最新研究：最凶险乳腺癌或有新的治疗靶点
RNA是细胞传递基因信息的重要“信使”，一旦细胞发生癌变，便很有可能产生异于常态的RNA，即“肿瘤特异性转录本”。复旦大学附属肿瘤医院方面8日透露，该院邵志敏教授、江一舟教授团队携手黄胜林教授团队，发现在三阴性乳腺癌的细胞中存在大量“肿瘤特异性转录本”，并据此率先成功绘制出三阴性乳腺癌“肿瘤特异性转录本”图谱。 研究团队还鉴定出其中高频表达的“肿瘤特异性转录本”MARCO-TST，证实BET抑制剂可作为三阴性乳腺癌患者的潜在治疗选择。这意味着长期以来缺乏有效治疗策略的三阴性乳腺癌，有望获得新的治疗靶点。该项研究成果8日在线发表于国际权威期刊《美国科学院院报》(PNAS)。 乳腺癌是女性发病率最高的恶性肿瘤，其中三阴性乳腺癌最为“凶险”，其复发转移的风险显著高于其他乳腺癌亚型。由于缺乏有效的治疗靶点，三阴性乳腺癌长期疗效不佳。 近年来，邵志敏教授、江一舟教授团队开展了三阴性乳腺癌精准治疗的系列临床研究，大幅提升了三阴性乳......阅读全文
－长读取测序揭秘转录本结构
短读取的 RNA-seq 虽然可以精确计数已表达的转录本，但无法提供这些转录本的结构信息。 现在，斯坦福大学研究人员在《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上报告称，他们开发出了一种能保留转录本结构信息的新方法，他们通过环状 cDNA 模板和长读取测序，
如何在基因中选择合适的转录本？
一段基因的DNA序列，一般按从5’到3’的方向分别为：5’非编码区（图中黑色）、外显子（Exon，图中红色）与内含子（intron，图中浅蓝色）区、3’非编码区（图中黑色）等。而在从DNA转录到mRNA的过程中，其中的内含子会被剪切掉、而外显子区再次重新连接起来，最终形成的序列就是mRNA序列了。
转录组测序揭示乳腺癌重排
即将在本周《美国科学院院刊》（PNAS）的网络版上发表的一篇论文中，一个国际研究小组介绍了一项利用高通量的转录组测序来发现乳腺癌细胞系中的基因组重排的原理论证研究。美国克莱格凡特研究院（J.Craig Venter Institute）、Lugwig癌症研究所的三个分所、以及纽约斯隆-凯特琳癌症
科研家提出环形RNA全长转录本解析技术
近日，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-实验手册》（Nature Protocols）上，发表了题为Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究论文，建立了环形RNA全长转录本解析
北京生科院提出环形RNA全长转录本解析技术
4月12日，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-实验手册》（Nature Protocols）上，发表了题为Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究论文，建立了环形RNA全长
分子植物卓越中心揭示天然反义转录本调控机制
近期，中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所研究员何玉科研究组在Nature Communications上，发表题为Natural antisense transcripts of MIR398 genes suppress microR398 processing and a
科学家成功解码鱼类胚胎中的新生转录本
上海海洋大学教授陈良标、胡鹏团队，在活体鱼类胚胎中实现了单细胞新生RNA测序技术的系统优化和应用，首次实现对“合子激活”阶段新转录基因的高灵敏度、高准确性检测，打开了研究生命起源奥秘的新窗口，也为水产育种的基因精准设计提供了重要工具。相关研究近日发表于《自然-通讯》。每个新生命的开始都经历过一次“主
基因组所小鼠组织新转录本鉴定研究取得进展
近日，中国科学院北京基因组研究所胡松年项目组利用新一代测序数据，运用生物信息学方法，在小鼠的几个组织中发现了几千个新的转录本。该研究成果的完成拓宽了转录组数据分析的思路，有利于更全面地认识小鼠的转录组组成，并进一步补充了其基因组的注释，相关成果论文在frontiers in genetics
北京生科院提出环形RNA全长转录本重建和定量新方法
国际学术期刊Genome Medicine 在线发表了中国科学院北京生命科学研究院计算基因组学实验室赵方庆团队题为Reconstruction of full-length circular RNAs enables isoform-level quantification 的最新研究成果。该研
乳腺癌全转录组关联分析发现新的风险基因
美国范德堡大学和澳大利亚昆士兰医学研究所（QIMR Berghofer）领导的研究团队利用全转录组关联分析方法，找到与乳腺癌存在明显关联的48个基因。这项成果于6月18日发表在《Nature Genetics》上。 研究人员利用近12.3万名乳腺癌患者和近10.6万名对照的遗传预测基因表达谱
赵方庆团队提出环形RNA转录本重建和定量新方法
在以往的研究中，环形RNA的识别方法主要是利用环形RNA特有结构——反向剪接序列特征进行识别。然而，由于二代测序的读长普遍较短，研究者们虽然可以获得大量的反向剪接位点，却无法高通量获得环形RNA的完整内部结构信息，也无法对不同可变剪接产物进行精确定量。 2018年1月19日，Genome Me
Nature：新研究让mRNA转录本上的m6A标记不再神秘
在一项新的研究中，来自美国康奈尔大学和密歇根大学的研究人员发现在一些mRNA转录本上出现的化学修饰可能在一定程度上有助于细胞在遭受损伤后进行自我修复，并且也可能是了解重要的人类疾病的关键。相关研究结果近期发表在Nature期刊上，论文标题为“m6A enhances the phase sepa
西达本胺获TFDA核准进入乳腺癌三期试验
近日，据媒体报道，西达本胺获台湾TFDA核准进入乳腺癌临床三期试验 ，西达本胺(chidamide，HBI-8000)是一个新一代表观遗传调控剂，由中国、美国、日本、韩国与台湾等多个区域国家同步开展临床的新药。 西达本胺的第一适应症是用于复发难治的外周T细胞淋巴癌(peripheral T-c
中国首发纳米孔RNA直接测序揭示其在全长转录本中的作用
近日发表在RNA Biology上的研究中，来自中国科学院北京生命科学研究院、动物研究所及中国科学院大学等多家单位的科学家们首次通过5’-Cap捕获法对蝗虫的 RNA直接测序，揭示了Piwi 外显子化模式的广泛建立以及蝗虫转录组中的转座子（TEs）对RNA剪接的重要作用。 转座子（TEs）在后
Cell子刊：转录因子SLUG有助于决定乳腺癌的类型
最近，塔夫斯大学医学院、塔夫斯医学中心、德克萨斯大学、北卡大学和麻省理工学院等处的研究人员在Cell期刊旗下《Stem Cell Reports》杂志发表论文表明，在乳腺组织的发育过程中，转录因子SLUG在调节干细胞功能的过程中发挥作用，并能够决定乳腺细胞将会长成管腔细胞还是基底细胞。 他们所
最新研究：最凶险乳腺癌或有新的治疗靶点
RNA是细胞传递基因信息的重要“信使”，一旦细胞发生癌变，便很有可能产生异于常态的RNA，即“肿瘤特异性转录本”。复旦大学附属肿瘤医院方面8日透露，该院邵志敏教授、江一舟教授团队携手黄胜林教授团队，发现在三阴性乳腺癌的细胞中存在大量“肿瘤特异性转录本”，并据此率先成功绘制出三阴性乳腺癌“肿瘤特异
时评：合并批次，只限二本、三本够吗
日前，广西壮族自治区招生考试院宣布，2015年广西高考录取将把本科第二批与本科第三批合并，统一进行本科第二批录取。这意味着，本三不再作为一个单独的批次出现在该省的招生目录中。 合并二本、三本批次，广西绝非首创。近年来，浙江、福建、山东等省份实行的就是本科重点批次、非重点批次和专科批次录取，并
《奥本海默》之外的奥本海默
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508071.shtm ①年轻时的奥本海默。 ②奥本海默（右）与爱因斯坦。 ③1948年11月，奥本海默登上《时代》杂志封面。 ④在洛斯阿拉莫斯举行的一场科学研讨会。
关于基因转录的转录因子介绍
转录因子(transcription factor)是起调控作用的反式作用因子。转录因子是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。真核生物基因在无转录因子时处于不表达状态，RNA聚合酶自身无法启动基因转录，只有当转录因子(蛋白质)结合在其识别的DNA序列上后，基因才开始表达。转录因子的结合位点
转录图谱的转录图谱的意义
在于它能有效地反应在正常或受控条件中表达的全基因的时空图。通过这张图可以了解某一基因在不同时间不同组织、不同水平的表达；也可以了解一种组织中不同时间、不同基因中不同水平的表达，还可以了解某一特定时间、不同组织中的不同基因不同水平的表达。人类基因组是一个国际合作项目：表征人类基因组，选择的模式生物的D
RNA复制、转录与逆转录
转录是以DNA为模板合成RNA的过程，经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中，再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的，以RNA分子中的一条链为模板，在逆转录酶的作用下，以四种脱氧核苷酸为原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大
RNA的转录和逆转录
转录是以DNA为模板合成RNA的过程，经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中，再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的，以RNA分子中的一条链为模板，在逆转录酶的作用下，以四种脱氧核苷酸为原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大
昆明动物所揭示KLF5转录因子在乳腺癌中的功能和机制
转移是导致乳腺癌患者死亡的主要原因，因此防治转移是乳腺癌研究的关键。而在乳腺癌中，基底型ER/PR/HER2三阴性乳腺癌恶性程度最高，具有较高的侵袭性，术后复发转移风险高，疾病进展快，目前还没有找到有效的药物治疗靶标，是乳腺癌治疗的瓶颈和研究的热点。中国科学院昆明动物研究所研究员陈策实领导的肿瘤
关于体外转录的转录条件介绍
转录模板必须满足： 1. 在基因组全长克隆过程中，在正向引物5‘末端添加T7启动子序列； 2. 以T7启动子作为体外转录启动子，在启动子后面靶位序列连续带有3个G,转录效率最 高； 3. 在正向引物5/端添加一个帽子G,有利于提高体外转录RNA分子的侵染活性。
转录因子的转录调控区的介绍
同一家族的转录因子之间的区别主要在转录调控区。 转录调控区包括转录激活区（transcription activation domain）和转录抑制区（transcription repression domain）二种。近年来，转录的激活区被深入研究。它们一般包含DNA结合区之外的30-10
格列本脲
性状本品为白色结晶性粉末;几乎无臭。本品在三氯甲烷中略溶,在甲醇或乙醇中微溶,在水或乙醚中不溶。熔点本品的熔点(通则0612)为170~174℃。鉴别(1)在含量测定项下记录的色谱图中,供试品溶液主峰的保留时间应与对照品溶液主峰的保留时间一致。(②)取本品适量,加乙醇溶解并稀释制成每1ml中含0.1
格列本脲
本品为白色结晶性粉末;几乎无臭。本品在三氯甲烷中略溶,在甲醇或乙醇中微溶,在水或乙醚中不溶。熔点本品的熔点(通则0612)为170~174℃。
格列本脲
性状本品为白色结晶性粉末;几乎无臭。本品在三氯甲烷中略溶,在甲醇或乙醇中微溶,在水或乙醚中不溶。熔点本品的熔点(通则0612)为170~174℃。鉴别(1)在含量测定项下记录的色谱图中,供试品溶液主峰的保留时间应与对照品溶液主峰的保留时间一致。(②)取本品适量,加乙醇溶解并稀释制成每1ml中含0.1
2019年JCR中科院分区汇总|一区化学33本－物理26本－环境20本
近日，中科院期刊分区在线平台公布了2019年最新数据，值得一提的是，去年被归纳到二区的综合性期刊PNAS、Science Advances和Nature Communications，今年重新回到一区（相关链接：2019年JCR中科院分区出炉！PNAS Nat. Commun重回一区）。国产期刊
关于转录因子的转录抑制区的介绍
也是转录因子调控表达的重要位点，但是对其作用机理研究尚不深入。可能的作用方式有三种：1）与启动子的调控位点结合，阻止其它转录因子的结合；2）作用于其它转录因子，抑制其它因子的作用；3）通过改变DNA的高级结构阻止转录的发生。 转录因子必须在核内作用，才能起到调控表达的目的。因此，转录因子上的核