导入哺乳动物细胞后面两种方法则依赖能够表达siRNAs的DNA载体或者表达框转染到细胞中。每种方法都有自己的......阅读全文

RNA干扰的详细实验步骤

步骤包括:(一)siRNA的设计1. 在设计RNAi实验时,可以先在以下网站进行目标序列的筛选:GenesilAmbion2. RNAi目标序列的选取原则:(1)从转录本(mRNA)的AUG起始密码开始,寻找“AA”二连序列,并记下其3'端的19个碱基序列,作为潜在的siRNA靶位点。有研究

RNA干扰实验技术

实验概要本文介绍了RNA干扰的原理及基本实验方法,包括了siRNA的设计、siRNA的制备和siRNA的转染等方法,及RNA干扰实验中的注意事项。实验原理近年来的研究表明,将与mRNA对应的正义RNA和反义RNA组成的双链RNA(dsRNA)导入细胞,可以使mRNA发生特异性的降解,导致其相应的基因

《ACS-Nano》:传递DNA至脑瘤细胞的可降解纳米粒子

Biodegradable plastic molecules (orange) self-assemble with DNA molecules (intertwined, black circles) to form tiny nanoparticles that can carr

RNAi的实验原理与方法

近年来的研究表明,将与mRNA对应的正义RNA和反义RNA组成的双链RNA(dsRNA)导入细胞,可以使mRNA发生特异性的降解,导致其相应的基因沉默。这种转录后基因沉默机制(post-transcriptional gene silencing, PTGS)被称为RNA干扰(RNAi)。一、RNA

RNAi实验原理与方法

RNAi实验原理与方法近年来的研究表明,将与mRNA对应的正义RNA和反义RNA组成的双链RNA(dsRNA)导入细胞,可以使mRNA发生特异性的降解,导致其相应的基因沉默。这种转录后基因沉默机制(post-transcriptional gene silencing, PTGS)被称为RNA干扰(

RNAi实验原理与制备方法(二)

3.用RNase III 消化长片断双链RNA制备siRNA其他制备siRNA的方法的缺陷是需要设计和检验多个siRNA序列以便找到一个有效的siRNA。而用这种方法——制备一份混合有各种siRNAs “混合鸡尾酒” 就可以避免这个缺陷。选择通常是200—1000碱基的靶mRNA模版,用体外转录

RNAi实验原理与方法(二)

3.用RNase III 消化长片断双链RNA制备siRNA其他制备siRNA的方法的缺陷是需要设计和检验多个siRNA序列以便找到一个有效的siRNA。而用这种方法——制备一份混合有各种siRNAs “混合鸡尾酒” 就可以避免这个缺陷。选择通常是200—1000碱基的靶mRNA模版,用体外转录

RNAi的实验原理和操作实用技术

  几十年来生物学上最重要的进展,也许是关于RNA分子能调节基因表达的发现。RNA干涉(RNAi)是指双链RNA分子使基因表达沉寂的现象,是在线虫中发现的,在 1998年的一篇Nature论文中被公诸于众。    此后,科学家们明白,RNAi还有其他形式,它既是一种了解基因功能的强大工具,又是很多生

RNAi实验原理与方法选择(一)

一、RNAi的分子机制通过生化和遗传学研究表明,RNA干扰包括起始阶段和效应阶段(inititation and effector steps)。在起始阶段,加入的小分子RNA被切割为21-23核苷酸长的小分子干扰RNA片段(small interfering RNAs, siRNAs)。证

通过RNAi使基因特异性沉默

RNA interference (RNAi) is a phenomenon in which the introduction of double-stranded RNA (dsRNA) into a diverse range of organisms and cell types caus

一种新方法评定在培养细胞中siRNA效率

A novel approach for evaluating the efficiency of siRNAs on protein levels in cultured cells.Wu W, Hodges E, Redelius J, Hoog C.Nucleic Acids Res. 200

一种新方法评定在培养细胞中siRNA效率

A novel approach for evaluating the efficiency of siRNAs on protein levels in cultured cells.Wu W, Hodges E, Redelius J, Hoog C.Nucleic Acids Res. 200

siRNA-Design-Guidelines

Using siRNA for gene silencing is a rapidly evolving tool in molecular biology. There are several methods for preparing siRNA, such as chemical synthe

《细胞》:利用RNA干扰抵御艾滋病毒

这种策略可能被开发成对人类的临床应用 美国科学家近日开发出了一种利用抗体将短链RNA(siRNAs)直接送至免疫细胞的方法,并通过RNA干扰极大地帮助抑制HIV病毒对小鼠的感染。相关论文8月7日在线发表于《细胞》(Cell)杂志上。 进行此次研究的是美国哈佛医学院的Priti Kumar和同事。

RNAi原理图解

The Mechanism of RNA Interference (RNAi)Long double-stranded RNAs (dsRNAs; typically >200 nt) can be used to silence the expression of target genes in

哺乳动物RNAi技术全面实验方法

WHENVIRUSESINFECTEUKARYOTICCELLSdomly integrate into host genomes, double-stranded RNA (dsRNA) is frequently produced from the invading genes, either

SiRNA用户指南

Selection of siRNA duplexes from the target mRNA sequenceUsing Drosophila melanogaster lysates (Tuschl et al. 1999), we have systematically analyzed t

siRNA用户手册

The siRNA user guide  (revised May 6, 2004) Selection of siRNA duplexes from the target mRNA sequenceUsing Drosophila melanogaster lysates (Tuschl et

多肽制备

固相多肽合成就是不断地在固相载体上加入α-氨基和侧链基团被保护的氨基酸。FMOC基团是用来保护α-氨基中的N的,去除保护基团后,再加入第二个氨基酸。产生的多肽通过一个连接臂将C端连接在树脂上,它可以被裂解下来。通常情况下,在多肽从树脂上裂解下来的同时去除侧链保护基团,一般采用哌啶去 FMOC保护基团

制备TLC

制备TLCTLC还可用于少量如100毫克左右的化合物的分离,此时混合物样品不是“点”在板上,而是涂抹在TLC板上且高于洗脱剂液面上的位置,形成一条水平的样品带。然后如同展开小型TLC板一样将制备TLC板展开并晾干,然后将每条携带不同化合物的色带从板上分别刮下,并用合适的溶剂萃取洗涤(如二氯甲烷)并过

抗原制备

不管是制备单抗还是多抗,抗原的设计与制备都是一个非常重要的问题,设计或者制备得不好的抗原有可能完全不能免疫出抗体来。一个良好的抗原必须具体的条件:(1)分子足够大。对于多肽或蛋白质类的抗原来说,一个抗原决定簇(又叫表位,epitope),通常由6-8个氨基酸残基组成。而平均每5-10kD才有一个表位

RNAi的实验原理和操作实用技术(1)

几十年来生物学上最重要的进展,也许是关于RNA分子能调节基因表达的发现。RNA干涉(RNAi)是指双链RNA分子使基因表达沉寂的现象,是在线虫中发现的,在 1998年的一篇Nature论文中被公诸于众。此后,科学家们明白,RNAi还有其他形式,它既是一种了解基因功能的强大工具,又是很多生物的基因组所

什么是制备与半制备液相

制备与半制备主要是指待制备样品的量来区别,1克以上是制备级别,100毫克到1克之间是半制备级别

半制备色谱和制备色谱的区别

1.制备与半制备的差异是流速与色谱柱;半制备一般会选择直径为10mm的色谱柱;而制备选择的是直径为20的色谱柱;同样,流速也会相应提升,半制备的流速一般为1.0ml/min,而制备一般会设置为8ml/min。液相色谱仪有分析型以及制备型,分析型一般用来分析多个化学成分,可以进行定性以及定量,而制备型

制备电泳实验——等电聚焦制备电泳

实验方法原理等电聚焦制备电泳是一种非变性制备技术。由于等电聚焦电泳技术的特点,因而是一种理想的制备方法。试剂、试剂盒电极液两性电解质Ultrodex实验步骤一、液体介质垂直柱状蔗糖密度梯度等电聚焦是原瑞典 LKB 公司早期用于制备和分析目的的等电聚焦方法。载体两性电解质在蔗糖密度梯度柱中形成 pH

人工制备抗体制备方法有哪些

抗体在疾病的诊断和免疫防治中的重要作用,使人们对抗体的需求越来越大。人工制备抗体是大量获得抗体的重要途径。早年人工制备抗体的方法主要是以相应抗原免疫动物,获得抗血清。由于抗原常常含有多种不同的抗原表位,加之所获得的抗血清也未经免疫纯化,因此,获得的抗血清实际上是含多种抗体的混合物,即多克隆抗体(po

RNA干扰(RNAi)实验原理与方法(2)

dsRNA消化法的主要优点在于可以跳过检测和筛选有效siRNA序列的步骤,为研究人员节省时间和金钱(注意:通常用RNAse III通常比用Dicer要便宜)。不过这种方法的缺点也很明显,就是有可能引发非特异的基因沉默,特别是同源或者是密切相关的基因。现在多数的研究显示这种情况通常不会造成影响。最

RNAi表达载体构建(一)

近年来的研究表明,一些短片断的双链RNA可以通过促使特定基因的mRNA降解来高效、特异的阻断体内特定基因表达,诱使细胞表现出特定基因缺失的表型, 称为RNA干扰(RNA interference,RNAi).siRNA(small interfering RNAs)就是这种短片断双链RNA分

单克隆抗体上清制备实验——大量制备

实验材料目的杂交瘤试剂、试剂盒完全 DMEM-10 培养液(含 5~10 mmol/L HEPES pH 7.2~7.4)仪器、耗材250 ml 无菌锥形离心管转瓶培养装置850 cm2 旋转培养瓶175 cm2 组织培养瓶实验步骤1. 重复基本方案 1 步骤 1,并按 1:10 分传到终体积为 1

QIAGEN-与上海-Biochip-公司签订合作协议

QIAGEN亚洲区将向中国首要药品开发及发展的供应商提供RNAi以及相应的解决方案 Shanghai, May 30, 2008 - (ACN Newswire) -QIAGEN宣布已选定上海Biochip公司(SBC)作为首要合作伙伴,为SBC提供各种小干扰RNA (siRNA)库。SBC将使用