PARP9：RNA病毒的非经典感受器
RNA病毒感染在人群能引起严重的疾病，对人类健康造成严重的威胁。最近正在流行的2019冠状病毒病（COVID-19）就是由RNA病毒严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）感染引起的, 这也让抗病毒免疫研究再次成为媒体关注的焦点。天然免疫细胞是人体对抗病毒感染的第一道最重要的防线。它能利用细胞内的模式识别受体(PRRs) 检测病毒来源的包括核酸（DNA和RNA）在内的病原相关分子模式，然后激活下游信号通路产生I型干扰素，I型干扰素进一步激活机体的天然免疫和适应性免疫应答最终清除病毒和病毒感染细胞。RNA感受器是检测RNA病毒感染产生的RNA的重要PRRs。截至目前，一些RNA感受器被鉴定出来，包括视黄酸诱导基因I（RIG-I），黑素瘤分化相关分子5（MDA5）和张志强团队以前鉴定的解旋酶 (helicase) 家族成员DDX1-DDX21-DHX36复合体，DHX9，DHX15，DHX33等。这些经典的RNA感受......阅读全文
病毒RNA提取实验方法（protocol）
1，用异硫氰酸胍提取提禽流感病毒的详细步骤，可参考（我提过N次做定量PCR都没问题）：1.取200ul样品数+阴性对照+阳性对照个1.5ml灭菌eppendorf管2.加600ul异硫氰酸胍，然后加入对照和样品，再加200ul氯仿，颠倒混匀3.13000rpm离心15min4.在第3步离心快结束时，
禽流感病毒RNA提取protocol
1，用异硫氰酸胍提取1.取200ul样品数+阴性对照+阳性对照个1.5ml灭菌eppendorf管2.加600ul异硫氰酸胍，然后加入对照和样品，再加200ul氯仿，颠倒混匀3.13000rpm离心15min4.在第3步离心快结束时，另取同样多eppendorf管，加入400ul -20度预冷的异丙
非编码RNA为癌症研究提供新思路
澳大利亚纽卡斯尔大学和中国科技大学等机构合作完成的两项最新研究表明，非编码RNA（核糖核酸）在癌症治疗方面存在巨大潜力，有助于开发出新型的癌症靶向治疗方法。 非编码RNA是指不编码蛋白质的RNA。长期以来，全球各地开展的癌症研究主要针对能编码蛋白质的基因，这些基因只占人类基因组的2%。 发表
Cell惊人发现：谁说非编码RNA不编码？
来自德克萨斯大学西南医学中心的Eric Olson和同事们在分析梳理肌肉特异性的长链非编码RNAs(lncRNAs)以了解它们的功能时，发现了一种在骨骼肌中特异性表达的lncRNA。尽管这一RNA以往被归类为是非编码RNA，它的序列中包含的一小段却看上去好像一个编码区域。这一研究发现发布在《细胞
长期被误解－非编码RNA存在“认知黑洞”
在人类基因组中95%的基因并不编码蛋白质，其他物种也有大量的非编码基因。这些DNA不会被编码成蛋白质，却又会转录出非编码RNA，它们对生命活动起什么作用？是进化的冗余还是神秘的缓存？ 《细胞》杂志近日刊登中国工程院院士曹雪涛团队的研究论文，他们发现一种全新非编码RNA分子。该分子能够调控免
长期被误解－非编码RNA存在“认知黑洞”
在人类基因组中95%的基因并不编码蛋白质，其他物种也有大量的非编码基因。这些DNA不会被编码成蛋白质，却又会转录出非编码RNA，它们对生命活动起什么作用？是进化的冗余还是神秘的缓存？ 《细胞》杂志近日刊登中国工程院院士曹雪涛团队的研究论文，他们发现一种全新非编码RNA分子。该分子能够调控免疫
长链非编码RNA与淋巴瘤
类基因组中仅有1.5%~2.0%编码蛋白的基因得以稳定转录，而剩余的绝大多数RNA无编码蛋白的功能。长链非编码RNA（lncRNA）是一类异质性的非编码RNA，根据lncRNA的功能，可将其分为信号分子、诱饵分子、引导分子和骨架分子4类。人们以往仅将这些不具编码功能的RNA视为进化过程中产生的废
Cell封面故事：抗癌向着非编码RNA开炮
一种常见儿童血癌中对触动及推动肿瘤生长和进展的因子开展大型遗传分析，来自纽约大学Langone医学中心的研究人员报告称，他们鉴别出了一个可能的、治疗这种疾病的新药物靶点。 T细胞急性淋巴母细胞性白血病（T-cell acute lymphoblastic leukemia）是一种最常见且具有侵
中国科大发现新型非编码RNA
最近，中国科学技术大学单革教授实验室在国际知名杂志《自然-结构和分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)发表研究性论文，报导了其实验室发现的一类新型非编码RNA以及此类非编码RNA的功能和功能机理。 非编码RNA是一大类不编码蛋白质而在细胞中起
长链非编码RNA:－从科研到临床
长链非编码RNA (LncRNA)是一类真核生物中长度大于200 nt的非编码RNA分子；根据其与邻近基因的位置可以分为反义lncRNA、增强子lncRNA、基因间lncRNA、双向lncRNA、和内含子lncRNA；它具有多种作用机制，比如在细胞核中作为分子支架、协助可变剪接、调节染色体结构
定量蛋白质组学揭开巨噬细胞活化的秘密
巨噬细胞活化是许多疾病发展过程中的关键步骤，包括动脉疾病。最近，布莱根妇女医院和哈佛医学院的研究人员通过蛋白质组学及其他分析，强调了PARP9和PARP14在调节巨噬细胞活化中的作用。这项成果发表在《Nature Communications》上。布莱根妇女医院的Masanori Aikawa及其同
非编码small－RNA参与缺氧下的血管生成（二）
接下来，Northern blot实验也验证了其中上调的tRNAVal(CAC)和tRNAGly(GCC)来源片段。此外，qPCR分析也表明，这些small RNAs在缺血后24hr，48hr和72hr时都显著提高。为了进一步探究胁迫诱导的tRNAs剪切过程，研究人员在缺血条件下对不同时间
非编码RNA的调控作用机制研究计划项目指南
非编码RNA是由基因组转录产生的一类不同于mRNA的遗传信息分子。对真核细胞中非编码RNA及其基因的发掘和功能研究，有可能揭示一个由非编码RNA介导的遗传信息传递方式和表达调控网络，从不同于蛋白质编码基因的角度注释和阐明基因组的结构与功能，深入阐明生命活动的本质和规律。 一、科学目标 本重大
调节免疫应答的新途径——长链非编码RNA
“我们需要知道细菌感染引发的炎症反应是由什么来调节该过程的。”该研究的领导者，UTA大学化学副教授Subhrangsu Mandal说。 “如果我们能做到这一点，我们就可以控制中枢神经系统炎症性疾病，迄今为止这些疾病一直难以治疗，如败血症和脑膜炎，以及癌症和肌肉营养不良，它们也可以看作一种炎症
非编码small－RNA参与缺氧下的血管生成（一）
非编码RNA是近年来转录组学研究的热点，其中，long non-coding RNA（lncRNA），microRNA，circularRNA是大家研究的非常多的非编码。其实，在small non-coding RNAs世界，除了我们熟知的microRNA之外，还包括piwi-interac
2017年不能错过的长非编码RNA研究推荐
2017年即将过去，这一年的非编码RNA研究取得了很多重磅级成果。与早先的主要是在不同类型的疾病（癌症）中大规模鉴定非编码RNA，今年的研究是对非编码RNA机制的更深入探索，给我们展现了作用方式更丰富多彩的非编码RNA世界。图片来源于网络 一 长非编码RNA（lncRNA） 长非编码RNA是
关于基因表达的机制非编码RNA的成熟的介绍
多数生物体中的非编码基因（ncRNA）被转录为需要进一步加工的前体。核糖体RNA（rRNA）通常被转录为含有一个或多个rRNA的前体rRNA，前体rRNA后来在特定位点被大约150种不同的snoRNA切割和修饰。转移RNA（tRNA）的5'和3'端序列分别被RNase P和tRN
视觉感受器中的G蛋白介绍
黑暗条件下视杆细胞(或视锥细胞)中cGMP浓度较高，cGMP门控钠离子通道开放，钠离子内流，引起膜去极化，突触持续向次级神经元释放递质。视紫红质(rhodopsin, Rh)为7次跨膜蛋白，含一个11顺-视黄醛。是视觉感受器中的G蛋白偶联型受体，光照使Rh视黄醛的构象变为反式，Rh分解为视黄醛和视蛋
化学感受器瘤的概述
副神经节起源的肿瘤均属于APUD系统肿瘤，分为两类即：有生物活性的肿瘤和无生物活性的肿瘤。无生物活性的肿瘤为非嗜铬副神经节细胞瘤(也称化学感受器瘤)，有生物活性者为嗜铬细胞瘤，二者均可以恶变。
百人计划范祖森团队揭示非编码RNA维持细胞静息态的机制
在国家自然科学基金重大研究计划项目（项目编号：91640203）等资助下，中国科学院生物物理研究所范祖森研究员在环状RNA调控造血干细胞稳态机制领域取得突破进展，揭示了一类特殊的环状RNA维持LT-HSCs （Long-term Hematopoietic Stem Cells，长期造血干细胞）
RNA测序深入了解疱疹病毒
近日，发表在《Nature Communications》上的一项研究中，研究人员利用单细胞RNA测序深入了解了疱疹病毒，为预防疱疹感染带来了新的见解。 如果你的嘴唇开始刺痛发痒，通常意味着你将患上唇疱疹，这是一种小而令人疼痛的水泡，里面充满了具有高度传染性的单纯疱疹病毒（HSV）。 单纯疱疹
怎么看丙肝病毒RNA检查？
丙肝病毒RNA定量检查对丙肝的治疗起着至关重要的作用，丙肝病毒携带者和患者每6个月要做一次该项检查，以便对体内病毒复制情况有所监控了解，但大家在检查后通常对结果并不了解， 其实临床上对于丙肝病毒的检查可以分为：定性和定量检查两个部分，定性检查也是我们常说的阴性还是阳性，而定量检查就是具体的检
北京生科院发表环形非编码RNA识别新技术
2月28日，国际学术期刊Briefings in Bioinformatics 发表了中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队题为Circular RNA identification based on multiple seed matching 的最新研究成果。因为目前在环形RNA识别方面存
长链非编码RNA:－从科研到临床（一）
概述长链非编码RNA (LncRNA)是一类真核生物中长度大于200 nt的非编码RNA分子；根据其与邻近基因的位置可以分为反义lncRNA、增强子lncRNA、基因间lncRNA、双向lncRNA、和内含子lncRNA；它具有多种作用机制，比如在细胞核中作为分子支架、协助可变剪接、调节染色体结
Cell:长期被误解－非编码RNA存在“认知黑洞”
在人类基因组中95%的基因并不编码蛋白质，其他物种也有大量的非编码基因。这些DNA不会被编码成蛋白质，却又会转录出非编码RNA，它们对生命活动起什么作用？是进化的冗余还是神秘的缓存？ 《细胞》杂志近日刊登中国工程院院士曹雪涛团队的研究论文，他们发现一种全新非编码RNA分子。该分子能够调控免疫
eLife：首次发现促癌非编码RNA因子—LAST
中国科学技术大学吴缅教授研究组发现一条受c-Myc转录激活的长非编码RNA。 中国科学技术大学吴缅教授研究组发表了题为“LAST, a c-Myc-inducible long noncoding RNA, cooperates with CNBP to promote CCND1 mRNA
Nature里程碑研究：新型非编码反义RNA
在研究帕金森氏病的过程中，一个国际研究小组获得了一个可以提高工业蛋白质合成用于治疗用途的新发现。他们设法了解了非蛋白质编码RNA的一个新功能：借助这类称作“反义”的非编码RNA的活性可以提高编码基因的蛋白质合成活性。相关成果发表在10月14日的《自然》(Nature)杂志上。 为了合成蛋白
非编码RNA－Nfi调控水稻固氮酶活性
近日，生物所微生物功能基因组创新团队林敏课题组在水稻根际联合固氮施氏假单胞菌中发现新型非编码RNA参与协同调控固氮酶活性，为进一步揭示生物固氮网络调控机制奠定了重要理论基础。该成果发表在最新一期的经典微生物学杂志《应用环境微生物学（Applied and Environmental Micro
长链非编码RNA:－从科研到临床（三）
肾脏疾病与糖尿病 糖尿病经常伴随着肾病的发生[5]. 比如基因间lncRNA PVT1与二类疾病都紧密关联。研究人员在II型糖尿病人的晚期肾病进程中发现了PVT1的基因变异。高糖处理可以诱导人的肾间质细胞中PVT1和纤连蛋白1、IV型胶原蛋白、TGF β1、PAI 1等因子的高表达。相反，敲除P
关键非编码RNA分子促进皮肤癌恶化
在最近一项研究中，图尔库大学中心医院和西方癌症中心（FICAN West）的研究人员发现了一种新的RNA分子PRECSIT，它参与调节了皮肤鳞状细胞癌的生长和侵袭过程。将来，PRECSIT可能会成为检测快速进展或扩散的鳞状细胞癌的新标志物，以及有可能成为新疗法的靶标。 皮肤癌是世界上最常见的癌